Cours 6 : Le noyau Flashcards

1
Q

Qu’est ce qui provoque le mouvement dans le cytoplasme , comment font-ils

A

Les moteurs protéiques, en
circulant le long des filaments

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Quel est le role du noyau

A
  • protège
  • séquestre l’ADN,
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Quel est l’avantage que la séquestre l’ADN

A

Cela évite des collisions avec les protéines
moteurs ou les cargos qu’elles traînent

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Expliquer grossièrement les étapes de la transcription

A

gène → ARN pré-messager → ARN messager

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Expliquer grossièrement les étapes de la traduction

A

ARN messager → protéine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

L’ARNm transcrit à partir de l’ADN doit subir quoi avant la traduction

A
  • plusieurs étapes de
    maturation
    => Éssage, coiffe en 5’,
    poly-adenylation en 3’
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Le noyau empêche quoi

A

la traduction précoce des ARNm en contrôlant leur sortie vers le cytoplasme

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

V/F : Chez les procaryotes le cytoplasme des bactéries possède 5 types de moteurs protéiques

A

Faux : Le cytoplasme des bactéries ne possède pas de moteurs protéiques

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Quel est l’impact du fait que l’ADN des bactéries ne possède pas d’introns

A

la transcription et la traduction ont lieu simultanément dans le cytoplasme

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Puisque les procaryotes n’ont pas d’introns et de moteur protéique il n’ont pas besoin de quoi

A

De noyau

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Les chromosomes mitotiques sont constitués de quoi

A

Ce sont des gros complexes d’ADN et de protéines (chromatine)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

V/F : les chromosomes mitotiques sont visibles au microscope photonique

A

Vrai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Qu’est ce qui est utilisé pour différencier les CM

A

Différents colorants:
- Giemsa (patron caractéristique de bandes)
- des sondes fluorescentes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Comment les colorant se lie au CM

A

Il sont complémentaires à des séquences spécifiques
=> Et colore des bandes sur un chromosomes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Quel est l’intérêt d’utiliser un colorant pour les chromosome homologue

A

Pour chaque paire de chromosome ont a le même patron de bande ( on peut ainsi reconnaitre les chromosome homologues )

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Qu’est ce qu’un caryotype

A

Les chromosomes homologues placée ensemble

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

L’information génétique sur les chromosome se trouve sous quel forme

A

Sous forme de gène

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

V/F : il n’y a juste les gènes sur les chromosome

A

Faux

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

De quoi est composer un gène

A

Exon : séquence codantes
intron : séquence qui ne code pas
Séquence régulatoire
=> Diapo 7

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Quels sont les lieux de la transcription - traduction

A

Transcription => dans la noyau
Traduction => dans le cytoplasme

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Le génome humain contiennent combien de paires de bases

A

3 milliards

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Quelles sont les type de séquences qui sont conservées entre les organisme ( présent chez l’humain comme chez la souris )

A

Les séquences codantes et régulatrices

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Qu’est ce qu’une séquence codante

A

Une séquence qui code pour qqc ( une protéine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Qu’est ce qu’une séquence conservée

A

Une séquence qu’on retrouve à travers l’évolution chez plusieurs espèces

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Qu'est ce qu'une séquence régulatrice
Toutes séquence présentes pour réguler le métabolisme de la cellules ( en général l'expression des gènes et la quantité de transcription )
26
Que fait on lorsque l'on fait un BLAST
Il est possible d’aligner les séquences d’ADN ( en nucléotides ) de plusieurs espèces différent
27
V/F : on peux juste utiliser le blast avec l'ADN
FAUX : Il est aussi possible d’aligner les séquences des protéines (en acides aminés) connues chez plusieurs espèces
28
Lorsque qu'on aligne l'ADN qu'est ce que la séquence consensus
La séquence conservée =>Elle est composée des acides aminés ou nucléotides qui occupent une position donnée le plus fréquemment lors de l'alignement
29
Nommer des éléments qui compose le génome humain
- Gène codant pour une protéine ( très petit pourcentage ) Séquence répété - répétition de séquence simple - Segment de duplication Introns Transposon - ADN Transposons - LTR transposons - SINE - LINE Séquence non-répété - hétérochromatine - Séquence unique
30
Qu'est ce que les transposons
Séquences répétées dont la majorité sont mobiles
31
Comment se déplace les transposons
De manière autonome
32
En plus des transposons l'ADN répétitif comporte quoi
- des duplications de segments chromosomiques - des séquences simples de 2-6 pb, répétées jusqu’à 100 fois
33
Les duplications de segments chromosomiques et les séquences simples de l'ADN répétitif peuvent être défini comme quel type de séquence
Séquences non -mobile
34
Les séquence simple se retrouve où
dans les centromères et les télomères
35
L'information génétique se trouve ou
sous forme de gène dispersé parmi des séquence répétitives
36
Qu'est ce que crossing over ( lors de la duplication de segment chromosomique
Lors de la duplication de segment chromosomique il y a des échange des parties des chromosomes homologue ( 1 du papa et 1 de la maman )
37
Qu'est ce que le crossing over inégal
Le mécanisme du crossing over se trompe et échange dans les chromosomes homologue pas les même séquence exactement ( pas la même taille ou les même segments )
38
Quelle est la composition du génome d'une bactérie
Principalement des séquences codant pour des protéine:
39
Qu'est ce qui est nécessaire puisque l'ADN eucryote est très long
Il doit être condensé à l’intérieur du noyau
40
Quel est le problème lorsque l'on compacte l'ADN
Les groupements P chargés ‘-’ se retrouve à proximité (accumulation de la charge du même type)
41
Que fait on pour remédier au charge négative qui se retrouve à proximité lors du repliement de l'ADN
Protéines avec des charges ‘+’
42
Les protéines constituent quel pourcentage de la masse moléculaire d’un chromosome eucaryote
La moitié
43
V/F : plus l'organisme est complexe plus la densité génique est faible
Vrai : pour un même segment humain 2 gène E.Coli 57 gène s
44
En interphase il y a combien de niveaux de compactions
2
45
Quel sont les deux niveau de compaction lors de l'interphase
o Fibres condensées de ≥ 30 nm (région non transcrite) o Fibres étendues ~ 10 nm (région active pour la transcription), perles sur un fil
46
Qu'est ce que le nucléosome
(perles sur un fil): - Structure de base de la chromatine - le premier niveau de compaction
47
Combien de paires de base s'enroulent autour du nucléosomes
146 paires de bases
48
Les nucléosomes sont composé de quoi
8 histones (4 types différents, deux de chaque type). => H2A, H2B, H3, H4
49
l'histone H1 permettent quoi
H1: stabilise l’ADN sortant des nucléosomes (approche les 2 extrémités) et permet leur empilement en fibre
50
V/F : l'histone H1 fait partie du nucléosome
FAUX
51
Les 4 types d'histone sont composé de quoi quel sont les rôle
Deux régions bien distinctes : - une queue N-terminale variable, qui permet la régulation ( se modifie selon les signaux ) de la liaison de l’histone avec l’ADN - une partie C-terminale conservée, qui permet l’assemblage du nucléosome.
52
V/F : Les queues N d’histones sont à l'intérieur du nucléosome et peuvent être modifiées par des enzymes
FAUX : elles sortent du nucléosome
53
Quelle sont les modifications que peuvent subir des queues d'histone N
- Acétylation - Phosphorylation - Méthylation et ubiquitination
54
Acétylation sert à quoi
Décondenser l'ADN ( disponible pour d'Autre protine )
55
Qu'est ce que l'Acétylation
cache la charge ‘+’ sur les lysines des histones et donc il y a une perte d’interaction avec l’ADN chargé ‘-‘ (=perte des liens ioniques) = l’ADN se détache et donc moins condensé
56
Qu'est ce que la phosphorylation
le P ajouté sur les sérines et il va neutraliser une charge ‘+’ voisine de la lysine ou d’arginine. Le P peut aussi augmenter l’effet de répulsion de l’ADN (en ajoutant plus de charges ‘-‘).
57
Qu'est ce que la méthylation / ubiquitination
L’ajout de ces groupements rend l’histone compatible à d’autres protéines (plateforme de recrutement pour les autres; = permettent les changements de configuration de la queue N la rendant complémentaire à d’autres protéines … ou d’autres possibilités avec interaction protéine-protéine
58
Quels sont les différents type d'ADN selon la condensation
Euchromatine : L’ADN en fibres de 11 nm peut être transcrit en ARN. Hétérochromatine : à partir de 30 nm , ADN non transcrit
59
Plus l'ADN est condensé ...
= Moins il est accessible aux protéines lors de la transcription, réplication, recombinaison
60
Comment fait t'on des boucles d'hétérochromatine
à l’aide des protéines Sir (silent information regulator, => une condensation de plus)
61
Les queues N des histones doivent porter les modifications compatibles avec quelle protéine
protéines Sir
62
Expliquer les étapes de condensation de l'ADN
=> Diapo 21
63
V/F : le nucléole est délimité par une membrane
Faux : Une section du noyau apparaît plus sombre au microscope MET (présence de plusieurs protéines)
64
Quelle sont les deux zones du nucléoles
o La zone fibrillaire est la zone de transcription des ARN ribosomaux, à partir de 200 gènes arrangés en tandem ( distribués sur 5 chromosomes chez l’humain) o La zone granuleuse est le site d’assemblage des sous-unités ribosomales (ARNr + protéines). + foncé
65
Quel est le rôle du ribosome
sert à la traduction de l’ARNm en protéine
66
Le ribosome est composé de quoi
2 sous-unités
67
Quand est ce que s'assemble les sous-unités des ribosome
Lors de la traduction
68
Les sous-unités des ribosome est composé de quoi
d’ARN (ARNr) et de protéines.
69
La formation des sous-unités s'effectue où
Dans le noyau près du nucléole
70
Quel sont les différents sites sur le ribosomes
o Un site de liaison pour l’ARNm. o Un site de liaison de l’amino-acyl-ARNt ou site A, qui fixe la molécule d’ARNt entrante portant un acide aminé. o Un site peptidyl-ARNt ou site P, qui fixe la molécule d’ARNt liée à l’extrémité en croissance de la chaîne polypeptidique. o Un site de sortie de l’amino-acyl-ARNt ou Site E (E : exit).
71
Donnez les 6 étapes de la biogenèse des ribosomes
(i) Transcription des composants (ARNr, ARNm codant pour les protéines ribosomales (RP) et les facteurs d'assemblage (AF) et snoRNA ) : ARNr et ARNm transcrits dans le noyau (ARNr dans le nucléole et ARNm à l’extérieur du nucléole) (ii) Traitement (épissage des pré-ARNr), on enlève les introns (iii) Modification des pré-ARN, RP et AF; (iv) Assemblage des sous-unités en périphérie du nucléole; (importation nucléaire de RP et d’AF); (v) Transport : exportation de pré-ribosomes vers le cytoplasme; (vi) Assemblage final des sous-unités et contrôle de la qualité et la surveillance
72
Expliquer le déplacement des éléments lors de la biogenèse des ribosomes
les ARN sont dans le noyau , Les ARN sort dans le cytosol pour se traduire pour arriver à l'étape 4
73
Qu'est ce que les snoRNP et snRNP
Complexe qui participe à la maturation d'ARN messager et d'ARN ribosomique
74
Qu'est ce que le corps de Cajal
site d'assemblage et de recyclage protéique
75
Quel est le rôle des snRNPs
- Les ARNm doivent être épissés durant leur maturation à l’aide des snRNPs - Ces derniers sont utilisés pour lier les séquences spécifiques aux extrémités des introns (ce que permet de les enlever
76
Quel est le rôle des snoRNPs
Les ARNr précurseurs doivent être modifiées et coupées par les snoRNPs durant leur maturation