Cours 3: La matrice extra-cellulaire ( MEC) & la membrane plasmique Flashcards
Donnez une déf. de la MEC et leur fct
≡ Ensemble des molécules extracellulaires sécrétées par les cellules
≡ fournit un apport structurel et biochimique aux cellules environnantes.
Toutes les cell. possèdent une ME, mais les MEC varie selon les types cellulaires ( donnez les types cellulaires desquelles varient la MEC )
o Bactéries (procaryotes)
o Cellules végétales (eucaryotes)
o Cellules animales (eucaryotes)
Qu’est ce qui est particulier avec la MEC des archées
elle est peu connue (peu étudiée).
- Chaque organisme de ce groupe
possède une MEC individuelle
Chez les cell. animales la MEC est composée de quoi
de liquide, d’un gel et de fibres, dont les proportions
varient beaucoup d’un tissu à un autre
Vrai ou Faux : la MEC est composée d’une paroi chez les cell. animales
FAUX ( voir la carte d’Avant )
Donnez les caractéristiques de la forme de la MEC selon le tissu et la variété est lié à quoi
- Très volumineuse dans le tissu conjonctif (cartilage, os, sang, tissus de soutien, etc.).
- Une grande variété de formes et s’adapte aux besoins fonctionnels de chaque tissu
Donnez les carcatéristiques des fibres, gel et liquide qui compose la MEC
Liquide: liquide interstitiel
(lymphe), c’est un dialysat de
plasma
Gel: formé de
glycosaminoglycanes (GAG)
Fibres : différents types de
collagènes et de fibres élastiques ( voir diapo 4)
=> Fibroblaste
=> Fibre ( trans.)
=> Fibres ( long.)
=> Liquide et gel
Dans les cell. des bactéries la MEC constitue quoi
la MEC constitue la paroi
Donne les caractéristique de la MEC chez les bactéries ( et elle est composée de quoi )
- solide, ferme, flexible et poreuse (ne limite pas le trafic des molécules à travers la membrane plasmique).
- composée de peptidoglycane: une «grille» formée des longues chaînes de disaccharides aminés et de
tetrapeptides reliés entre eux par un lien peptidique direct ou par un pont interpeptidique (pont de pentaglycine)
Qu’est ce que la diff. entre des parois GRAM + et GRAM -
La paroi GRAM + :
- Couche de peptidoglycane bcp plus épaisse ( permet la coloration de GRAM )
- Acides lipotéichoiques
- Polymères capsulaires
La paroi GRAM - :
- Couche peptoglycane plus mince
- Périplasme
- Membrane externe
=> Voir diapo 6
Expliquer la coloration de GRAM
1) Coloration ( cristal violet )
2) Mordancage ( lugol )
3) Décoloration ( éthanol ):
=> les gram + ayant une paroi plus épaisse ne se laisse pas décoloré et reste violet
=> Les GRAM - sont décoloré
4) Deuxième coloration ( fuschine)
=> la coloration étant plus faible que la première ca ne va pas affecter les GRAM +
=> Les GRAM - se colore d’uen autre couleur
Quel est le premier élément de classification de bactéries
les parois GRAM + / GRAM -
Qu’est ce que les chaînes de glycosaminoglycanes p/r à la MEC (GAG)
C’est la substance fondamentale de la MEC. Il remplit l’espace.
Donné les caractéristiques des GAG ( Charge + Composition + nature des liaison )
o Chargé négativement : il attire les ions Na+ et l’eau
(fortement hydrophile). Ce qui permet la
turgescence (pression).
o Composé de glycosaminoglycanes (GAG) : longues
chaînes de disaccharides répétitifs, dont un est
toujours un glucide aminé (N-acétylglucosamine ou
N-acétylgalactosamine) et le second est habituellement
un acide uronique (glucuronique ou iduronique)
o les GAG sont liés de façon covalente à une protéine
Quelle GAG N’EST PAS liés de manières covalentes à une protéines
l’acide hyaluronique lui il se lie au protéoglycane eux même
L’association des GAG de façon covalente avec des
protéines, donne quoi
Les protéoglycanes
Qu’est ce que l’arthrose ( que se passe t’il avec les chondrocytes + comment y remédier )
L’arthrose est une maladie qui affecte les articulations : le cartilage articulaire s’effrite
avec le temps.
- les chondrocytes sont dérégulées et détruisent la matrice (au lieu de la
fabriquer). Entre autres, l’acide hyaluronique devient moins abondant.
- Des injections d’acide hyaluronique dans une articulation affectée,
peut améliorer sa mobilité et soulager la douleur.
La MEC du cartilage articulaire (_ composée de quoi+ fabriquer par quoi )
Sa MEC est composée de GAG (dont l’acide hyaluronique) et de
fibres.
Elle est fabriquée et renouvelée par les chondrocytes(fibroblastes différenciés).
Expliquer le role de la formation de maille dans les articulation
La formation de mailles par les GAG et en particulier
l’acide hyaluronique:
o Absorption de grandes quantités d’eau
o Gel d’un volume 1000-10 000 fois le volume initial
=> Création d’une pression de gonflement = turgescence
=>Résistance aux forces de compression
Qu’est ce que les fibres de collagène
- Principales protéines de la matrice
o constituent 25-30 % de la masse protéique totale chez les mammifères.
Parlez tu collagène de type I vs le collagène de type II
le type I est le plus abondant et il est retrouvé dans le tissu conjonctif de
soutien et dans les os, alors que le type II se retrouve dans les cartilages.
Cmb de différent type de collagène
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Pour les fibres de collagène les roles diff. sont exprimés dans quoi
Des tissus diff
Donnez la caractéristiques de la structure du collagène
longue, rigide et hélicoïdale à 3 brins
Expliquer la constitution de la triple hélice de collagène
o La triple hélice de collagène est formée de 3 polypeptides ayant chacun une structure secondaire unique.
Chaque hélice fait un tour par 3 acides aminés (X-Y-Gly). Les trois polypeptides sont très collés.
Expliquer la stabilité de la triple hélice de collagène
La stabilité la structure en triple hélice se fait grâce à des ponts hydrogènes entre hélices et très dépendante d’hydroxyproline
Comment le collagène se dénature
Par ébullition => donne de la gélatine
Expliquer de quoi est constituer le cuir
Le cuir, c’est du derme (rempli de collagène) traité avec de l’acide tannique
Après la dénaturation du collagène en gélatine que se passe t’il si on fait une hydrolyse
On obtient des peptides
Qu’est ce que le syndrome d’Ehlers-Danlos
mutations dans les gènes
codant pour les collagènes (dans la structure ou le repliement)
ou dans des gènes codant pour la synthèse des GAGs.
Qu’est ce que l’élastine ( fibres de la MEC ) ( + fct )( + où on la retrouve le plus )
≡ une protéine hydrophobe, aussi riche en proline et glycine (forme hélicoïdale), qui permet l’élasticité du tissu.
- C’est elle qui est responsable du retour à la forme normale d’une peau étirée.
- protéine dominante de la MEC des artères, du cœur et de la vessie.
Qu’est ce qui influence l’état tendue ou relachée des molécules d’élastine
la conformation des liaison de pontage
V/F :Une personne déshydrater n’aurait pas la même élasticité qu’une personne bien hydrater
Vrai la peau ne revient pas a sa forme initiale rapidement
qu’est ce que la fibronectine ( fibre de la MEC )
≡ une protéine qui agit comme une colle liant le collagène et les GAGs avec les cellules via leur membrane
plasmique (il faut ancrer le tout, quand même !)
Quelle séquence de la fibro nectine est nécessaire juste pour lier les cell.
La séquence RGD (Arg-Gly-Asp)
Qu’est ce que les intégrine ( + donné ses domaines )
≡ Protéines de la membrane plasmique ( PAS DE LA MEC ) qui lient de façon réversible la séquence RGD de la fibronectine.
Elles ont un domaine extracellulaire, un domaine transmembranaire et un domaine intracellulaire
Donné la fct des intégrines
- d’adhérence,
- récepteurs pour des
signaux cellulaires et sont le point de départ de nombreuses voies de signalisation. - Elles font partie d’une grande famille de récepteurs
Donnez largement les structures de la MEC
- Paroi bactéries
- GRAM + vs GRAM
- les chaines GAG
- Fibre de collagène
- l’élastine
- fibronectine
- Intégrine ( pas la MEC MAIS STRUCTURE IMP)
Qu’est ce que la membrane plasmique ( +particularité de chaque couche + membrane des organites )
≡ C’est une double couche de lipides dont les deux côtés ne sont pas interchangeables
o chaque couche a sa propre composition lipidique et protéique.
o Les organites sont aussi entourés d’une membrane, mais leur composition varie selon l’organite et sa
fonction.
Quel est la composition des membranes
Les membranes sont construites avec des bicouches de molécules amphiphiles qui possèdent à la fois un groupement
hydrophile et un groupement hydrophobe: phosphoglycérolipides, glycolipides, cholestérol, etc.
Quels sont les lipides les plus abondants de tous les types de membranes
Les phospholipides
Vrai ou faux les deux couche de la membranes sont constituer de la même manière
Faux : asymétrique , pas la même proportion des diff. phospholipides ( Hémimembrane interne ps = hémimembrane externe )
Les phosphoglycérolipides sont composé au min. de quoi
d’un ester de glycérol, d’un groupement phosphate et de deux chaînes d’acide gras
Donné les deux caractéristique des chaines d’acide gras des phosphoglycérolipides
o Plus ou moins longues (14 à 23 carbones en général)
o Plus ou moins saturés
Donné la structure des phosphoglycéro lipide
diapo 22
Le groupement phosphate est-il hydrophile ou
hydrophobe ?
hydrophile
que veut dire saturés
Présence de liaison double ds les chaines d’acide gras
les double liaison des chaine d’Acide gras permettent quoi
Permet au chaine des plus flexible
Donné les varaiations qui peuvent être présente sur les phosphoglycérolipide
o D’autres groupements hydrophiles peuvent se lier au groupement phosphate pour constituer divers
phosphoglycérolipides (liaison d’un céramide à un acide phosphorique et à un alcool aminé)
- Des modifications liées au glycérol peuvent aussi être observées : souvent une éthanolamine ou une
choline
donné la diff. de structure entre le phospholipide ( phosphatidylcholine ) vs sphingolipide
Diapo 25
Expliquer les variation spécifique des phospholipide donné des ex. ( + qu’est ce que la sphingomyeline )
Certains sont spécifiques à un type cellulaire précis.
Exemple: principaux éléments de la gaine de myéline
des neurones, les phosphosphingomyélolipides
=> sphingomyéline est issue de la liaison phosphodiester
d’un céramide et une choline
Qu’est ce qu’un céramide
C’est un sphingosine + acides gras
V/F: La majorité des membranes cellulaires possèdent une proportion de glycolipides.
Vrai
Qu’est ce qu’un glycolipide ( vs les phospholipides )
Liaison simple d’un oligosaccharide à un glycéroglycolipide
(via OH du glycérol) ou un sphingolipide (OH d’un céramide)
À la place du groupement phosphate, on ajoute divers sucres. Il peut y en
avoir plusieurs et ils peuvent différés sur un même lipide
Donné le role du glycocalyx
o Dans toutes les cellules eucaryotes et
certaines bactéries
o Protection à la membrane externe, aspect
d’un revêtement duveteux ou fibreux.
o Reconnaissance cellulaire (CMH ou HLA)
Dans un environnement aqueux comment s’Assemble les molécule amphiphiles + selon quel forme
- les molécules amphiphiles s’assemblent spontanément en deux structures
possibles, selon leur forme intrinsèque. - la micelle
- La bicouche se renferme spontanément pour former un
compartiment avec de l’eau à l’intérieur.
Pourquoi les molécules amphiphiles s’Assemble spontanéement
Plus favorable et stable énergétiquement
V/F: la bicouche lipidique est fixe
FAUX
Expliquer le mouvement latéral d’une couche
- Les lipides d’une même couche peuvent facilement bouger de
façon latérale et tourner sur eux-mêmes. - Pas besoin d’énergie
- Les lipides peuvent se déplacer à 360° et
latéralement dans le plan de la bicouche
Expliquer le passage d’un lipide d’une couche à l’autre ( FLIP-FLOP )
- Contraire de ce qui est stable énergétiquement
- Besoin de la flipase pour faire passer une tête hydrophile dans les queues hydrophobe
- Difficile
- Pas spontanément
pk les archées n’ont pas les mêmes membranes que d’autres cell.
De nombreuses Archaea connues vivent à des températures extrêmement chaudes.
=> Sous l’effet de la température élevée, une membre normale deviendrait beaucoup trop fluide et donc trop perméable (n’assurerait plus ses fonctions).
Donné les caractéristiques de la membrane des Archées
o Confère une plus grande stabilité à température élevée.
o La bicouche est formée par des diéthers et des tétraéthers de glycérol, à la place d’un simple éther.
o Les chaînes de carbones, liées au glycérol sont ramifiées (molécules d’isoprène à la place d’acides gras)
Donnez les carcatéristique du cholestérol dans la membrane ( + présence / absence + proportion des lipides + s’insère où+ transporté comment )
- Uniquement dans les membranes plasmiques dans cellules animales.
o Absent des membranes intracellulaires
o Représente ≈ ¼ des lipides des membranes plasmiques
o Il s’insère entre les acides gras des phospholipides et son groupe
hydroxyl interagit avec les groupements polaires.
o Transporté dans le sang sous forme de lipoprotéines de haute densité
(HDL) ou faible densité (LDL).
Quel est le rôle du cholestérol
o empêche la cristallisation des acides gras
o rigidifie la membrane (4 cycles = stabilité mécanique)
o diminue la perméabilité aux molécules hydrosolubles (hydrophiles)
o permet la formation de radeaux lipidiques (rassemblement des lipides
avec des chaînes plus longues)
Qu’est ce que les glycoprotéine ( expliqué la position du sucre )
≡ Protéines enchâssées dans la membrane qui sont généralement modifiées de façon post-traductionnelle.
=> Ajout de sucres sur la partie extracellulaire
donnez le role des glycoprotéines
Rôles:
o Participent à la formation du glycocalyx
o Rôle dans la reconnaissance cellulaire (et l’immunité : la reconnaissance du soi et du non-soi)
Quels sont les trois type de protéines membranaires
- transmembranaires
- ancrées
- périphérique
Donné les caractéristiques des protéines périphériques
Interragissent avec les composantes de la membrane ( 6) ou des protéines protéines trans-membranaire ( 7,8)
=> voir diapo 34
Donné les caractéristiques des protéines transmembranaire
Passent une (1) ou plrs ( 2) fois à travers la membrane sous forme d’hélide alpha (1,2)ou de feuillets plissés beta ( 3)
=> Voir diapo 34
Donné les caractéristiques des protéines ancrées
Sont enchassé sur un seul feuillet ( intra ou extra cellulaire )par une hélice alpha amphipatique ( 4) ou par une chaine lipidique (5) ( juste un hémimembrane traverse pas la bicouche )
=> Voir diapo 34
Donne les roles des protéines membranaires
- canal ionique : permet à un ion spécifique de passer ( passif )
- Transporteur : transporte des substances spécifiques en changeant la forme
- Récepteur : reconnait un ligand et modifie le fonctionnement de la cell.
- Enzyme : catalyse une rct
- Amarre : fixe des flaments ce qui confère une stabilité
- Marqueur d’identité cellulaire : Confère un caractère unique au cell. de chaque individu
Qu’est ce que la cryofracture
Congélation de l’échantillon dans l’azote liquide, puis découpe fine à l’aide d’un
couteau froid
