Cours 3 : génétique biochimique Flashcards

1
Q

La génétique biochimique est le lien entre les gènes et les ___________ et ___________ du patient. Les gènes codant pour ceux-ci représentent environ ____% du génome humain.

A
  • enzymes
  • transporteurs
  • 20
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2
Q

**Rappel

Qu’est-ce qui est important de se rappeler des vésicules?

A
  • peuvent libérer contenu direct à l’ext de cell

- peuvent aller vers lysosome, soit en partant de l’int de la cell, ou en étant intériorisé avant

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3
Q

La phénylcétonurie…

1) héréditaire?
2) cause
3) conséquence
4) mode de transmission

A

1) oui
2) déficience de l’enzyme phénylalanine hydroxylase (PAH)
3) augmentation de l’a.a. phénylalanine
4) autosomique récessif

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4
Q

IMP…

PAH (phénylalanine hydroxylase) est exprimée dans maj dans quel organe? Slmt lui?

A

Foie, non (mais ++ maj)

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5
Q

Qu’est-ce que PAH fait à la phénylalanine?

A

L’hydroxyle pour qu’elle devienne une tyrosine

pour ça que si pas de PAH, phénylalanine s’accumule

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6
Q

** Niv normal de phénylalanine.

A

60 umol/L (micromol/L)

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7
Q

Métabolisme de la phénylalanine…

Apports :

1) maj
2) min

Devenir :

3)
4)
5)
6)

Carence du devenir :

3a)
4a)
5a)
6a)

A

1) diète
2) prots

3) dégradation
4) catécholamines
5) mélanine
6)
hormone thyroïdienne

3a) 4 erreurs innées
4a) neurodégénérescence
5a) albinisme
6a) hypothyroïdie + goitre (thyroïde enflée)

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8
Q

La PCU (phénylcétonurie)…

Le signe maj est ___________. Elle se développe de façon ___________ et a toute une gamme de ___________. La déficience est (traitable/permanente). La vaste maj des patients dans les pays dév sont _______________ et traités rapido.

A
  • déficience intellectuelle
  • progressive
  • phénotypes (varie de ++ à - - sévère)
  • traitable
  • détectés par dépistage néonatal
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9
Q

Qu’est-ce qu’/comment on prélève pour la PCU?

A
  • papier buvard : sang doit pénétrer et traverser le papier

- d’autres détails, mais l’IMP : CONDITIONS TRÈS PARTICULIÈRES

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10
Q

Quel test faisions-nous, dans le passé, sur les échantillons pour la PCU? Explique un peu.

A
  • test de Guthrie
    1) rondelles contrôles contenant diff concentrations de phé
    2) échantillons des patients comparés
    3) si spectre bactérien autour de l’échantillon : ++ phé (+ spectre gros, + phé présent)
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11
Q

Quel test faisons-nous, de nos jours, pour la PCU?

A

Tests automatisés permettant dosage simultané de plsrs métabolites

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12
Q

Comment le niv de phé fluctue dans les 1er jours de vie d’un bébé? Pk?

A
  • augmente chaque jour
  • l’épuration : cordon ombilical permet d’épurer le sang. Mère avait taux normal, mais dès que le cordon est coupé,
    bébé commence à accumuler la phé
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13
Q

V/F?

Le dépistage néonatal sanguin au Québec est le même depuis des décennies.

A

F!

Change tjrs (ne sera plus le même quand on aura gradué!)

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14
Q

Quelle est la diff entre dépistage et diagnostic?

A
  • dépistage = valeurs anormales

- diagnostic = si c’est grave pour santé ou juste un métabolisme diff (ex. tous les a.a. sont augmentés)

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15
Q

Comment se fait le diagnostic de PCU?

A
  • comparaison de chromatographie normale VS patient PCU suspecté
  • si 1 seul pic anormal et que c’est phé, alors diagnostic fait
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16
Q

Traitement maj de PCU.

1) traitement
2) problème engendré par traitement
3) solution

A

1) modification diète : apport restreint en phé

2) surtout pour le lait : si une source naturelle de prots est utilisée, il
ne fournit pas un apport normal de volume ou des autres
nutriments essentiels. Par contre, si on offre des
aliments naturels à la satiété, les apports en phé seront
excessifs.

3) aliments thérapeutiques avec - - phé mais ++ autres a.a.

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17
Q

Est-ce que les enfants qui ont PCU ont une qualité d’alimentation acceptable de nos jours?

A

OUI!

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18
Q

Concernant la phé, qu’est-ce que la “tolérance”?

A

qtt max de phé diététique permettant taux sanguin acceptable

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19
Q

Le fctionnement du métabolisme protéique normal…

  • -
A

les chiffres = g/jour

1)

  • sécrétions GI : +70
  • diète : +100
  • perte GI : -10
  • absorption tot : 160 (100+70-10)

2)
- apport du GI : +160
- catabolisme-anabolisme tissulaire : -75
- dégradation en urée/énergie : env. 90 (160-75)

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20
Q

Dans le métabolisme des patients ayant PCU, quel est le problème qui fait en sorte qu’il faut diminuer apport diététique?

A

patient manque capacité d’ajuster dégradation selon qtt dispo

(donc pas en urée/É… il faut donc couper d’environ 90mg/J avec la diète, comme tu vois à la Q.19)

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21
Q

La croissance des enfants ayant PCU permet quoi comme ajustement? Pk?

A

Augmenter qtt alimentaire de phé, car plus d’anabolisme au niv des tissus

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22
Q

Le rhume des enfants ayant PCU permet quoi comme ajustement?

A

Diminuer qtt alimentaire de phé, car rhume = bcp de catabolisme protéique tissulaire

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23
Q

Pk qtt de phé doit être personnalisée chez patients PCU?

A

Car métabolisme prot a 4-5 flux maj (autre que diète), qui affectent aussi pool protéique.

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24
Q

Comment est le suivi des patients PCU?

A
  • visites cliniques rapprochées initialement (pour ajustements rapides)
  • étroit suivi de croissance et paramètres nutritionnels
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25
Q

Suivi des patients PCU…

L’impact d’une hyperphénylalaninémie est
plus grand dans les ___________ mais un effet nocif sur la performance
__________ est détectable même à __________.

A
  • 2 premières années de vie
  • psychomoteur
  • l’âge
    adulte
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26
Q

Quelles autres approches qu’ajuster la diète peut-on imaginer pour le traitement de la PCU, sachant que c’est un enzymopathie.

A

1) donner cofacteur BH4 (pour transformer ++ en tyrosine)?
2) remplacer l’enzyme?
3) diminution catabolisme prots tissulaires?
4) jouer sur ce qui crée la tyrosine?
5) voies alternatives dans la nature (ex. chez bactéries)

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27
Q

Les 3 variantes cliniques de la PCU.

A

1) hyperphénylalaninémie
2) PCU atypique (“maligne”)
3) PCU maternelle

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28
Q

Diff entre PCU (phénylcétonurie) et HPÉ (hyperphénylalaninémie)

A
  • À haut taux de phé, la transamination
    = activée. La phénylpyruvate (une phénylcétone) = excrété
    urine.
  • En présence de FeCl3, devient
    verdâtre (ce fut une des premières méthodes diagnostiques de
    la PCU)
  • Le terme « PCU »
    = donc réservé pour formes sévères
    (déficience quasi-complète en PAH)
  • Moindres taux = peu de phénylcétones donc
    « hyperphénylalaninémie » (ça reste dans sang, va pas dans urine)
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29
Q

HPÉ (hyperphénylalaninémie)…

Il y a une relation _____________ entre _____ et ______. C’est une maladie ayant un type de transmission _____________. Ceci veut dire que ça ne prend pas grand-chose en terme ___________ pour faire une grande diff dans le taux concentration phé/activité PAH.

A
  • non linéaire
  • concentration phé
  • activité PAH
  • autosomique récessif
  • d’enzyme
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30
Q

** rappel

Cofacteur BH4 = lié à quoi?

A

Aide la PAH pour transformer phénylalanine en tyrosine

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31
Q

PCU atypique liée à quoi?

A

Erreurs innées de la
biosynthèse ou de la régénération de la
tetrahydrobioptérine (BH4).

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32
Q

Signes de la PCU atypique

A
  • hyperphénylalaninémie
  • anomalies neurologiques :

a) encéphalopathie
progressive ou dystonie.

b) déficience des
neurotransmetteurs (tyrosine hydroxylase->
DOPA et tryptophan hydroxylase-> 5HT)

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33
Q

Comment régler PCU atypique?

A

1) supplémentation en BH4 (pour régler l’HPÉ)

2) signes neurologiques réglés par supplémentation en DOPA

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34
Q

PCU maternelle…

Est une cause de _____________. Le ________ est normal, mais exposé à _________ dès sa conception. Le __________ va concentrer la phé du côté fœtal. Le ____________ a peu de capacité de _________ la phé. Chez les femmes PCU, il faut contrôler la phé plasmatique à un moment précis
: ___________. Il faut les suivre pendant la ____________.

A
  • retard mental sévère
  • fœtus
  • phé élevé
  • placenta
  • foie embryo
  • dégradation
  • AVANT conception et pendant toute grossesse, SURTOUT 1er trimestre
  • période entière de fertilité
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35
Q

Signes de PCU maternels chez bébé (5).

A

1) dysmorphie facial
2) microcéphalie
3) retard dév
4) difficultés d’apprentissage
5) maladie cardiaque congénitale

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36
Q

La tyrosinémie de type 1…

Est une maladie génétique d’un _______ précis : __________. Il y a mutation canadienne-française fondatrice dans le gène ______.

A
  • peuple
  • les Québécois
  • FAH
37
Q

Symptômes de la tyrosinémie de type 1.

A
  • insuffisance, cirrhose et cancer hépatiques

- rachitisme hypophosphatémie (déformation osseuse)

38
Q

Dans la voie métabolique incluant la tyrosinémie type 1, il y a une grande diversité de maladies qui peuvent avoir lieu : dire lesquelles

A
  • tyrosinémie type 2 (affecte peau et cornée)
  • déficience intellectuelle
  • alcaptonurie (cause arthrite)
39
Q

Qu’est-ce qu’on test au dépistage de tyrosinémie type 1? Pk?

A
  • augmentation de succinylacétone (augmente slmt si trop de tyrosine à une étape du mécanisme)
  • car tyrosine = non spécifique (prématurés, autres formes de tyrosinémie) et non-sensible
40
Q

Qu’est-ce qui crée les dommages dans la tyrosinémie type 1? Relié à quel concept?

A

Augmentation FAA (fumarylacétoacétate) = dommage dans cell d’origine = dommages hépatiques. C’EST L’AUTONOMIE CELLU!

41
Q

Principe de traitement de la tyrosinémie type 1.

A

Inhibition en amont : réduction de la prod de prods toxiques…

1) inhibition par NTBC (++ spécifique pour l’enzyme en jeu)
2) restriction diététique en phé et tyr.

42
Q

V/F?

Grâce à la santé publique, on ne meurt plus de la thyrosinémie type 1 au Qc, quand tout le monde mourrait avant, sans greffe.

A

V!

43
Q

V/F?

Toutes les maladies métaboliques héréditaires sont détectées par dépistage.

A

F!

Plsrs ne le sont pas : faut avoir vigilance clinique élevée.

44
Q

Présentations cliniques aiguës des maladies métaboliques héréditaires non dépistées (erreurs innées non traitées) (4).

A
  • neurologique (diminution des boires… mène à coma)
  • insuffisance des organes
  • systémique : acidose, cétose, hypoglycémie
  • odeur anormale caractéristique
45
Q

Comment est l’évolution des erreurs innées non-traitées? (2 types)

A
  • INTERVALLES LIBRES
    : hauts et bas… multiples épisodes aiguës de sévérité variable, parfois fatal
  • type SURCHARGE ou autres pathos lentement progressives : dégénération progressive.
46
Q

Pk enfant nait normal et détériore en qqs jours avec des erreurs innées non-traitées?

A

Même raison que PCU (plus de cordon ombilical)

47
Q

Aller faire le schéma du métabolisme intermédiaire des a.a. dans le document Word.

A

GO!

48
Q

Pour le diagnostic des erreurs innées non traitées, on fait de multiples __________, tel que tester la glycémie ou faire un ionogramme pour mesurer le _________. Il faut faire les prélèvements à un moment précis : ___________ (car les ____________). Il n’y a pas de ___________ pour toutes les situations.

A
  • prélèvements
  • anion gap (trou anionique)
  • lorsque l’enfant est symptomatique
  • nivs pourraient se normaliser en période asymptomatique
  • prélèvement standard
49
Q

Comment calculer l’anion gap et quelle est la valeur normale?

A

Na - (Cl + HCO3) = 7-16mmol/L.

(on prend juste ces ions, car ce sont les charges principales dans le sang neutre).

50
Q

Comment on mesure la qtt de HCO3- dans le sang pour calculer le anion gap?

A

pH sanguin : calcul

51
Q

Si anion gap augmenté, qq cela signifie?

A

Peut-être un peu trop d’acides aminés (acides diminuent HCO3-, donc logique).

52
Q

On mesure les acides aminés dans __________ et les acides organiques dans ___________.

A
  • le sang (car a.a. = rares : reins réabsorbent)

- l’urine (car pas réabsorbés par reins)

53
Q

Les 3 tests de décompensations métaboliques aiguës, avec liquide dans lequel ils sont faits.

A

1) chromatographie des a.a. (sang hépariné)
2) acylcarnitines (sang hépariné)
3) chromatographie des a.o. (urine)

54
Q

Leucinose…

Maladie caractérisée par _____________. Déficience de la ________ des ___________ à ____________, qui dégrade la ___________ de la ________, l’____________ et la ____________, après leur ___________. Le cofacteur en jeu est la ____________.

A
  • senteur de sirop d’érable dans l’urine
  • déshydrogénase
  • a.o.
  • chaîne ramifiée
  • chaîne carbonée
  • leucine
  • isoleucine
  • valine
  • transamination
  • thiamine (vit B1)
55
Q

Quel est le concept à retenir de la vitaminothérapie?

A

Parfois, on peut traiter avec le cofacteur de l’enzyme (qui joue sur le fctionnement de l’enzyme)

56
Q

Est-ce que la restriction diététique suffit dans la situation d’une intoxication aiguë? (ex. leucinose)

A

non : métabolites accumulés = toxiques (coma, mort) et les pertes autres que la dégradation sont minimes. Les restrictions diététiques ont trop un effet lent : il faut qqc pour épurer de plus rapide

57
Q

La restriction diététique ne suffit pas dans la situation d’une intoxication aiguë : qu’est-ce qui peut être fait?

A

Hémodialyse (on enlève susbt du sang)

58
Q

L’hémodialyse est bcp plus efficace que quoi? Pk?

A

Que diurèse car, normalement, on garde les a.a. dans le sang.

59
Q

Qu’est-ce que la “MCADD”?

A

• medium chain acyl-CoA dehydrogenase
deficiency

• déficience de la déshydrogénase des
acyl-CoA à chaîne moyenne (truc : exactement l’inverse qu’en anglais)

60
Q

Explique le métabolisme des AG.

A

1) AG estérifié avec les CoA (coenzymes A) : création d’acyl-CoA

(AG venant de CHYL ou VLDL ou tissus adip)

2) Acyl-CoA traverse membrane des mitoch des hépatocytes grâce à carnitine (navette)
3) chaque cycle de B-oxydation = 1 Ac-CoA (et 1 acyl-CoA raccourci de 2C)

4) (3 choix)
- prod d’É
- réserve sous forme de citrate
- cétogenèse

61
Q

Le moment où la personne devient hypoglycémique nous permet de savoir quoi?

A

Permet de savoir quel est le problème de l’hypoglycémie (car à certains temps, on utilise le glycogène, puis les TG, puis les prots).

62
Q

Comment fctionne la navette qu’est la carnitine pour le transport des Acyl-CoA dans les mitoch hépatiques?

A

1) CPT1 (carnitine palmitoyltransférase 1) synthétise une acylcarnitine
2) translocase transporte la carnitine à la matrice mitoch
3) CPT2 crée une acyl-CoA pour la B-oxydation

63
Q

La carnitine est essentielle pk?

A

Transport des AG à chaîne longue (+14C et maj des AG ont 16-18C)

64
Q

3 voies que peuvent prendre les acétyl-CoA (après B-oxydation)

A

1) entrer dans Krebs pour É
2) si excès, transporté au cytoplasme en tant que citrate
3) cétogenèse : corps cétoniques peuvent entrer dans tissus, dont cerveau (carburant pour cerveau)

65
Q

Pour la MCADD…

Parfois, elle peut arriver dans la ________. Dans celle-ci, il y a une série de __________. Différents groupes __________ sont utilisés selon la ____________. Ici, le problème est avec l’enzyme de la chaîne ________.

A
  • B-oxydation
  • 4 réactions
  • d’enzymes
  • longueur de la chaîne C
  • moy (d’où le “MCAD”)
66
Q

Les principaux organes qui consomment les AG (avec les chaînes qu’ils utilisent)

A
  • cœur : chaînes longues
  • mscls : chaînes longues
  • foie : chaînes longues et moy
67
Q

V/F?

Toutes les maladies des AG peuvent toucher le foie.

A

V!

68
Q

Toutes les maladies des AG peuvent toucher le foie. Cela explique quoi comme symptômes des MCADD?

A
  • hypoglycémie

- stéatose hépatique

69
Q

Pk le cerveau est atteint chez les enfants atteints de MCADD?

A
  • Le cerveau dépend de circulation pour son É. Réserves internes = minimes.
  • Normalement cerveau consomme glucose.

• Si hypoglycémie, corps cétoniques
augmentent, et alimentent cerveau.

• Dans l’hypoglycémie sans cétose, les 2 sources
É maj = absentes.

• EN PLUS dans la MCADD : accumulation d’acide
octanoïque, un acide gras à chaîne moy (C8) qui
est neurotoxique.

70
Q

Dépistage de MCADD.

A

Mesurer acyl-carnitines à chaîne moy (C8) dans rondelle de sang

71
Q

Pour le MCADD…

Le régime est __________ est il n’y a pas de restrictions ___________. Il faut éviter de manger des ___________. En cas de jeûne/vomissement, on donne un ___________. Il faut aussi faire l’évaluation de certaines personnes : ____________. On va faire de la supplémentation de ___________.

A
  • normal
  • d’activité
  • TG à chaîne moy
  • soluté glucosé
  • frères et sœurs
  • L-carnitine
72
Q

Quel est le rôle principal des mitoch?

A

Prod É!

73
Q

Les 2 types génétiques des maladies mitoch héréditaires

A

1) gènes nucléaires (autosomiques ou liés au X)

2) gènes à transmission mitoch (mat)

74
Q

Explique le processus d’entrée de prots dans la mitoch.

A

1) transcription + traduction à partir d’un gène nucléaire
2) prot a un “séq de tête” en N-terminal
3) séq reconnue par récepteurs sur mitoch : translocation dans la matrice mitoch
4) séq de tête clivée dans matrice

75
Q

Pour l’ADN mitoch…

Certaines ______ peuvent être liées à ADN mitoch. Elles ont leur propre _______. Il est présent en ________ dans une _____, et même dans une _______, il y a plsrs copies du même ADN. Juste 13 prots de ____________ qui sont produites dans ce génome, mais ces prots sont ____________. Si grosses __________ ou __________ de l’ADN mitoch, les prods de l’ADN mitoch ne pourront pas bien former la __________ (qui est nécessaire à notre survie). En fait, il y a ____ complexes de la chaine respi sur ____ qui ont des constituants venant de l’ADN mitoch. C’est uniquement le complexe ____ qui n’a pas de gène mitoch. Lors de la transmission des gènes mitoch aux enfants de la mère, toute sorte de ____________ peuvent arriver.

A
  • maladies
  • génome
  • plsrs copies
  • cell
  • mitoch
  • la chaîne respi
  • NÉCESSAIRES
  • délétions
  • mutations ponctuelles
  • chaîne respi
  • 4
  • 5
  • II
  • combinaisons
76
Q

La maladie d’atrophie optique de Leber (LHON : Leber hereditary optic neuropathy)…

1) mode de transmission
2) phénotypes
3) mutation
4) métabolisme
5) pénétrance

A

1) mitoch

2)
- perte de vision centrale d’un œil ou des 2 yeux

  • l’autre œil suit après qqs jours/mois/années (rarement)… ++ rare qu’un seul œil atteint
  • rarement : matière blanche atteinte (ressemble à sclérose en plaques)
    3) mutations ponctuelles homoplasmiques dans les sous-unités du complexe I dans l’ADNmt
    4) pas de métabolites anormaux

5) 5-10x + chez gars VS filles
: pénétrance + chez gars que filles!

77
Q

Les maladies de surcharge sont liées à quel principe?

A

Qu’un substrat ne peut pas sortir de la cell et s’accumule dans un lysosome

78
Q

Maladie de Gaucher…

1) type de maladie
2) phénotype
3) biochimie

A

1) maladie de surcharge lysosomale (gauCHer…surCHarge)

2)
- splénomégalie
- une fonte
musculaire
- infiltration
osseuse avec fracture
- ÉNORME GAMME CLINIQUE (va de asymptomatique à mort)

3) déficience en B-glucocérébrosidase (Gluco… Gaucher)

79
Q

Que fait la déficience en B-glucocérébrosidase dans la maladie de Gaucher?

A

B-glucocérébrosidase participe à la dégradation séquentielle des glycolipides complexes dans le lysosome, donc pas de dégradation.

80
Q

Maladie de Gaucher : diagnostic.

A

• globules blancs isolés et
glucocérébrosidase dosée

• résultat: déficience (<5% de l’activité
normale)… confirmation du diagnostic

• analyse moléculaire du gène GBA

81
Q

Que fait le gène GBA dans la maladie de Gaucher?

A
  • homozygotie
    pour la mutation
- mutation
associée au développement d’une atteinte
viscérale (splénomégalie) et osseuse, mais elle
protège contre le dév de complications
neurologiques
82
Q

2 traitements de la maladie de Gaucher

A

1) greffe de moelle osseuse d’un donneur sain (donc enzyme est bueno bueno)
2) thérapie de remplacement enzymatique utilisant enzyme exogène : infusions hebdomadaires

83
Q

Quand est-ce que les phénotypes disparaissent après le traitement pour la maladie de Gaucher?

A

12 mois après

84
Q

Homocystinurie…

1) phénotypes
2) famille

A

1)
- céphalées
- vomissements
- thrombose temporale
- luxation du cristallin
- ostéoporose
- aspect allongé (marfanoïde)

2) lien entre fratrie = ++

85
Q

Diagnostique de l’homocystinurie

A
  • dosage de l’homocystine tot

- chromatographie de a.a. plasmatiques pour doser homocytine libre et méthionine

86
Q

Quelles sont les 2 formes de l’homocystinurie?

A

1) troubles de reméthylation : méthionine normale ou basse

2) déficience en cystathionine-B-synthase (CBS) : méthionine haute

87
Q

Comment est le métabolisme de l’homocystinurie?

A

Cyclique (non linéaire) avec pts de branchement

88
Q

Traitement de l’homocystinurie

A
  • diète restreinte en méthionine

- supplémentation en vits, car elles sont des cofacteurs