Dx laboratoire Flashcards
Quelles sont les trois étapes de cheminement diagnostique en microbiologie infectiologique ?
1) Phase pré-analytique
2) Phase analytique (avec survol des cultures)
3) Phase post-analytique
Que comprend la phase pré-analytique ?
1) Hypothèses diagnostiques
2) Prescription de prélèvements selon le cas présenté (examen direct, culture, détection antigénique/PCR, sérologie)
3) Prélèvements nécessitant la requête du prescripteur et identification double du spécimen pour le patient (acheminement au labo)
4) Réception des prélèvements au labo.
Vrai ou faux : Il est très important pour les cultures de connaître les germes recherchés de routine et ceux nécessitant une demande spéciale.
Vrai.
Que comprend la phase analytique avec survol des cultures ?
Désolée pour ce flashcard, c’est du gros par coeur pas le fun :/
- Selon le protocole, examen direct sur le prélèvement
- Pour les cultures bactériennes courantes : étapes progressives et successives (ensemencement/incubation - durée variable selon spécimen et pathogène*, isolement/épuration avec objectif de culture pure, lecture périodique aux 24h pour pathogènes usuels)
*48-72h pour urines
*recherche TB : 6 sems - Identification (aspect des colonies, hémolyse sur gélose sanguine (bêta = complète, alpha = partielle, aspect verdâtre), tests biochimiques rapides, aspect au gram des colonies (staph = coques en amas gram +, strep : coques en ligne gram +, entérobactéries = bâtonnets gram -))
SI NÉCESSAIRE :
- Analyse biochimique de l’isolat (plus répandu et moins cher = Vitek)
- Malditof (plus rapide mais beaucoup plus cher)
- Antibiogramme (souvent décidé par le labo)
- Notion de résultats critiques
- Rapports préliminaires selon les étapes analytiques
Que comprend la phase post-analytique ?
- Émission du rapport final (validé par microbiologiste infectiologue, importance de la VALIDITÉ DU RÉSULTAT et du DÉLAI DE RÉALISATION ANALYTIQUE)
- Interprétation finale du médecin prescripteur
VOIR EXEMPLE CONCRET D’UN CHEMINEMENT DIAGNOSTIQUE EN MICROBIOLOGIE (p.22 à 24)
Beaucoup plus simple comme ça…
Vrai ou faux : La coloration de gram est la plus utilisée pour l’examen microscopique des bactéries.
Vrai.
Explique la procédure de la coloration de Gram.
1) Coloration de gram pendant au moins 15 secondes (colore la cellule d’un violet-bleu).
COLORATION QU’ON VEUT RETENIR !
2) Lavage à l’eau, puis au lugol (iode) comme mordant pendant au moins 15 secondes.
3) Acétone/alcool (décoloration) pendant au moins 15 secondes.
4) Lavage à l’eau.
5) Contre-colorant, safranine (teint les microbes en rouge/rose si gram négatif) pendant au moins 15 secondes.
Quelles sont les limites du gram (sensibilité) ?
- Densité bactérienne du prélèvement (plus elle est dense, plus la sensibilité est accrue)
- Résolution optique (ex : treponema qui est invisible)
- La présence ou non d’une paroi bactérienne (ex : mycoplasma demeure invisible)
- Type de paroi bactérienne donnant un aspect fantôme aux bactéries (ex : mycobacterium qui demeure invisible)
Les bactéries visibles habituellement au gram peuvent notamment faire un phénomène de Gram variable. Qu’est-ce que cela implique ?
- Bactéries affectées par les conditions de cultures
- Bactéries exposées préalablement aux antibiotiques
- Bactéries peuvent se décolorer intrinsèquement (propriété)
Quelles sont les utilités du Gram ?
- Reconnaître rapidement les bactéries possiblement pathogènes (y compris les éléments fongiques parfois) dans le prélèvement et d’en informer le clinicien.
- Évaluer la présence ou l’absence de flore normale quand le prélèvement provient d’un site non stérile.
- Évaluer la réponse inflammatoire car les globules blancs sont colorés dans le processus.
- Quantifier de façon relative les polynucléaires vs les cellules mononucléées et aider à distinguer infection bactérienne et infection virale.
Sur quels types de spécimen peut être fait la coloration de Gram ?
- De routine, en urgence : LCR
- De routine, non urgent : expectorations
- Sur demande spéciale : Prélèvement urinaire.
Qu’en est-il des hémocultures ? Que se passe-t-il dans ce cas-là ?
Les prélèvements sont incubés : coloration de Gram effectuée UNIQUEMENT sur les bouteilles ciblées + par l’appareil.
- 90% des bouteilles qui seront positives le seront dans les premières 48h d’incubation.
Vrai ou faux : Un résultat positif à la coloration de Gram sur une hémoculture sera toujours jugé critique.
Vrai !
Le sang est supposé être stérile, donc si on y trouve une densité bactérienne intense (où coloration de Gram adhère/ou non), c’est un drapeau rouge.
À quel type de bactérie s’adresse les colorations d’acido-alcoolo-résistance ?
S’adressent aux bactéries dont la paroi est riche en acides mycoliques (acides gras à longues chaines)
- qui sont difficiles à colorer au Gram notamment
- où les bactéries résistent à une décoloration par un alcool acidifié (éthanol/HCL, dans le cas du Ziehl ou Kinyoun)
Nomme deux exemples de ces bactéries pouvant être colorées par les coloration d’acido-alcoolo-résistance ?
- Bacilles acido-alcoolo-résistants
- Mycobactéries (tuberculeuses et non tuberculeuses)
Quelle est la procédure de base d’une coloration d’acido-alcoolo-résistance ?
1) Lame colorée avec Carbol Fuschine
2) Décoloration avec alcool acidifié
3) Contre-coloration bleu de méthylène
4) Résultats + bactéries rouges (bâtonnets) sur fond bleuté
Quels sont deux exemples de coloration d’acido-alcoolo-résistance ?
- Ziehl-Neelson (coloration à chaud)
- Kinyoun (coloration à froid)
S’adresse à la rechercher des mycobactéries !!