Cours 9 : génétique et intégration Flashcards
IMP
La déficience intellectuelle (DI) a 3 conditions qui doivent être respectées : lesquelles?
1) fctionnement intellectuel sous la moy
2) limitations dans au moins 2 des sphères suivantes :
- communication
- loisirs et travail
- autonomie
- utilisation des ressources sociales
- social abilites
- école
- santé et sécurité
(CLAUSES)
3) survenir avant 18 ans (pour distinguer de démence)
Le QI pour DI est de combien, et quel % de pop?
- QI = 70
- 2,3%
La DI est le problème ___________ le plus IMP en Occident (+ grand que coût que cancer et maladies cardiovascu). Les causes de la DI sont 20% ______________ et 50% __________. On estime que le 30% restant est ___________.
- socio-économique
- environnementales
- génétiques
- aussi génétique
Explique la diff entre “retard global de dév” et “DI”.
RGD = avant 4-5 ans et DI = après. On attend de pouvoir tester avant de dire DI, car ça peut ne pas être cela et être stigmatisant.
Explique diff entre DI légère, modérée et sévère.
L = QI de 70 à 55
M = QI de 55 à 40
S = QI de moins de 40
Forme syndromique VS non-syndromique de DI.
S = caractérisée par anomalies de structs ou métaboliques additionnelles
Déficience intellectuelle et co-morbidités…
Les 2 co-morbidités svt associées à la DI sont ___________ et ____________. ____% des sujets autistes présentent une DI. _____% des sujets autistes sont épileptiques. _____% des sujets avec DI sont épileptiques.
- épilepsie
- autisme
- 50
- 20
- 20
Diff entre…
- maladie extrêmement rare
- très rare
- rare
- commune
(dire principe de base et spécifiquement pour chaque)
Principe : mutations qui causent affectent de + en + l’ADN.
- mutation spécifique
- 1 gène muté
- 2-3 gènes mutés
- plsrs gènes mutés (ex. 1000 pour DI ou maladies mitoch)
Il y a une hétérogénéité génétique de la DI : nommer les 2 grosses catégories de causes et les sous-catégories si lieu.
1) mutations affectant nombre de copie
2) mutations ponctuelles :
- liées au X
- autosomique
Pour les DI engendrées par mutations affectant le nombre de copies…
On peut les identifier par _____________ (____% des cas de DI) et par ____________ (____% des cas de DI identifiables par cette méthode). Le + svt, les mutations surviennent _____________ (mais elles peuvent aussi être transmises).
- caryotype
- 5%
- hybridation génomique sur micropuces
- 14
- de façon spontanée : de novo
IMP
Pour les DI engendrées par des mutations ponctuelles…
Pour ce qui est de celles liées au X, elles n’expliquent que ________ des cas de DI chez les ________. Il y a env. ______ gènes associés à la DI sur le X.
Pour ce qui est de celles qui sont autosomiques, elles peuvent être ________ ou ________. Dans le cas des dominantes, elles peuvent survenir _____________. On estime que plus de ______ gènes sont associés à la DI, et la grande maj de ces gènes sont ___________.
- 10%
- gars
- 100
- récessives
- dominantes
- de novo ou transmises
- 800
- autosomiques
IMP
Les mutations ponctuelles de novo…
Le taux de mutation est de __________ nucléotides muté/nucléotides normaux. Comme le génome diploïde a __________ nucléotides, il y a environ _______ mutations de novo par génome diplo. Comme les régs codantes représentent env. ____% du génome, il y a environ _____ mutations de novo par exome. Les ___________ sont associés à un taux de mutation très grand : soit ____x + grand.
- 1 x 10^8
- 6 x 10^9
- 60
- 2
- 1,2
- sites CpG
- 10
IMP
Les mutations de novo…
Le taux de mutation est différent selon le ___________. En effet, les variations de structure de plus de 20pb mutées arrivent chez ____% de la pop, et celles de plus de 100pb arrivent chez _____% des personnes. Par personne, il y a env. ______ indels (1-20pb) et _______ (single nucléotide polymorphisme), donc soit, en moyenne, ______ SNV/exome.
- type de mutation
- 16
- 1-2
- 2,94
- 60-70
- 1
Le séquençage du génome permet de détecter…?
virtuellement toutes les mutations (techno encore en dév, mais permettrait de tout trouver)
IMP
Quelle est la techno générale qu’un utilise pour trouver les mutations de nos jours (jusqu’à ce qu’on trouve qqc de mieux)?
Capture de l’exome
Quels sont les 2 choses qu’on ne peut trouver en capturant l’exome, qu’on peut trouver en capturant le génome?
- réarrangements éq
- mutations ponctuelles dans régs non codantes
Quelle est la seule possible utilité du caryotype pour trouver les mutations?
trouver réarrangements éq
Quelle est la seule possible utilité du CGH standard pour trouver les mutations?
CNV de - de 5mb
Gène responsable du syndrome de Schinzel-Gideon
SETBP1
On peut identifier des mutations de nova par l’étude de 2 groupes : lesquelles?
- multiples patients (avec même syndrome)
- cas unique (en regardant père, mère, cas-index)
IMP
Quelles sont les causes principales des DI modérées à sévères?
mutations de novo touchant 1 seul gène!
IMP
Il y a 3 types d’impact fctionnels des mutations dominantes : quels sont-ils (et dire le type de mutation)?
- haploinsuffisance (mutation amorphique)
- dominant-négatif (mutation antimorphique)
- gain de fct (mutation néomorphique)
IMP
Pour l’haploinsuffisance…
Il y a une _____________ de la _________ de la ___________. Le gène est sensible à ___________. On les distingue des mutations hypomorphiques, qui est une entre-deux de ___________ et de _________.
- perte complète
- fct
- prot
- l’effet de dosage
- la situation normale
- l’haploinsuffisance
IMP
Pour le dominant-négatif…
La _________ agit de façon ___________ sur la __________. Les structures qui sont affectées sont les ___________. Dans ce genre de situation, ____% des récepteurs sont non fctionnels : peut donc être considéré comme pire que l’haploinsuffisance. La prot est donc produite et c’est sa ___________ avec d’autres prots qui cause problème.
- prot mutante
- antagoniste
- prot sauvage
- récepteurs
- 75
- relation
IMP
Pour les gains de fct…
Il y a __________ d’une ___________. C’est la cause maj des ___________.
- acquisition
- activité aberrante
- maladies dominantes
Pour dire que qqn souffre du trouble de l’autisme, il faut que cela début avant l’âge de ______ et que au moins un des 3 domaines suivants soit affecté :
- _________
- __________
- _________
- 3 ans
- interactions sociales
- langage nécessaire à la communication sociale
- jeu symbolique ou d’imagination
Le type de mutations le + svt impliquées dans le TSA (trouble du spectre de l’autisme)
mutations de novo
Comment varie le taux de mutation de novo selon l’âge paternel?
Augmente ave l’âge paternel
IMP
Pk pères donnent + de mutations de novo que mères?
Les mutations de novo se font pendant les divs cellu. Le gars fait bcp + de div cellu que femmes avec ses spermatozoïdes, donc plus de mutations de novo transmises de chez l’homme
La plupart des de novo sont de lignée ________. Quand la mutation arrive en post-zygotique, ça donne un ___________ et va donc toucher un moins grand __________.
- germinale
- mosaïcisme
- nombre de cells
IMP
Quel est le risque de transmission d’une mutation de novo à un membre de la fratrie?
1,3% (car la plupart des mutations de novo = transmises de façon germinale)
Est-ce que le “timing” des mutations de novo ont une influence? Comment?
Oui : si arrivent + tard, vont affecter moins de régions du corps.
Comment expliquer que certains individus ont un même CNV, et que la pénétrance est incomplète?
Il faut qu’il y ait un 2e hit : un autre CNV de même grosseur, des facteurs environnementaux, des plus petits CNV, etc.
Est-ce que quand on a une mutation de novo, il faut tjrs un 2e hit du CNV pour que la mutation ait un impact?
Non : juste pour mutation à pénétrance réduite
Est-ce qu’un CNV de novo est tjrs d’emblée pathogénique?
Non : pourrait être à pénétrance réduite
Est-ce qu’un CNV hérité est tjrs d’emblée bénin?
Non : pourrait être à pénétrance réduite
Est-ce que la transmission héréditaire peut avoir lieu pour l’autisme, même si parents pas autistes?
Oui.
Pour les CNV/SNV suivant, dire si le risque de transmission pat est plus élevé, le risque de transmission mat est plus élevé, ou si les risques sont env. =…
- SNV de novo
- CNV héréditaire
- SNV héréditaire
- CNV de novo
- pat
- =
- =
- pat
Est-ce que les femmes sont “protégées” de l’autisme? Et des DI en général comparées au gars? Pk?
- oui (4 gars pour 1 fille)
- oui
- sont + protégées des CNV (il faut + de CNV chez les filles pour avoir un phénotype anormal)
IMP
Est-ce que le chromosome X explique complètement l’excès de DI chez les gars VS fille? Précise.
NON : n’explique que 10% des cas de DI chez les hommes
Quel est l’excès de garçons avec DI.
25%
Nombre de gènes de DI lié au chromo X.
Au moins 100
Incidence du syndrome du X fragile et % des DI des gars lié à ce syndrome.
- 1/6000
- 2%
