f6 - RTKs Flashcards
hvad er de to overordnede receptorklasser
plasmamembranlokaliserede receptorer
intracellulære receptorer
giv eksempler på plasmamembran lokaliserede receptorer
receptor-serin/threonin-kinaser
receptor-tyrosin-kinaser (RTK)
guanylylcyklase-receptorer
tyrosinkinase-koblede receptorer
(alle enzymkoblede)
giv eksempler på intracellulære receptorer
vitamin d
østrogen
testosteron
cortisol
thyroidhormon
hvad kaldes ekstracellulære signaler også
ligander eller signalmolekyler
(inkluderer hormoner & vækstfaktorer)
hvad afgør en celles respons
ikke bare et, men en kombination af signaler
ANP-domæner omdanner hvad?
GTP til cGMP via guanylylcyklase-domænerne
cGMP aktiverer hvad
proteinkilder G (PKG)
cGMP nedbrydes af hvad
fosfodiesteraser (PDE)
PDE5 er cGMP specifik
hvordan virker intracellulære receptorer?
signal molekyle ankommer til celle
hvis receptor er i cytosol, rykkes den til nukleus efter signal har bundet
hvorfor kaldes receptorerne enzymkoblede
de kobler til enzymer der påvirker acetylering af histoner (?)
hvad kan receptor når signalmolekyle ikke er bundet
virke som transkriptionel repressor;
binder corepressor og corepressor bindende proteiner
hvad sker med corepressor, når ligander kommer
konformation af receptor ændres
corepressor kan ikke længere binde
receptor får affinitet for coaktivatorer
hvorfor er RTK ikke i sig selv velegnet til at overføre signal fra signalmolekyle til cytosol
har næsten altid kun et transmembran segment
hvad sker der når signalmolekyle(r) binder
to RTK monomerer dimeriserer
- cytosolære tyrosinkinase domæner bringes tættere
- kan krydsfosforyleres med ATP som co-substrat
hvordan kan RTK’er allerede være dimeriserede
via disulfid-binding mellem monomere
- bringes stadig tættere
hvordan binder signalproteiner til de fosforylerede tyrosin-rester på den cytosolære side
via SH2-domæne, der har affinitet for fosfotyrosin-rester
hvad er nogle berømte RTK’er
insulin (vigtig for metabolisme)
IGF-1 (vigtig for længdevækst)
aktivering af RTK medfører hvad
krydsfosforylering
rekruttering/aktivering af cytosolære signalproteiner
hvad er Ras
small GTP-binding protein
(og monomerisk GTPase; kan hydrolysere GTP)
hvordan aktiveres Ras
ved binding af GTP, som stimuleres af Ras-GEF (guanine nucleotide exchange factor)
hvad gør Ras-GEF
udskifter GDP til GTP på Ras
hvordan inaktiveres Ras
hydrolyse af GTP til GDP + Pi
stimuleres af Ras-GAP (GTPase-activating protein)
HUSK! ikke udskiftning, men hydrolyse
hvordan sidder Ras fast i plasmamembran
via lipid-anker
Ras er ofte muteret i hvad
cancer
hvad er et adaptorprotein
protein uden enzymatisk aktivitet, men som virker ved at binde til andre proteiner
hvor aktiveres Ras
nedstrøms for aktiveret RTK
hvad er MAPK
signaleringsmodul; består af flere kinaser
- MAPKKK (Raf), MAPKK (MEK), MAPK (ERK)
aktiveret af Ras
hvordan aktiveres PI3K nedstrøms for RTK
ved binding til fosfotyrosin-rest på aktiveret RTK
PI3K fosforylerer hvad?
inositolfosfolipider i plasmamembranen (PIP2 -> PIP3)
PIP3 rekrutterer hvad
Akt og proteinkinase 1 til plasmamembran
hvordan aktiveres Akt
ved fosforylering på en serin- & en threonin-rest ved proteinkinase 1 & 2
hvordan aktiveres celleoverlevelse via Akt
protein Bcl2 er bundet til Bad og er inaktiv
Akt fosforylerer Bad, som slipper Bcl2
fri Bcl2 fremmer celleoverlevelse ved at forhindre apoptose
hvordan aktiveres cellevækst via Akt
Akt fosforylerer/hæmmer protein, der normalt holder Tor i inaktive form
aktiveret Tor inhibere protein degradering og stimulerer protein syntese
hvad gør fosforylering ved et protein
2 negative ladninger (-PO3-gruppe) introduceres; kovalent modifikation
konformationsændring af det fosforylerede protein
hvad kan fosforylering resulterer i
forøgelse eller reduktion af protein aktivitet
hvordan kan fosforylering af protein detekteres
ved Wester blogs (immunoblotting)
forklar western blot
prøve tages, køres ud i gel, separeres efter protein størrelse
membran inkuberes med antistoffer
kan også observere om protein vandrer anderledes i gel efter behandling (skyldes ændring fosforylering, kan det checkes ved behandling med fosfatase inden gelkørsel)
hvilket antistof anvendes under immunoblotting
fsofospecifikt antistof; antistof der specifikt genkender bestemt fosforylering af bestemt protein
hvad er crosstalk
visse signalstoffer og kinaser påvirkes både af GPCR og RTK signalering
kan godt aktivere samme ting med forskellige signalstoffer og enzymer/kinaser
hvad er et eksempel på crosstalk
signalering involverer to fosforylering af et protein via aktivering af to forskellige receptorer (A og B)
hvad er notch
en plasmamembran lokaliseret receptor, som også er transkriptionsfaktor
hvad sker ved binding af delta til notch
afklædning af cytosolære del af notch
denne del translokerer til kernen
regulerer notch-responsive gener
- denne signalering kræver kun notch binding og protease til at kløve notch
hvad sker når ethylen ikke er bundet til ethylen-receptor i ER membran
receptoren er aktiv
aktiv receptor aktiverer associeret kinase, som forårsager nedbrydning af transkriptionsfaktor
(ville ellers fremme ekspression af ethylen-responsive gener)
hvad gør mutationen RasV12
glycin-12 bliver til valin
resulterer i konstitutivt aktiv Ras
kan ikke hydrolysere GTP
fremmer celledeling på ukontrolleret måde
hvad består ErbB-familien af RTK’er af
Her2-receptorer
EGF-receptorer (epidermal growth factor)
hvad sker der ved mutation i Her2-receptorer
valin-til-glutamin mutation i transmembrane domæne
signalmolekyle-uafhængig dimerisering
Her2-receptor er konstitutivt aktiv
hvad sker der ved mutation i EGF-receptor
mutation medfører dannelse af stopkodon
eliminerer meste af den ekstracellulære del af receptor
medfører signalmolekyle-uafhængig dimerisering af trunkerede receptor
konstitutivt aktiv
