Cours 1 Flashcards
2 types de clonage
1) clonage cellulaire (a l’échelle cellulaire)
2) clonage reproductif (a l’échelle de l’organisme entier)
Clonage =
Technologie de l’ADN recombinant
(Isoler et amplifier à l’identique une séquence d’ADN d’intérêt)
ADN recombinant provient de:
Combinaison entre l’ADN d’un organisme donneur et celui d’un vecteur (peut être d’une espèce différente)
Applications de la technologie d’ADN recombinant
1) analyser l’ADN génomique , sequencage de l’ADN
2) analyser la structure et l’expression de l’ARNm
3) expression de protéines recombinantes (bactéries, système mammifère, modèle animal)
4) produire Ag pour générer de Ac
5) générer vaccins et med. recombinants
Étapes pour avoir un ADN recombinant ou produits du gène
1) isolement du gène d’intérêt (avec enzymes de restriction)
2) insertion du gène dans un vecteur avec un marqueur (pour repérer les cellules modifiées) et un promoteur (permet le gène de s’exprimer)
3) vecteur modifié est introduit dans un organisme (E. Coli ou autre)
4) bactérie mise en culture = réplication accélérée
5) extraction du plasmide modifié ou du gène d’intérêt cloné
5) utilisation du produit (protéine)
4 outils de clonage
1) vecteurs de clonage
2) cellules hôtes
3) enzymes pour manipuler l’ADN
4) techniques reliées au clonage et à l’analyse
Définition d’un vecteur
Séquence d’ADN permettant la propagation, la sélection, et la modification d’une séquence d’ADN d’intérêt
L’ADN dans lequel on insère le fragment d’ADN à étudier (adn exogène)
Généralement des plasmides ou bacteriophages
4 vecteurs
Choix en fonction de la taille du gène à cloner
1) plasmides (<10kb)
2) bacteriophages (25-100 kb)
3) cosmides (vecteur artificiel d’un plasmide hybride contenant la séquence cos du phage lambda) (45 kb)
4) autres: BAC-bacterial, YAC-yeast, HAC-human
(X artificial chromosome)
Contenu du vecteur
1) marqueur de sélection
2) origine de réplication
3) site de clonage (polylinker)
Les éléments non essentiels sont remplacés par l’ADN d’intérêt/etranger
Définition cellule hôte
Cellule hébergeant un matériel génétique étranger apporté par un virus, plasmide, ADN recombiné in vitro, ou une cellule entière
Exemple de cellules hôte
1) bactéries - taux d’expression élevé , sécrètent mal les protéines (éclatement des bactéries) , pas de modif. post-traductionelles
2) levures - modif. Post- traductionelles, difficile sécrétion de protéine
3) cellules de mammifères - cher, rendement faible, protéines complexes faisables
4) cellules d’insectes
Enzymes pour copier adn/arn
ADN/ARN polymerase (5’->3’)
Enzymes pour Couper ADN/ARN
Exonuclease (5’->3’) (3’-5’)
Endonuclease
Topoisomerase
Recombinase
Enzymes pour coller ADN/ARN
ADN/ARN ligase
Topoisomerase
Recombinase
Enzymes pour modifier adn
Phosphatase (dephosphoryle)
Phosphokinase (phosphoryle)
Terminal transferase