BM11 4) élongation et maturation de l'ARN Flashcards
Que recrute l’ARN polymérase II après sa dissociation avec le promoteur?
2 facteurs d’élongation (TFIIS et hSPT5)
des facteurs de maturation (FSC et FSCP)
Où sont recrutés les 2 facteurs d’élongation (TFIIS et hSPT5)
des facteurs de maturation (FSC et FSCP)?
sur la queue carboxy-terminale phosphorylée de l’ARN pol II
Comment l’ARN pol II est lors de son recrutement au promoteur?
Hypophosphorylée
Comment est l’ARN pol II lors de l’élongation?
Hyperphosphorylée
Que favorise les différents états de phosphorylation de la QCT de la pol II?
la substitution de facteurs d’initiation par ceux de l’élongation puis par ceux de la maturation
Combien mesure la QCT
800 A soit 7x la taille de l’ARN pol II
Où se situe la QCT?
à proximité du canal de sortie de l’ARN nouvellement synthétisé
Les facteurs d’élongation et de maturation liés à QCT sont en relation directe avec quoi?
avec l’ARN nouvellement synthétisé
Que recrutent les activateurs transcriptionnels?
la kinase P-TEFb sur l’ARN pol II
Que fait la Kinase P-TEFb?
Phosphoryle les sérines 2 de la QCT ce qui active l’élongation
QU’est-ce que le coeur fonctionnel de P-TEFb?
une kinase cycline-dépendante associée à une sous-unité régulatrice cycline T
comment se fait l’activation de l’élongation par phosphorylation des sérines 2 de la QCT de l’ARN Pol II?
les signaux d’activation du complexe P-TEFB provoquent le largage des dimères de CDK9/cycline T, ce qui permet à P-TEFb de phosphoryler les serines 2 de la CTD
Comment est l’activation de l’élongation par phosphorilation des sérines 2 ET 5 de la QCT de l’ARN pol II?
Spécifique du promoteur car est induite par des activateurs transcriptionnels qui n’intéragissent qu’avec le promoteur
Que nécessite l’activation de la phase d’élongation de la transcription?
la phosphorylation par P-TEFb des facteurs inhibiteurs de l’élongation (DSIF et NELF)
À quelle vitesse se fait la transcription?
40 nucléotides/seconde
QU’active la kinase P-TEFb?
2 facteurs d’élongation:
hSPT5 et TAT-SF1
Que font les protéines ELL?
activent la pol II sinon Pol II reste en veille
TFIIF joue-t-elle un rôle dans l’Élongation?
oui (sinon cette question n’existerait pas)
Que fait TFIIS dans la stimulation et la correction de l’élongation?
- Empêche la mise en veille de l’ARN pol II (qui est séquence dépendante)
- Corrige les erreurs: stimule l’activité RNase de Pol II qui est indépendante du site actif
autour de quoi est enroulé le substrat de l’ARN polymérase?
autour d’octamères d’histones
Quest-ce que le facteur FACT?
un hétérodimère (Spt16 et SSRP1) qui facilite la transcription de la chromatine en dissociant et réassemblant les nucléosomes
Avec quoi se lie Spt16?
au dimère H2A-H2B
Avec quoi se lie SSRP1?
au tétramère H3-H4
Que fait le facteur FACT?
REtire un dimère H2a-H2b en amont de l’ARN polymérase II et le rajoute après son passage
Pourquoi SPT6 se lie à l’histone h3?
pour aider le réassemblage du nucléosome
Que permet l’action locale de FACT?
D’Éviter de décompacter une grande région d’ADN
EN quoi les phases d’élongation, de terminaison et de maturation sont interconnectées?
Certains facteurs sont impliqués dans plusieurs de ces phases
QUe fait hSPT5 dans l’élongation?
Recrute l’enzyme de coiffage en 5’ sur la QCT de l’ARN pol II
QUe fait TAT-SF1 dans l’élongation?
Recrute les composants de la machinerie d’épissage alternatif sur l’ARN pol II en phosphorylant les sérines 2 de la QCT
Que permet l’ajout d’une guanine méthylée en 5’ de l’ARN?
- Une liaison 5’-5’ grâce à 3 phosphates
- protège l’ARN des 5’-ribonucléases
Quelles sont les étapes de l’ajout d’une guanine méthylée en 5’ de l’ARN?
- Retrait du phosphate gamma en 5’ de l’ARN
- la guanylyltransférase liée à la GTP-alpha-bêta-gamma lui retire son pyrophosphate pour générer une GMP alpha
- La GMP alpha est alors transférée au phosphate bêta du 1er nucléotide en 5’ de l’ARN
- La guanine nouvellement ajoutée reçoit un groupe méthyle en C7
Quand se fait le retrait du phosphate 5’ de l’ARN?
Dès la sortie de l’ARN de Pol II, marquant la fin de l’initiation et le début de l’élongation
Que fait la coiffe 5’ résultant de l’Ajout d’une guanine méthylée?
elle recrutera le ribosome sur l’ARN messager pour commencer la traduction
De quoi serait responsable la déphosphorylation des sérines 5 sur la QCT?
de la dissociation de la machinerie de coiffage
Quel est le dernier stade de maturation de l’ARN?
LA polyadénylation de la queue 3’
à quoi est intimement lié la polyadénylation de la queue 3’?
à la terminaison de la transcription AKA le clivage de l’ARN
Suite à la polyadénylation de la queue 3’, la QCT de l’ARN pol est appelée à recruter quoi?
FSCP (Facteur spécifique de clivage et de polyadénylation)
FSC (facteur de stimulation de clivage)
Que font FSCP et FSC après la transcription de la séquence de signal de polyadénylation?
Elles s’y lient et recrutent d’autres protéines qui provoquent le clivage de l’ARN puis FSC est relâchée
Qu’arrive-t-il après le clivage du trascrit?
la poly-a polymérase (PAP) est recrutée en 3’ pour ajouter 200 adénines
Comment la PAP ajoute des adénines (ATP)?
Comme ARN pol II mais sans utiliser de matrice
Quel est le précurseur utilisé par PAP?
Mg-ATP