המרכיב החלבוני בממברנה הפלסמטית (ביותא א) Flashcards

1
Q

אלו סוגי חלבוני ממברנה קיימים?

3

A
  • אינטגרלים
  • פריפריאלים
  • מעוגנים
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

כיצד חלבונים פריפריאלים מצומדים לממברנה?

A

דרך אינטראקציות חלבון-חלבון עם חלבון אינטגרלי אחר

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

אלו שינויים בתנאים הסביבתיים יגרמו לניתוק חלבון פריפריאלי?

2

A
  • שינוי ריכוז מלחים
  • שינוי ב
    pH
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

חלבונים שהם
GPI-anchored
ימצאו רק בעלעל ה______ של הממברנה

A

חוץ תאי

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

אלו קשרים יכולים להיווצר בין חלבון לליפיד שמעגן אותו לממברנה?
(3)

A
  • קשר אמידי (דרך קצה אמיני)
  • קשר תיואסטרי (דרך ציסטאין)
  • קשר תיואטרי (דרך ציסטאין
    C-S-C)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

איזו חומצת שומן תיצור קשר אמידי עם החלבון אותה היא מעגנת?

A

מיריסטיול

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

איזו חומצת שומן תיצור קשר תיואסטרי עם החלבון אותה היא מעגנת?

A

פלמטית

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

איזו חומצת שומן תיצור קשר תיואטרי עם החלבון אותה היא מעגנת?

A

פרנזיל

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

כיצד מעוגנים משפחת חלבוני
SRC
לממברנה?

A
  • עיגון דרך קשר אמידי עם ח”ש מריסטיול

- עיגון דרך קשר תיואסטרי עם ח”ש פלמטית במתן סיגנל מתאים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

איזו פעילות יש לחלבוני

SRC?

A

טירוזין קינאז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

כיצד חלבוני
RAS
מעוגנים לממברנה?

A

דרך קבוצת פרניל וחומצה פלמטית

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

מהו אורך הסגמנט חוצה הממברנה האלפא הליקאלי?

A

20-30

חומצות אמינו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

מהו אורך סגמנט חוצה ממברנה בקונפורמציה חבית בטא?

A

כ-10

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

מה מתאר גרף הידרופאתיות?

A

אזורים אלפא הליקאלים החוצים ממברנה בחלבון

חיובי=הידרופובי

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

מה תפקיד החלבון
FepA
וכיצד הוא פועל?
(באי-קולי)

A

תפקידו להעביר ברזל בין צידי הממברנה. זהו חלבון בצורת חבית בטא עם חלק גלובוראלי בתוכו האמון על העברת הברזל

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

היכן בתא חלבונים עוברים גליקוזילציה?

A

ER
ו/או
גולג’י

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

לאיזה צד של התא יפנו השיירים הסוכריים בגליקופרוטאינים?

A

אל חוץ התא

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

היכן נמצא קשרים דיסולפידים בגליקופרוטאינים?

A

בצד החוץ תאי

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

כיצד קרויה המעטפת הסוכרית של התא?

A

glycocalyx

20
Q

אוקטיגלוקוזיד וטריטון הם דוגמאות ל-

A

דטרגנטים לא יונים

21
Q

מהו ערך

CMC?

A

critical micelle concentration.

הריכוז ממנו המונומרים של הדטרגנט מתחילים להסתדר במיצלות

22
Q

מאלו תנאים סביבתיים מושפע ה
CMC?
(3)

A
  • טמפרטורה
  • pH
  • ריכוז מלחים
23
Q

כיצד דטרגנט יוני מאפשר טיהור חלבונים מהתמיסה?

A

הוא נקשר לחלקים ההידרופוביים של החלבונים הממברנאלים ויוצר עימם מיצלות המאפשרות בידוק יעיל וקל

24
Q

מה החיסרון בשימוש בדטרגנטים יונים?

A

הרס המבנה המרחבי של החלבון

25
Q

SDS

הוא סוג של-

A

דטרגנט יוני

26
Q

כיצד פועלים דטרגנטים לא יונים?

בריכוז גבוה ובריכוז נמוך

A
  • בריכוז גבוה הם מצליחים לבודד חלבונים

- בריכוז נמוך הם גורמים להיווצרות ליפוזומים ע”י הפוספוליפידים והחלבונים

27
Q

מה היתרון בשימוש בדטרגנט לא יוני?

A

יש שמירה על המבנה הנטיבי של החלבון

28
Q

מה החסרון בשימוש בדטרגנט לא יוני?

A

הליפוזומים הנוצרות אינם מאפשרים גישה לשני צידי החלבון לשם חקר פעילותו

29
Q

מהם ננודיסקים?

A

פאצ’ קטן של ממברנה המוקף בחגורה של

HDLs

30
Q

מתי משתמשים בננודיסקים?

A

כאשר רוצים ללמוד על פעילות של חלבון משני צידיו

מכניסין אותו לפאצ’ עם דטרגנט לא יוני בריכוז נמוך

31
Q

למי שייך חלבון בקטריורודופסין?

A

ארכיאה

32
Q

מה מבנה החלבון בקטריורודופסין?

2

A
  • בנוי מ7 אלפא הליקסים טראנסממברנאליים היוצרים אינטראקציות ביניהם.
  • במרכז יש מולקולת רטינאל הקשורה קוולנטית לליזין.
33
Q

כיצד פועל החלבון בקטרירודופסין?

A

בקליטת פוטון, מולקולת הרטינאל משתנה מציס לטראנס וגורמת לשאיבת פרוטונים החוצה מהארכיאה, ליצירת גרדיאנט אלקטרוכימי, שחלבונים אחרים ישתמשו בו.

34
Q

למה משמש (בין היתר) הגרדיאנט האלקטרוכימי שנוצר ע”י פעילות בקטריורודופסין?

A

להזזת הפלג’לה של הארכיאה בתנועה סיבובית והתקדמותו אל עבר מקור האור

35
Q

מה מאפשרת שיטת

FRAP?

A

מאפשרת למדוד את קצב הדיפוזיה הלטראלית של חלבונים ממברנאלים

סימון פלורוסנטי ואז פוטובליצ’ינג

36
Q

מהו הערך
partition coeficient
וכיצד ניתן למצוא אותו?

A
  • קבוע הדיפוזיה הלטראלית של חלבונים ממברנאלים
  • ניתן למצוא אותו ע”י שימוש בשיטת
    FRAP
37
Q

מה חסרונות שיטת
FRAP?
(2)

A
  1. אין אפשרות לעקוב אחרי חלבונים בודדים אלא רק קבוצות
  2. אם אין
    recovery
    לא ניתן לקבוע אם החלבון חסר מוביליות או לחלופין ממודר לאזור ממברנאלי קטן
38
Q

מהי שיטת
single particle tracking
ומה יתרונה?

A
  • חיבור נוגדן מסומן לחלבון ומעקב אחריו

- מאפשר מעקב אחר חלבון בודד

39
Q

צמתי אטימה גורמים למידור חלבונים וחלק מהפוספוליפידים לאזורים מסוימים בתא.
אלו פוספוליפידים נשארים מקובעים למדור מסוים ואלו לא?

A

אלו שבעלעל החיצוני אינם עוברים דיפוזיה בין שני האזורים המופרדים אך אלו שבעלעל הפנימי כן.

40
Q

כיצד תאים מייצרים דומיינים הממברנה?

A
  • יצירת קומפלקסים חלבוניים גדולים
  • אינטראקציות עם מאקרומולקולות או חלבונים חוץ תאיים (למשל עם פרוטאוגליקאנים)
  • אינטראקציות עם מאקרומולקולות או חלבונים תוך תאיים (שלד התא למשל)
  • אינטראקציות עם חלבונים המצויים בפני השטח של תא אחר (צמתי אטימה למשל)
41
Q

מה תפקיד החלבון ספקטרין?

A

עיצוב צורת כדוריות
הדם והקניית גמישות
(חלבון שלד תוך תאי)

42
Q

מה מוטנטי במחלה
heridety spherocytosis (HS)
ולמה שה גורם?

A
  • החלבון ספקטרין מוטנטי
  • כדוריות הדם עגולות ושבריריות
  • אנמיה מגלובלסטית ספונטנית
43
Q

כיצד בנויה רשת הספקטרין בתאי דם אדומים?

A
הטרודימר (אלפא ובטא) אנטימקבילי של ספקטרין מתחבר לעוד אחד ליצירת טטרמר.
ההתאררגנות לרשת נעשית בעזרת 
junctional complexes
המכילים- 
שרשראות אקטין קצרות (13) 
חלבוני צומת
(band4.1, adducin, tropomyosin)
חלבוני עיגון לממברנה
(band3, glycopurin, akyrin)
44
Q

מהם

corals?

A

דומיינים ממברנאלים הנוצרים מהשלד התוך תאי

45
Q

אלו סוגים של
bending proteins
קיימים?
(3)

A
  1. חלבון עם אזור הידרופובי הנכנס לממברנה
  2. חלבון גדול וקשיח המתיישב על הממברנה וכופה עליה את צורתו
  3. חלבון שנקשר לממברנה וגורם להתאגוד של ראשי פוספוליפידים גדולים יחד