(ביותא ב) ER Flashcards
איזה אחוז מכלל הממברנות בתא מהווה ממברנת ה
ER?
כ-50%
איזה אחוז מנפח התא מהווה הלומן של ה
ER?
כ-10%
היכן בתא ניתן למצוא ריבוזומים המצויים ע”ג ממברנה?
rER
ובממברנה החיצונית של הגרעין
היכן ניתן למצוא מאגרי סידן בתא?
במיטוכונדריה וב
ER
לאחר הומוגינציה של התא אלו פרקציות של ה
ER
נמצא?
- מיקרוזומים של
sER - מיקרוזומים כבדים יותר של
rER
מהו ה
sugnal sequence
המכווין חלבונים אל ה
ER?
רצף של כ20 ח”א, מתוכן לפחות 8 הידרופוביות, בקצה האמיני
היכן מצוי
signal peptidase
של ה
ER?
בסמוך לטרנסלוקון
מה המבנה של
SRP?
בנוי מ6 תת יחידות חלבוניות ומולקולת
RNA
מה תפקיד חלקיק ה
SRP?
זיהוי הרצף המכווין ל
ER
והבאת החלבון לטרנסלוקון ע”י קישור לרצפטור שלו
היכן מצוי
SRP receptor?
על ממברנת ה
ER
בסמוך לטרנסלוקון
מה מאפשר ל
SRP
לזהות מגוון רחב של רצפי הכוונה של חלבונים המיועדים ל
ER?
הימצאות מספר ח”א מתיונין, בעלות שייר הידרופובי וגמיש, בכיס ההידרופובי שלו
כיצד
SRP
חוסם את תהליך התרגום?
הוא חוסם את אתר הקישור לפקטורי אלונגציה ע”ג הריבוזום
מה מאפשר את פתיחת הטרנסלוקון ומעבר החלבון המתורגם אל ה
ER?
הידרוליזת GTP ע"ג SRP וע"ג הרצפטור שלו
מה מבנה הטרנסלוקון?
- ליבה: sec61 המורכב מ3 תתי יחידות (אלפא, בטא, גמא) - plug (אלפא הליקס)
מה ייחודי לתת יחידה אלפא של
sec61?
יש בה
inverted repeats
המקנה לה מבנה של פסאודו-סימטריה
כיצד רצף ממברנאלי של חלבון מועבר לממברנה?
sec61
יודע להיפתח גם הצידה
ישנם חלבונים המועברים ל
ER
לאחר תרגום מלא בציטוזול. אלו חלבונים משתתפים בתהליך באוקריוטים?
- התעלה: sec62,63,71,72 - HSP70 של ה ER: Bip
ישנם חלבונים המועברים ל
ER
לאחר תרגום מלא בציטוזול. אלו חלבונים משתתפים בתהליך בחיידקים?
- SecA שדוחף פנימה מהציטוזול תוך שימוש ב ATP - SecY התעלה
קיימים 3 סוגים של חלבונים החוצים את הממברנה פעם אחת. מהו
type 1?
חלבון בעל signal sequence בקצה האמיני (שיחתך) ו stop transfer בהמשך. מתקבל קצה אמיני בתוך ה ER וקצה קרבוקסילי בציטוזול.
קיימים 3 סוגים של חלבונים החוצים את הממברנה פעם אחת. מהו
type 2?
חלבון בעל signal sequence באמצע החלבון המשמש כ start transfer. בעל ח"א חיוביות בסמוך לסיגנל, בצד של הקצה האמיני. מתקבל חלבון עם קצה אמיני ציטוזולי וקרבוקסילי בתוך ה ER
קיימים 3 סוגים של חלבונים החוצים את הממברנה פעם אחת. מהו
type 3?
חלבון בעל signal sequence באמצע החלבון המשמש כ start transfer. בעל ח"א חיוביות בסמוך לסיגנל, בצד של הקצה הקרבוקסילי. מתקבל חלבון עם קצה אמיני ב ER וקרבוקסילי ציטוזולי
מה יקבע את כמות הפעמים שחלבון
multi pass
יחצה את ממברנת ה
ER?
מספר רצפי ה
start
וה
stop
איזה רצף הידרופובי המצוי בחלבון
multi pass
קובע את האוריינטציה שלו בממברנה?
רק הראשון, בהתאם לח”א שסביבו
אלו חלבונים משתתפים בתהליך עיגון חלבוני
tail anchored
לממברנת ה
ER?
- Get1,2
- Get3 ATPase
- pre targeting complex
תאר/י את תהליך עיגון חלבוני
tail anchored
לממברנת ה
ER
1. pre targeting complex מזהה רצף הידרופובי בקצה הקרבוקסילי של החלבון המתורגם ומביא אותו ל Get3 ATPase דימרי - Get3 מביא את החלבון ל Get1-Get2 המעוגנים לממברנה - הידרוליזת ATP ע"י Get3 גורמת לשחרור Get3 ופירוקו למונומרים - Get1-Get2 מחדירים את הזנב הקרבוקסילי של החלבון לממברנה במנגנון שאינו ידוע