Chapitre 5 - Nucléotides

Question 1

Différence entre nucléoside et nucléotide

Answer 1

• Nucléoside = le pentose et la base azotée (purine ou pyrimidine)
• Nucléotide = nucléoside avec 1, 2 ou 3 phosphates

Question 2

Comment se nomment le premier, deuxième et troisième phosphates accrochés à un nucléoside?

Answer 2

1 = Alpha
2 = Beta
3 = Gamma
1 est collé au nucléoside et 3 est le plus éloigné

Question 3

Quelles sont les sortes de purines (R)?

Answer 3

• Guanine (G)
• Adénine (A)

Question 4

Quelles sont les sortes de pyrimidines (Y)?

Answer 4

• Cytosine (C)
• Thymine (T)
• Uracile (U)

Question 5

Entre T et U, lequel est dans l’ARN et lequel est dans l’ADN?

Answer 5

T = ADN
U = ARN

Question 6

De quel sens se fait la polymérisation de l’ADN

Answer 6

5’ à 3’

Question 7

Quelle sorte de ponts (et combien) se forment entre les pyrimidines et les purines de l’ADN?

Answer 7

Des ponts hydrogènes.
- A et T (ou U) en font 2
- G et C en font 3

Question 8

Décrire la structure de l’ADN

Answer 8

• 2 brins
• Chaque brin complémentaire à son voisin
• Les 2 brins sont antiparallèles
• Les 2 brins forment une hélice de pas droit

Question 9

Comment mesurer l’ADN en longueur?

Answer 9

On calcule ne nombre de paires de bases (pb) ou le millier de paires de bases (kb).
Le génome humain fait à peu près 3x10*9 pb

Question 10

Comment calculer la masse de l’ADN?

Answer 10

On compte, par pb, 660g/mol (en moyenne)

Question 11

Comment mesurer la concentration d’ADN en solution?

Answer 11

L’ADN absorbe les rayons UV.
Une densité optique = 1 correspond à 50ng/microlitre d’ADN double brin.
Si la densité optique = 1,5 la concentration sera de 75ng/microlitre

Question 12

Quelle sorte de lien est plus faible que l’autre dans l’ADN?

Answer 12

Les liens A-T car ont juste 2 ponts H

Question 13

Comment faire pour dénaturer l’ADN?

Answer 13

On sépare les 2 brins en brisant les ponts H en chauffant, par exemple.

Question 14

Comment faire pour renaturer de l’ADN dénaturé?

Answer 14

Quand on le refroidit.
Il peut soit;
- S’annéliser s’il rejoint son partenaire ou
- S’hybrider s’il rejoint un autre brin de séquence convenable

Question 15

Qu’est-ce que le Tm?

Answer 15

Température à laquelle 50% d’un bout d’ADN est séparé (dénaturé)

Question 16

Quelle substance est essentielle à la réaction de synthèse du dTMP à partir du dUMP et qu’est-ce que cette situation implique?

Answer 16

Acide folique
C’est de l’uridine (U) qui synthétise de la thymine (T)

Question 17

Quelle lettre correspond à la position ambigüe entre A ou G

Answer 17

R (purines)

Question 18

Quelle lettre correspond à la position ambigüe entre C ou T

Answer 18

Y (pyrimidines)

Question 19

Quelle lettre correspond à la position ambigüe entre A ou C

Answer 19

M (mac)

Question 20

Quelle lettre correspond à la position ambigüe entre A ou T

Answer 20

W (weak car 2 ponts H)

Question 21

Quelle lettre correspond à la position ambigüe entre C ou G

Answer 21

S (strong car 3 ponts H)

Question 22

Quelle lettre correspond à la position ambigüe entre G ou T

Answer 22

K (KGT)

Question 23

Quelle lettre correspond à la position ambigüe entre C, G ou T

Answer 23

B (non A)

Question 24

Quelle lettre correspond à la position ambigüe entre A, G ou T

Answer 24

D (non C)

Question 25

Quelle lettre correspond à la position ambigüe entre A, C ou T

Answer 25

H (non G)

Question 26

Quelle lettre correspond à la position ambigüe entre A, C ou G

Answer 26

V (non T et on skip U car existe déjà)

Question 27

Quelle lettre correspond à la position ambigüe entre A, C, G ou T

Answer 27

N (nucléotide, n’importe quoi…)

Question 28

Différence entre synthèse naturelle et artificielle de l’ADN

Answer 28

• Naturelle = Enzymes polymérisent les désoxyribonucléotides en utilisant un brin d’ADN pré-existant comme modèle
• Artificielle = Désoxyribonucléotides sont polymérisés par une série de réactions chimiques répétées encore et encore. L’ADNp synthétise un bout d’ADN en ligant des nucléotides en direction 5’ - 3’ en utilisant un brin complémentaire comme modèle (besoin d’une amorce au bout 5’). Sujette aux erreurs (système de relecture)

Question 29

Grands types d’ARN et leur fonction

Answer 29

• ARNm (messager) = Message codé pour la structure primaire des protéines
• ARNt (transfert) = Transporteur d’acides aminés vers le ribosome, où les polypeptides sont synthétisés
• ARNr (ribosomique) = Infrastructure du ribosome, en coopération avec plus de 80 protéines.

Question 30

Méthode utilisée pour la synthèse chimique de l’ADN

Answer 30

Méthode des phosphoramidites;
- Technique automatisée
- Peu dispendieux
- Ne fait qu’un brin à la fois
- Il y a des phosphoramidites pour chaque nucléotide

Question 31

Que sont les endonucléases et leurs particularités?

Answer 31

Enzymes qui coupent l’ADN.
- Reconnaissent et coupent une séquence précise
- Laissent un bout 3’-OH et un bout 5’-PO4
- Peuvent couper dans la séquence de reconnaissance ou en dehors
- Coupures presque toujours symétriques

Question 32

Que sont les ligases?

Answer 32

Enzymes qui recollent l’ADN coupé
- Besoin d’une extrémité 3’-OH et 5’-PO4
- Plusieurs sites de restriction existent

Question 33

Combien de paires de bases environ compte un tour d’ADN

Answer 33

10

Question 34

Que fait la puromycine?

Answer 34

• Transfère chaîne sur acide aminé pas rapport
• Empêche la synthèse des protéines
• Agit comme antibiotique (inhibe la traduction de l’ARNm)

Question 35

Sur quels carbones sont accrochés ensemble le pentose et la base azotée d’un nucléoside de purine?

Answer 35

1’ du pentose et 9’ de la purine

Question 36

Sur quels carbones sont accrochés ensemble le pentose et la base azotée d’un nucléoside de pyrimidines?

Answer 36

1’ du pentose et 1’ de la pyrimidine