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DIVERSITÉ MICROBIENNE (3984) > COURS 07 > Flashcards

COURS 07 Flashcards

Archées

1
Q

Ou se trouvent les Archées?

A

Partout.
–> Mais on estime que la majorité se trouve dans les couches profondes de la Terre.

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Q

Quelles sont les Archées prédominantes?

A
  • Les extrêmophiles
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3
Q

Décrivez les extrêmophiles.

A
  • Adaptées à vivre dans des milieux extrêmes.
  • Repoussent les limites de la définition d’un milieu propice à la vie sur Terre et dans l’Univers.
  • Peuvent être poly-extrêmophiles.
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4
Q

Dans quels milieux peuvent vivre les thermophiles et les barophiles?

A
  • Milieux très chauds et forte pression.
    –> Lokiarchaeota
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Q

Dans quelles conditions peuvent vivre les thermophiles et acidophiles?

A
  • Milieux très chauds et acides.
    —> Sulfolobales ,Acidilobales et Thermoproteales.
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6
Q

Décrivez les Thermoproteales.

A
  • Acide toléré par des transports actifs de protons hors de la cellule
  • Membrane et protéines adaptées aux hautes pressions
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7
Q

Dans quels milieux peuvent vivre les halophiles?

A

Dans les milieux très salés
–> Haloarchaea

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8
Q

Décrivez les Haloarchaea

A

-Maintien de la pression osmotique : forte concentration cellulaire interne en ions K+
- Adaptation des biomolécules à une forte concentration interne en sels
- Si on les passe dans l’eau, elles lysent

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9
Q

Dans quels types de milieux peuvent vivre les psychrophiles?

A

Dans les milieux très froids.
–> Halorubrum lacusprofundii et Methanococcoides burtonii.

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10
Q

Décrivez les mésophiles.

A
  • Température entre 20-45 degrés
  • Abondants dans les milieux mésophiles (océans, sols)
  • Dominants dans certains sols.
  • Rôle important dans les cycles géochimiques.
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11
Q

Les archées ont des caractéristiques et des gènes homologues aux…

A
  • Bactéries
  • Eucaryotes
  • Uniques aux archées.
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12
Q

Quelles sont les caractéristiques/gènes homologues des archées avec les bactéries?

A
  • Organisation cellulaire
  • Métabolisme.
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13
Q

Quelles sont les caractéristiques/gènes homologues des archées avec les eucaryotes?

A
  • Machineries de réplication, transcription et traduction
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14
Q

Donnez les caractéristiques uniques aux archées.

A
  • Lipides, enveloppe
  • Grand nombre d’ORFs annotées avec une fonction hypothétique ou sans homologue dans les autres domaines
  • Des homologues avec des fonctions différenes.
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15
Q

Décrivez la membrane des Archées.

A
  • Une seule membrane
  • Constituée de phospholipides spécifiques aux Archées
  • Formation de monocouche lipidique avec liaisons tétra-éther.
  • Peut y avoir une alternance de lipides bicouches et monocouches tetra-éther dans la membrane des archées
  • Modifie la fluidité et la perméabilité des membranes
  • Permet une adaptation aux environnements extrêmes et aux conditions de stress
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16
Q

Décrivez la constitution des phospholipides de la membrane des Archées.

A
  • Liaisons éthers
  • Branches et ramification de la chaine carbonée (archéols)
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17
Q

Décrivez l’enveloppe des archées.

A
  • Différente des bactéries : PAS de peptidoglycane
  • Constituée d’une couche de protéines Surface layer (S-layer)
  • S-layer est plus flexible que PG.
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18
Q

Quelles sont les caractéristiques de S-layer?

A
  • Assemblage en monocouche très organisée.
  • Taille variable, parfois constituée de 2 sous-unités avec des assemblages à géométrie variable.
19
Q

Nommez les autres types d’enveloppe possibles.

A
  • Bicouche de S-layer
  • Pseudomurein : structurellement semblable au PG constituée de L-amino acid au lieu de D-amino acid et différentes liaisons.
  • Pas de S-layer et 2 membranes
  • S-layer + couche protéique
20
Q

Qu’est-ce que les Crenarcheaota?

A
  • Mécanisme de division cellulaire.
  • Protéines homologues au système d’endosorting des eucaryotes.
21
Q

Qu’est-ce que les Euryarchaeota?

A
  • Protéines homologyes au divisome des bactéries
  • 2 FtsZ avec des rôles différents.
  • Protéine SepF pour ancrer Ftsz2 à la membrane
  • Divisome des bactéries : + de 20 protéines , seulement 3 homologues pour les archées.
22
Q

Décrivez Methanobrevibacter smithii.

A
  • 1 seule FtsZ
  • MreB
  • Enveloppe = pseudomurein
  • La + ‘‘bacteria-like’’
23
Q

Décrivez Asgrad Archaea.

A

Grand nombre de protéines signatures des eucaryotes incluant :
- Homologues du système d’endosorting ESCRT-II et homologues aux actines

24
Q

Nommez les différents types de modes de vie.

A
  • Planctonique/motile
  • Biofilm
  • Symbiotique
25
Q

Décrivez le mode de vie planctonique.

A
  • Motile ou non
  • Pour certaines espèces la motilié est associée à une phase de croissance et à une forme cellulaire.
  • Mécanismes de chemotaxis pour recherche de nutriments.
  • Appendice = archaellum
26
Q

Décrivez le biofilm comme mode de vie.

A
  • Encore peu étudié
  • Plusieurs structures cellulaires semblent être impliquées dans l’adhésion et l’attachement sur les surfaces : pilus, archaellum, fimbriae, hami
27
Q

Décrivez le mode de vie symbiotique.

A
  • Certains DPANN Archaea requièrent une cellule archaeae hôte pour se développer et acquérir des nucléotides, lipides, acides aminés, co-facteurs.
  • Interaction symbiotique
  • Interaction parasite
28
Q

Décrivez les interactions symbiotiques.

A
  • Contact entre les 2 espèces Nanoarchaeum equitans avec Ignicoccus hospitalus
29
Q

Décrivez l’interaction parasite.

A
  • Internalisation de C. nsnohaloarchaeum antarctisu dans son hôte H. laccusprofondii qui mène à sa lyse cellulaire
30
Q

Quels sont les types de virus présents chez les Archées?

A
  • Virus à ADN
31
Q

Décrivez le concept d’une seule santé.

A
  • Approche unifiée de la santé humaine, animale et environnementale.
  • Vision systémique de la santé de la planète.
  • Interdépendance des écosystèmes
32
Q

Quels sont les rôles des microbiomes dans la santé des écosystèmes?

A
  • Chaine alimentaire
  • Cycles géochimiques
  • Passage de barrière d’hôte pour les agents infectieux
  • Propagation des gènes de résistance aux antibiotiques.
33
Q

Qu’est-ce qu’un agent méthanogène?

A
  • Produisent du méthane à partir du CO2 et de l’hydrogène
34
Q

Dans quels types de microbiomes peuvent être présentes les Archées?

A
  • Tube digestif
  • Cavité nasale
  • Poumons et voies respiratoires
  • Peau
35
Q

Qu’est-ce que les méthanogènes?

A
  • Espèces principales d’Archées dans le tube digestif et cavité nasale.
36
Q

Quelles sont les espèces principales d’Archées sur la peau?

A
  • Thaumarchaeota
37
Q

Est-ce qu’il y a des archées pathogènes?

A

Non. Mais :
- elles peuvent induire une réponse immunitaire
- des variations de leur ratio ont été associées avec certaines pathologies.

38
Q

Vrai ou faux?
On observe une augmentation ou diminution de certaines espèces d’Archées dans un certain nombre de maladie sou pathologies.

A

Vrai

39
Q

Décrivez les applications en biologie médicale des Archées.

A
  • Extremozymes : enzymes actives dans des conditions extrêmes.
  • PCR
  • Taq polymérase
  • Enzymes de restriction
40
Q

Décrivez les applications en santé humaine et animale des Archées.

A
  • Liposomes
  • Archaeosomes
41
Q

Qu’est-ce que les liposomes?

A
  • Vésicules formées à partir de lipides
  • Encapsulation de molécule d’intérêt
  • Vecteur d’administration de mx et autres
42
Q

Décrivez les archaeosomes.

A
  • Liposomes formés à partir de lipides d’archées
  • Plus stables que les liposomes
  • Plus résistantes à la température et au pH
  • Induit une réponse immunitaire chez les cellules de mammifères
  • Internalisation par les phagocytes supérieurs aux liposomes
43
Q

Quelles sont les archées qui peuvent être une source de nouveaux antibiotiques?

A
  • Archaeocines : molécules anti-archées
  • Haloarchaea : halocines. Spectre étroit
  • Sulfolobales : sulfolobicines (spectre étroit)
  • Peptide antimicrobien : isolé de S.islandicus avec activité contre Gram+, Gram -, anti-fongique et anti-protozoaire
44
Q

Quelles sont les applications environnementales (bioremédiation)?

A

Comme MO producteurs d’enzymes :
- Capables de vivre dans milieux extrêmes
- Versatilité de métabolisme
- Résistant aux atb
- Dégradation de pesticides
- Production de cellulases
- Production de biosurfactants

DIVERSITÉ MICROBIENNE (3984) (9 decks)

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