deuxieme partie chapitre 3

Question 1

Quel est l’utilité du cycle d’azote et comment se produit la phase d’ammonification?

Answer 1

L’azote comme le carbonne est essentiel et très abondant dans l’atmosphère sous forme de N2, que nous ne pouvons pas assimiler, il se retrouve alors sous forme combiné dans les tissus biologique et matière organique dans les protéeine et acides nucléique.

l’azote emprisoné dans la matière organique est libéré par décomposition par des micro-organisme HÉTÉROTROPHE et produit du NH4+(libération d’ions d’ammonium).

lorsque décomposition de matière l’azote devient NH3 (minéralisation) en matière inorganique?

Question 2

comment se déroule la phase de nitrification, quels sont les intrants et extrans?

Answer 2

elle se déroule par l’oxydation des ions d’ammonium (NH4+ ou NH3) pour former du NO2-(nitrite), puis en nitrate(NO3-).
Elle est réalisé par des bactérie qui utilisent l’oxygène comme accepteur final d’éléctrons (chimioautotrophe), le nitrate formé redevient de la matière organique par la suite pour compléter le cycle de l’azote.
probleme: perte d’azote dans environnement.

Question 3

À quoi est du la perte d’azote dans le sol?

Answer 3

à la respiration anaérobie, il y a deux forme de respiration nitrate:
la dénitrification; réduction du nitrate en nitrite puis azote moléculaire (N2) ce qui se traduit en perte de nitrate hors du sol (azote est limitant), ceci se produit lorsqu’on ne retrouve plus d’oxygène dans le sol, l’azote sert alors d’accepteur d’éléctrons.
ammonification de l’azote: convertir nitrate en nitrite, puis en ammonium (NH4+) par des bactéries.

Question 4

Q:
Nitrosomonas europaea est une bactérie aérobie chimioautrotophe oxydant l’amonium (NH4+) pour obtenir l’énergie nécessaire à la fixation du gaz carbonique (CO2). Durant cette oxydation de l’amonium, la bactérie produit de l’ATP grace:

Answer 4

Au transfert de des électrons vers l’oxyène.

Question 5

Qu’est ce que la réaction anammox?

Answer 5

La réaction anammox favorise la formation anaérobie d’azote moléculaire(ou azote nitreux N2O) à partir d’ammoniaque(NH4+ ou NH3) et de nitrite(NO2-), donc sans qu’il soit nécessaire d’obtenir la formation de nitrate (NO3-) par oxydation, contribue à la perte d’azote dans l’environnement(soit réaction anammox ou dénitrification).

Question 6

Qu’est-ce que la nitrogénase?

(des variantes chez bactérie ex: MoFe, un cofacteur), mais plus au moins meme enzyme

Answer 6

Capacité de certaines bactéries et archaea de fixer azote atmosphérique (N2) par procéssus de réduction en ammoniac (NH4+)grâce à la nitrogénase, une enzyme. Besoin énergétique et besoin d’éléctrons.
particularité absence de O2, pcq sensible.
Réduit azote atmosphérique en azote moléculaire (amonium) dans le sol, utile pour les plantes.
ex: bactérie anaérobie stricte pouvant être fixateur d’azote.

Question 7

Comment se fait-il qu’il y a des bactéries fixatrices d’azote mais qui sont aérobie strice, alors qu’elles ont la nitrogénase qui est sensible à O2?

Answer 7

Elles ont une grosse membrane (Gram négative), O2 aussitot capté par chaine de transport, O2 ne se rend pas à nitrogénase qui se retrouve__.

Il y a également des exemple d’une protéine qui peut protéger nitrogénase en présence de O2.

Question 8

Expliquer le fonctionnement de la cyanobactérie fixatrice d’azote, celle qui détient un Hétérocyste.

Answer 8

De jour, les cellules végétatives fixes le CO2 produisant des sucres. Pendant le cycle de nuit, l’hétérocyste fixe le N2 à l’aide des sucres comme sources d’énéergie et d’éléctrons, elle produit alors de la glutamine, utilisé pour le cycle de jour.

Question 9

Q:

Les hétérocystes et les cellules végétatives des cyanobactérie fixatrices vivent-ils en symbiose?

Answer 9

non, PK? (deux organismes différents)

Question 10

Les eucaryotes peuvent-il fixer de l’azote?

Answer 10

Non, seulement par symbiose, les cellues eucaryotes n’ont pas de nitrogénase.

Question 11

rhizobium (bactérie fixatrice d’azote symbiotique) elles fixent que lorsqu’il sont fixé en symbiose.

Answer 11

il existe des bactérie fixatrice libre qui peuvent fixer de façon libre: elles peuvent fixer l’azote de façon libre, sans être associé, ils peuvent être hétérotrauphe ou autotrophe, ils fournissent les éléctrons sous forme de NADH.
Bactéroide: fixateurs symbiotiques de l’azote lorsque internalisé dans cellule. leur source de carbone provient de leur association symbiotique.

Question 12

la nitrogénase est un exemple de regularisation d’expression genetique.

Answer 12

gene de la nitrogenase n’est pas actif des fois, exemple capable de fixer azote que lorsque internalisé.

Question 13

plasmide peut être transmit d’une bactérie à une autres

Answer 13

fact (particularité qui peut se retrouver chez plusieurs bactérie par la suite)

Question 14

Ou se produit l’association auprès des légumineuse?

Answer 14

Au niveau de la racine des légumineuse ou vont se développer des poils absorbant (servant à capter les éléments nutritif)c’est au niveau niveau de ces poils que va se produire l’association des bactéries.

Question 15

Comment se produit l’association entre plante et bactérie?plante produit substances, flavonoide, genre de messager qui vont indiquer au bactéries qu’une racine proche est entrin de se developper

Answer 15

La plante va produire des flavonoide (chaque plante à des flavonoide particuler, meme chose pour des bactéries qui peuvent reconnaitres ou non plusieurs flavonoide) qui servent de messanger pour indiquer aux bactéries avoisinante qu’une racine est entrin de se développer. La bactérie par la suite va produire FACTEUR NOD (dialogue moléculaire) (plante cogne à la porte de la bactérie, en reponse on ouvre la porte et parler,communiquer selon resultat de l’échange).
bactérie doit reconnaitre flavonoide, plante doit reconnaitre facteur nod et l’ondulation va s’ensuivre.

Question 16

Q:

La détection des flavonoide de légumineuse par les rhizobiums correspond-elle à une détection du quorum?

Answer 16

non, car les flavonoide sont produit par la plante, tandis que la détection du quorum l’auto-inducteur est produit par la bactérie elle-même.

Question 17

Comment la plante absorbe-t’elle la bactérie?

Answer 17

Poils absorbant produit courbure et capture bactérie, plante accueille bactérie, la bactérie se divise bcp plus vite que la plante. l’hote bactérien n’est pas envahisant, mutualisme, la bactérie va s’ajuster à son hote. la bactérie va rester dans le cordon d’infection pour contenir leur progression.courbubure du poils absorbant (mince couche de cellulose, pour faciliter absorbtion de l’eau)

Question 18

c’est quoi le primordium nodulaire?

Answer 18

début du cordon

Question 19

c’est quoi le cortex racinaire?

Answer 19

siege de la bactérie au sein de la plante.

Question 20

bactérie entre dans plante sous quelle forme?

Answer 20

Entre que dans vesicule endocytique que bactérie avec condition propice à la multiplication (carbonne de photosynthèse)

Question 21

c’est quoi un rhizobium?

Answer 21

bactéries hétérotrophes aérobies

capables de fixer l’azote en association avec les racines des légumineuses.

Question 22

c’est quoi bactéroide?

Answer 22

bactérie internalisé devenu fixatrice d’azote.

Question 23

nitrogénase

Answer 23

ne doit pas être en contact avec de l’oxygène, alors comment bactérie fait? surtout si bactérie est en symbiose avec plante, les bactéroide sont souvent alors microaérobie.

Question 24

leghémoglobine role?

Answer 24

capter O2 de facon controlé, permet respiration sans activer nitrogénase.

Question 25

Qu’est-ce une membrane semi-permeable?

Answer 25

souvent permet mouvement d’eau (ou solvant) à travers la membrane pour équilibrer concentration de sucre.

Question 26

Pourquoi dit-on que la cellule est un système fermé?

Answer 26

Il y a d’avantage de sucre à l’interieur de la cellule que exterieur.

Question 27

expliquer pression osmotique?

Answer 27

ex: eau pure veut entrer dans cellule, effet de piston pour empecher cellule de faire entrer eau, la paroi cellulaire qui contient peptidoglycane, se produit souvent dans un milieu hypotonique puisque l’eau veut entrer dans bactérie.

Question 28

c’est quoi un milieu hypotonique?

Answer 28

bcp plus d’eau que de soluté dans le milieu.

Question 29

Quelle sorte de bactérie va avoir de la difficulté avec les changements de pression? bactérie gram - vont avoir bcp de difficulté avec pression, remedier avec eau salé pour empecher choc osmotique en laboratoire

Answer 29

Les bactérie gram negative vont avoir beaucoup de difficulté avec le chanegement de pression en raison de leur petite couche peptidoglycane, c’est la raison pour laquelle nous travaillons avec de l’eau salé (physiologique) en laboratoire, pour tenter de recréer un milieu avec la même concentration que ces bactéries.

Question 30

milieu hypertonique

Answer 30

milieu riche en sucre, plus que le cytoplasme de bactérie. l’eau de la bactérie veut sortir de la bactérie.

Question 31

c’est quoi plasmolyse?

Answer 31

Lorsqu’il y a un milieu hypertonique (milieu riche en sucre) l’eau va chercher à quitter la bactérie, elle est alors en plasmolyse, elle meurt. État de hypertonicité, le cytoplasme se rétracte

Question 32

c’est quoi la turgescence?

Answer 32

en milieu hypotonique (milieux moins riches en sucre qu’en soluté), l’eau cherche à entrer dans bactérie la faisant gonfler, elle risque alors d’exploser.

Question 33

Comment les bactéries peuvent remédier au problème de milieu hypotonique et hypertonique?

Answer 33

À l’aide de soluté compatible (sachet de poudre brune, trehalose, levure actives). l’osmorégulation est le processus d’ajustement de solution interne. C’est des substance organique soluble dans l’eau, qui peut être dans le cytoplasme sans nuire à la cellule sans nuire au metabolisme de la bactérie. (bien comprendre son role): pouvoir s’accumuler dans la cellule lorsque celle risque d’etre en plasmolyse, ou disparaitre, mais doivent rester dans cellule, mais pas par diffusion passive. (fabriqué par bactérie) et est présent dans le CYTOPLASME.

Question 34

Q:

Les solutés compatibles peuvent-ils traverser facilement la membrane cytoplasmique par diffusion passive?

Answer 34

non, ces solutés doivent pouvoir demeurer dans la cellule pour equilibrer les concentrations des compartiments extracellulaire et intracellulaire

Question 35

halophile (halo, sel/ phile, aimer)

Answer 35

bactéries qui aiment le sel.

Question 36

liens entre bactérie halophyle et phénomène de plasmolyse? contrer avec soluté compatible?

Answer 36

il y a le cas des halophyles extrêmes, ils accumulent une très grande quantité d’ions de potassium à l’intérieur de la cellule, souvent ces archaea ou bactéries leur structures de la paroi cellulaire est différentes et se dissous si la concentration en sel n’est pas assez haute.

Question 37

prototrophe? facteur de croissance

Answer 37

…

Question 38

auxotrophe?facteur de croissance

Answer 38

…

Question 39

endosymbiotique obligatoire? facteur de croissance

Answer 39

…

Question 40

facteur de croissance, la temperature?

Answer 40

influence la vitesse de croissance des bactéries. si trop chaud, détruit liaison, dénaturer. (temperature maximale, ou la croissance est inhiber), si milieu trop froid, membrane figé, inactivé, métabolisme arrete.

Question 41

meso (milieu,genre moyen, nichaud ni froid)

Answer 41

…

Question 42

psychro = froid

Answer 42

…

Question 43

Cause de chaleur dans compost?

Answer 43

activité microbienne, perte d’énergie sous forme de chaleur.

Question 44

compostage aerobie mieux que anaerobie

Answer 44

…

Question 45

Q:
Pendant le compostage, les bactéries peuvent créer des conditions anaérobie. Quel métabolisme bactérien est-il responsable de la consommation d’oxygène pendant le compostage?

Answer 45

La respiration aérobie.

Question 46

Q:
Trois mecanisme sont responsable des pertes d’azote pendant le compostage, soit la volatilisation de l’amoniaque (NH3), la lixiciation de l’azote soluble, et:

Answer 46

la respiration nitrate (perte d’azote dans l’environnement).

Question 47

dénitrification

Answer 47

perte de CO2 et d’azote dans environnement

Question 48

milieux extremes

Answer 48

organisme extremophile, souvent peu de micro org qui peuvent se multiplier (petite diversité )

Question 49

tolérence au chaud du à quoi? membrane cytoplasmique a tendence a “fondre” mais chez procaryotes certaines particularité qui permet de resister. durée de vie plus courtes des arn chez procayotes

Answer 49

La tendence à résister au chaud est différente chez les procaryotes que les eucaryotes, dans les deux cas le problème réside dans la membrane cytoplasmique qui à tendence à “fondre”. mais chez les procaryotes ils investissent moins d’énergie pour créer des arn à courte vie, donc une dépense énergétique moins grande qui leur permet de survivre, alors que chez les eucaryotes; cette dépense est plus grande et mènent à leur perte. Tolérence au froid pareil pour eucaryote et procaryote.

Question 50

alcalins (ph 14) tres acide (ph 0)

Answer 50

bactérie autant que eucaryote sont capable de bien supporter milieux alcalin (importer des protons), pas dans milieux acide, bactérie preferent neamoins milieux neutres.

Question 51

fission binaire chez bactérie

Answer 51

cellule mère qui va double de volume, puis formation d’une paroi cellulaire transversale pour donner naissance à 2 cellules filles, qui devient par la suite cellule mère.

Question 52

croissance bactérienne

Answer 52

multiplication d’individu.

Question 53

équipartition

Answer 53

partition equitable de matiere génétique (ribosomes) et plasmides

Question 54

bactérie détient chromosome dans nucléoide

Answer 54

réplication de chromosome lors de réplication, chaque cellule fille doit hériter du chromosome (ségréation des chromosome)

Question 55

association de l’origine à la membrane?

Answer 55

action du cytosquelette? proteine de celui-ci

Question 56

Comment la cellule fait pour localiser le centre lors de la division de la paroi cellulaire transversale?

Answer 56

proteine du cytosquelette qui se repartissent aux poles, la ou faible concentration est ce qui détermine le centre, proteine du cytosquelette qui se fait au centre sous forme d’anneau FtsZ.

Question 57

le temps de génération

Answer 57

temps pour se diviser, doublement de la cellule, cycle cellulaire, plus temps de génération court, plus la croissance bactérienne est rapide.

Question 58

bourgeonnement

Answer 58

…

Question 59

constriction

Answer 59

…

Question 60

par tri??

Answer 60

…

Question 61

longitudinale?

Answer 61

…

Question 62

fission multiple

Answer 62

forme baeocyte, par fragmentation??

Question 63

définir état de latence?

Answer 63

lors de la courbe, il s’agit d’une période ou les bactéries sont inactive, mais pas dormante, elles ne se divisent pas encore.
(dormait,se reveiller, redevienne active, ne se divise pas encore)

Question 64

Définir croissance exponentielle?

Answer 64

periode pendant laquelle bactérie en fission binaire, selon fonction exponentielle

Question 65

Expliquer ce que survient lors de la phase stationnaire?

Answer 65

milieux devient impropre à la croissance, la multiplication s’arrete, pour bcp de raison; respiration aérobie et il manque d’oxygène, manque source d’azote et non par dechet…dans le cas de fermentation produit alors dechet toxique pour bactérie (exemple de levure).

Question 66

expliquer ce qui se produit lors de la phase de déclin?

Answer 66

milieux devient trop pauvre, à un point ou elles peuvent pas survivre dans le milieux qu’elles ont eu meme dégradé.

Question 67

Q:
On place une bactérie dans un milieux de culture qui permet la croissance, et on divise ensuite la suspension en deux moitiés contenant chacune un nombre égal de cellule…

Answer 67

autant de cellule dans la suspension A que B.

Question 68

Est-ce toutes les bactéries qui peuvent produirent des endospores? C’est quoi une endospore?

Answer 68

structure de dormance, lorsque milieux n’est plus favorables, puis produit cellule vegetative lorsque favorable, endospore se produit en l’interieur de la cellule. Pas toutes les bactéries peuvent produire des endospores.

Question 69

bactérie endosporulante 2 mode:

Answer 69

CROISSANCE VÉGÉTATIVE, puis limité, au lieux d’entrer en phase stationnaire, elle entre en endosporulation. Résultat est une spore, qui peu percister pendant bcp bcp de temps, puis GERMINATION (produire cellule vegetative qui va reprendre croissance).

Question 70

propriété de l’endospore?

comment est-elle produite?

Answer 70

grand compartiment (cellule mere) produit endospore. on y retrouve nucleoide, ribosome, chaine de transport d'electron (si fait respiration), paroi cellulaire,, mais aucun metabolisme actif, inerte,  mais toute les propriété de la cellule présente dans endospore.
propriété: par dessus paroi cellulaire des couches protectrice, dont le cortex de peptidoglycane amélioré, comprime endospore, le cortex va expulser l'eau du cytoplasme, cytoplasme desecher et bactérie ont besoin d'eau pour fonctionner.
la resistance/dormante; resistance au traitement thermique,coaguler proteine, chauffer en présence d'eau est mieux que en absence d'eau (oxidation) puisque pu de présence d'eau. resistance pcq pu d'eau, le cytoplasme est sec.
par dessus cortex il y a tunique, couche de proteine impermeable, resiste à l'éthanol (qui coagule cellule vegetative) puisque tunique protege.

Question 71

cellule sporulante

Answer 71

exemple de differenciation cellulaire

Question 72

Ou se trouve le nucléoide dans l’endospore?

Answer 72

il est lateral, il n’est pas central dans l’endospore

Question 73

exosporium joue quel role?

Answer 73

…

Question 74

cycle de sporulation

Answer 74

division polaire, formation du nucleoide axial

Question 75

C’est quoi l’engoufrement

Answer 75

phénomène pour former endospore: paroi flexible, il y a une poussé du grand compartiment pour l’engoufrer, forme une cellule à l’interieur. bordée de 2 membrane cytoplasmique. puis formation des autres paroi.

Question 76

C’est quoi l’étape de lyse?

Answer 76

premiere etape de germination, dissoudre couches de l’endospore avec lyze, protease, et introduire eau. tunique rompue

Question 77

clostridium vs bacillus

Answer 77

aerobie ou anaerobie strice?

Question 78

fonction du cristal (aussi appelé corps parasporal)?

Answer 78

cristal proteique qui se trouve à etre produit en meme temps que l’endospore, il est toxique pour certains insectes. sert à dissoudre epithelium, traverse paroi intestinal et infecte corps d’insectes.

Question 79

expliquer l’origine diderme (présence de 2 membranes chez bactéries).

Answer 79

cellule endosporulante, ayant acquis 2 membranes cytoplasmiques.