(ביותא ב) ER Flashcards

1
Q

איזה אחוז מכלל הממברנות בתא מהווה ממברנת ה

ER?

A

כ-50%

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

איזה אחוז מנפח התא מהווה הלומן של ה

ER?

A

כ-10%

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

היכן בתא ניתן למצוא ריבוזומים המצויים ע”ג ממברנה?

A

rER

ובממברנה החיצונית של הגרעין

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

היכן ניתן למצוא מאגרי סידן בתא?

A

במיטוכונדריה וב

ER

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

לאחר הומוגינציה של התא אלו פרקציות של ה
ER
נמצא?

A
  • מיקרוזומים של
    sER
  • מיקרוזומים כבדים יותר של
    rER
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

מהו ה
sugnal sequence
המכווין חלבונים אל ה
ER?

A

רצף של כ20 ח”א, מתוכן לפחות 8 הידרופוביות, בקצה האמיני

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

היכן מצוי
signal peptidase
של ה
ER?

A

בסמוך לטרנסלוקון

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

מה המבנה של

SRP?

A

בנוי מ6 תת יחידות חלבוניות ומולקולת

RNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

מה תפקיד חלקיק ה

SRP?

A

זיהוי הרצף המכווין ל
ER
והבאת החלבון לטרנסלוקון ע”י קישור לרצפטור שלו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

היכן מצוי

SRP receptor?

A

על ממברנת ה
ER
בסמוך לטרנסלוקון

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

מה מאפשר ל
SRP
לזהות מגוון רחב של רצפי הכוונה של חלבונים המיועדים ל
ER?

A

הימצאות מספר ח”א מתיונין, בעלות שייר הידרופובי וגמיש, בכיס ההידרופובי שלו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

כיצד
SRP
חוסם את תהליך התרגום?

A

הוא חוסם את אתר הקישור לפקטורי אלונגציה ע”ג הריבוזום

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

מה מאפשר את פתיחת הטרנסלוקון ומעבר החלבון המתורגם אל ה

ER?

A
הידרוליזת 
GTP
ע"ג
SRP
וע"ג הרצפטור שלו
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

מה מבנה הטרנסלוקון?

A
- ליבה:
sec61
המורכב מ3 תתי יחידות (אלפא, בטא, גמא)
- plug
(אלפא הליקס)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

מה ייחודי לתת יחידה אלפא של

sec61?

A

יש בה
inverted repeats
המקנה לה מבנה של פסאודו-סימטריה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

כיצד רצף ממברנאלי של חלבון מועבר לממברנה?

A

sec61

יודע להיפתח גם הצידה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

ישנם חלבונים המועברים ל
ER
לאחר תרגום מלא בציטוזול. אלו חלבונים משתתפים בתהליך באוקריוטים?

A
- התעלה:
sec62,63,71,72
- HSP70
של ה
ER:
Bip
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

ישנם חלבונים המועברים ל
ER
לאחר תרגום מלא בציטוזול. אלו חלבונים משתתפים בתהליך בחיידקים?

A
- SecA
שדוחף פנימה מהציטוזול תוך שימוש ב
ATP
- SecY
התעלה
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

קיימים 3 סוגים של חלבונים החוצים את הממברנה פעם אחת. מהו

type 1?

A
חלבון בעל
signal sequence
בקצה האמיני (שיחתך) ו
stop transfer
בהמשך. מתקבל קצה אמיני בתוך ה
ER וקצה קרבוקסילי בציטוזול.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

קיימים 3 סוגים של חלבונים החוצים את הממברנה פעם אחת. מהו

type 2?

A
חלבון בעל 
signal sequence
באמצע החלבון המשמש כ
start transfer. 
בעל ח"א חיוביות בסמוך לסיגנל, בצד של הקצה האמיני. מתקבל חלבון עם קצה אמיני ציטוזולי וקרבוקסילי בתוך ה
ER
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

קיימים 3 סוגים של חלבונים החוצים את הממברנה פעם אחת. מהו

type 3?

A
חלבון בעל 
signal sequence
באמצע החלבון המשמש כ
start transfer.
 בעל ח"א חיוביות בסמוך לסיגנל, בצד של הקצה הקרבוקסילי. מתקבל חלבון עם קצה אמיני ב
ER
 וקרבוקסילי ציטוזולי
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

מה יקבע את כמות הפעמים שחלבון
multi pass
יחצה את ממברנת ה
ER?

A

מספר רצפי ה
start
וה
stop

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

איזה רצף הידרופובי המצוי בחלבון
multi pass
קובע את האוריינטציה שלו בממברנה?

A

רק הראשון, בהתאם לח”א שסביבו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

אלו חלבונים משתתפים בתהליך עיגון חלבוני
tail anchored
לממברנת ה
ER?

A
  • Get1,2
  • Get3 ATPase
  • pre targeting complex
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

תאר/י את תהליך עיגון חלבוני
tail anchored
לממברנת ה
ER

A
1. pre targeting complex
מזהה רצף הידרופובי בקצה הקרבוקסילי של החלבון המתורגם ומביא אותו ל
Get3 ATPase
דימרי
- Get3 
מביא את החלבון ל
Get1-Get2
המעוגנים לממברנה
- הידרוליזת 
ATP
ע"י 
Get3
גורמת לשחרור
Get3 ופירוקו למונומרים
- Get1-Get2
מחדירים את הזנב הקרבוקסילי של החלבון לממברנה במנגנון שאינו ידוע
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

חלבוני
SNARE
הם דוגמה לחלבונים שהם

A

tail anchored

27
Q

על אילו חלבוני ימצא רצף

KDEL?

A

על חלבונים שהם דיירי קבע ב
ER
(למשל
PDI, Bip)

28
Q

על איזה שייר תתרחש גליקוזילציה מסוג

N?

A

אספרגין באוריינטציה של
NH2—-N-X-S/T—–COOH
(X
יכולה להיות כל ח”א מלבד פרולין(

29
Q

על איזה שייר תתרחש גליקוזילציה מסוג

O?

A

סרין או טריאונין

30
Q

מה מזרז האנזים אוליגו-סכריל טראנספראז?

A

העברת העץ הסוכרי מדוליקול לשייר אספרגין ב
N
גליקוזילציה

31
Q

היכן מצוי האנזים אוליגו-סכריל טראנספראז?

A

בתוך ה
ER
בסמוך לקומפלקס הטרנסלוקון

32
Q

מאלו סוכרים בנוי האוליגוסכריד המוסף ב
N
גליקוזילציה?

A

(Glc)3(Man)9(GlcNac)2

33
Q

אלו נוקלאוטידים מאקטבים את הסוכרים הבונים את האוליגוסכריד המוסף ב
N
גליקוזילציה?

A
  • UDP
    מאקטב גלוקוז וגלקטוז
  • GDP
    מאקטב מאנוז
34
Q

היכן מתרחש תהליך בניית העץ הסוכרי המתווסף בגליקוזילציה מסוג

N?

A

מתחיל בציטוזול ולאחר בניית 7 סוכרים העץ מתהפך והתהליך ממשיך בלומן של ה
ER

35
Q

קלנקסין וקלרטיקולין שייכים למשפחת ה-

מי ממברנאלי ומי מסיס?

A
  • הלקטינין

- קלנקסין ממברנאלי וקלרטיקולין מסיס

36
Q
האוליגוסכריד שמוסף על חלבונים בתהליך ה
N
גליקוזילציה עובר 
trimming
בכניסה ל
ER.
אלו סוכרים יוסר ומי אחראי על כך?
A

בין 2 ל3 גלוקוזים, תלוי במצב קיפול החלבון.

גליקוזידאז מבצע את ההסרה

37
Q

תאר/י את תהליך בקרת קיפול חלבוני ה
ER
ומתבצע ע”י קלנקסין/קלרטיקולין

A
  • חלבון שלא קופל נכון בעל גלוקוז בודד נקשר על ידם
  • גלוקוזידאז מסיר את הגלוקוז השלישי
  • אם קופל נכון החלבון ייצא מה
    ER
  • אם לא קופל נכון, גליקוזיל טראנספראז מוסיף גלוקוז וכן הלאה
38
Q

מה תפקיד הצ’פרון

ERp57?

A

נקשר לקבוצות סולפדריל חופשיות במטרה לעכב חלבונים שלא קופלו כראוי ב
ER
(מסייע לפעילות קלנקסין וקלרטיקולין)

39
Q

איזו מולקולה דרושה לקלנקסין וקלרטיקולין?

A

סידן

40
Q

מהו הטריגר לסימון חלבון שלא קופל כראוי ב
ER
לפירוק?

A

הסרת מנוז מסוים של האוליגוסכריד ע”י מנוזידאז

41
Q

תאר/י את תהליך ייצוא חלבונים שלא קופלו כראוי מה
ER
(6)

A
  • מנוזידאז מסיר מנוז ספציפי
  • לקטינים, צ’פרונים ו
    disulfid isomerases
    נקשרים לחלבון ומביאים אותה לטרנסלוקייטור
  • E3
    המצוי בטרנסלוקייטור מוסוף פולייוביקוויטין
  • AAA ATPase
    מושך אותו מבחוץ תוך פעולת הליקאז ופתיחה שלו
    -N glycanase
    מסיר את האוליגוסכרידים
  • פירוק בפרוטאוזום
42
Q

מה עושה האנזים

N glycanase?

A
מסיר את ה
N
גליקוזילציות מחלבונים שהוצאו מה
ER
בשל קיפול שגוי
43
Q
היכן מצוי
E3
המשתתף בסימון חלבונים שלא קופלו נכון ב
ER
לפירוק?
A

מצוי כחלק מהטרנסלוקייטור המוציא אותם החוצה

44
Q

מה מטרת הפעלת ה

unfolded protein response?

A

הגברת שעתוק גנים הקשורים לקיפול תקין של חלבונים/פירוק חלבונים שלא קופלו כראוי.

45
Q

מהם שלושת המסלולים המופעלים ב

unfolded protein response?

A
  1. IRE1
  2. PERK
  3. ATF6
46
Q

תאר/י את מסלול
IRE1
(4)

A
- שפעול קינאז טראנסממברנאלי 
IRE1
ע"י הצטברות חלבונים שלא קופלו נכון
- דמירזציה ופספור עצמי
- ribonuclease domain
מופעל ומתווך
alternative splicing
של מרנ"א ציטוזולי מסוים
- מהמרנ"א נוצר חלבון רגולטורי הנכנס לגרעין ומשמש כפקטור שעתוק לגנים רלוונטים
47
Q

תאר/י את מסלול
PERK
(2)

A
- הפעלת
PERK
ע"י הצטברות חלבונים לא מקופלים
- זרחון 
translational initiation factor
 כך שחלבונים נוספים לא יווצרו/ חלבונים רלוונטים לתגובה כן יווצרו
48
Q

תאר/י את מסלול
ATF6
(3)

A
  • הצטברות חלבונים שלו קופלו נכון גורם להעברת
    ATF6
    טראנסממברנאלי לגולג’י
  • פרוטאזות בגולג’י מבקעות אותו
  • הדומיין הציטוזולי נכנס לגרעין ומשמש כפקטור שעתוק לחלבונים רלוונטיים
49
Q

היכן ימצאו חלבונים המעוגנים דרך

GPI?

A

על הממברנה הפלסמטית כאשר הם פונים כלפי חוץ התא

50
Q

איזה סיגנל מכילים חלבונים המעוגנים דרך
GPI
לממברנה הפלסמטית ומדוע?

A
מאחר והם עוברים 
co-translational translocation
ב
ER
הם מכילים רצף סיגנל המכווינים אליו אשר ייחתך בסוף העיגון
51
Q

מה ייחודי בקצה הקרבוקסילי של חלבוני

GPI?

A

יש בו רצף הידרופובי המשמש כ
stop transfer
ועתיד להיחתך בסוף העיגון

52
Q

כיצד חלבון
GPI
עובר לשלד הפוספוליפידי בעת העיגון?

A

ע”י התקפה נוקלאופילית של הקצה האמיני ש הפוספוליפיד על הקרבניל הצמוד לרצף ההידרופובי בקצה הקרבוקסילי של החלבון

53
Q

אלו חלבונים מצויים בשכיחות גבוהה ב

lipid rafts?

A

חלבוני

GPI anchored

54
Q

היכן ב
ER
מיוצרים פוספוליפידים?

A

בעלעל הציטוזולי של ממברנת ה

ER

55
Q

כיצד משופעלות ח”ש המיועדות לייצור פוספוליפידים ב

ER?

A

ע”י צימוד ל
CoA
(ATP–>AMP)

56
Q

מה מקור ראש הכולין של פוספופוליפידים בהם הוא מצוי?

A

CDP-cholin

57
Q

מה מקור שלד הגליצרול של פוספוליפידים?

A

glycerol 3 phosphate

58
Q

מה מקור הפוספאט של פוספוליפידים?

A

מה
CDP-cholin
(לא מהגליצרול!!)

59
Q

איזה
lipid translocator
פעיל ב
ER?

A

סקראמבלאז

60
Q

איזה
lipid translocators
פעילים בממברנה?

A

פליפאז ופלופאז

סקראמבלאז מצוי אך לא פעיל

61
Q

היכן מתרחשת ביוסינתזה של צרמייד?

A

sER

62
Q

ממה נוצר צרמייד?

A

מספינגוזין וח”ש שנדחסו יחד

63
Q

ממה נוצר ספינגוזין?

A

ח”א סרין וח”ש פלמטואיל שנדחסו יחד