Cours 7 Flashcards

1
Q

Expliquer les étapes de la réplication semi-conservative de l’ADN.

A

Premier cycle de réplication: synthéthisation de l’ADN de cellules de bactéries ou autres, séparation des brins dans deux fourches de réplication allant à droite et à gauche. Complexe MCM s’associes aux 2 branches de la fourche (un pour chaque).

2e cycle de réplication: introduction de nouveaux brin. Réplication arrête lors de la phase mitose avec introduction de colchicine, puis ajout de colorant pour mieux observer.

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2
Q

L’ADN est répliqué à partir d’origines de réplication via la formation de…?

A

…bulles de réplication bidirectionnelles.

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3
Q

Le phénomène de surenroulement de l’ADN devant la fourche de réplication (ou la bulle de transcription) est causé par quoi? Et quoi peut aidé?

A

Causé par le déroulement de la double-hélice de l’ADN durant
la réplication (et la transcription).

Solution : topoisomérases (selon type, coupe un brin d’ADN ou les deux).

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4
Q

Éléments important lors de la réplication de l’ADN?

A
  • ADN polymérase : avec amorce et brin de matrice (pour déterminer quel nucléoside à ajouté à la chaîne en élongation), va faire la synthèse de 5’ vers 3’.
  • l’ADN hélicase (enzyme).
  • Complexe MCM (type d’hélicase) : s’associes aux 2 fourches (un pour chaque) et relâche de l’ADN à brin simple.
  • Protéines de liaison à l’ADN
    simple-brin.
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5
Q

Différence entre la réplication semi-
discontinue et semi-conservative ?

A

SEMI-CONSERVATRICE :
* Brin d’origine + nouveau brin.
* Pas desoin d’une nouvel amorce.

SEMI-DISCONTINUE :
* 2 brins : brin continu (fait en continu et dans le sens de la fourche de réplication) et brin retardé (synthétisé en fragments d’Okazaki).
* Besoin d’amorces supplémentaires.

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6
Q

l’ADN est parallèle ou antiparallèle?

A

antiparallèle (donc un brin 5’ vers 3’ et un autre brin 3’ vers 5’).

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7
Q

La double-hélice d’ADN est formé de quoi?

A

Couplage des bases azotées via des ponts hydrogènes entre les adénine-thymine (2 ponts) et cytosine-guanine (3 ponts).

+ liens phosphodiesters (pour tenir nucléotides ensemble).

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8
Q

Les enzymes ADN polymérases se fixent sur quel extrémité de la chaîne pour ajouter nucléotides?

A

Se fixent sur l’extrémité 3’

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9
Q

Pourquoi un des brins d’ADN est synthétisé de façon continue et l’autre brin doit être synthétisé de façon discontinue?

A

À cause de la direction dans laquelle l’ADN polymérase peut ajouter des nucléotides sur les brins au niveau de la fourche de réplication.

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10
Q

Expliquer comment sont formés les fragments d’Okazaki.

A

1 - Dans réplication semi-discontinue, dans le brin discontinu (qui va vers l’extrémité 5’) PRIMASE synthétise courts fragments d’ARN car toujours besoin de nouvelles amorces.

2 - Fragments utilisés comme amorces par l’ADN polymérase avant d’être retirés quand synthèse est complète.

3 - ADN ligase connecte les brins d’ADN sur le brin discontinu (forme final des fragments d’Okazaki).

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11
Q

Est-il possible qu’il y ai des erreurs durant la réplication de l’ADN?

A

Oui, mais les ADN polymérases sont souvent équipées d’une activité exonucléase 3’-5’ pour retirer les mauvais nucléotides.

+ d’autes mécanismes capables de détecter les lésions dans l’ADN et de les réparer : NER, BER, MMR, HR, NHEJ.

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12
Q

Expliquer le système de réparation des cellules NER.

A

Réparation par excision de nucléotides (N pour nucléotides), va retirer bases modifiées qui déforment l’hélice.

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13
Q

Expliquer le système de réparation des cellules BER.

A

Réparation par excision de base (b = base) pour réparer le mésappariement avec U
ou avec T-G.

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14
Q

Expliquer le système de réparation des cellules MMR (MisMatch Repair).

A

Réparation des mauvais appariements qui sont faits après réplication (A-C et T-G).

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15
Q

Expliquer le système de réparation des cellules HR.

A

Recombinaison homologue (h = homologue) des double-brins brisées ou fourches de réplications bloquées.

Voie anti-cancer.

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16
Q

Expliquer le système de réparation des cellules NHEJ (non-homologous end-joining).

A

Jonction non-homologue, répare double-brins brisés.

17
Q

Différentes sources intrinsèques et
extrinsèques de dommages à l’ADN?

A

Intrinsèques :
* Erreurs de réplication
* Le métabolisme

Extrinsèques :
* Rayons UV
* Rayons ionisants (gamma, X)
* Produits chimiques

18
Q

Types de lésions dans l’ADN?

A

Lésions volumineuses (UV) (NER les réparent)

19
Q

Étapes de la réparation par excision des nucléotides?

A

1 - Reconnaissance du
dommage

2 - Hélicase déroule région autour du dommage.

3 - Clivage du brin par des endonucléases.

4 - Hélicase enlève le brin endommagé.

5 - ADN polymérase
resynthétise l’information manquante en utilisant le brin intact comme matrice.

6 - ADN ligase recolle le brin.

20
Q

Quels enzymes reconnaissent les bases modifiées à réparer lors du système de réparation BER?

A

enzymes glycosylases

21
Q

Étapes de la réparation par excision des bases?

A
  1. Reconnaissance de la base modifiée par une glycosylase spécifique.
  2. Clivage de la base par un endonucléase.
  3. L’ADN polymérase polymérise le nucléotide manquant à partir du brin matrice intact.
  4. Une ADN ligase complète la réparation.
22
Q

Étapes de la réparation des
mésappariements ?

A
  1. Reconnaissance de la lésion et du brin mère et fille par des hétérodimères.
  2. Endonucléase sont recrutées et coupent ADN en brins simples autour de la lésion.
  3. Exonucléase 1 vient digérer le brin mésapparié.
  4. ADN polymérase resynthétise le brin-fille
    sans mutation.
  5. ADN ligase complète la réparation.
23
Q

Quelle est la différence entre la voie de réparation NHEJ et la recombinaison homologue pour les bris double-brins d’ADN ?

A

NHEJ (Non-Homologous End Joining) : recolle directement les extrémités des bris double-brins, mais INTRODUIT DES ERREURS.

Recombinaison homologue : utilise une copie d’un brin homologue, souvent le chromatide-sœur après la réplication (en phases S ou G2), pour réparer SANS ERREURS.