Enzymy

Question 1

Cechy charakteryzujące enzymy jako biokatalizatory

Answer 1

1. Wydajność
2. Swoistość
3. Funkcjonowanie w łagodnych warunkach
4. Możliwość regulowania aktywności

Question 2

Klasy enzymów

Answer 2

1. Oksyreduktazy
2. Hydrolazy
3. Liazy
4. Transferazy
5. Izomerazy
6. Ligazy

Question 3

Wzór na stałą szybkości reakcji k

Answer 3

k= A * exp^(-Ea/RT)

Question 4

Wzór na standardową zmianę energi swobodnej

Answer 4

G’= -2.3RT * logK

Question 5

Kontrola aktywności enzymów w organizmie

Answer 5

1. Hamowanie lub aktywacja ekspresji genów
2. Aktywacja zymogenowa
3. Kompartmentacja
4. Modyfikacja kowalencyjna
5. Regulacja allosteryczna

Question 6

Równanie Hilla

Answer 6

log(V0/Vmax) - Vo = nlog[S] - nlog[K]

Question 7

Co wykorzystują oksydoreduktazy?

Answer 7

NAD+
FAD
Wit. C
HEM

Question 8

Co wykorzystują transferazy?

Answer 8

DPT
CoA-SH
PLP
Tetrahydrofolian

Question 9

Co wykorzystują hydrolazy?

Answer 9

Jony metali

Question 10

Co wykorzystują liazy?

Answer 10

DPT

PLP

Question 11

Co wykorzystują izomerazy?

Answer 11

Wit. B12

Question 12

Co wykorzystują ligazy?

Answer 12

Biotynę

Question 13

Strategie katalityczne enzymów

Answer 13

1. Ogólna kataliza kwasowo-zasadowa
2. Kataliza kowalencyjna
3. Kataliza z udziałem jonów metali

Question 14

Lizozym

Answer 14

1. Hydrolizuje wiązanie beta (1->4) glikozydowe między GlcNAc i MurNAc
2. Pierścień D w związanym w centrum aktywnym sześciocukrowym fragmencie peptydoglikanu musi mieć konformację półkrzesełkową zamiast zwykłej krzesełkowej (dopasowanie)
3. Glu 35 –ogólny kwas – protonuje tlen wiązania glikozydowgo
4. Powstaje jon oksokarboniowy w pierścieniu D a odłączeniu ulega część łańcucha z pierścieniem E i F4.
5. Asp 52– ogólna zasada –stabilizuje stan przejściowy
6. Hydroliza prowadząca do przyłączenia grupy –OH z cząsteczki wody do jonu oksokarboniowego i wodoru do Glu 35