הובלת חלבונים בתא (ביותא ב) Flashcards
אילו חלבונים חיוניים להנצת וזיקולת קלתרין?
7
- רצפטורים קושרי מטען
- חלבוני אדפטור
(AP) - קלתרין
- membrane bending protein
- dynamine
- PIP phoshatase
- HSP70 + auxilin
איזה דומיין מכילים
membrane bending proteins
ולמה הם משמשים?
- BAR domain
- עוזרים בעיצוב מבנה הווזיקולה (גם את אזור הצוואר)
מה המבנה של קלתרין?
הקסמר הבנוי מ3 יחידות כבדות ו3 קלות היוצרים יחד מבנה של טריסקליון
לאיזה מרכיב של שלד התא מתחברות השרשראות הקלות של קלתרין?
שלד האקטין
AP2
הוא חלבון מתאם נפוץ בווזיקולות של קלתרין. מה מבנהו ומה קושרת כל אחת מתתי היחידות?
מורכב מ4 תתי יחדות, 2 קטנות (סיגמא 2 ומיו2) ו2 גדולות (אלפא ובטא 2)
- הקטנות קושרות את ה
cargo receptor
והגדולות קושרות את הפוספואינוזיטיד
כמה פוספואינוזיטידים קושר חלבון האדפטור
AP2?
4
מה מגביר את תהליך הנצת הווזיקולה?
2
- קישור עוד חלבוני אדפטור
(AP2) לפוספואינוזיטידים שלהם - קישור של חלבוני המעטפת קלתרין
היכן בתא מיוצרים פוספואינוזיטידים?
ER
ממה מורכב פוספואינוזיטיד?
גליצרול, 2 ח”ש, פוספאט והסוכר אינוזיטול
על אלו פחמנים האינוזיטול המצוי בפוספואינוזיטידים יכול להיות מזורחן?
3,4,5
מה המבנה של חלבונים בעלי
BAR domain?
דימרים המתארגנים במבנה של
coiled coil
איזה חלבון מבצע את ה
pinching off
של ווזיקולת הקלתרין מהממברנה?
דינאמין וחלבונים נוספים אותם הוא מגייס
אלו שני דומיינים מצויים בחלבון דינאמין?
- דומיין קושר
PI(4,5)P2 - GTPase domain
כיצד מוסר ציפוי הקלתרין מהווזיקולה לאחר סיום ההנצה?
2
1. PIP phosphatase מדלל את כמות ה PI(4,5)P ממברנת הווזיקולה וגורם לניתוק חלבוני המתאם ממנה 2. HSP70 משתמש בהידרוליזת ATP ע"מ לחזק את הקשר בין קלתרין לאדפטורים כך שהם מוסרים יחד
מי נחשב כמשפעל HSP70 בתהליך ה uncoating ATPase של ווזיקולות הקלתרין?
אוקסילין
ווזיקולות המועברות מה
ER
אל הוגולג’י תהיינה עטופות ב-
COPII
אלו חלבונים משתתפים במערכת הציפוי של
COPII?
sar1, sec23, sec24, sec13, sec31
וקינאז
מה קורה ל sar1 לאחר שה GEF שלו מצמיד לו GTP?
הוא חושף אלפא הליקס אמפיפילי שנכנס לעלעל הציטוזולי של ה
ER
ומגייס את החלבונים נוספים
היכן מצוי
sar1-GEF?
בממברנת ה
ER
(חלבוון טראנסממברנאלי)
איזה חלבון נקשר ל
cargo receptor
בוזיקולות
COPII?
sec24
מתי משתחרר
sar1
מהוזיקולה המונצת?
בסמוך להנצה ע”י הידרוליזת
GTP
(כנראה במנגנון של טיימר)
מתי מושל ציפוי
COPII
מהוזיקולה ומי אחראי לכך?
בסמוך לאתר המטרה. יש קינאז המזרחן את חלבוני הציפוי וגורם לשחרורם
מתי מושל ציפוי
COPI
ומי אחראי על כך?
בסמוך להנצת הוזיקולה.
אינאקטיבציה של
ARF
גורר את פירוק הציפוי
ווזיקולות המניצות מהגולג’י ל
ER
תהיינה מצופות ב
COPI
יצירת ווזיקולות עם מבנה מוארך דורש השתתפות של
packaging proteins.
על מה הם אחראים?
הם אחראים על שינוי מבנה הוזיקולה בנוצרת
(למשל מונויוביקוויטין על
sec31
גורם לשינוי במבנהו)
מה תפקידם של חלבוני
Rab?
הכוונת וזיקולות לממברנת המטרה הספציפית שלהן
לאיזו משפחת חלבונים משוייכים חלבוני
Rab?
משפחת חלבוני
Ras
(G monomers)
על מה אחראים חלבוני
GDI?
עיכוב חלבוני
Rab
והבטחת הישארותם כמסיסים בציטוזול בזמן זה
היכן מצוי
Rab1?
גולג’י ו
ER
היכן מצוי
Rab2?
בציס גולג’י
היכן מצוי
Rab3A?
וזיקולות סינפטיות ווזיקולות הפרשה
היכן מצוי
Rab4/Rab11?
recyclinc enodosome
היכן מצוי
Rab5?
אנדוזום מוקדם, ממברנה פלזמטית ווזיקולות מצופות קלטרין
היכן מצוי
Rab6?
גולג’י מדיאלי ובטראנס גולג’י
היכן מצוי
Rab7?
אנדוזום מאחר
היכן מצוי
Rab8?
סיליה
היכן מצוי
Rab9?
אנדוזום מאוחר ובטראנס גולג’י
מה קורה ל
Rab
לאחר שלוף ל
GTP?
חושף אלפא הליקס אמפיפאטי שננעץ בעלעל הציטוזולי של הממברנה
כיצד חלבוני
Rab
מקרבים בין הוזיקולה לממברנת המטרה?
ע”י שימוש ב
rab effectors
היכולים לקרב ע”י משיכה (חכה) או ע”י שימוש כחלבוני מנוע
כיצד
Rabs
משתנים ע”מ לקבוע את הזהות הממברנאלית?
RabA מגייס, בין היתר את Rab-GEF. מעל רמה מסוימת RabB מגייס RabA-GAP שישתיק אותו
אילו חלבונים אחראים על זירוז פעולת האיחוי בין ממברנות?
SNARE
מה מקור האנרגיה לתהליך הזירוז של איחוי הממברנה המתבצע ע”י חלבוני ה
SNARE?
האנרגיה המשתחררת מהיכרכות החלבונים זה ע”ג זה
מה תפקיד הפקטור
NSF?
להפריד את חלבוני ה
SNARE
לאחר סיום האיחוי תוך שימוש ב
ATP
לאיזו משפחה משתייך
NSF?
AAA-ATPase