Cours 7 - virus Flashcards
Définition virus
Parasite obligatoire qui dépend d’une cellule hôte (aussi appelée cellule cible) pour se répliquer
De quoi est constitué un virus? (3) + définir
Génome => constitué d’un seul acide nucléique
Capside => entouré d’une coque protéique
Enveloppe => entouré (ou non) d’une membrane lipidique
Définition virion
Particule virale complète et capable d’infecter une cellule susceptible
Vrai ou faux un virus avec une enveloppe est plus résistant
FAUX, l’enveloppe (membrane lipidique) est très sensible, donc un virus avec une enveloppe est plus facile à inactiver
vrai ou faux tous les virus ont une enveloppe
faux, certaines familles virales n’ont pas d’enveloppe
De quoi est composé un nucléocapside?
acide nucléique + capside
Vrai ou faux un virus inactivé est tout de même capable d’infecter une cellule
FAUX, un virus inactivé n’est pas capable d’infecter une cellule
Bactéries
1) Ont-elles des organelles fonctionnelles?
2) de quoi est composé le génome?
3) Ont-elles besoin d’un hôte pour se reproduire?
4) Comment se répliquent?
5) Sont-elles sensibles aux antibiotiques?
1) Oui
2) ADN
3) non, possèdent leur propre appareillage pour synthétiser les macromolécules nécessaire à leur reproduction
4) Par fission binaire
5) oui
Virus
1) Ont-ils des organelles fonctionnelles?
2) de quoi est composé le matériel génétique?
3) Ont-elles besoin d’un hôte pour se reproduire?
4) Est-ce que l’acide nucléique viral peut être infectieux?
5) Sont-elles sensibles aux antibiotiques?
6) Sont filtrables?
1) non
2) ADN ou ARN
3) oui, dépendent obligatoirement de la « cellule hôte » pour se reproduire
4) oui
5) non
6) oui, voulant dire qu’ils passent à travers les filtres bactériologiques
Les virus sont visibles avec quel type de microscope
électronique (Pas visible par microscope optique)
Virus géants
1) Font parti de quel ordre
2) diamètre le + grand des virus et de leur génome
3) génome composé de quoi?
4) se répliquent où?
1) Mégavirales
2) diamètre > 1 um ; génome > 500kpb
3) ADN
4) dans le cytoplasme des amibes
Quels sont les deux types de virus de forme hélicoïdale ?
sans enveloppe et avec enveloppe
*forme = symétrie
Quelles sont les parties d’un virus de forme icosaédrique ? Qu’est-ce qui diffère entre les virus virulents et non virulents?
Capside
Acide nucléique
Capsomère
Nucléocapside
Virion
Virulent:
Enveloppe
Glycoprotéine (= spike)
Si enveloppe = virulent
Donc si pas enveloppe = inactivé
Décrire le génome des virus (5)
1- ADN ou ARN
2- Bicaténaire ou monocaténaire
3- Segmenté ou non segmenté
4- Linéaire ou circulaire
5- Poids moléculaire très variable
Nommer les 4 types de génomes viraux
ADN bicaténaire
ADN monocaténaire
ARN monocaténaire
ARN bicaténaire
Définir le cycle de réplication virale
Quels sont les deux conditions pour qu’une cellule puisse permettre la réplication virale
L’ensemble des étapes permettant au virus de se répliquer à l’intérieur d’une cellule hôte.
Requiert une cellule susceptible et permissive à l’infection:
- susceptible = munie de récepteurs cellulaires spécifiques
- permissive = dotée des conditions permettant la production de nouveaux virions
Nommer et décrire les étapes de la réplication virale (12)
1) Attachement - à l’aide d’une protéine à la surface du virus qui reconnaît un récepteur spécifique sur la cellule cible (le ligand s’attache au récepteur)
2. Entrée (par la membrane plasmique)
3. Décapsidation (‘uncoating’) = génome relâché dans la cellule
4. Transcription (précoce)
5. Traduction (précoce)
6. Synthèse des enzymes de réplication
7. Réplication de l’acide nucléique
8. Transcription (tardive)
9. Traduction (tardive)
10. Synthèse des protéines structurales
11. Assemblage des nucléocapsides
12. Libération (de capside rempli de génome) (sort par bourgeonnement)
*chaque famille virale se réplique de façon différente
Quels sont les deux exemples de cycle viral et leurs différences
*En général c’est les 2 types, mais il y a des exceptions
1) Dans le cytoplasme, ARN+
*ARN+= agit comme ARNm, peut être capté par polyribosome de cellule cible
2) Dans noyau (presque entièrement), ADN 2 brins
Expliquer le cycle viral qui se produit en grande partie dans le noyau
Transcription = dans le noyau
Traduction = dans le cytoplasme
*Donc ARN sort du noyau faire la traduction dans cytoplasme, puis re rentre faire la prochaine transcription
3 cycles de transcription
1- traduction IE (pré-précoe); avant réplication
2- traduction E (précoce)
3- traduction L (tardif) (surtout structural)
Puis assemblage dans le noyau
Puis sort du noyau, va dans appareil de Golgi -> réticulum endoplasmique -> se désenveloppe -> se réenveloppe (membrane finale) -> sortie de la cellule par bourgeonnement -> va infecter d’autres cellules
Décrire la classification des virus herpès; dire les critères de subdivision lorsqu’il y a lieu
1) Ordre
2) Famille (4 critères)
3) Sous-famille (4 critères)
4) Genre
5) Espèce
Ordre => …virales
Familles => …viridae
- DNA ou RNA
- ds ou ss
- forme de la capside
- enveloppés ou non
Sous-familles => …virinae (3 types)
- poids moléculaire de l’acide nucléique
- diamètre des particules virales
- nombre de capsomères (= unités de capside)
- hôtes infectés, etc
Genres (…virus)
Espèces (lettre ou chiffre qualifiant le genre) (2 types -> herpesvirus humain 1 et 2)
nomme 4 méthodes de diagnostic viral
microscopie électronique ( technique fastidieuse, cher, lente, pas vrm utilisé)
culture cellulaire + immunofluorescence (IF) avec un anticorps spécifique
PCR (réaction polymérisation en chaîne)
sérologie (recherche des anticorps dans le sérum par IF ou ELISA)
est ce que la microscopie électronique est utile pour Adénoviurs
non permet pas l’identification du type d’adénovirus
pas précise
est ce que la microscopie électronique est utile pour Astrovirus
non, méthode très longue et n’identifie pas le type
explique le processus d’immonofluorescence sur culture cellulaire
on fait pousser des entérovirus
on les incube 2 jours sur lamelle
anticorps contre protéine
réagit avec cellule: si vert = positif/ noir= négatif
???
quelle est la méthode la plus efficace pour diagnostiquer hépatite A
les sérologie IGM (4-12 semaines) et IGG (pour la vie), car elles sont spécifiques pour l’hépatite A (transaminases ne sont pas spécifiques )
explique brièvement ELISA
antigène fixé sur un support solide
fixation de l’anticorps à titrer sur l’antigène
fixation d’un 2e anticorps marqué qui reconnait l’anticorps
révélation de l’activité enzymatique
lecture d’absorbance avec spectromètre
explique la polymérisation en chaine (PCR)
il y a 3 étapes
1- T° élevé (95°C) permet la dénaturation de l’ADN - sépare les 2 brins (30 sec)
2- T° de 55°C, hybridation des amorces (15 sec)
3- T° de 72°C, extension à l’aide de TAQ polymérase (60 sec) - synthétise nouveau brin
ce cycle est répété environ 30-35 fois, et donne pleins de copies d’ADN (duplication) - amplifie de manière exponentielle la séquence cible
nomme les 4 voies de transmission virale
entrée respiratoire
entrée gastro-intestinale
entrée génitale
entrée parentérale
nomme les virus en cause de la gastroentérite (12)
virus de l’hépatite A (anciennement entérovirus 72)
norovirus
virus de l’hépatite E
rotavirus
entérovirus
adénovirus (types 40 et 41)
astrovirus, sapovirus, adénovirus, parvovirus, coronavirus, aichavirus
nomme les caractéristiques des virus causant la gastro (4)
non enveloppés (donc très résistants)
résistants au chlore, solvants organiques et pH acide (pas détruits pas acidité de l’estomac, et résistent à l’acidité des fruits)
résistants à la congélation
sensibles à l’ébullition et chaleur sèche
nomme les modes de transmission de la gatro (6)
voie fécale-orale
aliments contaminés par l’eau des égouts: mollusques, fruits et légumes
selles et vomissures de personnes infectées (>1million de particules virales/ g de selles). Une charge virale de 10 virions est suffisante pour causer la gastro.
transmission peut se faire par contact direct avec la personne infectée ou indirect (surfaces)
transmission facile dans les milieux où les gens sont en contact étroit (écoles, garderies..)
résistants à des taux relativement élevés de chlore et à des T° diverses. Beaucoup de ces virus survivent jusqu’à 12h sur des surfaces dures et jusqu’à 12 jours sur de la moquette contaminée
nomme des mesures de prévention contre la gastro (6)
se laver les mains fréquemment au savon et à l’eau tiède ( au moins 20 sec)
manger des aliments cuits à point (minimum 2 minutes à 70°C, idéalement 1,5 minute à 85°C)
bien laver les F&L avant de les manger
nettoyer endroit contaminé avec eau chaude et savon, utiliser gants en vinyl, désinfecter surface avec désinfectant à base de chlore, retirer et laver vêtements + literie contaminés, utiliser laveuse au cycle chaud (85°C)
jeter selles et vomissures dans toilettes et nettoyer
ne pas secouer le linge contaminé et porter des gants pour manipuler objets contaminés
nomme les 2 vaccination pour gastro virales
vaccin twinrix: protection contre hépatite A et B
vaccin rotarix: protection contre Rotavirus (enfants et nourrissons)
nomme des préventions pour la gestion des manipulateurs d’aliments atteints de gastro
tout employé souffrant de vomissement et diarrhée doit être libéré immédiatement, et ne doit pas retourner au travail avant une période asymptomatique d’au moins 48h
pour le virus hépatite A, période d’exclusion recommandée est de 1 semaine suite à l’apparition de jaunisse (en réalité, les personnes infectées sont plus infectieuses avant ça)
honnêteté essentielle, faut encourager les employés à déclarer leurs symptômes dès que possible
nomme des caractéristiques de la famille Picornaviridae (3)
virus non enveloppés, résitants dans l’environnement
transmission fécale-orale
exemple: poliovirus- cause la poliomyélite (paralysie du système nerveux central qui touche le plus souvent les jambes)
décrit l’étiologie du poliovirus + nomme les 3 groupes d’espèces
le poliovirus fait partie de la famille des Picornaviridae (petits, RNA, viridiae). Le genre Entérovirus es inclus dans cette famille virale. Ce genre est divisé en 2 groupes d’espèces susceptibles d’infecter les humaines:
1. Entérovirus A à J (>75 sérotypes)
2. Rhinovirus A-C (>99 sérotypes)
3. Hépatovirus (1 seul membre, anciennement entérovirus 72)
nomme des caractéristiques du modèle picornaviridae (5)
petits virus à RNA+
stables à pH acide (3 à 5)
multiplication dans le tube digestif
très large prédominance des infections inapparentes
diversité clinique des infections apparentes (symptômes varient d’une personne à l’autre)
explique la physiopathologie du poliovirus
virus se rend à la voie digestive par la bouche —> période d’incubation (amygdales, adénoides, tissu lymphoide du tube digestif), durée 1-2 semaines/ infections inapparentes dans > 80% des cas
***si l’infection progresse:
phase d’invasion = virémie (virus dans le sang), durée 4-5 jours/ fièvre, douleurs musculaires, maladies digestives, maux de tête, vomissement= atteinte méningée/ maladie bénigne dans >90% des cas
***10% des cas:
paralysies= poliomyélite= infection des neurones moteurs
***et tout le monde fini par: excrétion dans selles
voir tableau diapo 45? pertinent?
nomme des caractéristiques du modèle coronaviridae (4)
virus enveloppés
génome ARN+
causent des infections respiratoires, donc certaines sont des zoonoses très pathologiques pour l’humain
transmission: contact direct ou indirect (surfaces), gouttelettes, aérosol, fécale-orale? (voir diapo 48)
nomme des manifestations cliniques de la covid-19
multisystémique: nez, gorge, bouche, poumons, coeur, neurologique, musculaire, digestif, odorat, goût, fatigue, fièvre….
nomme 6 prévention/ traitement de la covid 19
mesures de santé publique: lavage des mains, distanciation sociale, port de masque, visière et autre EPP
vaccins: pfizer/ BioNtech, Moderna, J&J, AstraZeneca, etc (atténue symptômes, mais n’empêche pas la transmission)
antiviraux: remdesivir?
monoclonaux
sérums immnuns ?
corticostéroïdes: dexaméthasone (atténue réaction immunitaire)
