Cours 6 : Le noyau Flashcards

1
Q

Qu’est ce qui provoque le mouvement dans le cytoplasme , comment font-ils

A

Les moteurs protéiques, en
circulant le long des filaments

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Q

Quel est le role du noyau

A
  • protège
  • séquestre l’ADN,
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3
Q

Quel est l’avantage que la séquestre l’ADN

A

Cela évite des collisions avec les protéines
moteurs ou les cargos qu’elles traînent

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4
Q

Expliquer grossièrement les étapes de la transcription

A

gène → ARN pré-messager → ARN messager

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Q

Expliquer grossièrement les étapes de la traduction

A

ARN messager → protéine

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6
Q

L’ARNm transcrit à partir de l’ADN doit subir quoi avant la traduction

A
  • plusieurs étapes de
    maturation
    => Éssage, coiffe en 5’,
    poly-adenylation en 3’
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7
Q

Le noyau empêche quoi

A

la traduction précoce des ARNm en contrôlant leur sortie vers le cytoplasme

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8
Q

V/F : Chez les procaryotes le cytoplasme des bactéries possède 5 types de moteurs protéiques

A

Faux : Le cytoplasme des bactéries ne possède pas de moteurs protéiques

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9
Q

Quel est l’impact du fait que l’ADN des bactéries ne possède pas d’introns

A

la transcription et la traduction ont lieu simultanément dans le cytoplasme

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10
Q

Puisque les procaryotes n’ont pas d’introns et de moteur protéique il n’ont pas besoin de quoi

A

De noyau

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11
Q

Les chromosomes mitotiques sont constitués de quoi

A

Ce sont des gros complexes d’ADN et de protéines (chromatine)

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12
Q

V/F : les chromosomes mitotiques sont visibles au microscope photonique

A

Vrai

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13
Q

Qu’est ce qui est utilisé pour différencier les CM

A

Différents colorants:
- Giemsa (patron caractéristique de bandes)
- des sondes fluorescentes

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14
Q

Comment les colorant se lie au CM

A

Il sont complémentaires à des séquences spécifiques
=> Et colore des bandes sur un chromosomes

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15
Q

Quel est l’intérêt d’utiliser un colorant pour les chromosome homologue

A

Pour chaque paire de chromosome ont a le même patron de bande ( on peut ainsi reconnaitre les chromosome homologues )

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16
Q

Qu’est ce qu’un caryotype

A

Les chromosomes homologues placée ensemble

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17
Q

L’information génétique sur les chromosome se trouve sous quel forme

A

Sous forme de gène

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18
Q

V/F : il n’y a juste les gènes sur les chromosome

A

Faux

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19
Q

De quoi est composer un gène

A

Exon : séquence codantes
intron : séquence qui ne code pas
Séquence régulatoire
=> Diapo 7

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20
Q

Quels sont les lieux de la transcription - traduction

A

Transcription => dans la noyau
Traduction => dans le cytoplasme

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21
Q

Le génome humain contiennent combien de paires de bases

A

3 milliards

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22
Q

Quelles sont les type de séquences qui sont conservées entre les organisme ( présent chez l’humain comme chez la souris )

A

Les séquences codantes et régulatrices

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23
Q

Qu’est ce qu’une séquence codante

A

Une séquence qui code pour qqc ( une protéine

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24
Q

Qu’est ce qu’une séquence conservée

A

Une séquence qu’on retrouve à travers l’évolution chez plusieurs espèces

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25
Q

Qu’est ce qu’une séquence régulatrice

A

Toutes séquence présentes pour réguler le métabolisme de la cellules ( en général l’expression des gènes et la quantité de transcription )

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26
Q

Que fait on lorsque l’on fait un BLAST

A

Il est possible d’aligner les séquences d’ADN ( en nucléotides ) de plusieurs espèces différent

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27
Q

V/F : on peux juste utiliser le blast avec l’ADN

A

FAUX : Il est aussi possible d’aligner les séquences des protéines (en acides aminés) connues chez plusieurs espèces

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28
Q

Lorsque qu’on aligne l’ADN qu’est ce que la séquence consensus

A

La séquence conservée
=>Elle est composée des acides
aminés ou nucléotides qui occupent une position donnée le plus fréquemment lors de l’alignement

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29
Q

Nommer des éléments qui compose le génome humain

A
  • Gène codant pour une protéine ( très petit pourcentage )

Séquence répété
- répétition de séquence simple
- Segment de duplication

Introns

Transposon
- ADN Transposons
- LTR transposons
- SINE
- LINE

Séquence non-répété
- hétérochromatine
- Séquence unique

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30
Q

Qu’est ce que les transposons

A

Séquences répétées dont la majorité sont mobiles

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31
Q

Comment se déplace les transposons

A

De manière autonome

32
Q

En plus des transposons l’ADN répétitif comporte quoi

A
  • des duplications de segments chromosomiques
  • des séquences simples de 2-6 pb, répétées jusqu’à 100 fois
33
Q

Les duplications de segments chromosomiques et les séquences simples de l’ADN répétitif peuvent être défini comme quel type de séquence

A

Séquences non -mobile

34
Q

Les séquence simple se retrouve où

A

dans les centromères et les télomères

35
Q

L’information génétique se trouve ou

A

sous forme de gène dispersé parmi des séquence répétitives

36
Q

Qu’est ce que crossing over ( lors de la duplication de segment chromosomique

A

Lors de la duplication de segment chromosomique il y a des échange des parties des chromosomes homologue ( 1 du papa et 1 de la maman )

37
Q

Qu’est ce que le crossing over inégal

A

Le mécanisme du crossing over se trompe et échange dans les chromosomes homologue pas les même séquence exactement ( pas la même taille ou les même segments )

38
Q

Quelle est la composition du génome d’une bactérie

A

Principalement des séquences
codant pour des protéine:

39
Q

Qu’est ce qui est nécessaire puisque l’ADN eucryote est très long

A

Il doit être condensé à l’intérieur du noyau

40
Q

Quel est le problème lorsque l’on compacte l’ADN

A

Les groupements P chargés ‘-’ se retrouve à proximité (accumulation de la
charge du même type)

41
Q

Que fait on pour remédier au charge négative qui se retrouve à proximité lors du repliement de l’ADN

A

Protéines avec des charges ‘+’

42
Q

Les protéines constituent quel pourcentage de la masse moléculaire d’un chromosome eucaryote

A

La moitié

43
Q

V/F : plus l’organisme est complexe plus la densité génique est faible

A

Vrai :
pour un même segment humain 2 gène E.Coli 57 gène s

44
Q

En interphase il y a combien de niveaux de compactions

A

2

45
Q

Quel sont les deux niveau de compaction lors de l’interphase

A

o Fibres condensées de ≥ 30 nm (région non transcrite)

o Fibres étendues ~ 10 nm (région active pour la transcription),
perles sur un fil

46
Q

Qu’est ce que le nucléosome

A

(perles sur un fil):
- Structure de base de la chromatine
- le premier niveau de compaction

47
Q

Combien de paires de base s’enroulent autour du nucléosomes

A

146 paires de bases

48
Q

Les nucléosomes sont composé de quoi

A

8 histones (4
types différents, deux de chaque type).
=> H2A, H2B, H3, H4

49
Q

l’histone H1 permettent quoi

A

H1: stabilise l’ADN
sortant des nucléosomes (approche les 2 extrémités)
et permet leur empilement en fibre

50
Q

V/F : l’histone H1 fait partie du nucléosome

A

FAUX

51
Q

Les 4 types d’histone sont composé de quoi quel sont les rôle

A

Deux régions bien distinctes :
- une queue N-terminale variable, qui permet la régulation ( se modifie selon les signaux ) de la liaison de l’histone avec l’ADN

  • une partie C-terminale conservée, qui permet
    l’assemblage du nucléosome.
52
Q

V/F : Les queues N d’histones sont à l’intérieur du nucléosome et peuvent être modifiées par des enzymes

A

FAUX : elles sortent du nucléosome

53
Q

Quelle sont les modifications que peuvent subir des queues d’histone N

A
  • Acétylation
  • Phosphorylation
  • Méthylation et ubiquitination
54
Q

Acétylation sert à quoi

A

Décondenser l’ADN ( disponible pour d’Autre protine )

55
Q

Qu’est ce que l’Acétylation

A

cache la charge ‘+’ sur les lysines des histones et donc il y a une perte d’interaction avec l’ADN chargé ‘-‘ (=perte des liens ioniques) = l’ADN se détache et donc moins condensé

56
Q

Qu’est ce que la phosphorylation

A

le P ajouté sur les sérines et il va neutraliser une charge ‘+’ voisine de la lysine ou
d’arginine. Le P peut aussi augmenter l’effet de répulsion de l’ADN (en ajoutant plus de charges ‘-‘).

57
Q

Qu’est ce que la méthylation / ubiquitination

A

L’ajout de ces groupements rend l’histone compatible à d’autres
protéines (plateforme de recrutement pour les autres; = permettent les changements de configuration de
la queue N la rendant complémentaire à d’autres protéines … ou d’autres possibilités avec interaction
protéine-protéine

58
Q

Quels sont les différents type d’ADN selon la condensation

A

Euchromatine : L’ADN en fibres de 11 nm peut être transcrit en ARN.

Hétérochromatine : à partir de 30 nm , ADN non transcrit

59
Q

Plus l’ADN est condensé …

A

= Moins il est accessible aux protéines
lors de la transcription, réplication, recombinaison

60
Q

Comment fait t’on des boucles d’hétérochromatine

A

à l’aide des protéines Sir (silent information regulator,
=> une condensation de plus)

61
Q

Les queues N des histones
doivent porter les
modifications compatibles avec quelle protéine

A

protéines Sir

62
Q

Expliquer les étapes de condensation de l’ADN

A

=> Diapo 21

63
Q

V/F : le nucléole est délimité par une membrane

A

Faux : Une section du noyau apparaît plus sombre au microscope MET (présence de plusieurs protéines)

64
Q

Quelle sont les deux zones du nucléoles

A

o La zone fibrillaire est la zone de transcription des ARN ribosomaux, à partir de 200 gènes arrangés en
tandem ( distribués sur 5 chromosomes chez l’humain)

o La zone granuleuse est le site d’assemblage des sous-unités ribosomales (ARNr + protéines).
+ foncé

65
Q

Quel est le rôle du ribosome

A

sert à la traduction de l’ARNm en protéine

66
Q

Le ribosome est composé de quoi

A

2 sous-unités

67
Q

Quand est ce que s’assemble les sous-unités des ribosome

A

Lors de la traduction

68
Q

Les sous-unités des ribosome est composé de quoi

A

d’ARN (ARNr) et de protéines.

69
Q

La formation des sous-unités s’effectue où

A

Dans le noyau près du nucléole

70
Q

Quel sont les différents sites sur le ribosomes

A

o Un site de liaison pour l’ARNm.
o Un site de liaison de l’amino-acyl-ARNt ou site A, qui fixe la molécule d’ARNt
entrante portant un acide aminé.
o Un site peptidyl-ARNt ou site P, qui fixe la molécule d’ARNt liée à l’extrémité en
croissance de la chaîne polypeptidique.
o Un site de sortie de l’amino-acyl-ARNt ou Site E (E : exit).

71
Q

Donnez les 6 étapes de la biogenèse des ribosomes

A

(i) Transcription des composants (ARNr, ARNm codant
pour les protéines ribosomales (RP) et les facteurs
d’assemblage (AF) et snoRNA ) : ARNr et ARNm transcrits
dans le noyau (ARNr dans le nucléole et ARNm à l’extérieur du
nucléole)

(ii) Traitement (épissage des pré-ARNr), on enlève les introns

(iii) Modification des pré-ARN, RP et AF;

(iv) Assemblage des sous-unités en périphérie du nucléole;
(importation nucléaire de RP et d’AF);

(v) Transport : exportation de pré-ribosomes vers le
cytoplasme;

(vi) Assemblage final des sous-unités et contrôle de la qualité et la surveillance

72
Q

Expliquer le déplacement des éléments lors de la biogenèse des ribosomes

A

les ARN sont dans le noyau ,
Les ARN sort dans le cytosol pour se traduire pour arriver à l’étape 4

73
Q

Qu’est ce que les snoRNP et snRNP

A

Complexe qui participe à la maturation d’ARN messager et d’ARN ribosomique

74
Q

Qu’est ce que le corps de Cajal

A

site d’assemblage et de recyclage protéique

75
Q

Quel est le rôle des snRNPs

A
  • Les ARNm doivent être épissés durant leur maturation à l’aide des snRNPs
  • Ces derniers sont utilisés pour lier les séquences spécifiques aux extrémités des
    introns (ce que permet de les enlever
76
Q

Quel est le rôle des snoRNPs

A

Les ARNr précurseurs doivent être modifiées et coupées par les snoRNPs durant leur maturation