Cours 2 Flashcards
Disomie uniparentale (upd et dup)
- Quand les deux chromosomes viennent d’un des deux parents
• heterodisomie : les deux
• Isodisomie : deux fois le meme chr chez l’un des deux parents
Variations structurelles (SV) 8 reponses
> 50pb
- translocation
- insertion
- inverstion
- les pertes/gain copie
- SV complexe
- Chr en anneau
- isochromosome
Translocation def
Echange entre chr non homologue
Comment appelle t on la translocation (chr 1 sur chr 22)
Derivatif chr 1 (der(1))
Translocation robertsonienne
2chr acrocentrique avec fusion des bras longs + perte de bras court
Les combinaison de translocations robertsonienne et leur frequence
13;14 la plus frequente
- 1 couple sur 100 avec des fausses couches à répétition
- 1/1000 nouveau né est porteur
Insertions > 50pb
Insertion d’une nouvelle region ou d’une region d’un autre chr
Dans le deuxieme cas il y a perte de la copie chez un chr et gain sur l’autre chr
Inversion >50pb (def + les 2 types)
Inversion de la sequence ABC devient CBA dans le meme chr
Pericentrique : cassure sur deux bras different
Paracentrique: deux cassures sur le meme bras
- Inversion de la séquence coupée
Deletion >50pb
- perte de copies
Gains de copie
Gain region C
- sur le mm chr en cis(mm chr) et tandem (à la suite)
- sur le mm chr en cis mais pas en tandem
- sur 2 chr different en trans
Duplication /triplication (haploïde/diploïde)
Haploïde :
Duplication : sans = 1 copie, avec = 2 copies
Triplication : sans 1 copie, avec 3 copies
Diploïde :
Duplication : sans deux copies, avec 3 copies au total
Triplication : sans 2 copies, avec 4 copies
CNV (copy number variant) def + taille
Perte ou gain de copies d’une sequence >1kb -5Mb
Comment nomme t on les sequences où l’on additionne plusieurs SV ?
SV avec rearrangement complexes multiples
Chr en anneau
- Cassure extremite d’un chr
- recollement avec perte des segments coupé
Isochromosome
Chr formé de deux bras q/p d’un mm chr avec perte de l’autre bras
- Monocentrique (si coupure au centromere)
- Dicentrique (si coupure autre que dans le centromere)
Formule du caryotype quand erreur (6)
- Nbre de chr (46)
- Enumeration (XY)
- Type de rearrangement (rob, del, inv, t, r, i…)
- Chr impliqué (14;21)
- Point de cassure sur les deux chr (q10;q10)
- Information supplementaire +21