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Genética > Epigenética > Flashcards

Epigenética Flashcards

1
Q

¿qué es la epigenética?

A

procesos y mecanismos que regulan la expresión génica sin cambiar la secuencia del ADN (son cambios heredables)

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2
Q

¿qué es epigenoma?

A

conjunto de modificaciones epigenéticas en un organismo o en una célula

tiene un impacto en la regulación de la expresión génica

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3
Q

reprogramación celular inducida (iPS)

A

cambio de una célula adulta de su estado diferenciado a un estado pluripotente

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4
Q

reprogramación somática

A

capacidad de células madre para diferenciarse en diversos tipos celulares

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5
Q

¿qué es la metilación del DNA?

A

proceso epigenético

adición de un grupo metilo (CH3) en el carbono del anillo de la citosina

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6
Q

¿cómo es inhibida la transcripción?

A

por metilación

la metilación recluta proteínas de silenciamiento a la cromatina

esto puede interferir con la unión de factores de transcripción

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7
Q

zonas muy metiladas = zonas ____

A

inactivas

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8
Q

la metilación participa en procesos como:

A

inactivación del cromosoma X
regulación de la expresión génica
embriogénesis

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9
Q

una desregulación de la metilación llevaría a ____

A

cáncer

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10
Q

¿quién lleva a cabo la metilación?

A

familia de enzimas DNMT
(DNA metiltransferasas)

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11
Q

¿quién lleva a cabo la desmetilación?

A

oxidasas (enzimas T)

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12
Q

proteína que reconoce regiones metiladas

A

proteínas MeCP2

se une a secuencias de ADN que contienen metilación en citosinas seguidas de guaninas (CpG), que son sitios comunes de metilación

esta unión conduce a la represión de la transcripción

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13
Q

técnicas para detectar la metilación del ADN

A

MeDIP: immuno-precipitation
- anticuerpo específico
- quedarnos con regiones metiladas

Secuenciación por bisulfito de sodio:
- para saber a nivel nucleótido que citosinas están o no metiladas
- citosina no metilada ⟶ se vuelve uracilo y luego timina
- citosina metilada ⟶ sin cambios

Cromatina Inmunoprecipitación Seguida por Secuenciación (ChIP-seq):
- identificar regiones de la cromatina asociadas con marcadores de metilación

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14
Q

¿a qué se asocia la acetilación de histonas?

A

a la apertura de la cromatina

acetilado ⟶ abierto
desacetilado ⟶ cerrado

zona acetilada ⟶ tiene nucleosomas flojos ⟶ mejor accesibilidad del complejo de transcripción a las regiones del ADN ⟶ aumento en expresión génica

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15
Q

¿qué son los writers?

A

enzimas que modifican las histonas, añaden modificaciones postraduccionales

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16
Q

familias de writers

A

HATs ⟶ ponen acetilaciones
HMTs ⟶ ponen metilaciones
PRMTs ⟶ ponen fosforilaciones

17
Q

¿qué hacen las readers?

A

reconocen y se unen a las marcas epigenéticas:

  • bromo domains ⟶reconoce zonas acetiladas
  • chromo domains ⟶ reconoce zonas metiladas
  • tutor domains ⟶ reconoce zonas fosforiladas

son mediadores en la transmisión de señales epigenéticas

18
Q

¿qué hacen las erasers?

A

remueven marcas postraduccionales:

HDACs ⟶ desacetilan
KDMs ⟶ desmetilan
PRDM ⟶ desmetilan

19
Q

¿dónde se llevan a cabo las modificaciones postraduccionales de las histonas?

A

colas amino terminales

20
Q

Inmunoprecipitación de cromatina (ChIP)

A

técnica de detección de modificaciones de histonas

  1. cruza/enlaza histonas
  2. lisis celular (romper células, liberar su contenido)
  3. inmunoprecipitación (aislar)
  4. purificación del DNA
  5. qPCR analysis
21
Q

¿qué son Polycomb y Thritorax?

A

complejos proteicos que tienen funciones opuestas

regulan activación o represión de genes del desarrollo y diferenciación celular

22
Q

funciones de Polycomb y Thritorax

A

mantenimiento expresión genes homeobox (diferenciación de tejidos específicos)

proliferación celular

inactivación cromosoma X

determinan cómo las células se especializan a partir de la compactación de la cromatina

23
Q

características de Polycomb

A

silencia genes
complejo de represión:
- HDAC, EED, SUZ12, JARID1EZH2

  • media moléculas de K27 metilación
  • dos complejos PRC1 y PRC2
  • pueden formar loops de cromatina (compactar regiones de cromatina aglomerando nucleosomas)
24
Q

características Trithorax

A

activa genes (promueve su transcripción en proteínas)
complejo de activación:
- WDR5, ASH2L, UTX, RBBP5, MLL

  • media moléculas de K4 metilación y acetilación
25
Q

el ___% del genoma es no codificante

A

98

26
Q

ejemplos de noncoding genes

A

lincRNA
microRNA
snoRNA

27
Q

tipos de genes no codificantes

A

bystandard
scaffolds
bridges

Genética (24 decks)

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