Cours 9 : Le transport à travers deux membranes

Question 1

Quels sont les problèmes lors du transports à travers la membrane des mitochondries et des chloroplastes

Answer 1

• Possède deux membrane
• Pas de pores suffisamment grand ( pour faire passer des
  protéines complètes dans le forme tridimensionnelle (structure tertiaire) )

Question 2

Comment doit on garder les protéines pour entre dans la membrane ( TOM )

Answer 2

• Garder dans leur structure primaire ( ou hélice alpha )
• Dérouler les protéine en structure primaire

Question 3

Qu’a t’on besoin pour dénaturer une protéine

Answer 3

Une étiquette
Un récepteur ( plrs )
L’énergie

Question 4

Quel est un des signaux les plus communs dans une mitochondrie

Answer 4

Une série d’acides aminés située en N-terminal du précurseur (future protéine mitochondriale) formant une hélice α amphiphile avec une moitié hydrophobe et une autre moitié chargée positivement

Question 5

La partie hydrophobe du signal chez les mitochondries est reconnu par quoi

Answer 5

Une récepteur situé sur la membrane externe

Question 6

Les récepteurs et les deux translocateurs des mitochondries opèrent ensemble sous quels complexes

Answer 6

TOM (membrane externe) et TIM (membrane interne)

Question 7

Donnez les étapes du chemin des protéines du récepteur jusqu’à l’entrée dans la mitochondrie

Answer 7

1) Le récepteur fait partie de TOM et passe le
peptide signal au translocateur (TOM40).

2) Les protéines entrent lorsque les chaperonnes
Hsp70 cytosoliques, qui conservaient les
protéines dépliées, hydrolysent l’ATP (énergie)
et se dissocient.

3) Dans l’espace intermembranaire, TOM transfert
le signal à TIM, qui fait passer les protéines dans
la matrice (avec l’aide des chaperonnes
mitochondriales, Hsp70).

4) Le signal est coupé (ne fait pas partie de la
protéine finale).

Question 8

Qu’est ce qui défini où vont passer les mitochondries après être passé par TOM

Answer 8

Dépends des signaux internes

Question 9

Nomme les chemin possible après avoir passé par TOM

Answer 9

=> DIAPO 7 trop imp.

Question 10

Donné un exemple du chemin que prends les protéines destinées à la membrane externe de la mitochondrie

Answer 10

• Précurseur traduit dans le cytoplasme.
• Passe par le complexe TOM.
• Chaperonnes dans l’espace intermembranaire.
• Insertion dans la membrane grâce à SAM et au signal interne
  (hydrophobe)

Question 11

Expliqué comment sont dégradé les signal

Answer 11

• le peptide signal (hélice α en N-terminal) est coupé par des peptidases après
  l’incorporation de la protéine à l’endroit désiré.
• S’il existe des signaux internes, ces derniers ne sont pas coupés

Question 12

Donnez les deux manière qu’une protéine peut être apportés au TOM

Answer 12

• Hsp70 cytosolique
• Autres moyens sans aide de chapperonnes

Question 13

Donne un exemple de protéine apportés sans aide de chaperonnes

Answer 13

l’hélice-α amphiphile (préséquence) est reconnue
par les sous-unités TOM20-22.

Question 14

La chaperonne hsp70 est reconnu par quoi

Answer 14

TOM70 ( hélice alpha est pas là )

Question 15

Est ce que l’incorporation membranaire à besoin d’énergie

Answer 15

oui, processus moins bien connu, probablement potentiel membranaire ou CTE

Question 16

Données la différence entre l’incorporation dans les mitochondrie et les chloroplaste

Answer 16

C’est le même principes mais protéines différentes

Question 17

Quelle sont les protéines principales de la membrane des chloroplastes

Answer 17

complexes de translocation TOC (membrane externe) et TIC (membrane
interne).

Question 18

Quel est la particularité avec les membrane du chloroplaste , que faut il pour y remédier.

Answer 18

Dans le chloroplaste, il y a une
membrane supplémentaire (la 3e, celle des thylakoïdes). Il faut donc un signal supplémentaire pour entrer dans ce troisième compartiment.

Question 19

Lorsqu’un échantillon de RE est centrifugé dans un gradient de densité il se sépare en quoi

Answer 19

le REL (lisse) et le RER (rugueux, granuleux).

Question 20

Quel méthodologie on utilise pour séparer les types de RE

Answer 20

Sédimentation en accélérée

Question 21

Quels sont les rôles du REL et RER

Answer 21

o Le REL s’occupe de la synthèse des lipides (production des membranes)
o Le RER s’occupe des protéines principalement destinées à la sécrétion (ou dans la voie de sécrétion)
=> Diapo 13

Question 22

Où se situe l’acyl-transférase

Answer 22

L’enzyme est située dans la membrane du REL, mais son site actif se retrouve dans le cytoplasme.

Question 23

Quel est le rôle de l’acyl-transférase

Answer 23

Elle construit les phospholipides à partir de deux acides gras et d’un glycérol phosphaté

Question 24

Que se passe t,il avec les nouveaux phospholipides suite à leur production

Answer 24

Les
nouveaux phospholipides s’ajoutent au feuillet externe de la membrane du REL.

Question 25

Quelles enzyme égalisent les 2 couches membranaire après qu'il s'ajoute

Answer 25

les enzymes scramblases (un type de flippase)

Question 26

Expliquer le voyage des phospholipide dans la cellule après leur production

Answer 26

1) les phospholipides sont envoyés par transport vésiculaire à la plupart des organites membranaires. 2) Une fois rendus à la membrane plasmique, les nouveaux lipides sont réarrangés par les flippases.

Question 27

Les flippases nécessite quoi pour générer une distribution asymétrique des deux hemi-membrane

Answer 27

l'hydrolysent de l'ATP

Question 28

Les protéines produit par le RER s'appelle comment

Answer 28

peroxines ( protéine du peroxysome)

Question 29

Où vont les peroxines suite à leur formation dans le RER

Answer 29

migrent vers le REL

Question 30

Par bourgeonnement , le REL crée quoi grace au peroxines

Answer 30

Vésicule précur

Question 31

Quels sont les focntions du peroxysome

Answer 31

- Oxydation des molécules organiques - Neutralisation du H2O2

Question 32

Autres que les péroxines les autres protéine du peroxysome sont synthétisées par quoi et incorporée dans l'organite comment

Answer 32

Les autres protéines du peroxysome sont synthétisées dans le cytoplasme et incorporées dans l’organite par les peroxines de façon post-traductionnelle (signal SKL en C-terminal)

Question 33

V/F : les peroxysome ont alors besoin du RER pour croitre et se diviser

Answer 33

FAUX : Les peroxysomes peuvent croître et se diviser par eux-mêmes.

Question 34

Nommez les deux facons de former et faire croitre un peroxysome

Answer 34

- Synthèse de novo ( lent ) - La croissance : fission des peroxysome existants ( RAPIDE)

Question 35

Expliquer la synthèse de novo des peroxysome

Answer 35

la fusion hétérotypique de 2 vésicules de RE (V1+V2)permet de construire les complexes de translocation fonctionnels. La fusion est possible grâce à Pex1-6. => Diapo 17 mauve

Question 36

Expliquer la croissance –fission des peroxysomes existants des peroxysome

Answer 36

Fission des peroxysome existants : 1) Croissance du peroxysome par ajout de V3 (ajout de membranes) 2) Croissance du peroxysome par incorporation post traductionnelle des protéines 3) Lorsque le peroxysome est volumineux, la Pex11 permet l’allongement, le DRP-interacting protein fait la constriction membranaire alors que le DRP (dynamin-relatedprotein) s’occupent de la coupure finale

Question 37

Qu,est ce que le PEX 3

Answer 37

Pex3=étiquette d’une vésicule destine aux peroxysomes et permet l’incorporation des protéines membranaires

Question 38

Qu'est ce que le PMP

Answer 38

complexe de translocation (ces protéines sont fabriquées par le RER –incorporation co-traductionnelle)

Question 39

Quel est le rôle de Pex5

Answer 39

Les transporteurs solubles Pex 5 amènent la cargaison au translocateur et se collent dessus => LePex5devientmembranaire. Il va être détaché rapidement en hydrolysant l’ATP de sorte qu’il y a toujours beaucoup de Pex 5 solubles et peu de Pex 5 membranaires (gradient!=énergie)

Question 40

On a besoin de plus de PEx membranaire ou soluble

Answer 40

Soluble

Question 41

La fonction des peroxysomes dépend de quoi

Answer 41

- des protéines qui y sont importées - du type cellulaire - de l’environnement cellulaire

Question 42

Comment la forme du peroxysome peut changer selon les nécessités de la cell.

Answer 42

La forme sphérique du peroxysome peut s’allonger et devenir réticulaire

Question 43

V/F : les peroxysome ont pleins de type

Answer 43

Vrai

Question 44

taux de multiplication des peroxysomes est similaire à quoi

Answer 44

À celui du cycle cellulaire

Question 45

Expliquer l'impact des ac. gras sur les peroxysomes

Answer 45

- Il y a plus de peroxysomes lorsqu’il y a plus d’acides gras dans son milieu (activité métabolique modifiée). - Le contrôle se fait au niveau transcriptionnel en réponse aux conditions environnementales

Question 46

V/F : Le même peroxysome d’origine peut se subdiviser en 2 peroxysomes ayant des activités métaboliques différentes

Answer 46

vrai

Question 47

Donnez un exemple dans la vraie vie des rôles des lysosomes

Answer 47

Bioluminescence des lucioles

Question 48

Qu'est ce que le trafic vésiculaire , est ce qu'il communique avec les mitochondries et les chloroplaste

Answer 48

(RE → Golgi → Vésicules) ne communique pas directement avec les mitochondries et les chloroplastes.

Question 49

Comment les mitochondries recoivent des lipides

Answer 49

grâce aux protéines d’échange des phospholipides (PEPs), qui font le lien entre le RE et les mitochondries et chloroplastes

Question 50

Les protéines pas destinée au peroxysome doivent passer par quoi

Answer 50

par le RER et la voie du trafic vésiculaire.

Question 51

L’entrée des protéines dans le RER se fait de quelle façon, l'énergie vient de où

Answer 51

co-traductionnelle, et l’énergie nécessaire au transfert vient du ribosome.

Question 52

Qu'est ce que le peptide signal

Answer 52

C'est une zone hydrophobe de 20 acides aminés située en N-terminal, nommée PSIT(Peptide Signal d’Initiation de Transfert).

Question 53

V/F : le peptide fait partie de la protéine finale

Answer 53

Faux c'est une séquence qui est généralement coupé par peptidase

Question 54

Le signal qui se lie à la protéine peut être suivi de quoi

Answer 54

Le signal peut être suivi d’un site de clivage AXA, car le signal est généralement coupé de la protéine mature

Question 55

Que se passe t'il avec le PSIT quand il est traduit

Answer 55

lie une poche hydrophobe située dans la Particule de Reconnaissance du Signal (SRP).

Question 56

Qu'est ce que le SRP

Answer 56

C' est une GTPase soluble formée de 6 protéines et d’un ARN.

Question 57

Que se passe t'il lorsque le SRP se lie à la PSIT d'une protéine en cours de transcription

Answer 57

elle bloque momentanément la traduction en cours en bloquant le site A du ribosome ( le site où l’ARN-t chargé d’un acide aminé s’installe lors de la traduction.) .

Question 58

La SRP liée au PSIT est reconnue par quoi ( il est situé où )

Answer 58

Récepteur situé sur la membrane du RER

Question 59

Une fois lié au récepteur la SRP fait quoi ce qui provoque quoi

Answer 59

hydrolyse son GTP, ce qui provoque le relâchement du signal (PSIT).

Question 60

Quels sont les rôles des translocateurs

Answer 60

-=> Situer sur l'extérieru de la membrane du RER Ils permettent au PSIT(et au reste de la protéine) d’entrer à l’intérieur du RER

Question 61

Le transporteur est appel cooment

Answer 61

C'est un complexe protéique appelé Sec61(αβγ)

Question 62

le translocateur est composé de quoi

Answer 62

a une poche hydrophobe dans sa « couture » et un bouchon dans le fond.

Question 63

Données les étapes qui permet à la protéine d'entrer dans le RER

Answer 63

1) Le PSIT, libéré de la SRP, tasse le bouchon pour ensuite s’installer au niveau de la couture pour l’ouvrir. 2) Ainsi, le reste de la protéine a de la place pour glisser vers la lumière du RER, au fur et à mesure qu’elle est traduite. 3) Durant ce temps, le PSIT est gardé dans le translocateur

Question 64

Que se passe t'il après que les protéine soit entrer dans la lumière du RER

Answer 64

leur PSIT sera coupé par une peptidase membranaire, qui coupe au niveau du site AXA, situé juste après le PSIT.

Question 65

Les protéines qui garde leur PSIT l'utilise pour quoi

Answer 65

d’ancrage à la membrane => Dans ces cas, le PSIT est généralement situé un peu plus loin dans la protéine (pas en N-terminal)

Question 66

V/F : les régions hydrophobe peuvent traverserle translocateur

Answer 66

Faux : Le centre du translocateur est hydrophile et les régions hydrophobes ne peuvent pas le traverser

Question 67

Une protéine membranaire peut être produite à partir d’un autre signal, quel est il ( RER )

Answer 67

la Séquence d’Arrêt de Transfert (SAT). Il s’agit d’une autre séquence d’acides aminés hydrophobe

Question 68

Les protéines membranaires avec des hélices α hydrophobes sont toutes synthétisées où **

Answer 68

Dans le RER et sa membrane => à l’exception des protéines mitochondriales et chloroplastiques.

Question 69

Que se passe t'il avec le SAT lorsqu'il arrive au translocateur sur la membrane

Answer 69

Le SAT ne peut pas traverser le translocateur, ni d’aller dans la couture de ce dernier (sa forme est non complémentaire). => Il est relâché dans la membrane directement et l’incorporation de la protéine s’arrête (même si sa traduction continue)

Question 70

Une fois entrées dans le RER (lumière ou membrane), toutes les protéines passent vers où

Answer 70

L'appareil de golgi via les vésicules

Question 71

V/F : À partir du Golgi, certaines protéines continueront leur périple, dans les autres organites que le RE.

Answer 71

Faux, d’autres retourneront vers le RER, car leur rôle est dans le RER

Question 72

Les protéines qui retournent au RER doivent posséder quoi, en plus du PSIT en N-termina

Answer 72

un signal de rétention en C terminal.

Question 73

Quel est le signal de rétention en C terminal.

Answer 73

Il s’agit de la séquence KDEL pour les protéine solubles et KKXX pour les protéines membranaires.

Question 74

La plupart des protéines synthétisées dans le RER seront sécrétées où

Answer 74

à l’extérieur de la cellule ( elle doivent être capable de survivre au condition extérieur )

Question 75

Quel sont les rôles de la disulfide isomérase

Answer 75

- catalyse la formation ou la rupture de ponts disulfures - s’assure que les liens S-S soient bien faits, avant que la protéine ne quitte le RER

Question 76

Qu'est ce que les GPI

Answer 76

- Une ancre lipidique de GPI (Glycosyl phosphatidyl inositol) qui peut être ajoutée sur les protéines - se retrouvent dans les radeaux lipidiques et peuvent être libérées par une phospholipase

Question 77

Quel complexe ajoute les GPI

Answer 77

le complexe enzymatique transmidase

Question 78

Quel est le rôle de l'oligosaccharide transférase membranaire

Answer 78

- ajoute une unité préformée de sucre sur le résidu asparagine

Question 79

L'asparagine pour se faire ajouter une unité perfomée de sucre doit avoir quoi

Answer 79

L’Asn doit faire partie du motif N-X-S/T

Question 80

Quel est l'unité de sucre ajoutée à l'Asn

Answer 80

- L’unité de sucre ajoutée est toujours la même : un oligosaccharide de14 sucres

Question 81

Durant la maturation de la protéine (RER et Golgi), l’unité ajoutée subira quel changement

Answer 81

modifiée et taillée pour finir avec un modèle de base à 5 sucres (2 NAG et 3 mannoses)

Question 82

La modification des sucres est lié à quoi

Answer 82

Controle qualité

Question 83

Les 2 glucoses terminaux sont enlevés quand

Answer 83

à la fin de la traduction et les différentes chaperonnes vérifient la forme de la protéine.

Question 84

Que se passe t'il avant de sortir du RE que se passe t'il lorsque les chaperonnes disent que la protéine est OK

Answer 84

le dernier glucose est clivé et elle sort du RE (par vésicule vers Golgi)

Question 85

Que se passe t'il avant de sortir du RE si la protéine est mal repliée

Answer 85

une glucosyl transférase lui ajoute un glucose et la protéine doit repasser par les chaperonnes qui essayeront de la plier correctemen

Question 86

Les compartiments cellulaires entourés par une membrane sont liés par quoi

Answer 86

par le trafic vésiculaire

Question 87

Dans le transport vésiculaire , Lles vésicules transportent les protéines d’un endroit à l’autre à l’aide des quoi

Answer 87

moteurs protéiques et des éléments du cytosquelette polaires (microtubules et actine-F )

Question 88

Comment les vésicules ( du trafic vésiculaire ) se forment comment

Answer 88

Se forment par bourgeonnement (à partir du compartiment donneur)

Question 89

Que se passe t'il avec les vésicules une fois rendues à destination

Answer 89

elles fusionnent avec la membrane du compartiment cible