BM7 1) erreurs de réplications Flashcards
Quelle est l’erreur de réplication la plus commune?
La substitution
Quelles sont les 4 substituions possibles
Transitions: Purine -> Purine et Pyrimidine -> Pyrimidine
Transversions: Purine -> Pyrimidine et Pyrimidine -> Purine
Quel type de substition est 2X plus fréquente que l’autre?
Transition
Comment appelle-t-on une mutation qui affecte un seul nucléotide?
une mutation ponctuelle
Qu’est-ce qui cause une délétion ou une insertion?
Le décalage du cadre de lecture
Qu’est-ce qu’une délétion ou insertion cause?
Des variants protéiques fonctionnels ou non
Entre les microsatellites et les séquences codantes, lesquels on un taux de mutation plus grand?
Microsatellites
Pourquoi les séquences codantes ont-elles un taux de mutation plus faible?
Ce n’est pas parce que les mutations arrivent moins souvent mais c’est qu’elles sont plus souvent corrigées
Pourquoi les taux de mutation varient?
- Car les gènes n’évoluent pas à la même vitesse
- Car les différents types de mutations ne se produisent pas à la même vitesse
- Car les différentes parties d’un même gène n’évoluent pas à la même vitesse
- Car les contraintes sélectives peuvent varier dans le temps
Pourquoi différentes parties d’un même gène n’évolutent pas à la même vitesse?
- Leurs contraintes sélectives sont plus ou moins fortes
- Il sont plus ou moins faciles à répliquer fidèlement
Comment appelle-t-on les séquences répétées?
Des points chauds de mutation
D’un facteur de combien le domaine 3’ exonucléase de l’ADN polymerase diminue le taux d’erreur?
De 100
Qu’arrive-t-il si l’erreur d’incorporation n’est pas corrigée avant le prochain cycle cellulaire?
Le changement induit sera permanent
À quelle condition le changement induit par une erreur d’incorporation qui n’est pas corrigé n’est pas permanent?
Si le changement est délétère
Qu’arrive-t-il au nucléotide mésapparié lors du cycle cellulaire suivant?
Il devient matrice
Qu’arrive-t-il lorsque le nucléotide mésapparié est devenu matrice?
- Il dirige l’incorporation de son nucléotide complémentaire
- Ce n’est plus un mésappariement mais bien une mutation
De combien le taux d’erreur est diminué grâce au système de réparation des mésappariements?
D’un facteur de 100 à 1000
Quels sont les deux défis du système de réparation des mésappariements?
- Il doit trouver et réparer les erreurs avant la prochaine replication
- Corriger le nucléotide du brin nouvellement synthétisé et non celui de la matrice
Quel est le système de réparation des mésappariements chez E.coli?
MutS
Que comprend MutS?
- 1 Dimère qui reconnait les distorsions du squelette sucre-phosphate
- 2 liaisons à 1 ATP
Par quoi sont causées les distorsions du squelette sucre-phosphate?
Par les bases mésappariées
Que permettent les liaisons ATP de Muts?
Changer de conformation et
Induire un changement de conformation local au double brin d’ADN
Pourquoi MutS peut courber l’ADN localement?
Car quand il y a un mésappariement, la conformation spatiale de la double hélice est plus flexible
Que permet l’hydrolyse d’une ATP chez MutS?
Le recrutement de MutL
Qu’est-ce que MutL?
une 2e composante du système de réparation
Qu’active MutL?
MutH
Qu’est-ce que MutH?
Une Enzyme qui incise le brin contenant le mauvais nucléotide
Qu’arrive-t-il après la césure par MutH?
Une hélicase spécifique (UvrD) est activée
Que fait UvrD?
Elle sépare les 2 brins du site incisé vers le mésappariement (MutS
Qu’arrive-t-il après la separation des 2 brins par UvrD?
Une exonucléase 5’ vers 3’ digère progressivement le simple brin au delà du mésappariement
Que permet l’hydrolyse de la 2e ATP?
Elle permet probablement à MutS de se décrocher du site de mésappariement
Qu’arrive-t-il après que MutS se soit décroché?
L’ADN pol III remplace le brin complémentaire
Qu’arrive-t-il après que l’ADN pol III ait remplacé le brin complémentaire?
L’ADN ligase accroche l’extrémité 3’-OH au reste de la molécule d’ADN en synthétisant un pont phosphodiester
Comment MutS reconnaît le nucléotide mésapparié?
Le double brin est hémiméthylé juste après la réplication. Le brin non méthylé est le nouveau brin.
MutH inactivée vient se lier aux sites hémiméthylés sur les séquences non méthylés jusqu’à ce qu’elle soit recrutée par MutS et MutL
Qu’advient-il au brin hémiméthylé quelques minutes après la réplication?
La méthylase Dam va marquer les résidus d’adénine de la sequence 5’-GATC-3’ sur le brin néosynthétisé
Où se fait l’incision par MutH?
Sur la séquence 5’-GATC-3’ non methylene la plus proche du site de mésappariement
Qu’arrive-t-il si l’incision est en 5’ du mésappariement?
L’ADN est retiré par l’exonucléas VII 5’ vers 3’
Qu’arrive-t-il si l’incision est en 3’ du mésappariement?
L’ADN est retiré par l’exonucléase I 3’ vers 5’
Quel est l’équivalent de MutS chez les eucaryotes?
MSH
Quel est l’équivalent de MutL chez les eucaryotes?
MLH
Quel est l’équivalent de MutH chez les eucaryotes?
PMS
Est-ce que les eucaryotes ont un système de reconnaissance du brin nouvellement synthétisé par Hémiméthylation comme chez E. coli?
non
Quelle est le système de reconnaissance du brin nouvellement synthétisé chez les eucaryotes?
Le pont phosphodiester manquant entre chaque fragment d’Okazaki sert de marquage du brin nouvellement synthétisé
Avec quoi MSH intéragit pour être recruit sur le site de synthèse du brin tardif?
la pince coulissante du réplisome
Qu’est-ce qui pourrait permettre le recrutement de proteins de reparations de mésappariement sur l’extrémité 3’-OH du brin précoce en cours de synthèse?
Encore L’interaction MSH-pince coulissante
Quelle est la particularité de MSH chez les eucaryotes?
Il y a plusieurs combinaisons de proteins selon le type d’erreur avec toute fois de la redondance
