College 6 inleiding virologie en replicatiestrategie van virussen en antivirale therapie Flashcards
Waar kijkt de ICTV-classificatie naar?
- soort genetisch materiaal (RNA of DNA)
- vorm van de capside (icosahedral of helix)
- enveloped of naked
Welke twee opties van de capsid zijn mogelijk bij de ICTV-classificatie bij RNA-virussen? En bij DNA virussen?
- icosahedral (voetbal)
- helix
DNA:
- icosahedral (voetbal)
- helix
- Complex (baksteen)
Is een envoloped of naked virus moeilijker te inactiveren? Waarom is dit?
Naked zijn lastiger
- envelop is menselijk plasmamembraan en bestaat dus uit vetten
- Dit is makkelijk kapot te maken met zeep of alcohol
- naked: eiwitten rond virus wat lastiger te inactiveren is
Welke virussen zijn over het algemeen het lastigst en welke het makkelijkst de inactiveren?
Lastigst: naked DNA-virussen
Makkelijkst: enveloped RNA-virussen
Wat is een capsid?
eiwit om genetisch materiaal van een virus
Wat is een belangrijk onderdeel van RNA-virussen? Wat hebben DNA-virussen met betrekking hiertot?
Bevatten genen voor hun eigen RNA-polymerase
Mensen hebben enkel DNA-polymerase
DNA-virussen hebben vaak wel genen voor eigen DNA-polymerase, maar sommige gebruiken het menselijke
Welke RNA-virussen MOETEN hun eigen viron RNA-polymerase sowieso bevatten?
Negative sense: moeten namelijk eerst omgezet worden naar positive sense
Positive sense: minder belangrijk dat het echt aanwezig is omdat geen omzetting meer nodig is
Hoe zorgt het Corona virus voor replicatie?
Komt binnen met mRNA –> host maakt hierdoor eiwitten –> onder andere polymerases
Wat is vaker een eigenschap van DNA-virussen?
Co-evalueren met ons mee en zijn latent in ons lichaam aanwezig
Welke classificatie deelt virussen in obv genetisch materiaal?
Baltimore classificatie
Gaat over hoe virussen mRNA maken
In welke vormen komt het genetisch materiaal voor in DNA-virussen?
Veel verschillende
- ds
- ss
- circulair
- gesegmenteerd
Waarom gaat groep IV van de Baltimore classificatie van + sense naar - sense en daarna weer naar + sense voor het mRNA?
Omdat hij een template wil maken zodat heel veel kopieen gemaakt kunnen worden
Hoe werkt het HIV virus met betrekking tot het genetisch materiaal?
- Binnen als ss RNA +
- Maakt dmv viraal reversed transcriptase ss DNA
- Maakt hieruit dd DNA (DNA intermediate)
- virale integrase integreert dit vervolgens in het genoom van de host
- humane cellulaire polymerase maakt hiervan mRNA en RNA +
- mRNA codeert voor eiwitten
RNA+ vormt weer het genoom van het nieuwe viruspartikel dat de cel kan verlaten om nieuwe cellen te infecteren
Hoe kan het dat HIV niet per se altijd zichtbaar is?
Er zijn cellen in de host die ALTIJD het pro-virus bij zich dragen –> dit kan in een slapende cel zijn en na jaren kan het dus opeens weer actief worden
Uit welke drie onderdelen bestaat een nucleotide?
- base
- suikerring: DNA heeft 1 OH-groep, RNA heeft 2 OH-groepen
- 3 fosfaatgroepen als INACTIEF –> ACTIEF dan 1 fosfaatgroep
Wat is kenmerkend voor de fosfaat groepen van een nucleotide en wat moet hiermee gebeuren voordat een nucleotide ingebouwd kan worden?
zijn er negatief geladen –> worden pas IN cel aan de nucleotide gemaakt omdat MET de fosfaatgroepen de nucleotide NIET de cel in zou kunnen komen (alleen apolaire stoffen door membraan)
Bij binding van nucleotide aan andere nucleotide (moet aan OH van vorige nucleotide) moeten twee fosfaatgroepen afsplitsen om de energie te leveren
Wat is een belangrijk medicijn tegen virussen en waarop is dit gebaseerd?
Nucleoside analogen
- Verwijdering van een OH-groep en vervangen door NH3-groep
- Verder vrijwel identiek
- deze worden ingebouwd –> stoppen met replicatie want OH groep is hiervoor nodig
Wat moet er met de nucleoside analogen gebeuren voordat ze werkzaam zijn?
Eerst gefosforyleerd worden in de cel tot trifosfaat