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BIO1101 - bio moléculaire > chap 1 - structure de l'ADN > Flashcards

chap 1 - structure de l'ADN Flashcards

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1
Q

unité de construction de l’ADN

A

nucléotide

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Q

composition atome

A

protons + neutrons + électrons

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Q

atomes + utilisés pour construction molécules du vivant (6)

A

C, O, H, S, P, N

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4
Q

def électronégativité d’un atome

A

force avec laquelle atome tient ses e- ensemble et attire les autres alentours / capacité attraction des e-

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Q

2 facteurs influant électronégativité

A
  • nb protons
  • distance (+ couches = + e- loin)
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6
Q

composante de l’atome qui participe dans formation liens chimiques

A

e- de valence (sur dernière couche de atome)

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7
Q

formation lien entre 2 atomes libres -> nécessite ou dégage NRJ ?

A

formation lien dégage NRJ VS brisure lien nécessite NRJ

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8
Q

liens chQ utilisés dans molécules du vivant (5)

A
  • liaisons covalentes polaires (- stables)
  • liaisons covalentes non-polaires (+ stables)
  • liaisons ioniques
  • liaisons H
  • interaction hydrophobe
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9
Q

lieu des liens covalents non-polaires

A

dans la molécule

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10
Q

lieu interactions hydrophobes

A

interaction hydrophobe entre molécules

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11
Q

lieu des liens covalents polaires + charges pleines

A

dans la molécule -> permettent liaisons H et ioniques

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12
Q

macromolécules (2)

A
  • forme 3D -> fonction
  • complémentarité (interaction) entre macromol. par liens non covalents
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13
Q

structure de ADN (5)

A
  • ADN + stable car double brin
  • ARN -> pas stable par nécessité
  • si ADN - stable -> - liens
  • si ARN + stable -> + atomes = + liens
  • attention atomes ajoutés -> ajout - groupements fonctionnels car portent charges + lourds
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14
Q

compo nucléotide

A

1 groupe phosphate + 1 sucre pentose + 1 BA

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14
Q

pyrimidine (3)

A
  • 1 cycle formé de 2C + 2N
  • mémo : forme soleil/cercle
  • pour C, U, T
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15
Q

purine (3)

A
  • 2 cycles formés de 5C + 4N
  • pour G et A
  • mémo : 4 “pattes” + “purr” = chat
16
Q

lien stabilité ADN VS ARN (4)

A
  • ARN = OH
  • ADN = H
  • détachement des P car + stables qd détachés
  • qd détachement = founit NRJ VS qd attachement = nécessite NRJ
  • nucléotides avec 3 P -> NRJ -> détachement P -> dégagement NRJ et balance positive
17
Q

nucléotide = sucre + BA + grpe phosphate
liens assos de ces 3 éléments ? (4)

A
  • lien phosphoester entre grpe phosphate et sucre (5’ utilisé pour groupement phosphate)
  • lien glycosidique entre BA et sucre
  • réaction condensation -> lib° 1 mol. H2O
  • réaction inverse de condensation = hydrolysation (ajout 1 mol. H2O)
18
Q

fonctions nucléotide (4)

A
  • molécule de base de ADN
  • source NRJ chQ -> liaison entre grouprments phosphate facilement hydrolysable
  • asso avc différents groupements chQ -> formation coenzymes
  • mol. signalisation intracelR / 2nd messager
19
Q

lien ester

A

à travers un -O-

20
Q

lien diester

A

à travers un -O- de chaque coté

21
Q

liaison phosphodiester

A

phosphore entre 2 O

22
Q

polymétysation (3)

A
  • nécessité enzyme polymérase + dNTP
  • dNTP = désoxyribonucléotides triphosphate, pas info sur BA
  • TJS du 5’ vers 3’
23
Q

caractéristiques ADN (4)

A
  • ADN bicaténaire = 2 chaines complémentaires, antiparallèles et hélicoïdales
  • appariements AT et CG dictés par position groupements fonctionnels de chaque BA
  • H doit être en ligne droite entre 2 atomes électronégatifs
  • appariement purine-pyrimidine -> nb idéal groupements phosphate pour ADN
24
Q

pourquoi mvmt rotation de ADN (3)

A
  • minimisation accès d’eau aux appariements -> pas hydrolysation + dérangement liens dejà en place (eau polaire + fait liens H -> déplacement liens H de ADN)
  • donne + d’espace aux atomes -> présence angle permet mvmt rotation
  • liens impliqués dans formation nucléotide -> oblique + dispo antiparallèle favorise rotation
25
Q

structures primaire, secondaire, tertiaire et quaternaire de ADN (5)

A
  • structure primaire -> ordre des nucléotides, écrit séquence du 5’ vers 3’
  • règle (G+C)% : % G+C sur total bases d’1 génome dépend de espèce / impt car + % élevé = ADN + stable et résistant
  • structure secondaire -> double hélice avec liaisons hydrogène / complémentarité BA essentielle à réplication
  • structure tertaire -> forme chr / linéaire chez eucaryotes et circulaire chez procaryotes
  • structure quaternaire -> asso avec prot de structure / histones chez eucaryotes
26
Q

interactions avec protéines : sillons (2)

A
  • sillon majeur -> accès facile aux grpes fonctionnels des BA
  • alternance entre sillons majeurs et mineurs car ADN tourne
27
Q

interation ADN-prot (6)

A
  • séquence spQ grâce aux grpements différents ds sillons majeurs
  • groupement accepteur lien H (charge patielle - )
  • groupement donneur lien H (charge partielle + )
  • groupement non polaire
  • groupement méthyl (non polaire)
  • différence entre CG-GC; TA-AT par sillons majeurs -> au niv des points d’ancrage pour matcher prot
28
Q

def dénaturation

A

perte structure quaternaire, tertiaire ou secondaire présente ds forme “native” de molécule (structure primaire doit être conservée sinon prot détruite)

29
Q

influence T° / temps dénaturation

A

pas identique pour tous les ADN car dépend de taille de molécule

30
Q

principe hybridation

A

entre 2 brins initiaux OU entre 1 brin de départ et 1 brin ajouté

31
Q

principe de la “sonde” (3)

A
  • détection présence d’une séquence/gène spQ ds 1 échantillon
  • marquage des sondes pour reconnaissance -> radioactivité / fluorescence / anticorps
  • dénaturation sondes marquées puis hybridation avec échantillon ADN
32
Q

spécificité de l’hybride (3)

A
  • spécificité = degré complémentarité entre 2 mol. dépend de complémentarité de formes + nb liens chQ formés
  • spécificité hydride déterminé par T° hybridation -> + T° élevée, + hybride spQ car il faut faire tous liens H pr rester -> chaleur déplace liens H
  • T° impte pr maintien dénaturation et hybridation
33
Q

techniques hybridation sur mbrane : électrophorèse sur gel (5)

A
  • visualisation + séparation par taille fragments ADN (ou ARN ou prot)
  • courant électrique -> migration -> tamis moléculaire
  • déplacement ADN du pôle (-) vers (+) avc courant car ADN a charge + à cause de groupement phosphate
  • influence taille fragment et vitesse -> + morceau petit = + arrivera rapidement à fin
  • ségrégation fragments selon taille
34
Q

analyse : southern (ADN) et northern (ARN) (5)

A
  • migration par capillarité
  • hybridation de la sonde liés avec complémentarité : gene -> 5’-CCCG-3’ / sonde -> 3’-GGGC-5’
  • chaque bande = 1 fragment où échantillon trouvé
  • southern -> observation potentiel génétique
  • northern -> observation utilsation concrète des gènes
35
Q

northern avec radioactivité (3)

A
  • sonde marquée à radioactivité visible = bandes noires -> émission radioactivité par sonde
  • QT gènes utilisés variable selon tissus -> spQ !
  • impce épaisseur bande -> montre impce affinité avec tissus visé (+ bande épaisse = + ARN utilisé)

BIO1101 - bio moléculaire (10 decks)

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