Cours 9 (Traduction) Flashcards
Qu’est-ce que la traduction?
Synthèse des protéines par les ribosomes à partir de l’information génétique contenue dans les ARNm
Quelles sont les molécules impliquées dans la traduction?
ARNt
Aminoacyl-ARNt synthétase
Ribosomes
Polyribosomes ou polysome
Qu’est-ce qu’un codon?
3 acides nucléiques qui codent pour 1 acide aminé
Comment s’effectue la lecture des codons?
a) 3’ vers 5’
b) 5’ vers 3’
c) Peu importe
b) 5’ vers 3’
Est-ce que le code génétique est universel? Qu’est-ce que cela apporte comme conséquence?
Oui
C’est la preuve de l’existence d’un ancêtre commun ayant existé il y a 2 milliards d’années, soit 1 milliard d’année après l’apparition de la vie sur terre
V/F : Le code génétique mitochondrial est similaire au code génétique nucléaire
Faux (différent)
Toute séquence nucléotidique peut être lue selon _______________ de lecture distincts qui résultent en des _______________ totalement __________________
3 cadres
traductions
différentes
Qu’est-ce qu’un code génétique dégénéré?
Plusieurs codons pour un même acide aminé Diminue l’impact des mutations
Qu’est-ce qu’un code redondant?
Plusieurs combinaisons pour un même acides aminés
Exemple : leucine = 6 combinaisons
Quels sont les 3 codons qui ne codent pas pour un acide aminé (codon STOP)?
UAA
UAG
UGA
Quel est le codon d’initiation?
AUG (Met)
Que fait l’ARNt?
C’est un intermédiaire clé dans la traduction et dans la lecture dans la lecture du code génétique → ils apportent les aa aux ribosomes
De quoi un ARNt est-il composé?
75-95 nucléotides
Lobe D et T
Tige acceptrice
Tige-boucle de l’anticodon
Que portent les lobes D et T?
Des ribonucléotides modifiées
Que fait la tige acceptrice?
Sur laquelle l’aa correspondant est estérifié
Que fait la tige-boucle de l’anticodon?
Reconnait et s’associe aux codons de l’ARNm
Quelle est la forme de la structure secondaire de l’ARNt?
Feuille de trèfle
Décris-moi la structure tertiaire de l’ARNt
Bras T s’empile sur le bras accepteur
Bras anticodon s’empile sur le bras D
Interactions entre les acides nucléiques modifiés
Que font les acides nucléiques modifiés?
Participent à la stabilisation de la structure
Dans la boucle anticodon, interviennent directement dans la liaison avec l’ARN
Une centaine de type de nucléotides modifiés ont été décrits dans ARNt chez différentes espèces
Dans la structure tertiaire de l’ARNt, l’extrémité 3’ comporte ___________________________ et se termine toujours par ______
4 nucléotides non appariés
CCA
Qu’est-ce que l’hypothèse des bases flottantes (Wobble)? Ça implique quoi?
C’est une interaction enre le 1er nucléotide de l’anticodon et le 3e nucléotide du codon qui est souvent un appariement non-canonique appelé paire wobble (ou bancale ou flottante)
Implique un nucléotide modifié
Quels sont les avantages des bases flottantes?
Nos cellules n’ont qu’un nombre limité d’ARNt et les bases flottantes permettent de réduire le nombre d’ARNt nécessaire à la traduction du code génétique en autorisant la lecture de différents codons synonymes par un seul et même ARNt
La stabilité des paires de bases flottantes est comparable à celle des paires de bases Watson-Crick
Ces paires favorisent une dissociation plus rapide des ARNt des ARNm, donc augmente la vitesse de la synthèse protéique
L’existence de ces bases minimise le dommage qui pourrait être causé par une mauvaise lecture du code génétique
Pour pouvoir utiliser l’ARNt dans la traduction, il faut charger celui-ci de quoi? Quelles enzymes peuvent effectuer cette réaction?
D’un acide aminé → aminoacyl-ARNt
aminoacyl-ARNt synthétases
V/F : Même s’il existe 6 codons pour la Ser et 6 ARNt isoaccepteurs, il ne faudra qu’une seule seryl-ARNt syntétase
Vrai (donc seulement 20 aminoacyl-ARNt synthétases)
Qu’est-ce que l’aminoacyl-ARNt synthétase catalyse?
L’addition d’un acide aminé à la molécule d’ARNt
Quelles sont les deux spécificités de l’enzyme aminoacyl-ARNt synthétase?
Reconnait spécifiquement un acide aminé (1 seul)
Reconnait spécifiquement l’ARNt non chargé correspondant (1 ou plusieurs ARNt)
Quelles sont les étapes de l’aminoacyl-ARNt synthétase?
1re étape : Activation de l’acide aminé
2e étape : Formation de l’aminoacyl-ARNt synthétase
Que se passe-t-il lors de la 1re étape de l’aminoacyl-ARNt synthétase?
Activation de l’acide aminé
Attaque nucléophile de l’acide aminé sur une molécule d’ATP. L’oxygène de cet acide aminé brisera le lien entre le premier et le second des trois phosphates de l’ATP
Formation d’un lien anhydride, entre l’acide aminé et l’AMP (adénosine monophosphate)
Que se passe-t-il lors de la 2e étape de l’aminoacyl-ARNt synthétase?
Formation de l’aminoacyl-ARNt
Catalyse du transfert de l’acide aminé activé sur le 3’-OH du ribose terminal de l’ARNt
En utilisant l’énergie contenue dans l’aminoacyl-adénylate, l’extrémité -OH de l’ARN de transfert effectue une attaque nucléophile sur l’acide aminé
Création d’un lien ester qui est encore riche en énergie
Quelle est la formule de la formation de l’aminoacyl-ARNt synthétase?
AA + ATP + ARNt → aminoacyl-ARNt + AMP + 2 Pi
Chaque ARNt doit absolument être chargé par ________________ qui lui _________________. Si le mauvais aa est chargé, il sera incorporé dans la ____________________________. Le ribosome ne contrôle pas la qualité des ________________ et n’est pas capable de détecter un ___________________________
l’acide aminé
correspond
synthèse protéique
aminoacyl-ARNt
ARNt porteur du mauvais a.a
La spécificité repose sur une reconnaissance par les __________________ de certaines ______________________ structurales des _________ correspondants
synthétases
structurales
ARNt
Que fait l’aminoacyl-ARNt synthétase si un mauvais acide aminé interagit?
L’aminoacyl-ARNt synthétase est capable de détecter l’erreur et de remplacer le mauvais acide aminé par le bon
La deuxième étape de la réaction de chargement n’aura pas lieu, il y aura une hydrolyse de la liaison ester de l’aminoacyl-ARNt
Le ribosome est un vaste _____________ constitué de ____________ et _____________
complexe
protéines
d’ARN
Quel est le rôle des ribosomes?
Effectuer la biosynthèse des protéines à partir de l’information génétique contenue dans l’ARNm (processus de la traduction)
Les ribosomes sont également composés d’une petite et d’une grande _______________
sous-unité
En fonction de quoi les ribosomes et leurs sous-unités sont-ils désignés?
En fonction de leur vitesse de sédimentation (unité de mesure : Sveldberg (S))
V/F : Les ribosomes procaryotes et eucaryotes ont une forme voisine et une composition chimique similaire
Faux (différente)
Aussi bien chez les procaryotes que chez les eucaryotes, il existe plusieurs gènes codant pour des ARNr. Qu’est-ce que cela permet-il?
Cela permet la production d’une grande quantité de ribosomes
VOIR DIAPO 17
VAS-YYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYY
Au moment de la synthèse d’une protéine, les ribosomes sont habituellement associés en…
chaînes de 10 ou plus appelé polyribosome ou polysome
V/F : Chaque ARNm peut être traduit plusieurs fois
Vrai (amplification de l’information génétique)
Pourquoi les ribosomes sont de très grosses molécules?
Puisqu’elles doivent aligner trois autres molécules:
ARNm
2 aminoacyl-ARNt
Le ribosome peut exister sous forme _____________ ou ______________ en fonction du moment de la ___________
dissociée
associée
traduction
La petite sous-unité intervient dans quelle étape?
Initiation
Le complexe ________________________________ mobilise la __________________ pour former un ___________________
petite sous-unité-ARNm-ARNt initiateur
grande sous-unité
ribosome complet
Les 2 sous-unités se _____________ à la fin de la traduction
dissocient
Il y a 3 sites différents au niveau du ribosome. Lesquels? Que fait chacun d’entre eux? Où sont-ils situé?
Site E : Site de sortie de l’ARNt déchargé de son a.a
Site P : Site pour peptidyl-ARNt
Site A : Site pour ARNt porteur de l’a.a activé
Situés à l’interface des deux sous-unités
Quelles sont les étapes de la traduction? En quoi consistent-elles?
Initiations : Assemblage du complexe de la traduction autour du premier codon
Élongation : Synthèse protéique de N-terminale vers C-terminale
Terminaison : Dislocation du complexe de la traduction
Où le complexe d’initiation se forme-t-il?
Qu’au niveau du codon d’initiation
V/F : Il existe 2 types d’ARNt Met
Vrai (un pour l’initiation de la traduction et un reconnaissant un codon Met à l’intérieur d’une chaîne)
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