Cellebiologi Flashcards
Gi to eksempler på kovalente bindinger som inngår i primær- sekundær- tertiær- og kvaternærstruktur
- Peptidbinding mellom aminosyrene i peptidkjeden
- Disulfidbinding mellom cysteiner. Kovalente bindinger mellom to polypeptidkjeder
Hvilken type binding holder aminosyrene sammen i polypeptidkjedenes primærstruktur, og hva er spesielt med denne bindingen?
Bindingstype: Peptidbindingen er en kovalent binding mellom to aminosyrer (den dannes når karboksylgruppen (en del av en aminosyre) kobles sammen med en aminogruppe fra en annen aminosyre og vann frigjøres)
Spesielt med binding: Delvis dobbeltbindingskarakter. Gjør at peptidbindingen blir sterkere (hindrer rotasjon langs bindingen)
Hvilke bindingstyper er viktige for proteinfolding?
- Ionebindinger
- Hydrofobe krefter
- Hydrogen bindinger
- Van der Waalske krefter
- Kovalente bindinger (disulfidbinding)
Hva slags aminosyresidekjeder finner man flest av sentralt i tertiærstrukturen i globulære proteiner?
Aminosyrer med hydrofobe sidekjeder (vannavstøtende sidekjeder); slik at de vil bli holdt vekk fra det vandige miljøet på utsiden av proteinet (hjelper til med foldingen)
Hvordan vil Vmax og Km være ved bruk av en kompetetiv hemmer?
- Vmax vil forbli uendret (krysningen på y- aksen vil være på samme sted med og uten hemmer)
- Km vil bli større (dette vil gjøre at linjen går lengre mot høyre - nærmere origo for enzymet med hemmer)
Benevning for Vmax
μM/ min (maksimal reaksjonshastighet)
Hvordan finner man ut affiniteten mellom enzym og substrat?
Regner ut Km
Hvordan finner man Vmax ved Lineweaver-Burk plot?
Der linja krysser y- aksen er Vmax, så benytter man formelen 1/Vmax og regner ut verdien)
Hvordan vil Vmax og Km være ved bruk av en non- competetiv hemmer?
- Vmax blir mindre
- Km forblir uendret
Hvordan finner man Km ved Lineweaver-Burk plot?
Der linja krysser x- aksen (deretter benytter man formelen -(1/Km) og regner ut verdien)
Hva er benevningen til Km?
μM (substratkonsentrasjon ved 1/2 Vmax)
Dersom Km er lik for begge linjene og Vmax blir mindre med hemmer enn uten (er ulik med og uten hemmer), hva slags type hemmer er til stede?
Ikke-kompetitiv hemmer
Hva kalles setet en kompetetiv hemmer binder til?
Aktive setet
Hva kalles setet en ikke- kompetetiv hemmer binder til?
Allosterisk
Dersom Km er ulik (blir større for den med hemmer enn uten) for begge linjene og Vmax er lik, hva slags type hemmer er til stede?
Kompetetiv inhibitor/ hemmer
Hva menes med turnover- tall?
«Turnover-tallet» er det maksimale antall substratmolekyler som kan omdannes til produktmolekyl med 1 molekyl enzym i en gitt tidsperiode (minutter eller sekunder). “Turnover- tall” er en indikasjon på hvor effektivt et enzym er i stand til å katalysere en reaksjon. Jo høyere “turnover-tallet” betyr at enzymet er i stand til å omdanne flere substratmolekyler til produkt per tidsenhet
Hva kalles to forskjellige enzymer som katalyserer den samme reaksjonen?
Isoenzymer
Blir etanol oksidert eller redusert i denne reaksjonen?
Etanol + NAD+ –> Acetaldehyd + NADH + H+
- Etanol blir oksidert
- NAD+ blir redusert
Dersom det er to ulike enzymer med samme enzymmengde, hvor den ene har høyere Vmax enn den andre. Hvilke av enzymene vil ha høyest “turnover- tall”? Den med laves eller høyest og hvorfor?
Den med høyest Vmax dersom det er benyttet samme mengde enzym vil ha et høyere “turnovertall”. Det er altså en indikasjon på hvor effektivt et enzym er i å katalysere en reaksjon. Et høyere turnovertall betyr at enzymet er i stand til å omdanne flere substratmolekyler til produkt per tidsenhet
Definer begrepene reduksjon og oksidasjon, reduksjonsmiddel og oksidasjonsmiddel
- Reduksjon: En reaksjon når et atom blir redusert i form av at det mottar elektroner.
- Oksidasjon: En reaksjon som skjer når et stoff gir fra seg elektroner.
- Reduksjonsmiddel: Det molekylet som reduserer et annet stoff (stoffet som gir fra seg e-)
- Oksidasjonsmiddel: Det molekylet som tar til seg e- for å oksidere et annet stoff som selv blir redusert
Hvorfor sammenstiller vi reduksjon og oksidasjon til ett ord – redoks(reaksjon)?
Dette gjøres da det alltid er et atom som blir oksidert og et som blir redusert. Elektroner forsvinner ikke bare: dersom det skjer en reduksjon, at et stoff blir redusert, er det et annet stoff som blir oksidert. Giver og mottaker utgjør et redokspar
Hvor i periodesystemet finner du grunnstoffer som er sterke oksidasjonsmidler? Begrunn svaret
Oksidasjonsmidler: Det er de stoffene som tar til seg elektroner og oksiderer andre stoffer. Derfor er disse plassert øverst til høyre i det periodiske system. Disse har mange elektroner i det ytterste skallet og tar derfor gjerne imot elektroner fra de edle metallene helt til venstre i periodesystemet for å få fylt opp sitt ytterste skall (oktettregelen). To ting som bestemmer: Mengden protoner i kjernen og avstand til ytre skall. Jo lenger til høyre man kommer langs perioden (horisontalt) jo flere protoner, jo lenger nedover man kommer langs gruppene jo mer øker avstanden til ytre skall
Hva betyr det når en reaksjon har positiv ΔG?
- Reaksjonen går ikke spontant (krever energi)
- Endergonisk
- Reaksjonen går fra B –> A
- Energi tilføres
Hva betyr det når en reaksjon har negativ ΔG?
- Reaksjonen er spontan
- Eksergonisk (den vil skje - Exit)
- Reaksjonen går fra A –> B
- Energi frigjøres