המרכיב החלבוני בממברנה הפלסמטית (ביותא א) Flashcards
אלו סוגי חלבוני ממברנה קיימים?
3
- אינטגרלים
- פריפריאלים
- מעוגנים
כיצד חלבונים פריפריאלים מצומדים לממברנה?
דרך אינטראקציות חלבון-חלבון עם חלבון אינטגרלי אחר
אלו שינויים בתנאים הסביבתיים יגרמו לניתוק חלבון פריפריאלי?
2
- שינוי ריכוז מלחים
- שינוי ב
pH
חלבונים שהם
GPI-anchored
ימצאו רק בעלעל ה______ של הממברנה
חוץ תאי
אלו קשרים יכולים להיווצר בין חלבון לליפיד שמעגן אותו לממברנה?
(3)
- קשר אמידי (דרך קצה אמיני)
- קשר תיואסטרי (דרך ציסטאין)
- קשר תיואטרי (דרך ציסטאין
C-S-C)
איזו חומצת שומן תיצור קשר אמידי עם החלבון אותה היא מעגנת?
מיריסטיול
איזו חומצת שומן תיצור קשר תיואסטרי עם החלבון אותה היא מעגנת?
פלמטית
איזו חומצת שומן תיצור קשר תיואטרי עם החלבון אותה היא מעגנת?
פרנזיל
כיצד מעוגנים משפחת חלבוני
SRC
לממברנה?
- עיגון דרך קשר אמידי עם ח”ש מריסטיול
- עיגון דרך קשר תיואסטרי עם ח”ש פלמטית במתן סיגנל מתאים
איזו פעילות יש לחלבוני
SRC?
טירוזין קינאז
כיצד חלבוני
RAS
מעוגנים לממברנה?
דרך קבוצת פרניל וחומצה פלמטית
מהו אורך הסגמנט חוצה הממברנה האלפא הליקאלי?
20-30
חומצות אמינו
מהו אורך סגמנט חוצה ממברנה בקונפורמציה חבית בטא?
כ-10
מה מתאר גרף הידרופאתיות?
אזורים אלפא הליקאלים החוצים ממברנה בחלבון
חיובי=הידרופובי
מה תפקיד החלבון
FepA
וכיצד הוא פועל?
(באי-קולי)
תפקידו להעביר ברזל בין צידי הממברנה. זהו חלבון בצורת חבית בטא עם חלק גלובוראלי בתוכו האמון על העברת הברזל
היכן בתא חלבונים עוברים גליקוזילציה?
ER
ו/או
גולג’י
לאיזה צד של התא יפנו השיירים הסוכריים בגליקופרוטאינים?
אל חוץ התא
היכן נמצא קשרים דיסולפידים בגליקופרוטאינים?
בצד החוץ תאי
כיצד קרויה המעטפת הסוכרית של התא?
glycocalyx
אוקטיגלוקוזיד וטריטון הם דוגמאות ל-
דטרגנטים לא יונים
מהו ערך
CMC?
critical micelle concentration.
הריכוז ממנו המונומרים של הדטרגנט מתחילים להסתדר במיצלות
מאלו תנאים סביבתיים מושפע ה
CMC?
(3)
- טמפרטורה
- pH
- ריכוז מלחים
כיצד דטרגנט יוני מאפשר טיהור חלבונים מהתמיסה?
הוא נקשר לחלקים ההידרופוביים של החלבונים הממברנאלים ויוצר עימם מיצלות המאפשרות בידוק יעיל וקל
מה החיסרון בשימוש בדטרגנטים יונים?
הרס המבנה המרחבי של החלבון
SDS
הוא סוג של-
דטרגנט יוני
כיצד פועלים דטרגנטים לא יונים?
בריכוז גבוה ובריכוז נמוך
- בריכוז גבוה הם מצליחים לבודד חלבונים
- בריכוז נמוך הם גורמים להיווצרות ליפוזומים ע”י הפוספוליפידים והחלבונים
מה היתרון בשימוש בדטרגנט לא יוני?
יש שמירה על המבנה הנטיבי של החלבון
מה החסרון בשימוש בדטרגנט לא יוני?
הליפוזומים הנוצרות אינם מאפשרים גישה לשני צידי החלבון לשם חקר פעילותו
מהם ננודיסקים?
פאצ’ קטן של ממברנה המוקף בחגורה של
HDLs
מתי משתמשים בננודיסקים?
כאשר רוצים ללמוד על פעילות של חלבון משני צידיו
מכניסין אותו לפאצ’ עם דטרגנט לא יוני בריכוז נמוך
למי שייך חלבון בקטריורודופסין?
ארכיאה
מה מבנה החלבון בקטריורודופסין?
2
- בנוי מ7 אלפא הליקסים טראנסממברנאליים היוצרים אינטראקציות ביניהם.
- במרכז יש מולקולת רטינאל הקשורה קוולנטית לליזין.
כיצד פועל החלבון בקטרירודופסין?
בקליטת פוטון, מולקולת הרטינאל משתנה מציס לטראנס וגורמת לשאיבת פרוטונים החוצה מהארכיאה, ליצירת גרדיאנט אלקטרוכימי, שחלבונים אחרים ישתמשו בו.
למה משמש (בין היתר) הגרדיאנט האלקטרוכימי שנוצר ע”י פעילות בקטריורודופסין?
להזזת הפלג’לה של הארכיאה בתנועה סיבובית והתקדמותו אל עבר מקור האור
מה מאפשרת שיטת
FRAP?
מאפשרת למדוד את קצב הדיפוזיה הלטראלית של חלבונים ממברנאלים
סימון פלורוסנטי ואז פוטובליצ’ינג
מהו הערך
partition coeficient
וכיצד ניתן למצוא אותו?
- קבוע הדיפוזיה הלטראלית של חלבונים ממברנאלים
- ניתן למצוא אותו ע”י שימוש בשיטת
FRAP
מה חסרונות שיטת
FRAP?
(2)
- אין אפשרות לעקוב אחרי חלבונים בודדים אלא רק קבוצות
- אם אין
recovery
לא ניתן לקבוע אם החלבון חסר מוביליות או לחלופין ממודר לאזור ממברנאלי קטן
מהי שיטת
single particle tracking
ומה יתרונה?
- חיבור נוגדן מסומן לחלבון ומעקב אחריו
- מאפשר מעקב אחר חלבון בודד
צמתי אטימה גורמים למידור חלבונים וחלק מהפוספוליפידים לאזורים מסוימים בתא.
אלו פוספוליפידים נשארים מקובעים למדור מסוים ואלו לא?
אלו שבעלעל החיצוני אינם עוברים דיפוזיה בין שני האזורים המופרדים אך אלו שבעלעל הפנימי כן.
כיצד תאים מייצרים דומיינים הממברנה?
- יצירת קומפלקסים חלבוניים גדולים
- אינטראקציות עם מאקרומולקולות או חלבונים חוץ תאיים (למשל עם פרוטאוגליקאנים)
- אינטראקציות עם מאקרומולקולות או חלבונים תוך תאיים (שלד התא למשל)
- אינטראקציות עם חלבונים המצויים בפני השטח של תא אחר (צמתי אטימה למשל)
מה תפקיד החלבון ספקטרין?
עיצוב צורת כדוריות
הדם והקניית גמישות
(חלבון שלד תוך תאי)
מה מוטנטי במחלה
heridety spherocytosis (HS)
ולמה שה גורם?
- החלבון ספקטרין מוטנטי
- כדוריות הדם עגולות ושבריריות
- אנמיה מגלובלסטית ספונטנית
כיצד בנויה רשת הספקטרין בתאי דם אדומים?
הטרודימר (אלפא ובטא) אנטימקבילי של ספקטרין מתחבר לעוד אחד ליצירת טטרמר. ההתאררגנות לרשת נעשית בעזרת junctional complexes המכילים- שרשראות אקטין קצרות (13) חלבוני צומת (band4.1, adducin, tropomyosin) חלבוני עיגון לממברנה (band3, glycopurin, akyrin)
מהם
corals?
דומיינים ממברנאלים הנוצרים מהשלד התוך תאי
אלו סוגים של
bending proteins
קיימים?
(3)
- חלבון עם אזור הידרופובי הנכנס לממברנה
- חלבון גדול וקשיח המתיישב על הממברנה וכופה עליה את צורתו
- חלבון שנקשר לממברנה וגורם להתאגוד של ראשי פוספוליפידים גדולים יחד