Cours 9 : Le transport à travers deux membranes Flashcards
Quels sont les problèmes lors du transports à travers la membrane des mitochondries et des chloroplastes
- Possède deux membrane
- Pas de pores suffisamment grand ( pour faire passer des
protéines complètes dans le forme tridimensionnelle (structure tertiaire) )
Comment doit on garder les protéines pour entre dans la membrane ( TOM )
- Garder dans leur structure primaire ( ou hélice alpha )
- Dérouler les protéine en structure primaire
Qu’a t’on besoin pour dénaturer une protéine
Une étiquette
Un récepteur ( plrs )
L’énergie
Quel est un des signaux les plus communs dans une mitochondrie
Une série d’acides aminés située en N-terminal du précurseur (future protéine mitochondriale) formant une hélice α amphiphile avec une moitié hydrophobe et une autre moitié chargée positivement
La partie hydrophobe du signal chez les mitochondries est reconnu par quoi
Une récepteur situé sur la membrane externe
Les récepteurs et les deux translocateurs des mitochondries opèrent ensemble sous quels complexes
TOM (membrane externe) et TIM (membrane interne)
Donnez les étapes du chemin des protéines du récepteur jusqu’à l’entrée dans la mitochondrie
1) Le récepteur fait partie de TOM et passe le
peptide signal au translocateur (TOM40).
2) Les protéines entrent lorsque les chaperonnes
Hsp70 cytosoliques, qui conservaient les
protéines dépliées, hydrolysent l’ATP (énergie)
et se dissocient.
3) Dans l’espace intermembranaire, TOM transfert
le signal à TIM, qui fait passer les protéines dans
la matrice (avec l’aide des chaperonnes
mitochondriales, Hsp70).
4) Le signal est coupé (ne fait pas partie de la
protéine finale).
Qu’est ce qui défini où vont passer les mitochondries après être passé par TOM
Dépends des signaux internes
Nomme les chemin possible après avoir passé par TOM
=> DIAPO 7 trop imp.
Donné un exemple du chemin que prends les protéines destinées à la membrane externe de la mitochondrie
- Précurseur traduit dans le cytoplasme.
- Passe par le complexe TOM.
- Chaperonnes dans l’espace intermembranaire.
- Insertion dans la membrane grâce à SAM et au signal interne
(hydrophobe)
Expliqué comment sont dégradé les signal
- le peptide signal (hélice α en N-terminal) est coupé par des peptidases après
l’incorporation de la protéine à l’endroit désiré. - S’il existe des signaux internes, ces derniers ne sont pas coupés
Donnez les deux manière qu’une protéine peut être apportés au TOM
- Hsp70 cytosolique
- Autres moyens sans aide de chapperonnes
Donne un exemple de protéine apportés sans aide de chaperonnes
l’hélice-α amphiphile (préséquence) est reconnue
par les sous-unités TOM20-22.
La chaperonne hsp70 est reconnu par quoi
TOM70 ( hélice alpha est pas là )
Est ce que l’incorporation membranaire à besoin d’énergie
oui, processus moins bien connu, probablement potentiel membranaire ou CTE
Données la différence entre l’incorporation dans les mitochondrie et les chloroplaste
C’est le même principes mais protéines différentes
Quelle sont les protéines principales de la membrane des chloroplastes
complexes de translocation TOC (membrane externe) et TIC (membrane
interne).
Quel est la particularité avec les membrane du chloroplaste , que faut il pour y remédier.
Dans le chloroplaste, il y a une
membrane supplémentaire (la 3e, celle des thylakoïdes). Il faut donc un signal supplémentaire pour entrer dans ce troisième compartiment.
Lorsqu’un échantillon de RE est centrifugé dans un gradient de densité il se sépare en quoi
le REL (lisse) et le RER (rugueux, granuleux).
Quel méthodologie on utilise pour séparer les types de RE
Sédimentation en accélérée
Quels sont les rôles du REL et RER
o Le REL s’occupe de la synthèse des lipides (production des membranes)
o Le RER s’occupe des protéines principalement destinées à la sécrétion (ou dans la voie de sécrétion)
=> Diapo 13
Où se situe l’acyl-transférase
L’enzyme est située dans la membrane du REL, mais son site actif se retrouve dans le cytoplasme.
Quel est le rôle de l’acyl-transférase
Elle construit les phospholipides à partir de deux acides gras et d’un glycérol phosphaté
Que se passe t,il avec les nouveaux phospholipides suite à leur production
Les
nouveaux phospholipides s’ajoutent au feuillet externe de la membrane du REL.
Quelles enzyme égalisent les 2 couches membranaire après qu’il s’ajoute
les enzymes scramblases (un type de flippase)
Expliquer le voyage des phospholipide dans la cellule après leur production
1) les phospholipides sont envoyés par transport vésiculaire à la plupart des organites membranaires.
2) Une fois rendus à la membrane plasmique, les nouveaux
lipides sont réarrangés par les flippases.
Les flippases nécessite quoi pour générer une distribution asymétrique des deux hemi-membrane
l’hydrolysent de l’ATP
Les protéines produit par le RER s’appelle comment
peroxines ( protéine du peroxysome)
Où vont les peroxines suite à leur formation dans le RER
migrent vers le REL
Par bourgeonnement , le REL crée quoi grace au peroxines
Vésicule précur
Quels sont les focntions du peroxysome
- Oxydation des molécules organiques
- Neutralisation du H2O2
Autres que les péroxines les autres protéine du peroxysome sont synthétisées par quoi et incorporée dans l’organite comment
Les autres protéines du peroxysome sont synthétisées dans le cytoplasme et incorporées dans l’organite par les peroxines de façon post-traductionnelle (signal SKL en C-terminal)
V/F : les peroxysome ont alors besoin du RER pour croitre et se diviser
FAUX : Les peroxysomes peuvent croître et se diviser par eux-mêmes.
Nommez les deux facons de former et faire croitre un peroxysome
- Synthèse de novo ( lent )
- La croissance : fission des peroxysome existants ( RAPIDE)
Expliquer la synthèse de novo des peroxysome
la fusion hétérotypique de
2 vésicules de RE (V1+V2)permet de construire les complexes
de translocation fonctionnels. La fusion est possible grâce à Pex1-6.
=> Diapo 17 mauve
Expliquer la croissance –fission des peroxysomes existants des peroxysome
Fission des peroxysome existants :
1) Croissance du peroxysome par
ajout de V3 (ajout de membranes) 2) Croissance du peroxysome par
incorporation post traductionnelle
des protéines
3) Lorsque le peroxysome
est volumineux, la Pex11 permet l’allongement, le
DRP-interacting protein fait la constriction membranaire
alors que le DRP (dynamin-relatedprotein) s’occupent
de la coupure finale
Qu,est ce que le PEX 3
Pex3=étiquette d’une vésicule destine aux peroxysomes et permet l’incorporation des
protéines membranaires
Qu’est ce que le PMP
complexe de translocation (ces protéines sont fabriquées par le RER –incorporation co-traductionnelle)
Quel est le rôle de Pex5
Les transporteurs solubles Pex 5 amènent la cargaison au translocateur et se collent dessus
=> LePex5devientmembranaire. Il va être détaché rapidement en hydrolysant l’ATP de sorte qu’il
y a toujours beaucoup de Pex 5 solubles et peu de Pex 5 membranaires (gradient!=énergie)
On a besoin de plus de PEx membranaire ou soluble
Soluble
La fonction des peroxysomes dépend de quoi
- des protéines
qui y sont importées - du type cellulaire
- de l’environnement cellulaire
Comment la forme du peroxysome peut changer selon les nécessités de la cell.
La forme sphérique du peroxysome peut
s’allonger et devenir réticulaire
V/F : les peroxysome ont pleins de type
Vrai
taux de multiplication des peroxysomes est similaire à quoi
À celui du cycle cellulaire
Expliquer l’impact des ac. gras sur les peroxysomes
- Il y a plus de peroxysomes lorsqu’il y a plus d’acides gras
dans son milieu (activité métabolique modifiée). - Le contrôle se fait au niveau transcriptionnel en réponse
aux conditions environnementales
V/F : Le même peroxysome d’origine peut se subdiviser en 2
peroxysomes ayant des activités métaboliques différentes
vrai
Donnez un exemple dans la vraie vie des rôles des lysosomes
Bioluminescence des lucioles
Qu’est ce que le trafic vésiculaire , est ce qu’il communique avec les mitochondries et les chloroplaste
(RE → Golgi → Vésicules) ne
communique pas directement avec les mitochondries et les
chloroplastes.
Comment les mitochondries recoivent des lipides
grâce aux protéines d’échange des phospholipides
(PEPs), qui font le lien entre le RE et les mitochondries et
chloroplastes
Les protéines pas destinée au peroxysome doivent passer par quoi
par le RER et la voie du trafic vésiculaire.
L’entrée des protéines dans le RER se fait de quelle façon, l’énergie vient de où
co-traductionnelle,
et l’énergie nécessaire au transfert vient du ribosome.
Qu’est ce que le peptide signal
C’est une zone hydrophobe de
20 acides aminés située en N-terminal, nommée
PSIT(Peptide Signal d’Initiation de Transfert).
V/F : le peptide fait partie de la protéine finale
Faux c’est une séquence qui est généralement coupé par peptidase
Le signal qui se lie à la protéine peut être suivi de quoi
Le signal peut être suivi d’un site de clivage AXA, car le signal est généralement coupé de
la protéine mature
Que se passe t’il avec le PSIT quand il est traduit
lie une poche hydrophobe située
dans la Particule de Reconnaissance du Signal (SRP).
Qu’est ce que le SRP
C’ est une GTPase soluble formée de 6 protéines et d’un ARN.
Que se passe t’il lorsque le SRP se lie à la PSIT d’une protéine en cours de transcription
elle bloque momentanément la traduction en cours en bloquant le site A du ribosome ( le site où l’ARN-t chargé d’un acide aminé
s’installe lors de la traduction.) .
La SRP liée au PSIT est reconnue par quoi ( il est situé où )
Récepteur situé sur la membrane du RER
Une fois lié au récepteur la SRP fait quoi ce qui provoque quoi
hydrolyse son GTP, ce qui provoque le relâchement du signal (PSIT).
Quels sont les rôles des translocateurs
-=> Situer sur l’extérieru de la membrane du RER
Ils permettent
au PSIT(et au reste de la protéine) d’entrer à l’intérieur du RER
Le transporteur est appel cooment
C’est un complexe protéique appelé Sec61(αβγ)
le translocateur est composé de quoi
a une poche hydrophobe dans sa « couture »
et un bouchon dans le fond.
Données les étapes qui permet à la protéine d’entrer dans le RER
1) Le PSIT, libéré de la SRP, tasse le bouchon pour ensuite s’installer au niveau de la couture pour
l’ouvrir.
2) Ainsi, le reste de la protéine a de la place pour glisser vers la lumière du RER, au fur et à mesure qu’elle
est traduite.
3) Durant ce temps, le PSIT est gardé dans le translocateur
Que se passe t’il après que les protéine soit entrer dans la lumière du RER
leur PSIT sera coupé par une
peptidase membranaire, qui coupe au niveau du site AXA, situé juste après le PSIT.
Les protéines qui garde leur PSIT l’utilise pour quoi
d’ancrage à la membrane
=> Dans ces cas, le PSIT est généralement situé un peu plus loin dans la protéine (pas en N-terminal)
V/F : les régions hydrophobe peuvent traverserle translocateur
Faux : Le centre du translocateur est hydrophile et les
régions hydrophobes ne peuvent pas le traverser
Une protéine membranaire peut être produite à partir d’un autre signal, quel est il ( RER )
la Séquence
d’Arrêt de Transfert (SAT). Il s’agit d’une autre séquence d’acides aminés hydrophobe
Les protéines membranaires avec des hélices α hydrophobes sont toutes synthétisées où **
Dans le RER et sa membrane
=> à l’exception des
protéines mitochondriales et chloroplastiques.
Que se passe t’il avec le SAT lorsqu’il arrive au translocateur sur la membrane
Le SAT ne peut pas traverser le translocateur,
ni d’aller dans la couture de ce dernier (sa
forme est non complémentaire).
=> Il est relâché dans la membrane
directement et l’incorporation de la protéine
s’arrête (même si sa traduction continue)
Une fois entrées dans le RER (lumière ou membrane),
toutes les protéines passent vers où
L’appareil de golgi via les vésicules
V/F : À partir du Golgi, certaines protéines continueront leur périple, dans les autres organites que le RE.
Faux, d’autres retourneront vers le RER, car leur rôle est dans le RER
Les protéines qui retournent au RER doivent posséder quoi, en
plus du PSIT en N-termina
un signal de rétention en C
terminal.
Quel est le signal de rétention en C terminal.
Il s’agit de la séquence KDEL pour les protéine
solubles et KKXX pour les protéines membranaires.
La plupart des protéines synthétisées dans le RER seront sécrétées où
à l’extérieur de
la cellule ( elle doivent être capable de survivre au condition extérieur )
Quel sont les rôles de la disulfide isomérase
- catalyse la formation ou la rupture de ponts disulfures
- s’assure que les liens S-S soient
bien faits, avant que la protéine ne quitte le RER
Qu’est ce que les GPI
- Une ancre lipidique de GPI (Glycosyl phosphatidyl inositol)
qui peut être ajoutée sur les protéines - se retrouvent
dans les radeaux lipidiques et peuvent être libérées par une
phospholipase
Quel complexe ajoute les GPI
le complexe
enzymatique transmidase
Quel est le rôle de l’oligosaccharide transférase membranaire
- ajoute une
unité préformée de sucre sur le résidu asparagine
L’asparagine pour se faire ajouter une unité perfomée de sucre doit avoir quoi
L’Asn doit faire partie du motif N-X-S/T
Quel est l’unité de sucre ajoutée à l’Asn
- L’unité de sucre ajoutée est toujours la même : un
oligosaccharide de14 sucres
Durant la maturation de la protéine (RER et Golgi), l’unité
ajoutée subira quel changement
modifiée et taillée pour finir avec un modèle de base à 5 sucres (2 NAG et 3 mannoses)
La modification des sucres est lié à quoi
Controle qualité
Les 2 glucoses terminaux sont enlevés quand
à la fin de la traduction et les différentes chaperonnes vérifient la forme de la protéine.
Que se passe t’il avant de sortir du RE que se passe t’il lorsque les chaperonnes disent que la protéine est OK
le dernier glucose est clivé et elle sort du RE (par vésicule vers Golgi)
Que se passe t’il avant de sortir du RE si la protéine est mal repliée
une glucosyl transférase lui ajoute un glucose et la protéine doit repasser par les chaperonnes qui essayeront de la plier correctemen
Les compartiments cellulaires entourés par une membrane sont liés par quoi
par le trafic vésiculaire
Dans le transport vésiculaire , Lles vésicules transportent les protéines d’un endroit à l’autre à l’aide des quoi
moteurs protéiques et des éléments du
cytosquelette polaires (microtubules et actine-F )
Comment les vésicules ( du trafic vésiculaire ) se forment comment
Se forment par bourgeonnement (à partir du compartiment donneur)
Que se passe t’il avec les vésicules une fois rendues à destination
elles fusionnent avec la membrane du compartiment cible
