Bioch chap 8

Question 1

AA en général

• obtenus par
• utilisés pour
• stockage

Answer 1

obtenus

• Diète : dérivés des protéines alimentaires
• biosynthèse : pour aa non essentiels
• dégradation protéine du corps

utilisés pour

• synthétiser protéines du corps
• former précurseurs de composé contenant azote
• être transformé en
• -glucose
• -glycogène
• -AG
• -corps cétoniques

pas de stockage
-excédent devient du pyruvate/oxaloacétate

Question 2

métabolisme du nitrogène

Answer 2

lié au catabolisme des aa
source d'azote : aa des protéines (diète)
élimination de l'azote sous forme de 
-urée
-ammoniaque
-autres composés métabolisme aa

Question 3

renouvellement des protéines du corps

Answer 3

majorité sont renouvelés continuellement

équilibre entre synthèse et dégradation (qt de protéines maintenue cst)
niveau de prots intracellulaire déterminé par rythme synthèse et dégradation
300 à 400g de prots synthétisés/jour

Question 4

demi-vie des protéines

Answer 4

dépend de la nature du N-terminal

• courte : voie métabolique très régulée
• • N-terminale : aspartate ou arginine
• longue : protéines de structure, très stables (ex : prots du cristallin)
• • N-terminale : sérine ou méthionine

Question 5

2 systèmes de dégradation des protéines

Answer 5

protéasome régulé par ubiquitine
-dégrade
– protéines cytosoliques/intracellulaires
dégradation lysosomale
-dégrade
– protéines extracellulaires
– protéines à la surface de la membrane plasmique

Question 6

qu’est-ce que l’ubiquitine

Answer 6

protéines régulatrice du protéasome
dans presque tous les tissus (ubiquitaire)
activée par 3 étapes enzymatiques
protéines à dégrader marquées à l’ubiquitine
- ubiquitine ligase forme lien entre protéine et ubiquitine
- protéasome dégrade juste protéine pas ubiquitine

Question 7

qu’est-ce que le protéasome?

Answer 7

complexe protéique
fct principale : dégrader liens peptidiques : catalysé par protéases
30 000 protéasomes/c
en 2 parties
-coiffe protéique
– régulent entrée, fixent et déplient protéines
– contient 6ATPase : défont structure 3D
-anneaux intérieurs
– dégrade
– contient enzyme de dégradation

Question 8

fonctionnement du système protéasome régulé par ubiquitine

Answer 8

1. ubiquitinylation : prots sélectionnées pour dégradation marquées à l’ubiquitine
2. prots marquées reconnues par protéasome
3. protéasome déplie prots et séparent en fragment peptidique
4. fragment libérés dans cytosol : dégradés en aa

Question 9

qu,est-ce qu’un lysosome?

Answer 9

provient de

• RE
• Appareil de Golgi

membrane contient

• pompe à protons
• protéines LAMP
• phosphatases acides

contient hydrolase
type de digestion
-hétérophagie : fusion avec endosomes - dégradation composés exogènes
-autophagie : fusion avec autophagosome - renouvellements composés cellulaires

Question 10

fonctionnement dégradation lysosomale

Answer 10

dépendant d’ATP

Question 11

quelles sont les sécrétions responsables de la dégradation?

Answer 11

sécrétions gastriques

• HCl : acidité dénature protéines
• pepsine : activée par pH acide, dégrade prots en aa libres et en longs fragments peptidiques

sécrétions pancréatiques

• protéases pancréatiques
• • dégradent longs peptides provenant de l’estomac
• • chaque enzyme a spécificité propre
• – coupe liaison spécifique
• – au total, la prot est complètement dégradée

Question 12

2 transports des aa/petits peptides par entérocytes (barrière intestinale)

Answer 12

symport par gradient de H+
-transport di ou tri peptides 
-- devient aa grâce à peptidases intracell ds le cytosol
symport par gradient de Na+
- transport aa

Question 13

devenir des aa

Answer 13

une fois que les prots sont des aa, ils sont absorbés
ensuite, diffusé par la veine porte
- amenés au foie : métabolisation
- relâchés ds circulation sanguine (distribution)

Question 14

transport des aa ds les c (à partir du sang)

Answer 14

transport actif car concentration intracell plus grande que concentration extracell
gradients de concentration H+ et Na+ (pour transport à partir des entérocytes) maintenus

7 systèmes de transport : spécifiques à certains aa

Question 15

clivage du groupement azote des aa

• pourquoi
• comment

Answer 15

raison : groupement aminé (NH2) empêche dégradation

1. NH2 clivé
2. début catabolisme
3. dégradation c

NH2 libres

• transférés à d’autres composés
• excrétés sous forme d’urée

Question 16

transamination

Answer 16

1e étape du catabolisme de aa
transfert du groupement aminé : part du aa et va sur a-cétoglutarate : ça donne du glutamate

enzyme : transaminases

• se trouvent ds tous les tissus : surtout foie, reins, intestin et muscles. Dans le cytosol et mitochondrie
• spécifique à un ou plusieurs aa
• nécessite coenzyme pyridoxal-phosphate
• • intermédiaire entre aa et a-cétoglutarate
• • dérivé vit B6
• • groupement fonctionnel important : aldéhyde

Question 17

diagnostic basé sur transaminase

Answer 17

normale : faible concentration transaminase ds le sang

trauma physique/maladie : augmente lyse cellulaire - augmente niveau transaminases ds le sang

dosage de transaminases utilisé pour diagnostiquer

• maladie hépatique
• maladies du myocarde et désordres musculaires

Question 18

désamination oxydative des aa

Answer 18

libération groupement aminé : formation ammoniaque libre

enzyme : glutamate déshydrogénase
-coenzyme : NAD+ ou NADP+ (selon dispo)

où : foie et reins

régulé selon

• glutamate
• a-cétoglutarate
• ratio coenzymes oxydés/réduits

activation

• ADP
• niveau É bas : dégradation fournit É

inhibition
-GTP

Question 19

transport ammoniaque des tissus périphériques vers foie

Answer 19

pourquoi : pour convertir en urée

problème? ammoniaque toxique, peut pas passer par circulation sanguine

solution : 2 mécanismes non toxiques

• formation glutamine : glutamate + ammoniaque
• transamination pyruvate en alanine (utilisé par muscles) : cycle glucose-alanine

Question 20

urée + dessiner cycle de l’urée

Answer 20

forme majeure excrétion aa
90% de l’azote contenu ds urine
produite ds foie
transportée ds le sang vers reins pour sortir sour forme d’urine

cycle :
ornithine ds cytosol mais doit aller ds mito
citrulline ds mito mais doit aller ds cyto
-antiport citrulline/ornithine

Question 21

devenir de l’urée

Answer 21

1,diffuse ds le foie

2. transporter par sang vers reins (une partie va vers intestin)
3. filtrée ds les reins
4. excrété ds l’urine (une partie ds les selles en allantoïne

Question 22

7 produits des 20aa dégradés

Answer 22

pyruvate
acétyl-CoA
acétoacétate
a-cétoglutarate
succinyl-CoA
fumarate
oxaloacétate

Question 23

destin des produits des aa dégradés

Answer 23

voie de synthèse du glucose et lipides

voies de production d’é comme intermédiaires métaboliques

Question 24

synthèse des aa

Answer 24

non essentiels : à partir d’intermédiaires métaboliques
essentiels : à partir de la diète

transamination simple

• pyruvate = alanine
• oxaloacétate = aspartate
• a-cétoglutarate = glutamate

synthèse par amidation

• nécessite ATP
• produits contiennent 2 atomes d’azote
• -glutamate + ammoniaque = glutamine
• -aspartate + glutamine = asparagine

synthèse proline
-cyclisation + réduction glutamate

synthèse sérine, cystéine et glycine

• 3-phosphoglycérate = sérine
• sérine = glycine
• sérine + homocystéine = cystéine

Question 25

aa céto, gluco ou les 2 formateurs

Answer 25

gluco

• alanine
• arginine
• asparagine
• aspartate
• cystéine
• glutamate
• glutamine
• glycine
• histidine
• méthionine
• proline
• sérine
• thréonine
• valine

céto

• leucine
• lysine

les 2

• isoleucine
• phenylalanine
• tryptophan
• tyrosine

Question 26

rôles des nucléotides

Answer 26

synthèse ADN et ARN (synthèse prots + voies métaboliques)
transporteurs (UDP-glucose)
précurseurs coenzymes (FAD)
seconds messages (AMPc)

Question 27

purine vs pyrimidine

Answer 27

purinAG : 2 cycles

pyrimidine : 1 cyles
C, T, U

Question 28

synthèse des ribonucléotides à purines (A et G)

Answer 28

1. synthèse du PRPP (pentose activé)
   - substrats : ribose-5-phosphate + ATP
   - régulation
   - -activé : Pi
   - -inhibé : nucléotides à purine (produit final)
2. synthèse IMP
   - substrats : PRPP + 5ATP + plusieurs aa
   - 11 rxns successives
   - IMP s’accumule pas : converti en AMP (hydrolse GTP ou GMP (hydrolyse ATP)
3. ajout groupements phosphates sur les nucléotides
   - enzyme : kinase spécifique à base azotée
   - phosphate provient d’ATP
   - conserve équilibre entre AMP, ADP et ATP

Question 29

voie de récupération des purines

Answer 29

pour récupérer purines venant du renouvellement des acides nucléiques c pas dégradés

enzymes : APRT + HGPRT

Question 30

inhibiteur synthétique de la synthèse

Answer 30

méthotrexate (analogue acide folique)

-interfère avec synthèse nucléotides : donc avec synthèse ADN/ARN

Question 31

synthèse désoxyribonucléotides à purines

Answer 31

enzyme : ribonucléotide réductase
coenzyme : thioredoxine (donne H)
- oxydé pdnt rxn
- retour à sa forme réduite (grâce à thioredoxine réductase)
substrat : ribonucléoside phosphate

régulation :
inhibition :
- liaison dATP (d : désoxy…) au site actif

activation :
- liaison ATP au site actif

un ou l’autre selon ce qui est requis
-liaisons substrats à des sites allostériques

Question 32

dégradation acides nucléiques alimentaires

Answer 32

1. hydrolyse ARN et ADN alimentaire : courte chaine : mono-nucléotides
   - enzyme pancréatiques
2. Retrait des groupements phosphates : nucléotides - nucléosides
   - enzyme nucléotidases ds muqueuse intestinale

3.séparation base azoté-sucre : purine - acide urique (relâché ds sang : excrété par reins en urine)

Question 33

goutte

• causes
• effets
• traitement

Answer 33

désordre : hyper-uricémie : trop d'acide urique ds le sang
causes
- suprod acide urique
-défaut excrétion acide urique
--concentration sanguine élevée en lactate, éthanol, corps céto
--obésité + diabète + hypertension
-- froid
--intoxication au plomb

effets : dépôts sels d’urate sur jointures - inflammation

traitement

• court terme : anti-infl (colchicine ou prednisone (cortico))
• long terme : allopurinol fait baisser niveau acide urique (empêche sa formation ds muqueuse intestinale)

Question 34

synthèse nucléotide à pyrimidine (C, T et U)

Answer 34

1. synthèse carbamyl-phosphate
   -enzyme : carbamyl-phosphate synthétase
   -produit : carbamyl-phosphate (précurseur cycle urée)
   2.étapes successives pour formation anneau pyrimidine
   3.Conversion de l’anneau
   produit : OMP
   substrat : anneau + PRPP
   4.conversion OMP
   -enzyme : décaboxylase
   produit : UMP
   5.phosphorylation UMP
   -produit : UDP et UTP
   -enzyme : ribonucléotide réductase
   6.synthèse CTP à partir d’UTP
   -enzyme : CTP synthétase
   -substrat : UTP + glutamine + ATP