Cours 6 : Écosystème digestif ✔✔ Flashcards
QSJ? Je suis un ensemble dynamique de micro-organismes organisés en communautés complexes
Microbiote/Écosystème microbien
Avec quoi interagit les micro-organismes du microbiote? (2)
1) entre eux-mêmes
2) environnement dans lequel ils vivent (corps humain, sol, eau,matrice alimentaire)
Donne des exemples de micro-organismes
(5)
1) bactérie commensales et pathogènes (procaryotes)
2) champignon unicellulaires (levures) (eucaryotes)
3) archaea (procaryotes)
4) protozoaires (parasites unicellulaires) (eucaryotes)
4). Virus/bactériophages (acaryotes)
Nomme des endroits du corps où se trouve un microbiote (5)
1) intestin
2) peau
3) bouche
4) système respiratoire
5) vagin
QSJ? Organismes vivants microscopiques
Micro-organismes
QSJ? Microbiote le plus peuplé de l’organisme
Microbiote intestinal
Où est réparti le microbiote intestinal?
Principalement dans l’intestin grève et le côlon.
Entre la lumière du tube digestif et le biofilm protecteur formé par le mucus intestinal qui recouvre la muqueuse intestinale
Quels micro-organismes sont en moins grandes quantités dans le microbiote intestinal?
Levures
Donner les 3 paramètres qui explique le gradient oral-anal de bactéries.
1) o2 (moins présent au niveau anal)
2) pH (plus élevé au niveau anal)
3) vitesse de transit ( plus lent au niveau anal)
VF? Dans le microbiote intestinal, les micro-organismes qui prédominent sont les levures?
Faux, plus de virus/phages (un peu plus important) et les bactéries.
Bactéries > Virus/phages > Archae > Levures
Dans l’intestin grêle, on retrouve des bactéries à croissance ___.
Dans le côlon, on retrouve des bactéries à croissance ___.
Rapide
Lente
Pourquoi trouve-t-on des bactéries à croissance rapide dans l’intestin grêle?
Grâce à la présence de quelques sucres simples qu’elles consomment
Décrivez la relation entre les bactéries de l’intestin grêle et l’oxygène
Les bactéries sont anaérobes facultatives (supportent autant l’oxygène que l’anoxie- CO2, N2)
Que consomment les bactéries du côlon?
Des résidus de nutriments non digérables (ex : fibres alimentaires)
Comment nomme-t-on la consommation de fibres alimentaires des bactéries du côlon?
Fermentation microbienne
Où est la couche de mucus la plus fine qui permet aux micro-organismes de facilement la pénétrer? Dans l’intestin grêle ou dans le côlon?
Intestin grêle
Où y a-t-il une bi-couche de mucus?
Dans le côlon
Décrivez les 2 couches de mucus du côlon
1 - Une couche externe semi liquide/solide, facilement pénétrable par les micro-organismes
2 - Une couche interne, presque impénétrable par les micro-organismes
VF? Les nourrissons allaités au sein ont un microbiote différent de ceux recevant un lait maternisé
Vrai
Nommer 4 sources de colonisation du microbiote chez l’enfant?
1) mode accouchement ( voie basse ou césarienne)
2) type d’allaitement
3) génétique
4) naissance à terme ou prématuré
Quelle est la période d’acquisition du microbiote?
1000 premiers jours de vie
La période d’acquisition du microbiote semble très importante pour la ___ du ___ ___
Maturation du système immunitaire
Vers quel âge la fraction dominante du microbiote devient stable?
3 ans
VF? À l’âge adulte, la composition du microbiote reste relativement stable jusqu’à la vieillesse
Vrai
Que se passe-t-il avec la diversité du microbiote à la vieillesse?
Elle s’affaiblit et laisse place à d’autres espèces délétères, qualifiées de pathogènes opportunistes
Vrai ou faux
Nous possédons un microbiote unique?
Vrai, ceci constitue notre propre carte d’identité biologique/microbienne. 🪪
VF? Les médicaments peuvent affecter notre microbiote intestinal
Vrai
Quelles sont les 4 grandes fonctions du microbiote intestinal?
- Fonctions métaboliques
- Fonctions de barrière/défense
- Effets trophiques
- Neuromodulation
QSJ? Réaction d’oxydo-réduction dégradant un substrat par des enzymes microbiennes pour libérer des métabolites secondaires au potentiel bioactif, des alcools, des gaz, etc.
Fermentation intestinale
Où se produit la fermentation intestinale?
Dans le côlon
La fermentation intestinale se déroule avec ou sans oxygène?
Sans (anaérobiose)
VF? La fermentation intestinale dégage beaucoup d’énergie
Faux, peu d’énergie
Quels sont les métabolites secondaires produits lors de la fermentation intestinale?
Acides gras à chaîne courte
Quelles sont les fonctions des métabolites secondaires de la fermentation intestinale? (3)
- Provision d’énergie pour l’organisme
- Réduire la charge osmotique colique (et donc le risque de diarrhée) (permet de retenir plus d’eau)
- Nourrit les colonocytes (épithélium du côlon)
VF? Un microbiote intestinal déséquilibré peut entraîner certains troubles
Vrai
Quelles sont les perturbations GI qui sont liées à un microbiote intestinal déséquilibré? (4)
- Toxi-infection alimentaire
- Diarrhées du voyageur
- Diarrhées lors d’antibiothérapie
- Maladies inflammatoires chroniques de l’intestin
Quelles perturbations extra-intestinales sont liées à un microbiote intestinal déséquilibré? (4)
- Syndrome métabolique, obésité
- Allergies
- Infections vaginales, urinaires
- Affections neuropsychiatriques : stress, anxiété, autisme, neurodégénérescence
Est-ce que les probiotiques, prébiotiques et psychobiotiques sont considérés comme des médicaments?
Non, comme suppléments
QSJ?
« Médicament utilisé pour traiter et prévenir les infections bactériennes »
a) Antibiotique
b) Probiotique
c) Prébiotique
d) Psychobiotiques
a) Antibiotique
QSJ?
« Microorganismes vivants qui, lorsqu’ils sont administrés en quantité adéquate, produisent un bénéfice pour la santé de l’hôte »
a) Antibiotique
b) Probiotique
c) Prébiotique
d) Psychobiotiques
b) Probiotique
QSJ?
« Substrat qui est utilisé sélectivement par les microorganismes de l’hôte exerçant un effet bénéfique sur la santé »
a) Antibiotique
b) Probiotique
c) Prébiotique
d) Psychobiotiques
c) Prébiotique
QSJ?
« Probiotiques et/ou prébiotiques qui procurent des bienfaits pour la santé mentale »
a) Antibiotique
b) Probiotique
c) Prébiotique
d) Psychobiotiques
d) Psychobiotiques
QSJ? Transplantation de microbiote fécal qui consiste à insérer les selles d’un donneur sain dans un receveur afin de rétablir un microbiote non sain
Fécothérapie 💩🥄🍽🥛
Comment peut être réalisée la fécothérapie?
Par lavements, spray au cours d’une colonoscopie, administration par sonde ou par des capsules
La fécothérapie semble très efficace pour quoi?
Mettre fin aux récidives d’infections à C. difficile
VF? Certains micro-organismes ont l’équipement génétique enzymatique pour participer au métabolisme des médicaments
Vrai
QSJ? Discipline émergente regroupant les domaines de la génomique microbienne, de la pharmacologie et de la microbiologie cherchant à comprendre comment les variations inter-individuelles dans le microbiote façonnent l’efficacité de réponses aux médicaments et leurs possibles effets secondaires
Pharmacomicrobiomique
Nommez 2 médicaments connus pour interagir avec le microbiote
- Antidiabétiques ( changement dans le gut microbiome)
- IPP ( réduit l’acidité gastrique, modifié le gut microbiome et réduit la résistance à la colonisation des infections entériques)
QSJ? Une alternative intéressante ou pouvant être utilisés en complémentarité à l’expérimentation animale et/ou aux études cliniques humaines
Modèles de digestion et fermentation in vitro
Remplir les mots manquants:
Tout au long de notre vie, le microbiote détient une
certaine capacité de ———— aux perturbations
écologiques (antibiothérapie, toxi-infection alimentaire, gastroentérite, etc.) qui n’est pas——-. En cas de résilience (perturbation), le microbiote peut malgré tout ——— à son état initial sous une période plus ou moins longue selon le ———- (immunocompétent/immunodéprimé).
1) résistance
2) infaillible
3) revenir
4) statut immunitaire de l’hôte
QSJ? Reproduit les principaux paramétres physico-chimiques de la partie haute du tractus digestif de l’Homme (estomac, duodénum, jéjunum, iléon)
Le TIM-1
Nommer des facteurs influençant le microbiote intestinal
Que fait la fonction métabolique?
- Synthèse
- Dégradation
- Transformations (acides biliaires, mx, xénobiotiques)
Que fait la fonction barrière/défense du microbiote intestinal?
- exclusion compétitive de pathogènes
- modulation des défenses innées ( défensine, igA) de la sécrétion de mucus
- immunomodulation
À quel endroit l’effet trophiques opère?
- sur les cellules du système immunitaire
- sur les cellules épithéliales
Que fait la neuro modulation du microbiote?
- sensibilité viscérale
- transit intestinal
- affection neuropsychiatrique ( anxiety, depression, autism, maladie neuro dégénérative)
Quelle est l’une des plus graves menaces pesant sur la santé mondiale?
La résistance aux antibiotiques 🤺
Vrai ou faux
Les interactions bidirectionnelles entre médicaments et microbiote intestinal sont sans conséquence pour la santé
Faux, conséquences peuvent être graves 😰
Les modèles in vitro sont une alternative intéressante
peuvent être utilisés en ———…
à l’expérimentation animale et/ou aux études
cliniques humaines, à condition que la ———- de
ces outils soit du niveau de celle des expériences faites
chez ———- et ————-.
- complémentarité
- pertinence
- l’Homme te l’animal
Nommez trois problèmes éthique que les modèles de digestion in vivo permettre de contourner.
- prélever en illimité dans le tractus
- étudier des substance particulièrement néfastes (microorganismes pathogènes, polluants) même à dose élevée
- tester de nouvelles molécules pharmaceutiques/diététique
Nommez 2 groupe qui regulent les études in vivo
- conseil canadien de protection des animaux (CCPA)
- Union Européenne
Nommer trois champs d’applications des systèmes de digestion et fermentation in vitro en recherche académique et industrielle.
- microbiologie
- nutrition
- pharmaco/toxicologies
Que mesure le TIM-1 ?
DIGESTION
- température
- pH
- péristaltisme
- temps de transit
- sécrétion digestives
- absorption passive
QSJ? Reproduit de façon successive l’estomac, l’intestin grêle en une seule partie ainsi que les trois régions du colon.
Le SHIME (SIMULATOR OF THE HUMAN INTESTINAL MICROBIAL ÉCOSYSTÈME)
Quelles paramètres le shime inclue?
FERMENTATION
- température
- pH
- agitation
- temps de transit
- sécrétion digestives
- anaerobie
Il intègre le microbiote intestinal à partir de selles humaines fraîchement collectées 🤤 (but: reproduire les différentes variables de l’écosystème colique)
VF? Le SHIME permet de distinguer les bactéries contenues dans le mucus à celles dans le lumen.
VRAAAIIIIIIII🤟
