המרכיב החלבוני בממברנה הפלסמטית (ביותא א)

Question 1

אלו סוגי חלבוני ממברנה קיימים?

3

Answer 1

• אינטגרלים
• פריפריאלים
• מעוגנים

Question 2

כיצד חלבונים פריפריאלים מצומדים לממברנה?

Answer 2

דרך אינטראקציות חלבון-חלבון עם חלבון אינטגרלי אחר

Question 3

אלו שינויים בתנאים הסביבתיים יגרמו לניתוק חלבון פריפריאלי?

2

Answer 3

• שינוי ריכוז מלחים
• שינוי ב
  pH

Question 4

חלבונים שהם
GPI-anchored
ימצאו רק בעלעל ה______ של הממברנה

Answer 4

חוץ תאי

Question 5

אלו קשרים יכולים להיווצר בין חלבון לליפיד שמעגן אותו לממברנה?
(3)

Answer 5

• קשר אמידי (דרך קצה אמיני)
• קשר תיואסטרי (דרך ציסטאין)
• קשר תיואטרי (דרך ציסטאין
  C-S-C)

Question 6

איזו חומצת שומן תיצור קשר אמידי עם החלבון אותה היא מעגנת?

Answer 6

מיריסטיול

Question 7

איזו חומצת שומן תיצור קשר תיואסטרי עם החלבון אותה היא מעגנת?

Answer 7

פלמטית

Question 8

איזו חומצת שומן תיצור קשר תיואטרי עם החלבון אותה היא מעגנת?

Answer 8

פרנזיל

Question 9

כיצד מעוגנים משפחת חלבוני
SRC
לממברנה?

Answer 9

• עיגון דרך קשר אמידי עם ח”ש מריסטיול

- עיגון דרך קשר תיואסטרי עם ח”ש פלמטית במתן סיגנל מתאים

Question 10

איזו פעילות יש לחלבוני

SRC?

Answer 10

טירוזין קינאז

Question 11

כיצד חלבוני
RAS
מעוגנים לממברנה?

Answer 11

דרך קבוצת פרניל וחומצה פלמטית

Question 12

מהו אורך הסגמנט חוצה הממברנה האלפא הליקאלי?

Answer 12

20-30

חומצות אמינו

Question 13

מהו אורך סגמנט חוצה ממברנה בקונפורמציה חבית בטא?

Answer 13

כ-10

Question 14

מה מתאר גרף הידרופאתיות?

Answer 14

אזורים אלפא הליקאלים החוצים ממברנה בחלבון

חיובי=הידרופובי

Question 15

מה תפקיד החלבון
FepA
וכיצד הוא פועל?
(באי-קולי)

Answer 15

תפקידו להעביר ברזל בין צידי הממברנה. זהו חלבון בצורת חבית בטא עם חלק גלובוראלי בתוכו האמון על העברת הברזל

Question 16

היכן בתא חלבונים עוברים גליקוזילציה?

Answer 16

ER
ו/או
גולג’י

Question 17

לאיזה צד של התא יפנו השיירים הסוכריים בגליקופרוטאינים?

Answer 17

אל חוץ התא

Question 18

היכן נמצא קשרים דיסולפידים בגליקופרוטאינים?

Answer 18

בצד החוץ תאי

Question 19

כיצד קרויה המעטפת הסוכרית של התא?

Answer 19

glycocalyx

Question 20

אוקטיגלוקוזיד וטריטון הם דוגמאות ל-

Answer 20

דטרגנטים לא יונים

Question 21

מהו ערך

CMC?

Answer 21

critical micelle concentration.

הריכוז ממנו המונומרים של הדטרגנט מתחילים להסתדר במיצלות

Question 22

מאלו תנאים סביבתיים מושפע ה
CMC?
(3)

Answer 22

• טמפרטורה
• pH
• ריכוז מלחים

Question 23

כיצד דטרגנט יוני מאפשר טיהור חלבונים מהתמיסה?

Answer 23

הוא נקשר לחלקים ההידרופוביים של החלבונים הממברנאלים ויוצר עימם מיצלות המאפשרות בידוק יעיל וקל

Question 24

מה החיסרון בשימוש בדטרגנטים יונים?

Answer 24

הרס המבנה המרחבי של החלבון

Question 25

SDS | הוא סוג של-

Answer 25

דטרגנט יוני

Question 26

כיצד פועלים דטרגנטים לא יונים? | בריכוז גבוה ובריכוז נמוך

Answer 26

- בריכוז גבוה הם מצליחים לבודד חלבונים | - בריכוז נמוך הם גורמים להיווצרות ליפוזומים ע"י הפוספוליפידים והחלבונים

Question 27

מה היתרון בשימוש בדטרגנט לא יוני?

Answer 27

יש שמירה על המבנה הנטיבי של החלבון

Question 28

מה החסרון בשימוש בדטרגנט לא יוני?

Answer 28

הליפוזומים הנוצרות אינם מאפשרים גישה לשני צידי החלבון לשם חקר פעילותו

Question 29

מהם ננודיסקים?

Answer 29

פאצ' קטן של ממברנה המוקף בחגורה של | HDLs

Question 30

מתי משתמשים בננודיסקים?

Answer 30

כאשר רוצים ללמוד על פעילות של חלבון משני צידיו | מכניסין אותו לפאצ' עם דטרגנט לא יוני בריכוז נמוך

Question 31

למי שייך חלבון בקטריורודופסין?

Answer 31

ארכיאה

Question 32

מה מבנה החלבון בקטריורודופסין? | 2

Answer 32

- בנוי מ7 אלפא הליקסים טראנסממברנאליים היוצרים אינטראקציות ביניהם. - במרכז יש מולקולת רטינאל הקשורה קוולנטית לליזין.

Question 33

כיצד פועל החלבון בקטרירודופסין?

Answer 33

בקליטת פוטון, מולקולת הרטינאל משתנה מציס לטראנס וגורמת לשאיבת פרוטונים החוצה מהארכיאה, ליצירת גרדיאנט אלקטרוכימי, שחלבונים אחרים ישתמשו בו.

Question 34

למה משמש (בין היתר) הגרדיאנט האלקטרוכימי שנוצר ע"י פעילות בקטריורודופסין?

Answer 34

להזזת הפלג'לה של הארכיאה בתנועה סיבובית והתקדמותו אל עבר מקור האור

Question 35

מה מאפשרת שיטת | FRAP?

Answer 35

מאפשרת למדוד את קצב הדיפוזיה הלטראלית של חלבונים ממברנאלים | סימון פלורוסנטי ואז פוטובליצ'ינג

Question 36

מהו הערך partition coeficient וכיצד ניתן למצוא אותו?

Answer 36

- קבוע הדיפוזיה הלטראלית של חלבונים ממברנאלים - ניתן למצוא אותו ע"י שימוש בשיטת FRAP

Question 37

מה חסרונות שיטת FRAP? (2)

Answer 37

1. אין אפשרות לעקוב אחרי חלבונים בודדים אלא רק קבוצות 2. אם אין recovery לא ניתן לקבוע אם החלבון חסר מוביליות או לחלופין ממודר לאזור ממברנאלי קטן

Question 38

מהי שיטת single particle tracking ומה יתרונה?

Answer 38

- חיבור נוגדן מסומן לחלבון ומעקב אחריו | - מאפשר מעקב אחר חלבון בודד

Question 39

צמתי אטימה גורמים למידור חלבונים וחלק מהפוספוליפידים לאזורים מסוימים בתא. אלו פוספוליפידים נשארים מקובעים למדור מסוים ואלו לא?

Answer 39

אלו שבעלעל החיצוני אינם עוברים דיפוזיה בין שני האזורים המופרדים אך אלו שבעלעל הפנימי כן.

Question 40

כיצד תאים מייצרים דומיינים הממברנה?

Answer 40

- יצירת קומפלקסים חלבוניים גדולים - אינטראקציות עם מאקרומולקולות או חלבונים חוץ תאיים (למשל עם פרוטאוגליקאנים) - אינטראקציות עם מאקרומולקולות או חלבונים תוך תאיים (שלד התא למשל) - אינטראקציות עם חלבונים המצויים בפני השטח של תא אחר (צמתי אטימה למשל)

Question 41

מה תפקיד החלבון ספקטרין?

Answer 41

עיצוב צורת כדוריות הדם והקניית גמישות (חלבון שלד תוך תאי)

Question 42

מה מוטנטי במחלה heridety spherocytosis (HS) ולמה שה גורם?

Answer 42

- החלבון ספקטרין מוטנטי - כדוריות הדם עגולות ושבריריות - אנמיה מגלובלסטית ספונטנית

Question 43

כיצד בנויה רשת הספקטרין בתאי דם אדומים?

Answer 43

``` הטרודימר (אלפא ובטא) אנטימקבילי של ספקטרין מתחבר לעוד אחד ליצירת טטרמר. ההתאררגנות לרשת נעשית בעזרת junctional complexes המכילים- שרשראות אקטין קצרות (13) חלבוני צומת (band4.1, adducin, tropomyosin) חלבוני עיגון לממברנה (band3, glycopurin, akyrin) ```

Question 44

מהם | corals?

Answer 44

דומיינים ממברנאלים הנוצרים מהשלד התוך תאי

Question 45

אלו סוגים של bending proteins קיימים? (3)

Answer 45

1. חלבון עם אזור הידרופובי הנכנס לממברנה 2. חלבון גדול וקשיח המתיישב על הממברנה וכופה עליה את צורתו 3. חלבון שנקשר לממברנה וגורם להתאגוד של ראשי פוספוליפידים גדולים יחד