Cours 10 : Compartiment cellulaire III Flashcards
Le trafic vésiculaire à combien de direction
Une
Résumé le trafic vésiculaire
- comprend le chargement d’une cargaison dans le site de bourgeonnement,
- la formation de vésicules à
partir d’une membrane donneuse - la fusion de ces
vésicules avec une membrane cible
Il y a combien de types de vésicules ( qu’est ce qui les différencie )
trois types de vésicules, recouvertes par trois protéines différentes, selon leur endroit dans la cellule et où elles se dirigent
Qu’est ce que le COP
coatprotein (manteau protéique)
Les vésicules COP-II sont formées à partir de quoi et acheminés où
à partir du RER et sont
acheminées vers le Golgi
Les vésicules COP-II se forment où
Elles se forment autour de leur cargaison.
La La Sar1(GTPase monomérique) est activée par quoi et insérée dans la membrane par quoi
- activée par une GEF de la membrane
- insertion de Sar1
dans la membrane grâce à une hélice α amphiphile.
Les protéines Sec23/24 lient quoi pour former quoi
- Sar1-GTP
- un récepteur de cargaison
=> Elles forment l’intérieur du manteau protéique des vésicules COP-II
Les protéines Sec13/31 se lient à quoi et forme quoi
- par-dessus Sec23/24
=> forment l’extérieur du manteau
protéique de COP-II
Quel sont les caractéristiques des protéines Sec 13/31
Elles sont courbées et leur forme détermine le diamètre de la vésicule
Que doivent faire les vésicules COP-II après avoir bourgeonner dans le RER
elles doivent se fusionner à une membrane cible
Quel types de protéine sont utilisé pour le ciblage des COP-II
- les Rabs (GTPase de type RAS)
- les SNAREs (protéines de fusion)
=> Les deux travaillent ensemble pour sélectionner la bonne membrane
Rab-GTP est activé par quoi et s’insère où
- activée par un GEF
membranaire situé sur la membrane donneuse de vésicule
Le récepteur de la Rab-GTP se trouve où
se trouve sur la membrane cible ( acceptrice de la vésicule)
V/F : Les Rabs et SNAREs
participent au ciblage
des autres vésicules
(COP-I et clathrine)
Vrai
Les SNAREs sont des protéines membranaires qui se trouvent sous quel forme ( donnez des exemples )
- Sous forme de paires complémentaires.
=>
Une v-SNARE sur la membrane de la vésicule
Une t-SNARE inséré dans la membrane cible.
La liaison v/t-SNAREs est tellement forte que se passe t’il
- l’eau entre les membranes est expulsée.
- Sans eau, les 2
couches externes de chaque membrane fusionnent
Une fois que la vésicule a fusionné avec la membrane cible que se passe t’il avec les SNARES
- il faut dissocier la paire de SNAREs(v-SNARE et t-SNARE)
=> grâce à l’hydrolyse de l’ATP
Quel sont les trois type de Golgi
Trans ( en haut )
Médiane ( milieu )
Cis ( intérieur )
Les Vésicule COP-II se fusionnent à quoi
le cis-Golgi
Que se passe t’il lorsque les vésicules COP-II fusionnent avec le Cis-Golgi
- Une partie des protéines retournera au RER via les vésicules
COP-I. - D’autres poursuivront leur route vers la région médiane-Golgi, puis le trans-Golgi.
Que se passe t’il avec les protéine dans le médiane-golgi
les protéines subissent une
maturation de leurs sucres
Que se passe t’il avec les protéine dans le trans-golgi
les protéines sont triées et emballées pour
leur destination finale :
=> endosome/lysosome(vésicules de clathrine)
=> la membrane plasmique (vésicules COP-I).
Quel vésicule transporte les protéines vers le RE entre les différentes parties du Golgi lui-même ou vers la membrane plasmique
Les vésicules qui bourgeonnent continuellement à partir du Golgi
Qu’est ce qui différencie les vésicules COP-I des vésicules COP-II
- utilisent les protéines de recouvrement différentes
- Leur formation commence par l’activation de ARF1 (protéine GTPase de type RAS) au lieu de Sar1
Dans le Cis-Golgi, les manteaux de COP-Ise forment autour de quoi
des protéines
transmembranaires ayant la séquence KKXX en C terminale
=> Dont les récepteurs KDEL
Le retour de lipides et des protéines KKXX/KDEL du cis-Golgi au RE est constitutif (continuel) et a besoin de quoi
Rab-snares appropriées
V/ F : le RE et le Cis-Golgi trient les protéines
FAUX , Le RE ne trie pas les protéines, c’est
pourquoi le cis-Golgi s’en occupe
Nommez et expliqué les deux modèles qui tente d’exprimer le mécanisme de transport des
protéines à travers les différentes citernes et vésicules du Golgi
Modèle de transport de vésicules :
Les citernes restent statiques, les protéines voyagent d’une citerne à l’autre via les vésicules (antérograde et rétrograde)
Modèle de maturation des citernes: Maturation graduelle des citernes et des protéines qu’elle contiennent (antérograde). Le transport rétrograde se fait par vésicules.
V/F : le mélange du Modèle de transport de vésicules et du Modèle de maturation des citernes est possible
Vrai
Quelle est le rôle de la matrice extra-golgienne
Responsable de l’intégrité structurale du Golgi, elle aide au transport et positionne le Golgi dans la cellule
La matrice extra-golgienne est composé de quoi , quel est l’impact de ce protéine
Composée de nombreuses protéines, majoritairement des golgines, associées aux membranes du Golgi, du
côté cytoplasmique.
=>Ces protéines s’allongent et forment un filet qui exclut la majorité des organites,
mêmes les ribosomes.
Expliqué la structure des golgines
des protéines « coiled-coil», une super hélice, retrouvées chez tous les eucaryotes
Expliqué comment les golgines s’insère à la membrane du Golgi
s’insèrent dans la membrane du Golgi via leur C-terminal et l’extrémité N-terminale peut se retrouver beaucoup plus loin dans le cytoplasme (100-600nm)
V/F : la structure des golgines dans la membrane est continue
Faux , La structure en super hélice est interrompue par endroits
pour permettre plus de flexibilité
La plupart des golgines peuvent lier quelle type de protéine
lier les protéines d’identité vésiculaire (Rab, Arf )
Lorsque les golgines sont recrutées à des citernes spécifique , que font elles
‘pêchent’ des vésicules spécifiques dans le cytoplasme.
Combine de type de golgine à la fois est exprimé sur la
mitochondrie, quel modification subissent t’elle cette modification permet quoi
Un type
=> ajout du signal d’insertion pour la membrane externe de mitochondrie
=> Analyse de ce qui a abouti à la surface de la mitochondrie
L’attachement d’une vésicule ou d’une citerne à la golgine peut mener à quoi
- la fusion membranaire (certaines golgines interagissent avec les SNAREs)
- à une stabilisation de la matrice externe du Golgi (empilement des citernes).
Expliqués les protéines arrivent au golgi de quelle manière , qu’est ce quo leur a été ajouté
Les protéines arrivent au golgi ayant une glycosylation fournie par le RER:
- toutes ont la même unité préformée liée aux Asns et composée de N-acétylglucosamine (GlcNac) et de mannose
Différentes enzymes golgiennes travailleront sur cette unité préformée des protéines de quelle manière , pour former quoi
de façon séquentielle :
Chaque produit est reconnu comme le substrat pour la prochaine enzyme
=>pour former une unité de
sucre différente
Qu’est ce que la tomographie immunoélectronique
localisation de l’enzyme mannosidase I (ManI) par les anticorps couplés aux particules d’or (observable en microscopie électronique), puis modélisation de l’appareil de golgi en 3D (tomographie)
V/ F :Le Golgi est formé de plusieurs compartiments ayant des
activités enzymatiques différentes.
Vrai
Quels sont les rôles des modification des sucres attachés aux protéines (glycosylation) lorsqu’elles passent par l’appareil de Golgi
- Ciblage: un moyen de signaler le lieu d’appartenance de la protéine lors du tri dans le trans-Golgi.
- Augmente la solubilité de la protéine, ce qui aide au repliement en milieu aqueux.
- Couche protectrice : résistance aux protéases, ce qui est très utile pour les constituants du lysosome.
- Adhérence intercellulaire et au substrat ( jonctions, glycocalyx)
- Signalisation intercellulaire. (ex. antigènes et globules blancs
V/F : le golgi participe juste à la formation de protéines
Faux , le Golgi participe également dans la production de glycolipides
Donnez les deux possibilités de destinations à partir du trans-golgi
- Vers la membrane plasmique : par des vésicules sécrétoires COP-I ayant des Rabs et SNAREs appropriées. Les protéines cargo sont ciblées par un sucre complexe.
- Vers les endosomes-lysosomes: par des vésicules de clathrine ayant des Rabs et SNAREs appropriées. Les protéines-cargo sont ciblées par un sucre riche en mannose phosphaté.
Qu’est ce qui existe pour des vésicules sécrétoires,
des voies constitutives et des voies contrôlées
Lors des voies contrôlées , les vésicules sécrétoires font quoi avant de fusionner à la membrane
les protéines sont emmagasinées
dans des vésicules qui attendent un signal
Qu’est ce qu’un retrait de membranes, à partir de la vésicule nouvellement formée
concentrer les protéines cargo des vésicules ayant quitté le trans-Golgi en une seule vésicule (si les protéines-cargo peuvent être ensemble).
Les membranes récupérées suite au retrait de membrane sont fait de quoi et retournent où
faites de clathrine, retournent au Golgi
Expliqué la relation entre le golgi et le MTOC chez les vertébrés
- le Golgi est adjacent au MTOC.
- Il s’attache aux microtubules et au MTOC directement.
=> Pour se déplacer, il s’accroche à la dynéine.
Chez les vertébrés , le golgi se positionne grace à quoi
plusieurs protéines dont les golgines
Chez les plantes et les mycètes, le Golgi se positionne et se déplace grâce à l’interaction de quoi
De la matrice (extra-golgienne) avec l’actine-F et la myosine
Durant la mitose, la phosphorylation des protéines de la matrice extra-golgienne (et donc des golgines) bloque quoi
la voie de sécrétion et défait les citernes en petites vésicules
Expliqué la distribution du golgi lors de la mitose
- le Golgi est distribué par «petits paquets» de façon égale entre
les cellules filles. - La distribution se fait à l’aide du fuseau mitotique et les
dynéines.
Que se passe t’il durant l’apoptose avec le golgi
la voie de sécrétion est bloquée et le Golgi est
fragmenté de façon similaire, mais irréversible
Qu’est ce qui détachent et
dégradent les protéines de la matrice extra-golgienne
Les enzymes protéolytiques, les caspases
Qu’est ce que le lysosome
- Le site intracellulaire de digestion
Qu’est ce qui part du golgi ou de la membrane plasmique et arrive au endosome
- Des vésicules de clathrine (contiennent les hydrolases acides)
- sont acheminées vers des compartiments intermédiaires ( endosome )
Que se passe t’il à l’endosome avec l’arrivée des vésicules
devient de plus en plus acide (grâce à l’activité de la pompe ATPase de type V) et accumule
les hydrolases acides (fusion avec des vésicules contenant ces enzymes)
=> il se transforme en lysosome.
Les protéines destinées au
lysosome/ endosome sont étiquetées dans le
Golgi avec quoi
un mannose-6-phosphate (M6P).
Qu’est ce qui est plus acide les lysosome ou les endosome
lysosome
Donne les deux rct en série pour créer le mannose-6
phosphate (M6P)
- Une phosphotransférase lie la région signal de la (future) protéine lysosomale et transfère un GlcNAc-P (N
acétylglucosamine phosphatée) sur un mannose. - Une hydrolase enlève le GlcNAc et ne garde que le phosphate
Les vésicules de clathrine se forment autour de leur cargaison grâce aux quoi
Adaptines
Expliquer comment se lie les adaptines
lient le récepteur membranaire du M6P d’un côté, puis la clathrine de l’autre
une unité de clathrine s’appelle comment
une triskèle, composée de 3 grosses protéines (chaînes lourdes) et 3 petites
(chaînes légères).
Les triskèle forme quoi
leur chevauchement forme un manteau épais sur une sphère.
=>La vésicule finale ressemble à un panier d’osier
Expliquer les formation des vésicules à partir du trans-golgi
- Une dynamine (GTPase) est nécessaire pour faire un «pincement» final et détacher la vésicule de la membrane donneuse. Cette protéine se tord grâce à l’énergie libérée par l’hydrolyse du GTP.
- Les vésicules détachées perdent leur manteau de clathrine. Cela permet de recycler la clathrine et
d’exposer les Rabs et SNAREs (le manteau de clathrine est plus épais que celui des COP).
V/F : Le transport des hydrolases acides est unidirectionnel
Vrai
Expliquer que se passe t’il au pH acide avec le M6P
- Le récepteur de M6P ne fonctionne pas au pH acide. La cargaison se détache et le récepteur est recyclé vers le Golgi (via des vésicules qui retournent au Golgi)
- Une phosphatase acide enlève le P de M6P dans le lysosome (la cargaison perd le signal reconnu par le récepteur)
Quel est le rôle des endosomes lorsqu’il recoivent les vésicules de clathrine du Golgi ET de la membrane plasmique
font le tri des molécules qu’ils reçoivent à partir des vésicules de clathrine. Ils recyclent les
récepteurs (les retournent soit vers le Golgi, soit vers la membrane plasmique) avant que la digestion ne commence.
L’endocytose se fait avec quel vésicules
vésicules en provenance de la membrane plasmique
Qu’est ce que la pinocytose
ingestion de molécules solubles. Elle utilise les puits
recouverts comme intermédiaires dans la formation des vésicules de
clathrine
Qu’est ce que l’endocytose par récepteur
profite de la pinocytose grâce à l’utilisation des adaptines
Expliquer les étapes de la phagocytose
- L’ingestion de grosses particules nécessite la formation de pseudopodes qui entourent «la proie».
- La cellule se contracte (avec actine et myosine) d’un côté et le cytoplasme est projeté de l’autre côté (région de formation des pseudopodes).
- Les filaments d’actine, formant un filet rigide, donne une direction au mouvement du cytoplasme projeté (création du pseudopode)
Donnez les deux étapes de la digestion chez les plantes
1-Endocytose
2-Endosome précoce (tri)
- Protéines mem. à recycler
- Protéines mem. à dégrader
- Protéines solubles à dégrader
Donnez les caractéristique de l’endosome chez les plantes
- Pas de lysosomes
- L’autophagie a eu lieu de la même façon que chez
les animaux mais c’est la vacuole prend la place du
lysosome - Pas de phagocytose
Donnez les rôles des vacuoles
- Remplace le lysosome
- Entrepôt des molécules anti-microbes et anti-herbivores
- Cell. de plus grande taille snas produire plus de cytoplasme
- Excrétion interne
Donnez les compartiments où il y a une incorporation des protéines co-traductionnelle
- RE
- Golgi
- membrane plasmique
- Lysosome
- Vésicules sécrétoire
Donnez les compartiments où il y a une incorporation des protéines post-traductionnelle
- Cytosol
- Noyau
- mitochondrie
- chloroplaste
