Chapitre 5 - Les compartiments et le trafic vésiculaire- 5.1 et 5.2 Flashcards
Les protéines peuvent/doivent entrer et sortir de certains compartiments de la cellule. Quels sont ceux que, quand les protéines les traversent, elles ne doivent traverser qu’une membrane?
RER, peroxysome
Les protéines peuvent/doivent entrer et sortir de certains compartiments de la cellule. Quels sont ceux que, quand les protéines les traversent, elles doivent traverser 2 membranes?
mitochondrie, chloroplaste
Qu’est-ce que le principe de la continuité?
quand des protéines peuvent potentiellement se promener librement (sans nécessiter de l’énergie) entre 2 compartiments cellulaires différents, on dit alors que ces 2 compartiments sont en continuité
Quelles sont les 3 choses nécessaires pour « ranger » les protéines dans une cellule?
- énergie (transport actif)
- étiquette (pour savoir où aller)
- destination (récepteur de l’étiquette)
Qu’est-ce qui fait office d’étiquette sur une protéine (pour savoir elle doit aller où)?
peptide signal (dans la séquence primaire) et parfois des sucres
Certains organites des cellules euca ont 2 membranes. Qu’est-ce que ça empêche de faire dans la cellule?
ça empêche le trafic vésiculaire
Une cellule végétale découle d’une symbiose entre 3 types d’organismes. Lesquels?
hétérotrophes anaérobiques, hétérotrophes aérobiques et autotrophes anaérobiques
Comment les organismes hétérotrophes anaérobiques produisent de l’énergie? Qu’est-ce qu’ils utilisent pour produire leur énergie?
avec la fermentation et la glycolyse, en mangeant des bactéries plus petites
Comment les organismes hétérotrophes aérobiques produisent de l’énergie? Qu’est-ce qu’ils utilisent pour produire leur énergie?
par la respiration, ils mangent du carbone organique provenant des déchets de d’autres organismes
Comment les organismes autotrophes anaérobiques produisent de l’énergie? L’énergie qu’ils produisent est sous quelle forme?
par la photosynthèse, ils produisent de l’énergie sous forme de sucre et d’O2
Une mitochondrie découle d’une symbiose entre 2 types d’organismes. Lesquels?
hétérotrophes anaérobiques et hétérotrophes aérobiques
Quel est le rôle de la fermentation?
Quand il y a beaucoup de pyruvate, la première étape de la glycolyse est inhibée, donc la fermentation embarque pour écouler le pyruvate et ainsi faire repartir la glycolyse. La fermentation ne produit pas d’ATP, mais la glycolyse oui, donc il faut tout faire pour que la glycolyse ne s’arrête pas
V ou F. L’extrémité N-terminale d’une protéine est son « début », et l’extrémité C-terminale est sa « fin ».
V
Dans la cellule (tous les organites), quel est le seul pore assez grand pour laisser passer une protéine sans qu’elle n’ait besoin de se dérouler?
pore nucléaire (la grosseur max est la grosse sous-unité ribosomale)
V ou F. Les chloroplastes et les mitochondries ont des pores assez grands pour laisser passer des feuillets β.
F. Leurs pores peuvent laisser passer au maximum des hélices α
Pour qu’une protéine se trouvant dans le cytoplasme se rende dans la lumière d’une mitochondrie, de quoi a-t-elle besoin? Sous quelle forme peut-elle passer?
elle a besoin :
- d’une étiquette sur elle-même
- d’un récepteur sur la membrane externe de la mitochondrie
- d’énergie
- de 2 canaux de translocation (car 2 membranes)
→ elle passe sous forme de structure primaire
Quel est l’un des signaux (étiquette) pour une protéine qui doit aller dans une mitochondrie? Comment le récepteur de ce signal reconnaît le signal?
Une hélice α amphiphile N-terminale, ayant un côté hydrophobe et un côté chargé +. Le récepteur (membranaire) du signal possède un sillon hydrophobe qui reconnaît la partie hydrophobe du signal
Que signifie TOM? Qu’est-ce que c’est?
Transport Outer Membrane. C’est un complexe sur la membrane externe de la mitochondrie qui possède le récepteur du signal (signal se trouve sur la protéine) et qui fait passer la protéine à travers la membrane externe (du cytoplasme vers l’espace intermembranaire).
Quelles sont les 2 fonctions principales de TOM? Comment appelle-t-on les 2 structures nécessaires à chaque fonction?
- reconnaître le peptide signal (récepteur)
- faire passer la protéine à travers la membrane (translocateur)
V ou F. Le peptide signal est chargé positivement.
V
D’où provient l’énergie nécessaire pour que la protéine traverse la membrane externe de la mitochondrie?
des chaperonnes (hsp70 cytosoliques), qui s’occupaient de garder la protéine sous une forme linéaire dans le cytosol, hydrolysent l’ATP une fois que le signal de la protéine est attaché au récepteur de TOM
Que signifie TIM? Qu’est-ce que c’est?
Transport Inner Membrane. C’est un complexe sur la membrane interne de la mitochondrie qui permet de faire passer la protéine de l’espace intermembranaire jusque dans la lumière de la mitochondrie
V ou F. L’espace intermembranaire de la mitochondrie est chargé négativement.
F. Il est chargé positivement
Qu’est-ce qui « motive » la protéine à passer à travers la membrane interne de la mitochondrie?
C’est le potentiel membranaire :
Une fois que le peptide signal est passé à travers TOM, TOM passe le signal au TIM et ce transfert utilise le potentiel membranaire (le peptide signal et l’espace intermembranaire sont chargés positivement, donc la charge positive de l’espace repousse le signal (le motive) à passer à travers TIM pour aller dans un endroit plus négatif, soit le côté matriciel de la membrane interne de la mitochondrie
Qu’est-ce qui aide la protéine à traverser au complet la membrane interne de la mitochondrie pour aller dans la matrice?
les chaperonnes hsp70 mitochondriales hydrolysent l’ATP pour « tirer » la protéine dans la matrice
Quel type d’enzyme s’occupe de faire la maturation des protéines une fois qu’elles ont incorporé la mitochondrie? Que font ces enzymes aux protéines?
peptidases, elles coupent des morceaux de protéines
Quelle est la première étape de la maturation des protéines une fois qu’elles ont incorporé la mitochondrie?
couper les signaux d’adresse pour éviter un retour en arrière
Qu’est-ce qui aide les protéines à garder une forme linéaire pour passer à travers les translocateurs pour traverser la membrane?
- souvent les protéines ont des petites séquences d’acides aminés (hélice-α amphiphile) dans leur séquence primaire
- si la protéine n’a pas d’hélice-α amphiphile, les chaperonnes hsp70 les aident à garder une forme linéaire
V ou F. L’incorporation des protéines dans les chloroplastes utilise un principe complètement différent que celui utilisé pour incorporer les protéines dans les mitochondries. Expliquer.
F. Les principes sont les mêmes, mais les protéines sont différentes. Il faut par contre des signaux supplémentaires pour que la protéine ait accès au 3e compartiment (thylakoïde) dans le chloroplaste
Quel est le principe général de la centrifugation par gradient de densité?
C’est une sédimentation en accéléré : un tube contient un gradient de sucre ou de sel avec un échantillon et, en le faisant tourner, les particules plus denses de l’échantillon descendent vers le bas jusqu’à l’endroit où leur densité équivaut à celle du sucre/sel
Une cellule qui contient beaucoup de réticulum endoplasmique et de golgi est sûrement quel type de cellule?
cellule sécrétrice
Quel est le rôle principal du REL?
synthèse des lipides (membranes)
Quel est le rôle principal du RER?
synthèse protéique destinée en grande partie à la sécrétion
Quel est le seul type de lipide membranaire que le REL ne produit pas?
chloestérol
Quelle est l’enzyme du REL qui synthétise les phospholipides?
acyl transférase
Comment sont synthétisées les nouvelles membranes dans le REL?
L’enzyme acyl transférase produit les phospholipides, puis les ajoute seulement dans le feuillet externe, car le site actif de l’acyl transférase se trouve du côté cytoplasmique. Ensuite, les enzymes scramblases (un type de flippase) égalisent les 2 couches membranaires
V ou F. Tous les types de lipides membranaires sont produits avec la même enzyme. Expliquer.
F. Le REL héberge d’autres enzymes membranaires pour faire tous les lipides membranaires différents
