Cours 7 Flashcards

1
Q

Expliquer les étapes de la réplication semi-conservative de l’ADN.

A

Premier cycle de réplication: synthéthisation de l’ADN de cellules de bactéries ou autres, séparation des brins dans deux fourches de réplication allant à droite et à gauche.

2e cycle de réplication: introduction de nouveaux brin. Réplication arrête lors de la phase mitose avec introduction de colchicine, puis ajout de colorant pour mieux observer.

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2
Q

L’ADN est répliqué à partir d’origines de réplication via la formation de…?

A

…bulles de réplication bidirectionnelles.

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3
Q

Le phénomène de surenroulement de l’ADN devant la fourche de réplication (ou la bulle de transcription) est causé par quoi? Et quoi peut aidé?

A

Causé par le déroulement de la double-hélice de l’ADN durant
la réplication (et la transcription).

Solution : topoisomérases (selon type, coupe un brin d’ADN ou les deux).

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4
Q

Éléments important lors de la réplication de l’ADN?

A
  • ADN polymérase : avec amorce et brin de matrice (pour déterminer quel nucléoside à ajouté à la chaîne en élongation), va faire la synthèse de 5’ vers 3’.
  • l’ADN hélicase (enzyme).
  • Complexe MCM (type d’hélicase) : s’associes aux 2 fourches (un pour chaque) et relâche de l’ADN à brin simple.
  • Protéines de liaison à l’ADN
    simple-brin.
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5
Q

Différence entre la réplication semi-
discontinue et semi-conservative ?

A

SEMI-CONSERVATRICE :
* Brin d’origine + et nouveau brin.
* Pas desoin d’une nouvel amorce.

SEMI-DISCONTINUE :
* 2 brins : brin continu (fait en continu et dans le sens de la fourche de réplication) et brin retardé (synthétisé en fragments d’Okazaki).
* Besoin d’amorces supplémentaires.

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6
Q

l’ADN est parallèle ou antiparallèle?

A

antiparallèle (donc un brin 5’ vers 3’ et un autre brin 3’ vers 5’).

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7
Q

La double-hélice d’ADN est formé de quoi?

A

Couplage des bases azotées via des ponts hydrogènes entre les adénine-thymine (2 ponts) et cytosine-guanine (3 ponts).

+ liens phosphodiesters (pour tenir nucléotides ensemble).

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8
Q

Les enzymes ADN polymérases se fixent sur quel extrémité de la chaîne pour ajouter nucléotides?

A

Se fixent sur l’extrémité 3’

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9
Q

Pourquoi un des brins d’ADN est synthétisé de façon continue et l’autre brin doit être synthétisé de façon discontinue?

A

À cause de la direction dans laquelle l’ADN polymérase peut ajouter des nucléotides sur les brins au niveau de la fourche de réplication.

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10
Q

Expliquer comment sont formés les fragments d’Okazaki.

A

1 - Dans réplication semi-discontinue, dans le brin discontinu (qui va vers l’extrémité 5’) primase synthétise courts fragments d’ARN (pas besoin d’amorce).

2 - Fragments utilisés comme amorces par l’ADN polymérase avant d’être retirés quand synthèse est complète.

3 - ADN ligase connecte les brins d’ADN sur le brin discontinu (forme final des fragments d’Okazaki).

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11
Q

Est-il possible qu’il y ai des erreurs durant la réplication de l’ADN?

A

Oui, mais les ADN polymérases sont souvent équipées d’une activité exonucléase 3’-5’ pour retirer les mauvais nucléotides.

+ d’autes mécanismes capables de détecter les lésions dans l’ADN et de les réparer : NER, BER, MMR, HR, NHEJ.

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12
Q

Expliquer le système de réparation des cellules NER.

A

Réparation par excision de nucléotides (N pour nucléotides), va retirer bases modifiées qui déforment l’hélice.

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13
Q

Expliquer le système de réparation des cellules BER.

A

Réparation par excision de base (b = base) pour réparer le mésappariement avec U
ou avec T-G.

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14
Q

Expliquer le système de réparation des cellules MMR (MisMatch Repair).

A

Réparation des mauvais appariements qui sont faits après réplication (A-C et T-G).

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15
Q

Expliquer le système de réparation des cellules HR.

A

Recombinaison homologue (h = homologue) des double-brins brisées ou fourches de réplications bloquées.

Voie anti-cancer.

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16
Q

Expliquer le système de réparation des cellules NHEJ (non-homologous end-joining).

A

Jonction non-homologue, répare double-brins brisés.

17
Q

Différentes sources intrinsèques et
extrinsèques de dommages à l’ADN?

A

Intrinsèques :
* Erreurs de réplication
* Le métabolisme

Extrinsèques :
* Rayons UV
* Rayons ionisants (gamma, X)
* Produits chimiques

18
Q

Types de lésions dans l’ADN?

A

Lésions volumineuses (UV)

19
Q

Étapes de la réparation par excision des nucléotides?

A

1 - Reconnaissance du
dommage

2 - Hélicase déroule région
autour du dommage.

3 - Clivage du brin par des endonucléases.

4 - Hélicase enlève le brin endommagé.

5 - ADN polymérase
resynthétise l’information manquante en utilisant le brin intact comme matrice.

6 - ADN ligase recolle le brin.

20
Q

Quels enzymes reconnaissent les bases modifiées à réparer lors du système de réparation BER?

A

enzymes glycosylases

21
Q

Étapes de la réparation par excision des bases?

A
  1. Reconnaissance de la base modifiée par une glycosylase spécifique.
  2. Clivage de la base
  3. Endonucléase coupe le lien phosphodiester en 5’ du phosphate du site AP.
  4. L’ADN polymérase polymérise le nucléotide manquant à partir du brin matrice intact.
  5. Une ADN ligase complète la réparation.
22
Q

Étapes de la réparation des
mésappariements ?

A
  1. Reconnaissance de la lésion et du brin mère et fille par des hétérodimères.
  2. Recrutement d’une endonucléase qui fait des bris simple-brins dans l’ADN à proximité de la lésion.
  3. Exonucléase 1 vient digérer le brin mésapparié sur une courte distance.
  4. ADN polymérase resynthétise le brin-fille
    sans mutation.
  5. ADN ligase complète la réparation.
23
Q

Quelle est la différence entre la voie de réparation NHEJ et la recombinaison homologue pour les bris double-brins d’ADN ?

A

NHEJ (Non-Homologous End Joining) : recolle directement les extrémités des bris double-brins, mais peut introduire des erreurs (gain ou perte de 1 à 2 nucléotides).

Recombinaison homologue : utilise une copie d’un brin homologue, souvent le chromatide-sœur après la réplication (en phases S ou G2), pour réparer sans incorporer d’erreurs.