Cancer genetics

Question 1

Beskriv hvordan akkumuleringen af mutationer er vigtig i dannelsen af cancer og hvilken konsekvens det har

Answer 1

Når en cancer opstår er det grundet en mutation, også kaldet driver-mutation, som giver den pågældende celle en lille vækst fordel, denne celle cloner sig selv, hvor nogle af cellerne overlever og andre dør. De celler der overlever får en ny mutation der gør at de har bedre forudsætninger for at dele sig, disse får en ny mutation og sådan fortsætter det, som resulterer i ukontrolleret vækst.

Question 2

Hvilke funktioner har proto-onkogener?

Answer 2

De promoverer cellevækst

Inhiberer apoptose

Question 3

Hvad er onkogener?

Answer 3

Proto-onkogener der har fået en mutation, således at de øger celle væksten og inhiberer apoptosen.

Question 4

Hvilke typer mutationer kan ske i et proto-onkogen?

Answer 4

Punkt-mutation i kodende og regulatoriske regioner
Tranlokation
Gen amplifikation

Question 5

Hvilket funktionelt produkt får man ved en punktmutation i den kodende region af onkogener?

Answer 5

Et abnormal protein

Question 6

Hvilket funktionelt produkt får man ved en punktmutation i den regulatoriske region af onkogener?

Answer 6

Overproduktion af proteiner

Question 7

Hvilket funktionelt produkt får man ved en tranlokation af et gen i den kodende region af onkogener?

Answer 7

En ny type protein

Question 8

Hvilket funktionelt produkt får man ved en gen amplifikation onkogener?

Answer 8

Overproduktion af proteiner

Question 9

Hvad slags aktivering er mutationer af onkogener på det cellulære niveau?

Answer 9

Dominant

Question 10

Er mutationer i proto-onkogener en LOF eller GOF mutation?

Answer 10

GOF.

Question 11

Nævn nogle typer tumor suppressor gener

Answer 11

Gatekeepers
Caretakers
Landscape genes

Question 12

Hvad er funktionen af gatekeppers generne?

Answer 12

Regulerer cell delingen ¨Promoverer apoptose

Question 13

Hvad er funktionen af caretaker generne?

Answer 13

Bevarer den genomiske integritet

Question 14

Hvad slags inaktivering er mutationer af tumor suppressor gener på det cellulære niveau?

Answer 14

Recessive

Question 15

Beskriv kort Knudson´s two-hit hypothesis

Answer 15

Den omhandler tumor suppressor gener og at begge alleler skal være inaktiveret for at en tumor kan dannes.

Question 16

Er mutationer i tumor suppressor gener en LOF eller GOF mutation?

Answer 16

LOF

Question 17

Hvordan kan alleler blive inaktiveret?

Answer 17

Loss of heterozygosity

Somatiske mutationer

Question 18

Beskriv loss of heterozygosity

Answer 18

Kan ske på kromosomalt niveau eller på cytogenetisk niveau. De handler kort om at alleler der før var heterozygote bliver homozygote

Question 19

På hvilke måder kan man miste heterozygosity på kromosomalt niveau?

Answer 19

Tab af et kromosom ved non-disjunction.
Replikation af tabt kromosom
Mitotiske recombination

Question 20

På hvilke måder kan man miste heterozygosity på cytogenetisk niveau?

Answer 20

Ved inaktiverende mutation

Epigenetisk forandringer der slukker for det normale gen.

Question 21

Hvad er driver mutation?

Answer 21

Mutationer der starter den øgede celle vækst i tumorer, de er nødvendige for at tumor dannelsen opstår.
Er non-synonomous mutationer.

Question 22

Hvad er passenger mutationer?

Answer 22

Er ledende mutationer, der kommer efter driver mutationer.

De kan både være non-synonomous eller synonomous.

Question 23

Når celler får disse driver mutationer begynder de at lave subkloner af sig selv, som de expanderer. Når næste driver mutation sker klones disse også. Hvorfor er det svært at behandle tumorer?

Answer 23

Fordi der er intratomural heterogenitet, alle celler har ikke samme mutations mønster, fordi der hele tiden sker mutationer.

Question 24

Efter flere mutationer og subkloner vil den første driver mutation da forsvinde i cellerne?

Answer 24

Nej, den vil altid være til stede. Det vil alle mutationerne.

Question 25

Hvad mener studier i forhold til den første driver mutation og deres evne til at blive detekteret som metastasis efter deres fjernelse?

Answer 25

At de tidligt er til stede i blodbanen og derved kan implementerer sig et andet sted.

Question 26

Hvorfor er det vigtigt at vide hvilke celler og mutationer metastaser oprinder fra?

Answer 26

Det er vigtigt i forhold til behandling af metastaserne.

Question 27

Hvorfor giver det mening at man har mange mutation i en cancer, når man har et defekt DNA reparations system?

Answer 27

Da non-synonyme mutation ikke bliver fikset og disse for lov at udbrede sig.

Question 28

Hvorfor giver det mening at man har mange mutation i en cancer, når man bliver udsat for mutagene substanser?

Answer 28

Fordi cellerne er i kontakt med mutagene substanser over længere tid som øger mutationsraten.

Question 29

Hvorfor giver det mening at man har lidt mutation i børnecancer typer?

Answer 29

Fordi canceren ikke kræver helt lige så mange mutationer for at udvikle sig.
Der er færre celledelinger og derved er der ikke sket så mange mutationer endnu.
De har ikke været udsat for så mange mutagene substanser der kan lede til mutationer eller skade på DNA

Question 30

Hvordan kan man ofte se at kræft skyldes arvelige faktorer?

Answer 30

Ved at personerne rammes i en ung alder.

Der er flere i hver generation som rammes

Question 31

Hvordan kan man se på et stamtræ at kræft skyldes nedarvning af mutationer tumor suppressor gener, også kaldet Li-Fraumeni syndrome?

Answer 31

Ved at personerne får kræft i en ung alder og at det er forskellige type kræft

Question 32

Hvordan opstår en sporadisk cancer?

Answer 32

Ved at der sket to somatiske mutationer i de to alleler.

Question 33

Hvad kendetegner ofte en sporadisk cancer på et normalt gen?

Answer 33

Enkelte tumorer
Unilateral
Personer rammes senere i livet

Question 34

Hvad er kendetegnet ved en monogenetisk cancer?

Answer 34

Mutiple tumorer
Bilateral
Personer rammes tidligt.

Question 35

Hvordan opstår en monogenetisk cancer?

Answer 35

Ved at gematen allerede nedarve en muterede allel som kun kræver en enkelt somatisk mutation for at opstå.

Question 36

Hvad er karakteristisk ved nedarverede cancer?

Answer 36

Man ser mange tilfælde i familier
Personer rammes tidligt
Bilateral og mange tumorer
Dominant nedarvet med inkomplet penetrance.
Kommer ved akkumuleringen af mutationer i mange gener.

Question 37

Kan man bruge polygenic risk score i cancer? Forklar gerne hvordan

Answer 37

Ja, også i cancer kan man være i høj- og lav risiko for at udvikle en cancer.

Question 38

Kig på session 10 slide 24 og beskriv de tendenslinjer man ser ift. risikoen for at udvikle brystkræft, hvis man har haft en mor eller søster der er diagnostiseret hhv. før alderen 45 og efter. Samt hvordan PRS har en påvirkning på tendenslinjernes forløb.

Answer 38

Hvis man har haft en mor eller søster som har fået brystkræft før alderes 45, kan man se at hvis ens PRS er på > 90% er en risiko noget højre, hvor risikoen falder i takt med lavere PRS.
Hvis man har haft en mor eller søster med brystkræft som er kommet efter alderen 45, så har man en øget risiko hvis man har en PRS > 90%, hvor hvis ens PRS er < 10% så er ens risiko faktisk lavere end for den man ser i populationer hvor der ikke er en historie med brystkræft i familien.