Cours 2 Flashcards

1
Q

Parties du système membranaire cellulaire d’un eucaryote

A

Cytoplasme subdivisé en compartiments entourés de membranes (ensemble = organelles, contiennent protéines spécialisées pour différentes activités. Pas structures stables, mais dynamiques et en perpétuelle réorganisation. Viennet du RE).

Compartiments du système : réticulum endoplasmique (RE), l’appareil de Golgi, les lysosomes et les endosomes.

Cargos = se promènent entre organelles.

Vésicules de transport = se déplacent directionnellement via des protéines moteurs sur les microtubules du cytosquelette.

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2
Q

Étapes (en gros) de la voie biosynthétique pour synthèse protéines ?

A

1 - Traduction commence avec un peptide signal reconnu par la PRS, qui dirige le ribosome vers le réticulum endoplasmique (RE).

2 - Peptide signal est clivé puis protéine est ensuite maturée (glycosylation, repliement) et transportée vers le Golgi pour finaliser la maturation avant d’être envoyée vers destination finale (e.g. membrane plasmique, lysosome, vacuole, extérieur de la cellule).

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3
Q

Synthèse protéines

A

Dans noyau, ADN passe par processus de transciption avec ARN polymérase. Une fois cela fait, ribosome traduit ARN en protéine.

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4
Q

Voies du ROUTAGE des protéines

A

Voie co-traductionnelle : en même temps que la synthèse des protéines.

Voie post-traductionnelle : après synthèse.

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5
Q

Fonctions des réticulum endoplasmiques

A

RER :
* Synthèse des protéines.
* Synthèse membrane plasmique.
* Maturation des protéines.(Glycosylation = ajout de chaînes de sucres ramifiées (oligosaccharides))

REL :
* Synthèse de lipides, phospholipides et stéroïdes (système endocrinien (hormones)).
* Synthèse phospholipides, stéroïdes, lipides.
* Dégradation des toxines.

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6
Q

Étapes de ciblage des protéines dans RER (indice : translocon)

A

1- La synthèse de la protéine commence sur un ribosome dans le cytosol (liquide présent à l’intérieur des cellules). Si la protéine est destinée au RE, elle possède une séquence signal (courte chaîne d’acides aminés) au début de sa structure.

2- Sequence signal est reconnu par la PRS. Pause dans la traduction de l’ARNm par le ribosome.

3- Le polypeptide se crée, puis est inséré dans le translocon, un pore protéique qui traverse la membrane du RE.

4- “Débouche” le pore du translocon et permet au polypeptide d’être inséré dans la lumière du RE. Une fois en dedans, la séquence signal est clivée par une protéase.

5- La traduction de la protéine reprend alors, permettant d’allonger la protéine.

7- Tout au long de la translocation du polypeptide naissant dans le RE, celui- ci est stabilisé par des protéines chaperones et des ponts disulfures sont formés entre des résidus cystéines par la protéine disulfure isomérase (PDI).

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7
Q

Appareil de Goldi (éléments, strucutre, fonctions)

A
  • Formé d’un réseau de sacs membranaires: les citernes, aplaties comme des crêpes les unes sur les autres.
  • Les citernes du Golgi «migrent» lentement du cis vers le trans Golgi.
  • De nouvelles citernes sont constamment formées par la fusion des vésicules du réseau cis-Golgi - les vésicules voyagent en sens inverse (recyclage des enzymes résidents)

Fonctions :
- Glycosylation des protéines (addition ou soustraction de sucres - oligosaccharides - à la chaîne existante formée dans le RE)

  • Récupération des protéines résidentes du RE : Transport rétrograde. Dans cis-golgi.
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8
Q

Vésicules de transport (et guidage des vésicules ce fait avec quoi) ?

A

Vésicules tapissées COPII : transport antérograde.

Vésicules tapissées COPI : rétrograde.

Vésicules tapissées de Clathrine :
Voie endocytaire et transport entre trans-golgi et membrane plasmique.

GUIDAGE : Protéines d’accrochags (Rab GTPases) et protéines d’arrimage (SNAREs)

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9
Q

Avec quoi ce fait le routage des protéines à la fin du Golgi

A
  • Granules de sécrétion
    (sécrétion régulée). Ici, granule et vésicules = synonymes. Voie d’exocytose.
  • Vésicules de sécrétion
    (sécrétion constitutive, = en continue). Voie d’exocytose.
  • Endosomes et Lysosomes, font partie de la voie d’endocytose
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10
Q

Définition et étapes voie endocytaire (inclu maturation des endosomes)

A

Déf. : La voie endocytaire est où se passe l’absorption de lipoprotéines. Elle unit les membranes internes dans un réseau interconnecté et dynamique.

Étapes :
1 - Lipoprotéines LDL est absorbé via l’invagination de la membrane dans cellule grâce à récepteurs.

2 - Manteau de clathrine recouvre la vésicule contenant LDL, début endosome hâtif.

3 - Perte du manteau. Endosome hâtif.

4 - Fusionnement avec lysosome, créer abaissement pH, complexe s’appelle maintenant endosome tardif.

5 - Avec snares, recyclage se fait.

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11
Q

Lysosome (quoi, fonctions) ?

A
  • Organelle digestive (plus de 50 sortes d’enzymes hydrolytiques)
  • pH maintenu par une pompe à protons (H+)
  • Routage des protéines (enzymes digestives) vers le lysosome implique les vésicules de clathrine.

FONCTIONS:
- Digestion des produits de la voie endocytaire
- Autophagie: destruction contrôlée et remplacement des organelles cellulaires (sorte de voie de signalisation, déclenché par mauvais fonctionnement des mitochondries).

Un peu comme phagocytose, mais sans clathrine. Accompli par macrophages et neutrophiles.

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12
Q

Étapes phagocytose et qui sont les phagocyteurs.

A

Faites par les macrophages et neutrophiles.

Étapes :

1 - Les phagocyteurs sont attirées vers le site par chimiotactisme.

2 - Liaison grâce à des récepteurs.

3 - La membrane plasmique du phagocyte entoure la particule et forme une vésicule appelée phagosome, est ensuite absorbé.

4 - Phagosome fusionne avec des lysosomes, ce qui forme un phagolysosome. Les 50+ enzymes dans le lysosomes vont détruire l’intru en petits morceaux.

5 - Bons nutriments sont absorbés alors que déchets sont expulsés du phagocyte par exocytose.

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13
Q

Étapes voie biosynthétique des protéines (lieu de synthèse, puis modifiés où?)

A

Les protéines sont synthétisées dans le RE, modifiées dans le Golgi et transportées à leur destination finale (e.g. membrane plasmique, lysosome, vacuole, extérieur de la cellule).

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14
Q

Le routage des protéines dans la cellule dépend de (au début)…?

A

séquences signal qui peuvent être composées d’acides aminés.

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15
Q

Différentes séquences signal dans une protéine

A

1 - Vers le réticulum endoplasmique (RE) : séquence d’acides aminés hydrophobes situés à l’extrémité N-terminale d’une protéine (début de la protéine).

2 - Pour les mitochondries : séquence localisée à l’extrémité N-terminale d’une protéine aussi.

3 - Peroxysomes : séquence de trois acides aminés situés à l’extrémité C-terminale de la protéine.

4 - Dans la lumière du RE : une séquence KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) à leur extrémité C-terminale.

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16
Q

Étapes maturation des protéines

A

1 - Glycosylation : Ajout de chaînes de sucres ramifiées (oligosaccharides)

2 - Repliement et assemblage de multimères (protéines) par des protéines chaperonnes, comme la BiP.
* Chaperonnes empêchent formation agrégats (régions hydrophobes des protéines ensembles) car elles reconnaissent sucre et entourent protéines puis repartent avec ce sucre.
* Enzyme de contrôle GT s’assure que la partie hydrophobe ne sois pas air libre. Si encore partie hydrophobe, remet sucre pour ramener chaperonne. Si pas capable encore protéasome.

3 - Formation des ponts disulfure par résidus cystéines d’une protéine (acide aminé) pour stabiliser la structure de la protéine en stabilisant le repliement. Accompli par une enzyme dans la lumière du RE: Protéine Disulfure Isomérase (PDI).

4 - Clivage spécifique : Pré-pro-protéine devient pro-protéine, une protéine active (comme insuline). Accompli en partie dans le RE et en partie dans les vésicules RE-Golgi. –> Acide aminés coupés, retire portion de protéine pour activer la protéine.

17
Q

Séquences signal (c’est quoi, types) ?

A

QUOI : Séquence d’acides aminés servant à distribuer les protéines aux bons endroits

TYPES :
- Contigus : suite continue.
- Patch signalétique : lisible seulement quand la protéine est entièrement repliée.

18
Q

La voie de sécrétion (étapes en gros et types) ?

A

Étapes : synthétisées dans RE puis exportées (sécrétées ou exocytosées) de la cellule.

Deux manières : Constitutive (constante) ou contrôlée : sécrétion (avec stimulus)