(ביותא ב) ER Flashcards

1
Q

איזה אחוז מכלל הממברנות בתא מהווה ממברנת ה

ER?

A

כ-50%

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

איזה אחוז מנפח התא מהווה הלומן של ה

ER?

A

כ-10%

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

היכן בתא ניתן למצוא ריבוזומים המצויים ע”ג ממברנה?

A

rER

ובממברנה החיצונית של הגרעין

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

היכן ניתן למצוא מאגרי סידן בתא?

A

במיטוכונדריה וב

ER

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

לאחר הומוגינציה של התא אלו פרקציות של ה
ER
נמצא?

A
  • מיקרוזומים של
    sER
  • מיקרוזומים כבדים יותר של
    rER
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

מהו ה
sugnal sequence
המכווין חלבונים אל ה
ER?

A

רצף של כ20 ח”א, מתוכן לפחות 8 הידרופוביות, בקצה האמיני

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

היכן מצוי
signal peptidase
של ה
ER?

A

בסמוך לטרנסלוקון

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

מה המבנה של

SRP?

A

בנוי מ6 תת יחידות חלבוניות ומולקולת

RNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

מה תפקיד חלקיק ה

SRP?

A

זיהוי הרצף המכווין ל
ER
והבאת החלבון לטרנסלוקון ע”י קישור לרצפטור שלו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

היכן מצוי

SRP receptor?

A

על ממברנת ה
ER
בסמוך לטרנסלוקון

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

מה מאפשר ל
SRP
לזהות מגוון רחב של רצפי הכוונה של חלבונים המיועדים ל
ER?

A

הימצאות מספר ח”א מתיונין, בעלות שייר הידרופובי וגמיש, בכיס ההידרופובי שלו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

כיצד
SRP
חוסם את תהליך התרגום?

A

הוא חוסם את אתר הקישור לפקטורי אלונגציה ע”ג הריבוזום

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

מה מאפשר את פתיחת הטרנסלוקון ומעבר החלבון המתורגם אל ה

ER?

A
הידרוליזת 
GTP
ע"ג
SRP
וע"ג הרצפטור שלו
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

מה מבנה הטרנסלוקון?

A
- ליבה:
sec61
המורכב מ3 תתי יחידות (אלפא, בטא, גמא)
- plug
(אלפא הליקס)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

מה ייחודי לתת יחידה אלפא של

sec61?

A

יש בה
inverted repeats
המקנה לה מבנה של פסאודו-סימטריה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

כיצד רצף ממברנאלי של חלבון מועבר לממברנה?

A

sec61

יודע להיפתח גם הצידה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

ישנם חלבונים המועברים ל
ER
לאחר תרגום מלא בציטוזול. אלו חלבונים משתתפים בתהליך באוקריוטים?

A
- התעלה:
sec62,63,71,72
- HSP70
של ה
ER:
Bip
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

ישנם חלבונים המועברים ל
ER
לאחר תרגום מלא בציטוזול. אלו חלבונים משתתפים בתהליך בחיידקים?

A
- SecA
שדוחף פנימה מהציטוזול תוך שימוש ב
ATP
- SecY
התעלה
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

קיימים 3 סוגים של חלבונים החוצים את הממברנה פעם אחת. מהו

type 1?

A
חלבון בעל
signal sequence
בקצה האמיני (שיחתך) ו
stop transfer
בהמשך. מתקבל קצה אמיני בתוך ה
ER וקצה קרבוקסילי בציטוזול.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

קיימים 3 סוגים של חלבונים החוצים את הממברנה פעם אחת. מהו

type 2?

A
חלבון בעל 
signal sequence
באמצע החלבון המשמש כ
start transfer. 
בעל ח"א חיוביות בסמוך לסיגנל, בצד של הקצה האמיני. מתקבל חלבון עם קצה אמיני ציטוזולי וקרבוקסילי בתוך ה
ER
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

קיימים 3 סוגים של חלבונים החוצים את הממברנה פעם אחת. מהו

type 3?

A
חלבון בעל 
signal sequence
באמצע החלבון המשמש כ
start transfer.
 בעל ח"א חיוביות בסמוך לסיגנל, בצד של הקצה הקרבוקסילי. מתקבל חלבון עם קצה אמיני ב
ER
 וקרבוקסילי ציטוזולי
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

מה יקבע את כמות הפעמים שחלבון
multi pass
יחצה את ממברנת ה
ER?

A

מספר רצפי ה
start
וה
stop

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

איזה רצף הידרופובי המצוי בחלבון
multi pass
קובע את האוריינטציה שלו בממברנה?

A

רק הראשון, בהתאם לח”א שסביבו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

אלו חלבונים משתתפים בתהליך עיגון חלבוני
tail anchored
לממברנת ה
ER?

A
  • Get1,2
  • Get3 ATPase
  • pre targeting complex
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
תאר/י את תהליך עיגון חלבוני tail anchored לממברנת ה ER
``` 1. pre targeting complex מזהה רצף הידרופובי בקצה הקרבוקסילי של החלבון המתורגם ומביא אותו ל Get3 ATPase דימרי - Get3 מביא את החלבון ל Get1-Get2 המעוגנים לממברנה - הידרוליזת ATP ע"י Get3 גורמת לשחרור Get3 ופירוקו למונומרים - Get1-Get2 מחדירים את הזנב הקרבוקסילי של החלבון לממברנה במנגנון שאינו ידוע ```
26
חלבוני SNARE הם דוגמה לחלבונים שהם
tail anchored
27
על אילו חלבוני ימצא רצף | KDEL?
על חלבונים שהם דיירי קבע ב ER (למשל PDI, Bip)
28
על איזה שייר תתרחש גליקוזילציה מסוג | N?
אספרגין באוריינטציה של NH2----N-X-S/T-----COOH (X יכולה להיות כל ח"א מלבד פרולין(
29
על איזה שייר תתרחש גליקוזילציה מסוג | O?
סרין או טריאונין
30
מה מזרז האנזים אוליגו-סכריל טראנספראז?
העברת העץ הסוכרי מדוליקול לשייר אספרגין ב N גליקוזילציה
31
היכן מצוי האנזים אוליגו-סכריל טראנספראז?
בתוך ה ER בסמוך לקומפלקס הטרנסלוקון
32
מאלו סוכרים בנוי האוליגוסכריד המוסף ב N גליקוזילציה?
(Glc)3(Man)9(GlcNac)2
33
אלו נוקלאוטידים מאקטבים את הסוכרים הבונים את האוליגוסכריד המוסף ב N גליקוזילציה?
- UDP מאקטב גלוקוז וגלקטוז - GDP מאקטב מאנוז
34
היכן מתרחש תהליך בניית העץ הסוכרי המתווסף בגליקוזילציה מסוג | N?
מתחיל בציטוזול ולאחר בניית 7 סוכרים העץ מתהפך והתהליך ממשיך בלומן של ה ER
35
קלנקסין וקלרטיקולין שייכים למשפחת ה- מי ממברנאלי ומי מסיס?
- הלקטינין | - קלנקסין ממברנאלי וקלרטיקולין מסיס
36
``` האוליגוסכריד שמוסף על חלבונים בתהליך ה N גליקוזילציה עובר trimming בכניסה ל ER. אלו סוכרים יוסר ומי אחראי על כך? ```
בין 2 ל3 גלוקוזים, תלוי במצב קיפול החלבון. גליקוזידאז מבצע את ההסרה
37
תאר/י את תהליך בקרת קיפול חלבוני ה ER ומתבצע ע"י קלנקסין/קלרטיקולין
- חלבון שלא קופל נכון בעל גלוקוז בודד נקשר על ידם - גלוקוזידאז מסיר את הגלוקוז השלישי - אם קופל נכון החלבון ייצא מה ER - אם לא קופל נכון, גליקוזיל טראנספראז מוסיף גלוקוז וכן הלאה
38
מה תפקיד הצ'פרון | ERp57?
נקשר לקבוצות סולפדריל חופשיות במטרה לעכב חלבונים שלא קופלו כראוי ב ER (מסייע לפעילות קלנקסין וקלרטיקולין)
39
איזו מולקולה דרושה לקלנקסין וקלרטיקולין?
סידן
40
מהו הטריגר לסימון חלבון שלא קופל כראוי ב ER לפירוק?
הסרת מנוז מסוים של האוליגוסכריד ע"י מנוזידאז
41
תאר/י את תהליך ייצוא חלבונים שלא קופלו כראוי מה ER (6)
- מנוזידאז מסיר מנוז ספציפי - לקטינים, צ'פרונים ו disulfid isomerases נקשרים לחלבון ומביאים אותה לטרנסלוקייטור - E3 המצוי בטרנסלוקייטור מוסוף פולייוביקוויטין - AAA ATPase מושך אותו מבחוץ תוך פעולת הליקאז ופתיחה שלו -N glycanase מסיר את האוליגוסכרידים - פירוק בפרוטאוזום
42
מה עושה האנזים | N glycanase?
``` מסיר את ה N גליקוזילציות מחלבונים שהוצאו מה ER בשל קיפול שגוי ```
43
``` היכן מצוי E3 המשתתף בסימון חלבונים שלא קופלו נכון ב ER לפירוק? ```
מצוי כחלק מהטרנסלוקייטור המוציא אותם החוצה
44
מה מטרת הפעלת ה | unfolded protein response?
הגברת שעתוק גנים הקשורים לקיפול תקין של חלבונים/פירוק חלבונים שלא קופלו כראוי.
45
מהם שלושת המסלולים המופעלים ב | unfolded protein response?
1. IRE1 2. PERK 3. ATF6
46
תאר/י את מסלול IRE1 (4)
``` - שפעול קינאז טראנסממברנאלי IRE1 ע"י הצטברות חלבונים שלא קופלו נכון - דמירזציה ופספור עצמי - ribonuclease domain מופעל ומתווך alternative splicing של מרנ"א ציטוזולי מסוים - מהמרנ"א נוצר חלבון רגולטורי הנכנס לגרעין ומשמש כפקטור שעתוק לגנים רלוונטים ```
47
תאר/י את מסלול PERK (2)
``` - הפעלת PERK ע"י הצטברות חלבונים לא מקופלים - זרחון translational initiation factor כך שחלבונים נוספים לא יווצרו/ חלבונים רלוונטים לתגובה כן יווצרו ```
48
תאר/י את מסלול ATF6 (3)
- הצטברות חלבונים שלו קופלו נכון גורם להעברת ATF6 טראנסממברנאלי לגולג'י - פרוטאזות בגולג'י מבקעות אותו - הדומיין הציטוזולי נכנס לגרעין ומשמש כפקטור שעתוק לחלבונים רלוונטיים
49
היכן ימצאו חלבונים המעוגנים דרך | GPI?
על הממברנה הפלסמטית כאשר הם פונים כלפי חוץ התא
50
איזה סיגנל מכילים חלבונים המעוגנים דרך GPI לממברנה הפלסמטית ומדוע?
``` מאחר והם עוברים co-translational translocation ב ER הם מכילים רצף סיגנל המכווינים אליו אשר ייחתך בסוף העיגון ```
51
מה ייחודי בקצה הקרבוקסילי של חלבוני | GPI?
יש בו רצף הידרופובי המשמש כ stop transfer ועתיד להיחתך בסוף העיגון
52
כיצד חלבון GPI עובר לשלד הפוספוליפידי בעת העיגון?
ע"י התקפה נוקלאופילית של הקצה האמיני ש הפוספוליפיד על הקרבניל הצמוד לרצף ההידרופובי בקצה הקרבוקסילי של החלבון
53
אלו חלבונים מצויים בשכיחות גבוהה ב | lipid rafts?
חלבוני | GPI anchored
54
היכן ב ER מיוצרים פוספוליפידים?
בעלעל הציטוזולי של ממברנת ה | ER
55
כיצד משופעלות ח"ש המיועדות לייצור פוספוליפידים ב | ER?
ע"י צימוד ל CoA (ATP-->AMP)
56
מה מקור ראש הכולין של פוספופוליפידים בהם הוא מצוי?
CDP-cholin
57
מה מקור שלד הגליצרול של פוספוליפידים?
glycerol 3 phosphate
58
מה מקור הפוספאט של פוספוליפידים?
מה CDP-cholin (לא מהגליצרול!!)
59
איזה lipid translocator פעיל ב ER?
סקראמבלאז
60
איזה lipid translocators פעילים בממברנה?
פליפאז ופלופאז | סקראמבלאז מצוי אך לא פעיל
61
היכן מתרחשת ביוסינתזה של צרמייד?
sER
62
ממה נוצר צרמייד?
מספינגוזין וח"ש שנדחסו יחד
63
ממה נוצר ספינגוזין?
ח"א סרין וח"ש פלמטואיל שנדחסו יחד