chap 4 part 2 - réparation de l'ADN Flashcards
solution cassure ADN bicaténaire : recombinaison homologue (HR) (6)
- recombinases permettent invasion de brin
- prérequis = coupure brin en escalier
- utilisation chrtide soeur OU homologies trouvées ailleurs si réplication déjà faite
- ~recombinaison génétique de méiose
- coupure franche -> embarque autre enz pr travailler escalier -> 1 brin qui dépasse ou en escalier
- Cf diapo 2
causes cassure ADN bicaténaire (2)
- rayons ionisants
- ROS
solution cassure ADN bicaténaire : ligature diecte avec voie NHEJ (8)
- protection rapide
- voie NHEJ = Non Homologue End Joining
- prot Ku nécessaire dès cassure -> exonucléases déjà présentes
- info perdue en attendant arrivée de Ku70-80 (prot, protection bouts cassés)
- DNA-PKcs (prot kinase) -> stabilisation + rapprochement + recrutement enz + activation enz réparation
- ligase IV -> attachement
- artemis -> endonucléase produit 1 cassure franche pr attachement par ligase
- Cf diapo 2
cassure la + dommageable de ADN bicaténaire (3)
- cassure la + dommageable = cassure db
- recrutement rapide nécessaire
- vitesse det QT info perdue
cassure ADN bicaténaire et gènes suppresseurs tumeurs : BRCA1 et BRCA2 (4)
- BRCA1 et BRCA2 découvert ds cancer sein humain -> présents ds tous cancers
- aug° vitesse réparation
- blocage devt cancer dès départ
- mutations ds ces 2 gènes -> aug° 50-80% risques devt camcer sein + aug° 30-50% cancer ovaires
cassure ADN bicaténaire et gènes suppresseurs tumeurs : rôles à travers signalisation celR (4)
- interaction avec autres suppresseurs tumeurs
- recrutement prot de réparation
- régulation transcription différents gènes
- régulation cycle celR
réparation cassure ADN db avec chrtide soeur (2)
- réparation à 100% = nécessité HR avec chrtide soeur
- possible en phase S (chrtine répliquée) et G (2 chrtides soeurs présentes)
réparation cassure ADN db sans chrtide soeur (7)
- utilisation SSA = répétitions
- SSA = Single-Strand Annealing
- utilisation Alt-NHEJ = microhomologies trouvées ds même chr (celui cassé)
- séQ répétées de chQ coté de cassure, complémentaires et hybridation (e)
- perte info des bouts qui dépassent
- SSA ou Alt-NHEJ -> - perte info que NHEJ car perte - rapide, - prot, complémentarité fait liaison tt seul, ligase et liaison phosphodiesters de chQ coté
- si 2 brins pas cassés mais altérés -> aussi utilisation voies HR, SSA et Alt-NHEJ
utilisation de HR pour incorporation de ADN étranger (4)
- cell pense que ADN extra est le sien et essaye de le rattacher au chr par les hm (homologies)
- séQ extra -> remplacer (perte région target et flip des hm) OU s’intégrer (cassure db nécessaire + hm de chQ coté brin)
- seulement 1 brin réussi transfert -> correction mésappariements par enz de réparation
- Cf diapo 5
mécanisme de HR (5)
- recombinases RecA (proca) -> ATP pr lier db -> recherche 1 hm sur db -> catalysation échange de brin
- 1) besoin coupure en escalier pr prendre partie sb
- 2) pl. RecA lient ADN sb sur charpente -> exposition BA pr recherche homologie
- 3) qd homologie trouvée -> catalysation transfert brin par RecA (invasion)
- invasion ADN sb par RecA -> recherche homologie par alignement db et sb / séparation db par hélicase pr trouver compatibilité
cassure ADN db : recombinaison V(D)J et NHEJ (8)
- utilisation cassures db intentionnelles par système immunitaire -> gérération grande variété Ac
- LB -> prod° Ac / diff° celR implique ré-orga gènes nécessaires pr faire Ac
- 1 Ac = 2 chaines lourdes (1V + 1J nécessaires) + 2 chaines légères (1V + 1D + 1J nécessaires)
- région constante reconnue par autres cells immuno
- 2 régions variables -> reconnaissance Ag
- régions variables ont domaines V, D et J
- chQ domaine -> pl. variants génétiques
- sélection variant au hasard -> domaines gardés découpés (cassures db) et collés (e) (NHEJ)
cassure ADN db : utilité des Ac (3)
- reconnaissance directe région constante microbe
- Ac = prot avc structure IV car 4 chaines (2 lourdes + 2 légères)
- recombinaison V(D)J touche tous nivx : niv 1 -> choix variant affecte chaine AA correspondante / niv 2 -> chQ variant a pas même nb feuillets + hélices / niv 3 -> formes différentes possibles à cause de structure des hélices et feuillets / niv 4 -> forme finale pr attraper Ag
quels systèmes de réparation mutagènes et pourquoi (4)
- NHEJ -> mutagène car coupure morceaux
- Alt-NHEJ + SSA -> répétitions morceaux compatibles / mutagène car perte petits bouts
- réparation translésionnelle -> mutagène car plupart ADNpol-trans mets nimporte quoi devant mutations donc autres mutations engendrées
- HR -> mutagène qd pas fait avec chrtide soeur
réarrangement ADN suite au déplacement d’1 segment (3)
- orga complexe = + transposons présents
- répétitions séQ simples et duplications segmentaires -> télomères et microsatellites (STR)
- ADN non-répétitif pas dans introns ou codons -> promoteurs et séQ régulatrices expression génique / origines réplication / centromères / séQ pr positionnement nucléosomes / sites attachement facteurs transcription / gènes pr ARN (ARNr et ARNt ont tous pl. gènes)
transposons des orgas complexes (6)
- génomes orgas complexes -> BCP transposons
- bouge des segments entiers -> perte Ou gain substantiel / mutations parfois bénéfiques
- aug° + persistance transposons ds génome -> sélection favorable par évolution
- drosophila = petite mouche, eucaryote multicelR
- saccharomyces = procaryote unicelR
- eshcerichia = procaryote unicelR