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DIVERSITÉ MICROBIENNE (3984) > COURS 02 > Flashcards

COURS 02 Flashcards

1
Q

Quel ‘‘type’’ de Carbone utilisent les autotrophes?

A

Carbone inorganique

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Q

Quel ‘‘type’’ de Carbone utilisent les hétérotrophes?

A

Le carbone réduit fourni par les autres organismes.

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3
Q

Décrivez les effets du changement climatique sur les microbes.

A
  • Complexes et difficiles de prédire
  • Plus de CO2 atmosphérique augmente la biomasse des plantes et la fixation du C dans le sol.
  • Long terme : appauvrissement du sol.
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4
Q

Qu’est-ce que l’eutrophisation?

A

Processus naturel qui se déroule sur une très longue période de temps.
- Explique comment un lac se transforme progressivement en marais puis en tourbière ou en prairie.
–> Diminution de la biodiversité.

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5
Q

Nommez les ‘‘groupes’’ de protéobactéries telluriques.

A
  • Alphaproteobacteria
  • Betaproteobacteria
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6
Q

Décrivez les Alphaproteobacteria.

A
  • Bactéries Gram NÉGATIF
  • Plusieurs sont symbiotiques de plantes et d’animaux, peu de pathogènes
  • Majoritaires dans le sol
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7
Q

Donnez des exemples d’alphaproteobacteria majoritaires dans le sol.

A
  • Bradyrhizobium sp : fixatrices d’azotes symbiotiques
  • Rhodoplanes sp : phototrophes
  • Sphingomonas sp : dépourvues de LPS
  • Devosia sp : certaines espèces son des fixatrices d’azote symbiotiques
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8
Q

Décrivez les betaproteobacteria.

A
  • Bactéries Gram NÉGATIF
  • Beaucoup de symbiotiques de plantes, pathogènes
  • Majoritaires dans le sol
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9
Q

Donnez des exemples de betaproteobacteria majoritaires dans le sol.

A
  • Methylibium sp
  • Ramlibacter sp
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10
Q

Décrivez les actinobactéries telluriques.

A
  • Bactéries Gram POSITIF
  • GC% élevé
  • Produisent un mycélium et certaines se reproduisent par sporulation
  • 40% des bactéries cultivables du sol
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11
Q

Donnez des exemples de de bactéries telluriques

A
  • Streptomyces sp : sécrète de nombreux composés volatils (GEOSMINS)
  • Mycobacterium sp
  • Salinibacterium sp
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12
Q

Décrivez les actinobactéries telluriques.

A
  • Bactéries Gram NÉGATIF
  • Beaucoup sont acidophiles
  • Très peu sont cultivables
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13
Q

Donnez des exemples d’actinobactéries telluriques.

A
  • Candidatus Solibacter sp
  • Ordre des iii1-15
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14
Q

Quel facteur influence significativement la diversité microbienne ?

A

Le pH.

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15
Q

Qu’est-ce que les nodules?

A
  • Petites boursouflures se formant sur les racines de nombreuses espèces de plantes, sous l’action de bactéries de l’ordre des Rhizobiales.
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16
Q

Qu’est-ce qu’une relation symbiotique entre les organismes nodulaires?

A

La plante fournit les substances carbonnées et les bactéries les substances azotées.

17
Q

Comment se forment les nodules?

A

1) Racines de plantes émettent des flavonoïdes qui se lient aux récepteurs dans la membrane du plasma
2) En réponse aux flavonoïdes, le rhizobia sécrète le facteur Nod qui se lie au récepteur dans les membranes de l’hôte (racines)
3) La liaison avec le récepteur cause une entrée de Ca2+ dans les racines de plantes. Les racines vont donc s’enrouler autour du rhizobia.
4) Rhizobia injecte des protéines d’infection ce qui cause une infection chez la racine de plante.
5) Les nodules (protéines) causent la division des cellules des racines ce qui forment les nodules.
6) Les nodules deviennent rose à l’intérieur : production d’hémoglobuline
7) Les nodules développent du tissu vasculaire qui transporte le nitrogen

18
Q

Décrivez les microorganismes phytostimulateurs libres.

A
  • Communauté microbienne du sol (microbiote du sol)
  • Microbiote racinaire
19
Q

Donnez des exemples de micro-organismes phytostimulateurs libres.

A
  • Azotobacter
  • Azospirillum
  • Pseudomonas
  • Bacillus
  • Paenibacillus
20
Q

Donnez les différentes étapes du mécanisme de phytostimulation.

A

1) Amélioration de la nutrition azotée : diazotrophie
2) Amélioration de la nutrition en P
3) Amélioration de la nutrition en Fe
4) Effets positifs sur la croissance racinaire
5) Émission de composé.s organiques volatils bactériens

21
Q

Décrivez la diazotrophie.

A
  • Aucune spécificité taxonomique
  • Implique la production d’une nitrogénase codée par le gène nifH
22
Q

Décrivez l’amélioration de la nutrition en Phosphate.

A
  • Les végétaux n’absorbent que le phosphate organique
  • Des bactéries peuvent solubiliser le P minéral
  • Les bactéries utilisent également le P organique : sécrétion d’enzymes (phosphatases et phosphonatases)
23
Q

Décrivez l’amélioration de la nutrition en Fe.

A
  • Le Fer est indispensable pour la synthèse de chlorohylle et la photosynthèse, la fixation d’azote, la respiration et les activités enzymatiques
  • FeIII : forme hyper prépondérante dans le sol mais insoluble
24
Q

Quel est le genre bactérien très fréquent en lien avec le fer?

A

Pseudomonas

25
Q

Quels sont les effets positifs sur la croissance racinaire?

A
  • Atténuation de la voie hormonale éthylène : réduction des effets du stress et levée de l’inhibition de la croissance racinaire
  • Excrétion de phytohormones (auxines, cytokines)
26
Q

Décrivez les bactéries dépolluantes.

A
  • Dégradent les polluants grâce à leurs enzymes, les réduisant en molécules moins nocives
  • Utilisation dans les biofiltres pour assainir les eaux contaminées et l’air pollué.
27
Q

Donnez des exemples de bactéries dépolluantes

A
  • Nitrates : Comamonas, Hyphomicrobium
  • Phosphates : Acinetobacter, Moraxella
  • Hydrocarbures lourds : Bacillus, Pseudomonas, Xanthomonas
  • Hydrocarbures légers : Acinetobacter, Flavobacterium, Bacillus, Pseudomonas, Achromobacter, Arthrobacter
  • Métaux lourds : Chlorella, Rhizopus, Saccharomyces, Thiobacillus, Zoogloea
28
Q

Décrivez le transfert du substrat à la cellule dans la biodégradation des hydrocarbures.

A
  • Production de surfactant : utilisation par les bactéries hydrocarbonoclastes comme source de C
29
Q

Qu’est-ce que la phytoremédiation?

A

Technique qui repose sur l’aptitude de certaines plantes :
à absorber des polluants et les transformer en composés moins toxiques
- à les accumuler en vue de leur extraction
- à les immobiliser lorsque les racine sont associées à des additifs capables de fixer ou d’absorber les métaux lourds

30
Q

Nommez différents moyens de lutte contre les pathogènes des plantes.

A
  • Bactéricides et fongicides
  • Contrôle microbien
31
Q

Quel est le rôle des bactéricides et fongicides dans les moyens de lutte contre les pathogènes des plantes?

A
  • Antibiotiques : dissémination dans l’environnement, résistance aux antibiotiques
  • Bactéricides et fongicides chimiques : dissémination dans l’environnement, pollution des sols
32
Q

Décrivez Trichoderma et son rôle dans la lutte contre les pathogènes.

A
  • C’est un champignon ubiquitaire du sol
  • Forme des colonies incolores
  • Bio-fongicide
  • Croissance rapide en culture
  • Produit un atb : GLIOTOXINE
33
Q
A

DIVERSITÉ MICROBIENNE (3984) (6 decks)

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