Dx laboratoire Flashcards

1
Q

Quelles sont les trois étapes de cheminement diagnostique en microbiologie infectiologique ?

A

1) Phase pré-analytique
2) Phase analytique (avec survol des cultures)
3) Phase post-analytique

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2
Q

Que comprend la phase pré-analytique ?

A

1) Hypothèses diagnostiques
2) Prescription de prélèvements selon le cas présenté (examen direct, culture, détection antigénique/PCR, sérologie)
3) Prélèvements nécessitant la requête du prescripteur et identification double du spécimen pour le patient (acheminement au labo)
4) Réception des prélèvements au labo.

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3
Q

Vrai ou faux : Il est très important pour les cultures de connaître les germes recherchés de routine et ceux nécessitant une demande spéciale.

A

Vrai.

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4
Q

Que comprend la phase analytique avec survol des cultures ?

Désolée pour ce flashcard, c’est du gros par coeur pas le fun :/

A
  • Selon le protocole, examen direct sur le prélèvement
  • Pour les cultures bactériennes courantes : étapes progressives et successives (ensemencement/incubation - durée variable selon spécimen et pathogène*, isolement/épuration avec objectif de culture pure, lecture périodique aux 24h pour pathogènes usuels)
    *48-72h pour urines
    *recherche TB : 6 sems
  • Identification (aspect des colonies, hémolyse sur gélose sanguine (bêta = complète, alpha = partielle, aspect verdâtre), tests biochimiques rapides, aspect au gram des colonies (staph = coques en amas gram +, strep : coques en ligne gram +, entérobactéries = bâtonnets gram -))

SI NÉCESSAIRE :
- Analyse biochimique de l’isolat (plus répandu et moins cher = Vitek)
- Malditof (plus rapide mais beaucoup plus cher)
- Antibiogramme (souvent décidé par le labo)
- Notion de résultats critiques
- Rapports préliminaires selon les étapes analytiques

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5
Q

Que comprend la phase post-analytique ?

A
  • Émission du rapport final (validé par microbiologiste infectiologue, importance de la VALIDITÉ DU RÉSULTAT et du DÉLAI DE RÉALISATION ANALYTIQUE)
  • Interprétation finale du médecin prescripteur
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6
Q

VOIR EXEMPLE CONCRET D’UN CHEMINEMENT DIAGNOSTIQUE EN MICROBIOLOGIE (p.22 à 24)

A

Beaucoup plus simple comme ça…

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7
Q

Vrai ou faux : La coloration de gram est la plus utilisée pour l’examen microscopique des bactéries.

A

Vrai.

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8
Q

Explique la procédure de la coloration de Gram.

A

1) Coloration de gram pendant au moins 15 secondes (colore la cellule d’un violet-bleu).
COLORATION QU’ON VEUT RETENIR !

2) Lavage à l’eau, puis au lugol (iode) comme mordant pendant au moins 15 secondes.

3) Acétone/alcool (décoloration) pendant au moins 15 secondes.

4) Lavage à l’eau.

5) Contre-colorant, safranine (teint les microbes en rouge/rose si gram négatif) pendant au moins 15 secondes.

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9
Q

Quelles sont les limites du gram (sensibilité) ?

A
  • Densité bactérienne du prélèvement (plus elle est dense, plus la sensibilité est accrue)
  • Résolution optique (ex : treponema qui est invisible)
  • La présence ou non d’une paroi bactérienne (ex : mycoplasma demeure invisible)
  • Type de paroi bactérienne donnant un aspect fantôme aux bactéries (ex : mycobacterium qui demeure invisible)
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10
Q

Les bactéries visibles habituellement au gram peuvent notamment faire un phénomène de Gram variable. Qu’est-ce que cela implique ?

A
  • Bactéries affectées par les conditions de cultures
  • Bactéries exposées préalablement aux antibiotiques
  • Bactéries peuvent se décolorer intrinsèquement (propriété)
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11
Q

Quelles sont les utilités du Gram ?

A
  • Reconnaître rapidement les bactéries possiblement pathogènes (y compris les éléments fongiques parfois) dans le prélèvement et d’en informer le clinicien.
  • Évaluer la présence ou l’absence de flore normale quand le prélèvement provient d’un site non stérile.
  • Évaluer la réponse inflammatoire car les globules blancs sont colorés dans le processus.
  • Quantifier de façon relative les polynucléaires vs les cellules mononucléées et aider à distinguer infection bactérienne et infection virale.
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12
Q

Sur quels types de spécimen peut être fait la coloration de Gram ?

A
  • De routine, en urgence : LCR
  • De routine, non urgent : expectorations
  • Sur demande spéciale : Prélèvement urinaire.
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13
Q

Qu’en est-il des hémocultures ? Que se passe-t-il dans ce cas-là ?

A

Les prélèvements sont incubés : coloration de Gram effectuée UNIQUEMENT sur les bouteilles ciblées + par l’appareil.

  • 90% des bouteilles qui seront positives le seront dans les premières 48h d’incubation.
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14
Q

Vrai ou faux : Un résultat positif à la coloration de Gram sur une hémoculture sera toujours jugé critique.

A

Vrai !

Le sang est supposé être stérile, donc si on y trouve une densité bactérienne intense (où coloration de Gram adhère/ou non), c’est un drapeau rouge.

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15
Q

À quel type de bactérie s’adresse les colorations d’acido-alcoolo-résistance ?

A

S’adressent aux bactéries dont la paroi est riche en acides mycoliques (acides gras à longues chaines)
- qui sont difficiles à colorer au Gram notamment
- où les bactéries résistent à une décoloration par un alcool acidifié (éthanol/HCL, dans le cas du Ziehl ou Kinyoun)

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16
Q

Nomme deux exemples de ces bactéries pouvant être colorées par les coloration d’acido-alcoolo-résistance ?

A
  • Bacilles acido-alcoolo-résistants
  • Mycobactéries (tuberculeuses et non tuberculeuses)
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17
Q

Quelle est la procédure de base d’une coloration d’acido-alcoolo-résistance ?

A

1) Lame colorée avec Carbol Fuschine

2) Décoloration avec alcool acidifié

3) Contre-coloration bleu de méthylène

4) Résultats + bactéries rouges (bâtonnets) sur fond bleuté

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18
Q

Quels sont deux exemples de coloration d’acido-alcoolo-résistance ?

A
  • Ziehl-Neelson (coloration à chaud)
  • Kinyoun (coloration à froid)

S’adresse à la rechercher des mycobactéries !!

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19
Q

En quoi le Kinyoun modifié se distingue-t-il du Ziehl-Neelson ?

A
  • Emploi d’un décolorant plus doux
  • S’adresse à la recherche de certaines espèces partiellement acido-alcoolo-résistantes (Nocardia par exemple)
20
Q

En quoi consiste la coloration à l’auramine (rhodamine) ?

A

Fluorochromes non spécifiques qui se lient aux acides mycoliques et résistent à la décoloration par l’alcool acidifié.

21
Q

Comment sait-on que le résultat d’une coloration à l’auramine (rhodamine) est positif ?

A

Bactéries (bâtonnets) fluorescentes jaunâtres sur fond noirâtre.

22
Q

Vrai ou faux : La valeur diagnostique est moins forte que celle du Ziehl-Neelson.

A

Faux. La valeur diagnostique est équivalente, la lecture est plus rapide pour le technicien.

23
Q

Quelle est la limite des colorations d’acido-alcoolo-résistance concernant la tuberculose ?

A

Sensibilité supérieure (50-60%) dans les prélèvements respiratoires que ceux extrapulmonaires (10-30%)

24
Q

Vrai ou faux : Ziehl-Neelson distingue aussi bien les mycobactéries que les bactéries Nocardia.

A

Faux.

Mycobactéries : +
Nocardia : - ou variable.

25
Q

Vrai ou faux : Le Kinyoun modifié distingue aussi bien les mycobactéries que les bactéries Nocardia

A

Vrai.

Mycobactéries : +
Nocardia : +

26
Q

En quoi consiste le test d’immunofluorescence ?

A

Anticorps combinés à un marqueur fluorescent qui se lient à un antigène spécifique.

Observation au microscope à fluorescence.

27
Q

Quelle bactérie peut-on observer avec le microscope à fluorescence et la coloration d’immunofluorescence ?

A

Légionella

28
Q

Est-ce que le KOH est une coloration en tant que telle ?

A

Pas vraiment… Elle vise plus à briser les tissus environnants (ongles, peau, cheveux) pour digérer la kératine et rendre plus visibles les éléments fongiques et mycéliens.

29
Q

Pourquoi utilise-t-on un fond noir pour distinguer certains types de bactérie ?

Quel type de bactérie cela concerne-t-il ?

A

Pour utiliser la diffraction de la lumière. Examen direct au microscope ayant un condensateur dédié pour les prélèvements obtenus de chancres notamment (ulcères)

  • La syphilis (spirochètes → Tréponèmes, non visibles au Gram
30
Q

Comment percevons-nous un test sur fond noir positif ?

A

Les bactéries sont brillantes sur le fond noir, elles sont mobiles.

31
Q

Pour être honnête, nous servons-nous beaucoup du fond noir ? Pour quelles raisons ?

A

Pas vraiment… Il devient désuet.

  • Faible demande
  • Expertise technique requise
  • Meilleurs tests sérologiques désormais disponibles
32
Q

Le calcofluor peut être utilisé avec une autre substance diagnostique. Laquelle ?

A

Le KOH

33
Q

À quoi ressemble le test de calcofluor ?

A

Azurant optique (blanchiment) qui se lie à la cellulose et à la chitine, fluorescent à une longueur d’onde dédiée aux UV (visible avec microscope avec fluorescence).

34
Q

Quand nous servons-nous du calcofluor ?

A
  • Détection de champignons (Pneumocystis jirovecii)
  • Détections des amibes pathogènes (Naegleria/Acanthamoeba)
35
Q

Qu’observons-nous quand un test de calcofluor est positif ?

A

Éléments fongiques blanc, bleuté à verdâtre fluorescents sur fond noirâtre

36
Q

Qu’est-ce qui nous retient de l’utiliser davantage ?

A

Coloration non spécifique, risque de faux positifs avec éléments tissulaires (collagène) ou de l’environnement (fibres de coton)

37
Q

Quand utilisons-nous un TAAN ? (test de détection rapide d’antigène)

INDICE : Autre que la COVID-19 ;)

A
  • Détection rapide des strep bêta-hémolytique du groupe A dans les gorges
  • Détection de cryptococcus neoformans (levure pathogène) dans le sang ou dans les LCR
38
Q

Sur quoi se base le principe du test PCR ?

A

Utilisation d’amorces et amplification d’une partie du génome de l’agent microbien à identifier (plusieurs copies)

Détection de la portion du génome amplifié

39
Q

Vrai ou faux : Le secteur diagnostique est en constant développement.

A

Vrai.

  • Sensibilité/spécificité usuellement élevés
  • Rapidité/automatisation du processus
  • Monoplex/multiplex
40
Q

Nomme deux exemples où on utilise le PCR.

A
  • Détection VHS (Herpès simplex)
  • Détection COVID-19
41
Q

Quelles sont les limitations d’utilisation du PCR ?

A

Le coût et l’accessibilité de l’appareil.

42
Q

À quoi sert la sérologie ?

A

Mettre en évidence des preuves indirectes de la présence d’un agent infectieux via la détection d’anticorps spécifiques contre un agent infectieux, usuellement dans le sérum (d’où le mot sérologie)

43
Q

Vrai ou faux : L’utilité la plus fréquente de la sérologie survient pour les virus.

A

Partiellement vrai.

(Mets-toi au moins vert pour cette question si tu as répondu vrai parce que tu as eu raison ou si tu as répondu faux parce que tu considérais que l’énoncé était incomplet.)

La sérologie permet également de détecter les infections parasitaires.

44
Q

Nomme quelques exemples de virus détectés en sérologie

A
  • Hépatites A, B et C
  • VIH
  • Rubéole
  • Toxoplasmose
  • EBV (Epstein-Barr Virus, vu en mononucléose notamment)
  • CMV (cytomégalovirus)
45
Q

Quelles sont les caractéristiques d’une apparition d’IgM en sérologie ?

A
  • Apparition en phase aiguë de la maladie
  • Spécificité parfois moindre que l’IgG
  • Nécessite un seul sérum pour le diagnostic

Utile au diagnostic de l’infection aiguë si la technologie est performante pour le germe recherché.

46
Q

Quelles sont les caractéristiques d’une apparition en IgG en sérologie ?

Encore désolée de cette méga flashcard…

A
  • Apparition en phase de convalescence de la maladie (infection récente mais pas nécessairement aiguë, donc pas nécessairement active)
  • Spécificité élevée
  • Nécessite 2 sérums pour le diagnostic
  • Notion de séroconversion : 2 sérums analysés à 2-3 semaines d’intervalle montrent un titre qui passe de négatif à positif OU le titre augmente significativement de 4 dilutions et plus (plus petite la fraction est, plus fort le résultat positif est)
47
Q

Que signifie une notion d’anticorps IgG neutralisants ?

Donne un exemple d’un IgG neutralisant et d’un IgG non neutralisant.

A

Signifie une immunité à long terme.

Neutralisant : IgG pour le virus de l’hépatite A

Non neutralisant : IgG pour le virus de l’hépatite C (exposition sans immunité)