Cours 10: Mycologie Flashcards
cmb y a-t-il d’espèces / nb de mycètes
- 150 000 espèces
- 2-4 millions estimées (> 5 % caractérisées)
qu’est ce que micromycètes
levure et moisissures (microscopique)
qu’est ce que macromycètes
champignons macroscopiques ; Sporophores/Condiophores visibles
est ce que les mycètes sont eucaryotes ou procaryotes
eucaryotes
V/F: les mycètes ont chlorophylle et spors
F: porteurs de spores mais sans chlorophylle
cmt se fait la nutrition des mycètes
absorption et utilisation du C orgnanique (hétérotrophe)
quelle est la reproduction des mycètes
reproduction souvent asexuée rarement sexuée
de quoi est faite la paroi cell des mycètes
paroi cell faite de la chitine et glucanes
quel est l’impact généralement des mycètes sur l’homme
moins de 100 sont pathogèness; sont pour la plupart saprophytiques
sur quoi est basée la morphologie des champignons
sur la forme de croissance végétative
quels sont les 3 types de morphologies des champignons
- levures: forme levuriforme
- moisissures: champignons filamenteux
- champignons dimorphiques: différencient des filaments et levures
quelles sont les 4 classifications morphologiques des mycètes
- levures
- moisissures
- pseudohyphes
- champignons dimorphiques
quelle est la forme la plus simple des champignons
levures
cmt se multiplient les levures
par bourgeonnement (Saccharomyces cerevisiae et
C. albicans -A) ou par fission (Schizosaccharomyces pombe- B)
quel est le nom des levures pathogènes de homme
Blastoconidies/blastospores (C. albicans)
cmt sont les cell des moisissures
Cellules filamenteuses et cylindriques souvent branchées nommées hyphes
qu’est ce qu’un mycélium
masse d’hyphes (cell filamenteuses des moisissures)
quels sont les 2 types d’hyphes
Hyphes avec (Aspergillus) ou sans septum (Mucor)
qu’est ce que les pseudohyphes
- Morphologie associée aux levures et distincte de la forme levure et la forme hyphale.
- Cellules levuriformes allongées et attachées (en forme de collier)
qu’est ce que les champignons dimorphiques
Filamenteux à ~ 25°C (dans l’environnement/sol) Levures à 37°C température corporelle.
qu’est ce que le dimorphisme
caractéristique de plusieurs champi pathogènes endémiques comme blastocytes et histoplasma
qu’est ce que la morphogénèse
changement morphologique qui est une caractéristique d’identification des champignons dimorphiques en lab
quels sont les champirgnons dimorphiques qui sont agents de blastocytose
Blastomyces derematitidis
quelles sont les 3 étapes de la reproduction asexuée
- production de spores
- fragmentation de mycélium
- production de stolons
quels sont les 3 types de spores pour la reproduction asexuée
- Endospores (produites à l’intérieur du sporocyste)
- Exospores (générées à l’extrémité des filaments/hyphes)
- Blastospores (propagules issues de bourgeonnement)
cmt se fait la production de stolons lors de production asexuée
propagation par extension des filaments
cmt se fait la fragmentation de mycélium lors de la reproduction asexuées
spores formés à la suite de la fragmentation d’hyphes / filaments
cmt calculer le nb d’espèce de champi
séquencage
V/F: des champi peuvent être micromycètes et macromycètes
V: peuvent être observé à l’oeil nu et microscope
V/F: le champi est très loin de homme
F: les cell des champi sont plus proches des cell huamaines que des cell bactériennes
cmt se fait la reproduction sexuée
- fusion de 2 gametes (isogamie) ou de contenu cell (Cystogamie/Plasmogamie)
- formation de spores après méiose dans sructures spécialisées: Asques contenant des ascospores (ascomycètes), Basides contenant des basidiospores (basidiomycètes)
pourquoi champi fait plus de reproduction asexuée
+ facile de se reproduire; conditions plus faciles
à quoi sont opposés les champignons parfaits
à l’opposé de champignons imparfaits (reproduction sexuée absente ou non connue); imparfait font juste repodu asexuée mais parfait dont 2 types de reproduction
de quoi dépend la classification actuelle taxonomique
dépend de présence / absence de reproduction sexuée (méiose) et des caractères morphologiques (présence septum / cycle de vie / physiologie)
sur quoi est basée la phycologie moléculaire et génétique
basée sur la ressemblance des séquences d’ADN
quelles sont les 3 catégories qui émergent de LUCA (last universal common ancestor)
- bactéries
- archée
- eucaryotes
quelles sont les 5 principales 5 embranchements / phyla basés sur l’analyse des génomes/ADN
- mortierellomycota
- mucoromycètes
- glomeromycota
- basidiomycètes
- ascomycètes
à quoi ressemble les pseudohyphes sur gélose; cmt les différencier
champi filamenteux; en suspension cell, les pseudohyphes peuvent se détacher facilement mais cell des champi filamenteux ne peuvent se détacher masi vont se briser
quels % des champignons connus sont des ascoycètes
75%
quels sont les types de champi qui sont des ascomycètes
levures ou filamenteux
quelle est la reproduction faite par les ascomycètes
- reprod sexuée (ascospores) ou asexuée par bourgeonnement (blastopores/levures) ou par prodcution de spores (conidies)
de quelle classification taxinomique font partie ces mycètes: Candida albicans, Aspergillus fumigatus, Fusarium, Penicillium
ascomycètes
quelle est la reprod faite par les basidiomycètes
Reproduction sexuée par formation des basidiospores (basidium) ou des conidies
quelles sont les apparences types des basidiomycètes
Sporophore/carpophore, levures, filaments, capsules,
de quelle classification taxonomique sont ces mycètes: Cryptococcus neoformans, Boletus, Agaricus, Russula
basidiomycètes
quels sont les 3 types de zydomycètes
Glomeromycètes, Mucoromycètes et Mortierellomycota
qu’est ce que sont les zygomycètes
forme primitive de champi
quelles sont les cell des zygomycètes
Cellules coenocytiques (en majorité, mais exception existe)
quelle est la reproduction faite par les zygomycètes
Formation de zygospores (reproduction sexuée), sporocystes (reproduction asexuée)
quels sont les 2 sous types de zygomycètes
Ectomycorhizes et endomycorhizes (forment symbiose avec racine de plante)
de quelle classification taxonomique font partie ces mycètes: Glomeromycètes (Glomus, Gigaspora, Rhizophagus), Mucoromycètes
(Mucor, Phycomyces), Mortierellomycota (Mortierella, Diussophora)
zygomycètes
qu’est ce que sont les microsporidies
pathogènes intracell de plusieurs animaux (une des classifications taxonomiques) donc vivent dans cell d’hote
quelles sont les caractéristiques de la cell fongique des levures
- Noyau avec membrane nucléaire
- Cytoplasme
- Mitochondrie
- Vacuole
- Réseau de transport vésiculaire : Réticulum endoplasmique et Golgi
- Membrane plasmique
- Paroi cellulaire
quelles sont les caractéristiques de la cell fongique de hyphe
1- Septum avec le pore septal
2- Corps de Voronine (Woronin body)
3- Noyau avec nucléole
4- Réticulum endoplasmique
5- Mitochondrie
6- Membrane plasmique
7-Paroi cellulaire avec 3 couches: Interne (chitine), intermédiaire (glucane) et externe (mannane)
8- Vacuole
9- Golgi
10- Spitzenkorper
quelles sont les composantes de la membrane plasmiques de la cell fongique
- ergostérol (cholestérol fongique)
qu’est ce que ergostérol
stérol spécifique des champi et de certains protozoaires et absent chez les cell animales; cholestérol fongique
à quoi contribue les constitants de la membrane des cell fongiques
contribue à régulation de sa fluidité
qu’est ce qui sert de cibles aux antigfongiques dans la membrane plasmique des cell fongiques
érgosterol est la cibles des antifongiques de la famille des Azoles et des Polyènes
quelles sont les composantes des 3 couches de la paroi cell des cell fongiques
- couche externe: mannanes et prot pariétales
- couche intermédiaire: glucane
- couche interne: chitine
dans quel type de champi peut on trouver de la mélanine
Présence de mélanine chez certains champignons filamenteux (Aspergillus, Alternaria)
qu’est ce que la chitine représente pour les champi
Présence de mélanine chez certains champignons filamenteux (Aspergillus, Alternaria)
de quoi est fait la chitine trouvée dans la paroi cell des cell fongiques
Microfibres insolubles du poly ß-(1→ 4)-N -acetylglucosamine polymère associés aux glucanes
qu’est ce que vacuole
équivalent de lysosomes; détoxification et stockage de nutriments essentiels
quel % de la masse de la paroi est représenté par le glucane
58/60%
de quoi est fait le glucane trouvé dans la paroi cell
- ß-(1→ 3)-D –Glucane et ß-(1→ 6)-D –Glucane
qu’est ce qui sert de cible pour les antifongiques de la famille des échinocandines
le glucane de la paroi (couche intermédiaire) des cell fongiques
de quoi le mannane est un composant majeur
Composants majeurs des protéines pariétales (38–40% de la masse de la paroi)
qu’est ce qui sert d’Ag majeur de C. albicans
mannanes de la paroi cell
de quoi est fait le mannane de la paroi cell
hémi cellulose
de quoi sont faites les prot pariétales de la paroi des cell fongiques
Protéines GPI ( glycosyl–phosphatidylinositol-Protéines) associées à la chitine et au ß-1→ 6-glucane:
quelle est la fonction des prot pariétales de la paroi des cell fongiques
adhésines (attachement à hote); biogénèse de paroi
quels sont les 4 mode de vie des champi
- saprophytes: se nourissent de matière organique en décomposition (recyclage)
- symbiotiques: vivent en symbiose avec racine de plantes (mycorhizes) ou algues (lichens)
- pathogènes / opportunists: pathogènes de plantes / hotes / animaux / homme / champi
- commensaux: font partie de flore et profitent de hote sans causer dommage
qu’est ce que le mode de vie en symbiose confère
confère avantage nutritid aux 2 partenaires
quels sont les types de champi pathogènes selon chez les plantes et homme/animaux
- plantes: nécrotrophes (tuent l’hôte pour se nourrir) ou biotrophes (se nourrissent de l’hôte vivante)
- homme/animaux: opportunistes (en condition d’immuno-supression) ou pathogènes stricts venant de l’environnement (sol, air, ..)
V/F: les champi commensaux peuvent être opportunistes dans certains contextes
V: comme C. albican
quelle est la différence de type de cell entre les champi en bactéries
- champi: eucaryotes
- procaryotes: procaryote
quelle est la différence d’organelles entre les champi en bactéries
- champi: présence (mito / peroxysome / vacuole)
- b: absence
quelle est la différence de membrane nucléaire entre les champi en bactéries
- c: présence
- b: absence
quelle est la différence de chromosomes entre les champi en bactéries
- c: plusieurs et linéaires
- b: 1 et circulaire
quelle est la différence de membrane cell entre les champi en bactéries
- c: présence de stérol (ergostérol)
- b: absence de stérol (saif mycoplasma)
quelle est la différence de paroi cell entre les champi en bactéries
- c: glucanes / mannanes / chitine (pas de peptidoglycane)
- b: peptidoglycane
quelle est la différence de spores entre les champi en bactéries
- c: produisent spores sexuées et végétatives de tt sortes
- b: endospores
quelle est la différence de sensibilité aux antimicrobiens entre les champi en bactéries
- c: antifongiques (azotés / polyènes / échinocandines)
- b: antibio
quelle est la différence de métabolisme entre les champi en bactéries
- C: hérétotrophe
- b: hétérotrophe / photoautotrophe
Qu’implique le fait que les champignons
sont des organismes eucaryotes ?
similarité avec humain; développement de antifongique compliqué car poison pour humain aussi car cible mm proccesus cellulaire
qu’est ce que sont les mycoses
des infections fongiques touchant les animaux incluant l’Homme.
quels sont les 3 types de mycose
- superficielles
- profondes
- systémiques
qu’est ce que mycologie médicale
discipline distincte de microbio médicale qui isole / caractérise des champi pathogènes dans but de caractériser origine mycologique ou non d’une pathologie
qu’est ce que le 2e siècle représente pour la mycologue médicale
Ère de la suppression immunitaire et des mycoses opportunistes nosocomiales (Candidoses et aspergilloses)
quelles sont les 4 découvertes de mycologie médicale au 20e siècle
- Chimiothérapie (traitement du cancer)
- Maintenance des greffons (immunosuppression)
- VIH/SIDA (1981-)
- Maladies auto immunes chroniques de intestin: crohn
quelles sont les 5 classifications des champi basées sur la pathogénèse selon les sites d’infections primaires
- Mycoses superficielles
- Mycoses cutanées
- Infections opportunistes systémiques
- Mycoses sous-cutanées
- Mycoses endémiques
qu’est ce que sont les mycoses superficielles
problèmes majoritairement cosmétiques
qu’est ce que la Tinea versicolor
Infection de la couche supérieure morte kératinisée de l’épiderme; causée par Malassezia
qu’est ce que les mycoses cutanées
Infections touchant la peau, les cheveux et les ongle
par quoi sont causées les mycoses cutanées
- Dermatophytes
quelle est la premières éclosion causée par champi au 20e siècle
Éclosion de Sporothrix schenckii (infections sous-cutanée) chez 3000 travailleurs
miniers en Afrique du Sud (1941-1944).
quel est le mycologie liée à la 2e guerre mondiale
apparition de zones endémiques aux USA (Histoplasma capsulatum, agent de l’Histoplasmose).
par quoi sont causées les mycoses opportunistes systémiques
Infections de tous les organes par des champignons environnementaux (Aspergillus fumigatus),
ou des endosymbiontes commensaux/Mycobiota (Candida albicans)
qu’est ce que sont les mycoses opportunistes systémiques
Infections touchant des patients dont le système immunitaire est compromis:
- Porteurs de VIH
- Patients immunosupprimés: transplantation d’organes, Chimiothérapies …
- Nouveaux nés, femmes enceintes, …
mais aussi chez personnes saines:
- champi dimorphiques
qu’est ce que les mycoses sous cutanées et par quoi sont causées
- Mycoses d’implantations (suite à des piqûres ou des traumatismes transcutanés)
- Causées par des champignons mélanisés ce qui donne couleur noir
qu’est ce que sont les mycoses endémiques
Causant majoritairement des infections pulmonaires qui peuvent évoluer en infections systémiques.
par quel type de champi sont causées les mycoses endémiques
Champignons ayant une répartition géographique restreinte
par quoi sont causées ces mycoses endémiques :
- Histoplasmose
- Blastomycoses
- Coccidiomycose
- Paracocciodomycose
- Penicillose
- Sporotrichose
- Cryptococcus gatti
- Histoplasmose: Histoplasma capsultum (USA centrale-River valleys)
- Blastomycoses: Blastomyces dermatitidis (même répartition que H. capsulatum mais aussi
Canada-Québec) - Coccidiomycose: Coccidioides immitis, C. posadasii (Californie et Arizona)
- Paracocciodomycoses: Paracoccidioides brasiliensis (Brésil et Colombie)
- Peniciliose: Penicillium marneffei (Asie sud-est)
- Sporotrichose: Sporothrix schenckii (plusieurs régions du monde)
- Cryptococcus gatii (Côtes ouest USA et Canada)
quels sont les pathogènes majeurs de homme
pathogènes fongiques; cas de candidose / C albicans
qu’est ce que l’aspergillus sp peut causer
- Aspergillomes pulmonaires et cérébrales
- Aspergilloses pulmonaires chroniques
- Infections superficielles : Sinus, otomycose (oreille), onychomycosis (ongles)
- Allergies
quels sont les 2 types de aspergillus sp
Aspergillus fumigatus et aspergillose invasive
qu’est ce que les cryptococcus peut causer
- Lésions cérébrales et pulmonaires, et Méningites
chez qui est ce que les cryptococcus causent des infections et quel est sont type
- Cryptococcus gattii
- chez sujets seins et immunosupprimés
quels sont les champi qui sont blastomyces
- Blastomyces dermatitidis
quelles sont les infections causées par les blastomyces
- Infection fatale
- Infections pulmonaires, lésions dermiques et ostéomyélites
quels sont les principaux types de candida sp
- C. albicans
- C. glabrata
- C. dubliniensis
- C. parapsilosis
- C. tropicalis
- C. krusei
- C. lusitaniae
- C. guilliermondii
- C. rugosa
- C. auris
qu’est ce que C. albican cause
candidose
quelle est la maladie nosocomiale la plus commune
candidose par C albican
qu’est ce que la candidose cause
Cause fréquente de morbidité et de mortalité chez les patients immunosupprimés
à quoi est ce que la virulence de candida albican est associée
associée à son dimorphisme:
- Hyphes dédiés à l’invasion et la colonisation des organes.
- Levures associées à la dissémination de C. albicans.
de quoi est constituée le biofilm de la levure C albican
hyphes, pseudohyphes, levures et une matrice polysaccharidique
quel type de mycose est causé par le voyage / camping
mycoses endémiques
quels sont les 3 types de thérapies antifongiques
- chimique: 3 classes de mol utilisées (azoles,
les échinochandines et les polyènes) - immuno modulation: vaccination
- immunothérapie: stimulation de défense immunitaire contre pathogènes fongiques
qu’est ce que sont des azoles
- antifongiques les + utilisés
quelle est l’action des azoles
fongiostatiques
contre quoi sont utilisées les azoles
contres des infections systémiques et superficielles
quelles sont les 2 sous classes des azoles
- 1,2,3-Triazoles (Fluconazoles, itraconazole)
- Imidazole (ketoconazole, Clotrimazole)
quelles sont les cibles cell et moléculaires des azoles
- Cible cellulaire: membrane plasmique
- Cible moléculaire: Les azoles inhibent la
biosynthèse de l’ergosterol
qu’est ce que sont les échinocandines
Antifongiques administrés par intraveineuse
quelle est l’action faite par les échinocandines
fongicides
contre quoi sont utilisés les échinocandines
contre infections systémiques graves
quelles sont les 3 molécules utilisées comme échinocandines
- Caspofungin (Cancidas-Merck): Contre C. albicans, Aspergillus
- Micafungin (Mycamine, Astellas Pharma): Contre C. albicans
- Anidulafungin (Eraxis, Pfizer): Contre C. albicans
quelles sont les cibles cell et mol des échinocnadines
- Cible cellulaire: Paroi cellulaire
- Cible moléculaire: Inhibent la biosynthèse des glucanes
(Inhibition de l’enzyme glucane synthase, Fks1)
qu’est ce que sont les polyènes (amphotéricine B)
Antifongiques administrés par intraveineuse ou par voie orale
V/F: l’utilisation d’antifongique cause presque tjrs toxicité
V
quelle est la particularité de C albican
fait des filaments; entre les 2 formes de champi dimorphiques et levure; facteur clé de sa virulence (échappe à la défense immunitaire + fait propagation a/n de organisme / facilement transmis)
quelle est l’action des Polyènes- Amphotéricine B
fongistatiques / fongicide ( concentration-dépendante)
qu’est ce qui permet de réduire toxicité de Polyènes- Amphotéricine B
la formulation liposomale (AmBisome) réduit sa toxicité
qu’est ce qui biofilm
amas de **; résistant aux antifongiques
V/F: le spectre antigongique des Polyènes- Amphotéricine B est petit
F: Spectre antifongique large:
- Aspergillus fumigatus
- C. albicsans, C. glabrata, C. krusei, C. lusitaniae
- Cryptococcus neoformans
- Fusarium oxysporum
**mm si pas d’antifongique a vrai large spectre
quelles sont les cibles cellulairs et mol des polyènes
- Cible cellulaire: membrane plasmique
- Cible moléculaire: Les polyènes inhibent la biosynthèse
de l’ergosterol et forment des pores qui fragilisent la membrane
quelles sont les 3 limites des thérapies antifongiques
- toxicité pour tt molécules connues car ressamblance aux cibles thérapeutiques due à nature eucaryotique des cell humaines/ fongiques
- perte d’efficacité dans certaines niches acides (vagin / abcès)
- résistance
quel est le premier antifongique utilisé
amphothéricine B
quelle est la limitation liée à l’utilisation des échinocandines
sont insolubles
quel est le problème associé à nature fongistique de certaines mol comme azoles
problène de récurrence et résistance
qu’est ce que ces champi ont causé: Batrachochytrium dendrobatidis (Bd) + Pseudogymnoascus destructans
- Batrachochytrium dendrobatidis (Bd): cause de Chytridiomycose des amphibiens à l’échelle mondiale
- Pseudogymnoascus destructans: extinction de chauve souris par bat white nose syndrome
V/F: champignons sont les seules microbes connus d’avoir causer une extinction d’une espèce
V
