Fiche 9 Flashcards
sens de synthèse de l’ADN polymérase?
5’ vers 3’
2 types de nouveau brin
brin continu (leading) brin issu de cassures (lagging)
brin/fragment d’Okazaki
puisqu’ADN polymérase synthétise slmt 5 vers 3 et qu’il y a un brin qui doit être ds le sens 3 vers 5, ça prend des brins d’okazaki pour former ce sens là
se sont des brins d’ADN (entre 100 et 200 nucléotides) qui sont polymérisés ds le sens 5 vers 3 à la fourche et ensuite réunis et retournés dans la bonne orientation
qu’est-ce que la fourche de réplication?
région de réplication particulière sur le chromosome en réplication, ça se déplace le long de la double hélice. Il y a un complexe avec plein d’enzyme, dont l’ADN polymérase, qui permet de synthétiser les 2 brins filles
fourche asymétrique, car synthèse du brin en continu (précoce/conducteur) + rapide que celle du brin discontinu (retardé)
synthèse du brin retardé
mécanisme discontinu de piqûre par points arrière
la polymérisation se fait ds le sens inverse (5 vers 3) au sens final du brin
rôle d’auto révision de l’ADN polymérase
avant ajout nucléotide : si c’est le bon nucléotide, l’affinité pour la polymérase sera meilleure, donc niveau d’É favorable
après ajout nucléotide : enzyme change de conformation(se resserre sur site actif) - dépend de la géométrie des bases, si c’est pas la bonne, le resserrement est moins favorable
correction des mésappariements par l’ADN polymérase
corrigé par exonucléase 3 vers 5
enlève toutes les bases mal appariées (recule) jusqu’à ce qu’elle trouve la base appariée à l’extrémité 3-OH’, synthèse continue après
fréquence d’erreur ADN vs ARN
beaucoup moins d’erreur dans ADN que ARN, car il y a révision/correction pour ADN mais par pour ARN
-il n’y a pas de mécanisme pour ARN polymérase, car erreur n’a pas d’impact à long terme
quelles sont les enzymes qui ont un rôle dans la fabrication des brins d’Okazaki et comment ça fonctionne?
ADN primase : utilise les nucléotides d’ARN pour synthétiser amorce ARN
- amorce nécessaire à ADN polymérase pour copier ADN du brin retardé
- amorce est loin sur le brin d’ADN : espace entre ADN synthétisé par ADN polymérase et amorce. ADN polymérase va rejoindre à l’extrémité la plus proche (3’) et synthétise dans le sens 5 vers 3 en se rapprochant de l’ADN déjà synthétisé
après : système pour effacer amorce d’ARN et remplacer par ADN
ADN ligase : unit extrémité 3’ du nouveau fragment d’ADN à l’extrémité 5’ de l’ancien (celui dont l’amorce d’ARN a été remplacée)
rôle de l’ADN hélicase
se lie à simple brin d’ADN : hydrolyse ATP (utilisée pour se propulser le long du brin)
-qd elle rencontre double hélice, poursuit son déplacement pour séparer l’hélice
adn primase
adn ligase
adn hélicase
primase : fait amorce d’ARN
ligase : lie ancienne amorce avec nouveau fragment
hélicase : ouvre hélice
adn topoisomérase
règle le problème de l’enroulement
comment?
-liaison covalente avec squelette de phosphate de l’ADN (brise liaison phosphodiester sur le brin : réversible dès que l’enzyme part)
– chaque brin fait rotation libre, moins besoin d’É
quel est le cycle cellulaire? dans quelle phase l’ADN est synthétisé
G1 - S - G2 - M
phase S : réplication des chromosomes en 2 copies reliées au niveau du centromère
toutes les origines ne sont pas actives en même temps
comment les modifications d”histones (ex : méthylation) se transmet à la seconde génération
quand la double hélice se sépare en 2, la moitié (4) des histones reste attachée à l’ADN et l’autre moitié est libérée.
ceux qui sont resté sur l’ADN parental se répartissent aléatoirement entre les brins fils, et il y en a des nouveaux d’ajoutés pour qu’il y en ait le bon nombre. Donc, pour les histones modifiées, slmt la moitié se trouvera sur les nucléosomes.
complexe lecture-correction (enzyme de modifications des histones) reconnait le même type de modifications que ce qu’elle a été capable de créer sur les anciennes queues des histones et peut le refaire sur les nouvelles
rôle de la télomérase
problème pour la synthèse du brin retardé : quand la fourche atteint la fin, il n’y a pas de place plus loi pour faire l’amorce pour le dernier brin d’Okazaki
d’où l’utilité des télomères qui ont la même séquence plein de fois (pas besoin de se rendre au bout)
télomérase est appelée quand protéines de liaison reconnaissent la séquence des télomères
- télomérase reconstitue les séquences à chaque division
- télomérase reconnait l’extrémité de la séquence et l’allonge dans le sens 5 vers 3 quelpour permettre de terminer la synthèse du brin
théorie du vieillissement
perte de fonction de la télomérase + raccourcissement des télomères : dysfonction cellulaire
- télomérase agit pas à chaque division, donc le nb de répétitions de la séquence diminue
- -chromosomes transmis deviennent défectueux au fl des générations
quel est le mécanisme d’action des hormones thyroïdiennes ou des corticostéroïdes?
activation de la transcription
caract ARN
AU et CG
simple brin
ARNm ARNr ARNt ARNmi ARNsi
m = messager
-molécules d’ARN copiées à partir des gènes de l’ADN. Spécifie séquence aa pour les prots - code les prots
r = ribosomal
-forme structure de base des ribosomes et catalyse synthèse protéines
t = transfert
- adaptateur entre ARNm et aa
mi = micro ADN
-contrôle l’expression des gènes en bloquant la traduction de certain ARNm
si = petits ARN interférents
-arrête expression d’un gène en dégradant l’ARNm + en rétablissant structure compacte de a chromatine
ARN polymérase
3 types (I, II et III) II est la principale
elles transcrivent des gènes différents, mais ont structure semblabe et sous-unités communes
pourquoi il y a une seule possibilité de brin d’ARN, alors que l’ADN est double brin, selon le brin matrice choisi, ça varierait
il y a slmt un promoteur sur le gène et l’ARN polymérase peut s’y lier slmt ds une orientation. ARN polymérase synthétise juste 5 vers 3
donc, slmt un des brin peut être transmis (selon localisation et orientation promoteur)
d’un gène à l’autre, le brin choisi change
qu’est-ce que la boite tata?
courte séquence d’ADN qui contient surtout des T et des A, là où la transcription commence (se situe 25 nucléotides avant le début)
pas la seule séquence qui signale le début, mais la plus importante pour les promoteurs.
fixation du facteur de transcription TFIID sur la boite pour amorcer
machinerie transcriptionnelle de base
complexe de protéines avec des fct enzymatiques qui fonctionne avec ARN polymérase
1.Liaison TFIID sur boite TATA : distorsion de l’ADN : permet au promoteur de trouver le site
- Assemblage d’autres facteurs de transcription avec la boite TATA
- ex : TFIIH déroule la double hélice pour exposer le brin - Synthèse d’un court segment d’ARN par ARN polymérase au site du promoteur
- Changement de conformation de l’ARN polymérase : libération pour transcrire gène en s’éloignant du promoteur
* facteurs de transcription libérés quand transcription (phase d’élongation) est commencée pour refaire autre cycle)
épissage de l’ARN
réunit les différentes portions qui codent la protéine (exons). enlève les introns
selon l’épissage qui est fait, transcription d’un même gène peut donner des protéines différentes
après épissage + maturation des extrémités : préARNm s’appelle ARNm
