f17 - ribosomer & proteasomer

Question 1

hvornår fjernes introns

Answer 1

ved RNA splicing i nukleus

Question 2

hvor cappes og polyadenyleres eukaryotisk mRNA

Answer 2

cappes ved 5’enden
polyadenyleres (poly-A hale) ved 3’enden

Question 3

hvordan foregår translation

Answer 3

1. aminoacyl-tRNA syntetase binder den rigtige amino syre til tRNA (charging) i cytoplasma
2. ladet tRNA binder til den rigtige kodon i mRNA (binding) i ribosomet

Question 4

hvad er funktionen af ribosomale proteiner

Answer 4

dekorerer overfladen af ribosomet

vigtige for at opretholde stabilitet og integritet, men ikke for katalysen

Question 5

hvor finder ribosom assembly sted

Answer 5

nukleolus i nukleus

Question 6

hvad er de tre bindings sites på ribosomet

Answer 6

E-site, P-site, A-site

Question 7

hvad er de fire trin under translation

Answer 7

1. tRNa binder til ribosom og RNA i A-site med aminosyrer, mens tRNA i E-site frigives
2. peptid binding formes mellem nyligt bundet aminosyrer og aminosyrer fra tRNA i P-site
3. large subunit af ribosom translokerer
4. lille subunit translokerer

Question 8

hvordan kan den voksende polypeptid forlade ribosomet

Answer 8

gennem en tunnel i den store subunit

Question 9

hvad betyder det at prokaryotisk RNAer ofte er polycistroniske

Answer 9

flere separate proteiner kodes for på samme mRNA

Question 10

hvordan initieres protein syntese i eukaryoter

Answer 10

initatior tRNA med met (altid første aminosyrer) binder til lille ribosomale subunit

mRNA bindes og tRNA bevæger sig langs den indtil den finder AUG

store ribosomale subunit binder

aminoacyl-tRNA binder til a-site (step 1)

Question 11

hvordan termineres translation

Answer 11

sættes i gang af stop kodoner

release factor kommer ind i A site og sætter gang i hydrolyse af peptidyl-tRNA binding; leder til frigivelse af protein

frigivelse af nyligt syntetiseret protein leder til disassociation af ribosomet

Question 12

hvor translateres mRNAer

Answer 12

på polyribosomer

Question 13

hvordan fungerer antibiotika

Answer 13

de er translations inhibitorer
interferer med bakteriel protein syntese, skader ikke eukaryoter

Question 14

hvilken funktion har proteasomet

Answer 14

degradering af cytosoliske og nuklære proteiner

Question 15

hvordan er proteasomet opbygget

Answer 15

core kompleks er en cylinder med 28 proteiner - 14 af dem er proteaser (protein degraderende) der vender indad

caps på hver side af cylinderen af 18 forskellige proteiner udholder proteiner og regulerer indgang i destruktionskammer

Question 16

hvilken rolle spiller ubiquitin

Answer 16

marker (posttranslationel modifikation) for protein degradering i proteasom

Question 17

hvordan bindes ubiquitin til protein

Answer 17

c-terminus af første ubiquitin bindes til lysin kæde på target protein

poly-ubiquinylation ved forlængelse af ubiquitin kæde ved peptidbindinger mellem lysin rester (eller fra n-terminus til c-terminus)

Question 18

hvilke enzymer involverer ubiquinylation

Answer 18

E1; ubiquitin aktiverende enzym
E2; ubiquitin konjugerende enzym
E3; ubiquitin ligase

Question 19

hvordan degraderes proteiner i proteasomet

Answer 19

polyubitquitin kæde på protein binder til polyubiquitin bindingssite i proteasom cap

protein kommer ind i cylinderen og degraderes, kløves

ubiquitin genbruges

Question 20

hvad er forskellen på lysosomer og proteasomer

Answer 20

lysosomer;
- organeller
- degraderer for det meste exogenous proteiner, membranproteiner, dysfunktionelle afdelinger

proteasomer;
- multi-protein kompleks (i cytosol og nukleus)
- degraderer mest endogenous proteiner, inkorrekt foldning, skadede proteiner med hurtig turnover (fx. cykliner)