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Bioquímica > Expresión génica > Flashcards

Expresión génica Flashcards

1
Q

cuales son los tipos de genes de acuerdo a su modalidad de expresión

A
  • constituitivos: se expresan constantemente independiente del estado de la célula
  • regulados: sólo en ciertos estados de la célula u organismo, pueden ser inhibidos o activados
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2
Q

ejemplos de puntos donde se puede regular la expresión de genes

A
  • síntesis de mRNA transcripto 1º
  • procesamiento post-traduccional (más común)
  • degradación del mRNA
  • traducción
  • modificaciones post-traduccionales de proteínas
  • degradación de proteínas
  • transporte de las proteínas
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3
Q

cuales son los tipos de genes de la expresión regulada

A
  • Iniciada: se trata de un gen inducido, se inicia su expresión. El proceso será de inducción
  • Finalizada: se tratará de un gen represible, se termina su expresión. El proceso es de represión
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4
Q

donde interactúan las proteínas reguladoras del ADN con el ADN

A
  • en las secuencias de consenso
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5
Q

de que depende la eficiencia de la transcripción

A
  • depende de la mayor o menor afinidad de la RNA pol con las secuencias de consenso del promotor (TATA box)
  • interacción de la RNA pol con el gen puede ser estimulada por activadores o inhibida por represores
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6
Q

cual es la diferencia fundamental de la regulación en los eucariontes y procariontes

A
  • procariontes: regulación negativa mediada por represores. si no hay represores hay cancha libre para la transcripción
  • eucariontes: regulación positiva mediada por activadores. todos los genes están desactivados y se activan por activadoras
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7
Q

donde se unen los represores en el ADN de los procariontes

A
  • en el “operador” que es un sitio dentro del promotor
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8
Q

donde se unen los activadores en los eucariontes

A
  • en regiones próximas o distantes a los promotores, río arriba.
  • activadores pueden también unirse a secuencias muy río arriba y se conocen como secuencias facilitadoras.
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9
Q

como se puede regular a los represores y activadores

A
  • represores:
    1. una molécula se le une y lo inactiva
    2. que el represor necesite un cofactor para que este activa
  • activadores:
    1. se le une una molécula y deje de activar
    2. necesita de molécula para que esté activo
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10
Q

que es el operón

A
  • unidad fundamental de la regulación en procariontes

- promotor + operador + genes estructurales (genes regulados)

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11
Q

que son los RNAm policistrónicos

A
  • RNAm que puede codificar varias proteínas

- normalmente son proteína de la misma ruta metabólica

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12
Q

que son los motivos estructurales, que permiten y ejemplos

A
  • conformaciones específicas de las proteínas
  • permiten la interacción de prots con ADN
  • ej: HELIX-TURN-HELIX en procariontes y “dedos de zinc” en eucariontes
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13
Q

en que surco se unen las proteínas reguladoras al ADN

A
  • se unen al surco mayor, que es la parte más ancha del ADN
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14
Q

que motivos estructurales permiten la interacción entre las sub-unidades de las proteínas reguladoras

A
  • zipper de leucina

- helix-loop-helix

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15
Q

que produce el operón LAC

A
  • lactasa
  • transportador galactósido permeasa
  • regulador de la lactasa
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16
Q

que molécula induce al operón LAC

A
  • alolactosa
  • operon LAC siempre está expresando una pequeña cantidad de sus proteínas, que se disparan cuando entra lactosa a la sangre
17
Q

cómo se produce el mecanismo de regulación “represión catabólica”

A
  • regulación del operón LAC para que no forme lactasa a menos que no haya presencia de glucosa
  • para la activación del operón LAC se requiere de proteína activadora CRP, que solo se activa con la presencia de AMPc
  • por lo tanto CRP solo se activa con bajos niveles de glucosa
18
Q

como se regula el operón triptófano en los bacterios

A
  • Normalmente el operador está libre, pero cuando está el triptófano se bloquea al operador mediante la activación de un represor inactivo
  • El represor del operón triptófano tiene motivo estructural hélix-turn-helix
  • además está regulado por un mecanismo de respuesta muy rápida que se conoce como atenuación
19
Q

que es el mecanismo de atenuación y cómo funciona

A
  • permite que la transcripción del mRNA policistrónico que codifica las enzimas de la biosíntesis se suspende bruscamente
  • río arriba en el gen que codifica las enzimas, hay secuencias que codifican un péptido “líder”
  • existen 4 secuencias, en la secuencia 1 hay codones que incorporan al triptófano al péptido líder
  • La secuencia 3 se puede autocomplementar con la secuencia 2 y la 4, dependiendo con cual se complemente es si se produce la transcripción o no
  • cuando hace el loop con la 2 es porque no hay triptófano, se reconoce la secuencia 1, pero como hay pocos ARNt de triptófano no se cubre secuencia 2, por lo que se forma un loop entre la secuencia 2 y 3 y se activa aún más el proceso de traducción, produciendo un mecanismo no atenuado
  • cuando hace el loop con la 4 es porque hay mucho triptófano, llega el tRNA respectivo y cubre la secuencia 1 y 2. Eso hace que la secuencia 3 y 4 formen el loop y liberen al ribosoma del ARN
20
Q

por qué la regulación génica en eucariontes es más compleja

A
  • Acceso a promotores es restringido por complejidad estructural de cromatina
  • Requiere de múltiples modificaciones estructurales de la cromatina (remodelación de cromatina)
  • Predominan elementos de regulación positiva (activadores)
  • Expresión de un gen es regulada por grandes complejos proteicos de muchas subunidades que interaccionan con el ADN en sitios diferentes al promotor
  • Transcripción ocurre en lugar distinto a traducción
21
Q

qué son y para qué sirven los factores de transcripción

A
  • son proteínas en la forma de homodímeros o heterodímeros que se unen al ADN y activan o desactivan la transcripción, en órganos o tejidos específicos
  • permiten la unión de la ARN pol
22
Q

que son las regiones hipersensibles

A
  • segmentos de cromatina más susceptibles a ser hidrolizadas x ADNasas
  • están menos protegidas por las histonas
  • las histonas acá son + susceptibles a acetilación, fosforilación o metilación
  • aquí hay genes de transcripción muy intensa
23
Q

como se acetila/deacetila una histona

A
  • Acetilación-deacetilacion de histonas implica cambios conformacionales y modificación de su interaccion con el ADN
  • histonas H3 y H4 forman un complejo activo, que cuando se acetila pasa a ser inactivo
  • la enzima que acetila se llama histona acetilasa y la que desacetila se llama histona deacetilasa
  • la acetilación ocurre en dominios estructurales ricos en lisina y que están cerca del segmento de ADN con el que interactúa la histona
24
Q

como es el metabolismo del hierro

A
  • Transferrina lleva hierro a célula desde el hígado
  • Se une al receptor y se hace endocitosis
  • En la célula la vesícula es atacada por lisosoma, cambia el pH y por ende libera el hierro y la transferina + receptor
  • Se recicla transferrina y receptor
  • Hierro se une a ferritina como depósito y se libera para procesos metabólicos
25
Q

que es la hematocromatosis y en que se relaciona con la regulación del ADN

A
  • Se hiperabsorbe hierro, el gen que codifica la proteína de regulación de absorción de hierro se encuentra mutado
26
Q

como se regula la homeostasis del hierro

A

Cuando hay hierro bajo, protegen que no se destruya el ARNm de la síntesis de receptor de la transferrina (más receptores), paralelamente se produce bloqueo de síntesis de ferritina (para que hierro esté disponible)

Cuando hay mucho hierro, se degrada el ARNm que sintetiza los receptores, y se aumenta la síntesis de ferritina

Bioquímica (14 decks)

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