Cours 1 Flashcards

1
Q

ADN nucléaire (cb de pb ? Chr?)

A

2x3,2x10^9pb (diploïde)

2x23chr

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Q

ADN mito (cb de molécule ? Cb de pb ?)

A

-1000 - 10’000 molécule ADNmt
- 16’569 pb

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3
Q

Compaction de l’ADN (dans chr ou dans le noyau)

A
  • chr : très compacté
  • Noyau : moins compacté
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4
Q

Génome diploïde/haploïde

A
  • Diploïde : 2 génomes = 6,4*10^9pb
  • Haploïde : 1 génome = 3,2*10^9pb
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5
Q

Formule chromosomique (à quoi ça sert + la nomenclature)

A
  • repère dans le génome humain
  • chr/bras/region/bande.sous bande
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6
Q

Formules chr nommer les différentes parties ? (centre, bout etc.)

A
  • telomeres pter et qter
  • Centromere q10 et p10
  • Bras long = q
  • Bras court = p
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7
Q

Comment réaliser un caryotype ?

A
  • liquide amniotique/cellules sanguine
  • en culture à 37 degrés
  • agent mitogene pour croissance
  • colchicine = bloque en metaphase
  • centrifuge
  • Solution hypotonique = detruit membrane
  • fixation noyau
  • Etalement sur lame les noyaux
  • Marquage : trypsine = denature prot. Coloration giemsa des sequences rendues accessibles
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8
Q

Quels sont les trois types de chr ?

A
  • Métacentrique p=q
  • Submétacentrique p<q
  • Acrocentrique P quasi inexistant (13,14,15,21,22)
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9
Q

Identifier les chr et les classer pour former le caryotype (5)

A
  • Index centromerique (type de chr→ acrocentrique)
  • Taille (plus grd au plus petit)
  • Homologie des paires de chr grâce aux bandes
  • 44 autosomes
  • 2 gonosomes
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10
Q

Coordonnée génomique

A

Chr: position début-position fin (numéro de l’assemblage)

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11
Q

Séquence référence du génome

A
  • Universelle
  • Publique
  • Séquence est haploïde 3,2*10^9 pb
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12
Q

Comment nomme t on une position donnée du génome ?

A

Locus

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13
Q

Qu’est ce qu’un génotype ? (des + deux types)

A

Information des 2 allèles d’une personne à un locus donné (p ê long)

  • homozygote : mm allèle
  • hétérozygote : allèle différent
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14
Q

C’est quoi un allèle ?

A

Version d’un gène, d’un locus (position)

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15
Q

Qu’est ce qu’un variant ?

A

quand les séquences sont différentes de celle de référence

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16
Q

Différence entre des personnes qui ne sont pas de la meme famille, deux tantes, frr-soeur, jumeaux ?

A

Moins de différence entre 2 personnes qu’entre tante.

–> c’est dû aux différences accumulée

  • jumeau/ frr-soeur moins de différences
17
Q

A quoi ça sert d’étudier génomes humaines ?

A
  • Voir les ∆ avec séqu. de réf.
  • Voir quelles variations = pré-disposition de maladie (degré de risque) ou adaptation à l’environnement
18
Q

Combien de % du génome humain diffère par sa séquence d’un autre génome ?

A

0,96%

19
Q

Homologie Humain avec
- Chimpanzé
- Vache
- Souris

A
  • 98-99% –> évolution espèce explique ces ∆
  • 80%
  • 90%
20
Q

MAF, c’est quoi ? Elle montre quoi ? (3)

A
  • Fréquence de l’allèle mineur
  • Montre rareté d’une allèle dans une population donnée (tout pays confondus, différents continents)
  • Vu que ce sont des variations rare, ils peuvent être source de maladie rare
21
Q

Haplotype, c’est quoi ?

A
  • Combinaison d’allèles sur le mm chr
  • Simplifie l’énumération de loci avec variations
22
Q

Quels sont les types de variations ? (du plus grand au plus petit, 6)

A
  • Anomalie chromosomique
  • Disomies uniparentales (UPD)
  • Variations structurelles (>50pb, SV)
  • Variants (<50pb)
  • Substitution d’une pb

-Répétition (séquences très variables)

23
Q

Anomalie chromosomique (= anomalie numérique/nbre de chr), c’est quoi ?

A
  • Euploïdie : multiple de n
  • Aneuploïdie : Variation d’un ou + chr

Aneuploïdie :
- Monosmie
- Nullisomie
- Trisomie
- Tétrasomie

24
Q

Maladie sur les autosomes ? (3)

A

Trisomie
- 21
- 13
- 18

25
Q

Quels sont les maladies affectant le gonosome ? (3)

A
  • Trisomie X (47 XXX)
  • Syndrome 47, (XXY ou XYY)
  • Monosomie X/ Syndrome 45,X (Turner)
26
Q

Quel est la fréquences des anomalies numériques à la naissance ?

A

Dysgonosomie
- Assez fréquentes (~1/1000 naissances)

Trisomie
- 21 –> la + fréquente (1 bb/800)
- 13 et 18 –> esp vie - d’1 an

27
Q

Quelle est la fréquence des anomalies numériques foetale ?
Quelle est la plus fréquente ?

A
  • Plus de résultats sans anomalie détectée –> car le foetus n’est pas anormale. (general)
  • La plus fréquente c’est trisomie 21 –> car bcp demande de diagnostique prénatal => très connu.
28
Q

Comment spécifier les anomalies numériques ? (“classement”, 4)

A
  • Type de chr (auto-/ gono-some)
  • Moment d’apparition (Constitutionnelle/ Acquise ou somatique)
  • Nbre de cell avec anomalie (mosaïcisme/ homogène)
  • Type cellulaire (somatique/ germinale)
29
Q

Anomalie numérique constitutionnelle/acquise, c’est quoi ?

A
  • Constitutionnelle : hérité des parents. Présent dans les gamètes des parents
  • Acquise : Anomalie apparaît dans une cellule de l’embryon
30
Q

Anomalie numérique mosaïque ou homogène ?

A
  • Homogène : toutes les cellules sont affectées
  • Mosaïcisime : qq cellules sont affectés. Apparition post-zymotique (après fécondation)

–> plus apparaît tard dans le dev - il y a de cell impacté.

31
Q

Disomies uniparentales, def ?

A
  • Présence de 2 chr homologues hérité d’un même parent.

–> Hétéro-/Iso-disomie