BM9 bis 2) 3 classes de transposons Flashcards
Quelles sont les 3 classes de transposons?
- Transposons à ADN
- Transposons à ARN
- Rétrotransposons non viraux
Donnez des exemples de transposons à ARN.
Rétrotransposons
Rétrovirus
Éléments LTR (Long terminal repeat)
Quels sont les 2 types de Transposons/Rétrotransposons?
Autonomes et Non-Autonomes
De quoi est constitué un transposon à ADN?
1 transposase
2 sites de recombinaison
De quoi est fait un site de recombinaison d’un transposon à ADN?
Séquences +/- répétées et inversés
Sites de liaison à la transposase
Quel type d’enzyme est la transposase?
une recombinase
Que font les autres gènes codant des transposons?
à la régulation de leur propre processus de transposition
Ou qui peuvent être utiles au génome hôte
Donnez un exemple de gènes de transposon utiles au génome hôte?
Transposons bactériens qui portent des gènes de résistance à des antibiotiques
De quoi sont formées les séquences flaquantes du transposon?
D’un même motif dupliqué de 2 à 20 pb
Quand les séquences flaquantes du transposon sont elles générées?
lors du processus de recombinaison
De quoi est constitué un transposon à ADN autonome?
1 transposase
2 séquences flanquantes inversées
De quoi est consitué un transposon non autonome?
Seulement 2 séquences flanquantes inversées
De quoi sont fait les transposons à ARN, éléments LTR et rétrovirus?
Sites de recombinaison idem aux transposons à ADN
Imbriqués dans les longues séquences répétées: LTRs
Quelles sont les 2 protéines indispensables à la mobilité des rétrotransposons?
Une intégrase (transposase)
une transcriptase inverse
Qu’est-ce qu’une transcriptase inverse?
ADN polymérase qui utilise l’ARN comme matrice pour synthétiser de l’ADN
Pourquoi al transcriptase inverse est-elle nécessaire?
Pour rétro-transcrire l’intermédiaire ARN en ADN double brin afin de pouvoir l’intégrer au génome de l’hôte
Quelle est la différence entre un rétrotransposon et un rétrovirus?
Le génome d’un rétrovirus est empaqueté dans une capsule virale qui peut sortir de sa cellule hôte pour en infecter une autre.
La séquence d’un rétrotransposon reste prisonnière de sa cellule hôte et ne peut se déplacer que vers de nouveaux sites à l’intérieur de cette même cellule.
Quelle est la particularité des rétrotransposons poly-A?
Pas de séquences terminales inversées et répétées.
Au contraire, les 2 extrémités de l’élément portent des séquences distinctes (5’UTR et 3’UTR (qui est suivi d’une séquence Poly-A))
Que sont les séquences flanquantes chez les rétrotransposons poly-A?
Des sites d’intégration dans l’ADN cible
Quelles sont les 2 protéines indispensables à la mobilité encodées par l’ARN des rétrotransposons Poly-A?
ORF-1 qui code pour une protéine de liaison à l’ARN
ORF-2 code pour protéine à double fonction: Transcriptase inverser et endonucléase