Descendencia con modificación y filogenias Flashcards
cuál fue el gran planteamineto del “origen de las especies de Darwin”
los organismos que viven en la actualidad descienden de un ancestro en común
cuáles son los 2 ámbitos en los que se relacionan los seres vivos al tener un mismo ancestro
- diversidad de los seres vivos por la modificación de las estructuras de los ancestros
- unicidad de los individuos al compartir el mismo ancestro
qué es la taxonomía
es el estudio de las relaciones entre grupos de organismos (con un ancestro en común)
qué es la filogenética
es un método de clasificación taxonómica basado en la historia evolutiva (a diferencia de la taxonomía, ahora se relacionan los individuos considerando el ancestro en común)
qué es la filogenia
representación gráfica de las relaciones de afinidad genética entre las taxas de individuos respecto a un ancestro en común
qué requerimientos se deben considerar para la construcción de filogenias
- definir carácteres discretos (presencia-ausencia) o continuos
- los individuos deben compartir dichos caracteres por transmisión desde un ancestro en común
cuáles son las posibles fuentes de carácteres para la construcción de filogenias
a) rasgos morfológicos: huesos, partes de flores, miembros, etc
b) rasgos moleculares: DNA, RNA, proteínas
(rasgos heredables, estables, inambiguos e inequivocos)
qué es la homología de carácteres
comparación de estructiras con un origen común, aunque tengan diferencias importantes en su forma final y funcionalidad, tienen características comunes y se relacionan con un origen en común
carácteres homólogos primitivos o ancestrales
son compartidos por todos los miembros en estudio que se desea comparar
carácteres homólogos derivados
son distintos al ancestro común más lejano, pero compartidos por un ancestro más cercano (sinapomorfías)
sinapomorfías
carácteres derivados compartidos
simplesiomorfías
carácteres derivados de un ancestro común más remoto que el ancestro común más cercano
autopomorfías
carácteres derivados propios
qué es la homoplasia
carácteres similares que no derivan del mismo carácter ancestral (similitudes no vienen de la homología)
ej: alas de murciélago y de ave sirven para volar, pero surgen de organismos distintos
qué son los carácteres análogos
son carácteres con igual función, aparentemente similares, pero con distintos ancestros (se explica por convergencia evolutiva, un caso particular de homoplasia)
qué representa la raíz en un árbol filogenético
es la separación entre un grupo externo y el resto de la filogenia (el árbol se polariza por mayor longitud de una rama)
¿para qué se realiza un análisis filogenético?
- determinar la historia evolutiva de un gen o especie
- caracterizar ancestros
- estimar el tiempo de divergencia entre 2 organismos desde el último ancestro compartido
- caracterizar familias génicas y protéicas
cómo se hace el alineamiento de secuencias
- establecer posiciones homólogas entre las secuencias
- se debe asegurar que se están alineando correctamente
qué nomenclatura se utiliza en el alineamiento de secuencias
- cuando las bases son iguales se ponen puntos
- en las regiones discordantes se pone la letra de otro color
cómo se pueden comparar organismos rxtremadamente distales en el alineamiento de secuencias
se comparan con genes altamente conservados
qué es un estado de carácteres distintos
es donde había una posición de carácter original del ancestro en común desde el cual han variado hacia distintas variables (bases)
cuál es el método de neighbor joining
a partir de un alineamineto se utiliza método de distancia (mínima evolución o NJ), genera valor de distancia a partir de la diferencia nucleotídica
qué muestra una matriz elaborada por el método de NJ
muestra qué tan cercanos o lejanos son los pares de secuencias comparadas (en porcentaje)
método de máxima parsimonia
- se crean múltiples árboles filogenéticos
- se determina cuántos pasos se requieren para llegar a cada árbol
- el árbol elegido corresponde al cual requiere de menos pasos
cuáles son los tipos de VIH
- HIV-1 es el principal en el mundo, uera de África
- VIH-2está principalmente dentro de África
qué establece la primera filogenia realizada para VIH-1 y 2
- HIV-1 está más relacionado con el SIV del chimpancé
- la filogenia sugiere más de un evento de transmisión entre hjumano-chimpancé
- HIV-2 está relacionado filogenéticamente de forma más estrecha con SIV de monos del viejo mundo
- la filogenia sugiere más de un evento de transmisión entre humanos y monos del viejo mundo
qué establece la segunda filogenia realizada para VIH-1
- VIH aparece 3 veces al interior de distintas ramas de SIV
- no hay claridad sobre las cepas O y P
- las cepas de los grupos N y M se relacionan directamente con el SIV del chimpancé
cómo se determinó la fecha de origen del sida
a partir de la cepa M se construyó una filogenia y se determinó un ancestro en común de ñas distintas variantes, se tomó la secuencia del ancestro en común y la compararon con la secuencia de todos los virus de la filogenia que demostró que las muestras de los 80s eran más similares a la muestra de los 90s, y a partir de esto se trazó una tendencia para determinar la fecha de aparición
