Enzymer Flashcards
Def/vad är ett enzym?
Enzym är biologisk katalysator som kan öka hastigheten på reaktioner utan att själv förbrukas.
Vilka slags “molekyler” kan vara enzymer?
Proteiner & en del RNAn (ribosym)
Varför behövs enzymer?
Pga Kinetiskt ofördelaktiga förutsättningar/miljö (“betingelser”):
Kemiska reaktioner i biologiska system
- Vattenmiljö (i cytosol/cellkärna/organell)
- Neutralt pH
- Kroppens temperatur (t.ex.37°C)
Hur kan kunskap om enzymer hjälpa i tex klinisk diagnostik?
Enzymaktivitet eller mängd i blodet kan ge indikation om sjukdom.
Varför är choklad farligt för hund o katt?
Innehåller Theobromine, vilket de saknar enzymet för att kunna bryta ned. —> påverkar CNS, hjärt, kärl, andings-system
Vad menas med “Transition state/övergångsläge”
E+S –> E+P // båda dessa tillstånden? idrk…. kolla upp!!!!
Expl Energibarriären/Aktiveringsenergi.
Energibarriären är energin som krävs för att
påbörja en reaktion = aktiveringsenergi.
//
Aktiveringsenergin = energin som krävs för att aktivera atomer eller molekyler till ett Övergångstillstånd (transition state) där de kan genomgå Kemisk omvandling.
Påverkar enzymer aktiveringsenergin?
JA!!!!
Enzymer sänker aktiveringenergin för en reaktion —> fler substrat tillr E överkomma Ea & slutföra reaktion —> högre reaktionshastighet
Påverkar enzymer energiskillnaden//fria energin mellan substrat och produkt? (delta H // delta G)
NEJ!!!! den är samma
Vad är den aktiva ytan / aktiva sätet (active site)?
= en tredimensionell klyfta/ficka skapad av aminosyror från olika delar av den primära strukturen.
Vart binder substratet in?
Substrat binder in till enzymet på den aktiva ytan,
som passar just det substratet, som en ”nyckel” i
ett ”lås”.
Ibland anpassas den aktiva ytan på enzymet så
att substratet passar in (induced fit)
Vad finns de för interaktioner när enzym o substrat interagerar?
Aktiva ytan skapar unika mikromiljöer för
substratet.
Interaktionen mellan enzymet och
substratet involverar flera svaga interaktioner
t.ex. van der Waals interaktioner, vätebindningar
m.m., eller bildar övergångsprodukt.
Dessa interaktioner underlättar och påskyndar
reaktionen.
icke kovalenta
Enzym har ju en specificitet, men passar substraten alltid perfekt?
Ibland anpassas den aktiva ytan på enzymet så
att substratet passar in = Induced fit
slide 13 idk (och de om vrf ska veta enzymer…)
Hur klassificeras enzymer? Hur många grpr?
Efter funktion! 6 grpr/klasser
Vad är co-enzym // co-faktorer i relation t enzymer?
+ exempel
Vissa enzymer behöver ko-faktor (eller ko-enzym) för att kunna katalysera reaktion)
- Metall joner t.ex. Mg2+, Mn2+, Fe2+, Zn2+, m.m. (co-faktorer)
- Organisk molekyl (kallas ofta ko-enzym) t.ex. CoA
(co-enzym A), NAD+, FAD, etc.
co-enzym - Vissa co-enzym binder permanent till enzym, t.ex.
Hem, FAD.
Har vitaminer nån koppling till co-enzym?
JA!!
Kan vara/är co-enzyms vitaminkällor
ffa vitamin B (olika typer)
Co-faktor viktig i glykolys?
Mg2+ viktig co-faktor i glykolys
Mg2+ beh ofta för
enzymer som heter
ngt m kinas
Vad är reaktionshastigheten, V?
V (hastighet) = förändring av [Produkt] / tid
Den totala reaktionshastigheten, V,
är antalet substratmolekyler som
omvandlas till produkt per tidsenhet
Anges oftast i μmol produkt/sekund.
inte conc/tid???? ger antal/tid verkligen rate???
Hastigheter för reversibel reaktion? Initial hastighet och bakåt reaktion…
Initial hastighet, V0, är reaktions
hastighet vid början av en reaktion,
då reaktionen går bara framåt,
eftersom bara en försumbar mängd
produkt, P, har bildats.
När tillräckligt [P] bildas, börjar den
bakåt reaktion med hastighet V-1
Reversibel reaktionshastighet och jämvikt
Vad händer med framåt
reaktionshastighet efter
reaktion har gått en längre tid?
När är jämvikt uppnådd?
Reversibel reaktionshastighet och jämvikt
Vad händer med framåt
reaktionshastighet efter
reaktion har gått en längre tid?
Ju längre tid det går, ju lägre
reaktionshastighet bli det
När total hastighet V = 0
(d.v.s. V1 = V-1, framåt o bakåt r är lika), då lika
många S omvandlas till P som
P till S, då sägs det att reaktionen har nått jämvikt.
Vad påverkas reaktionshastigheten av??
- Temperatur
- pH
- Koncentration av enzym och reaktant (substrat/produkt)
- Inhibitor/aktivator
Effekt av temperatur på enzym aktivitet / hastighet
optimal T olika olika enzymer
men likn att ökar –> max —> denat
Optimal temperatur: enzymsaktivitet är högst vid den temperatur de trivs bäst.
först incr T —> more f collisions —> incr rate
men at a certain point, max rate reached, when incr T further —> lower rate
since enzyme (~protein) loses its 3D shape – denatures
Effekt av pH på enzym aktivitet / hastighet
olika enzymer olika optimala pH
* Olika enzymer är optimerade för olika pH
rätt pH för
ionisering av
aminosyrornas
sidokedjor
(påverkar tertiärstr)
* Ett specifikt pH kan behövas om den aktiva ytan behöver ha
rätt jonisering (ex. -NH3+)
* Extrema pH kan denaturera enzymer som stabiliserades av
jon-jon interaktioner
