Bioquímica - Tradução Flashcards
Quais as etapas da tradução?
Ativação do aminoácido com o RNAt;
Iniciação, elongação e terminação
Quais os principais eventos das fases da tradução?
Antes do processo de iniciação, ocorre a ativação do aminoácido pelo RNAt, por meio do ATP, o qual facilita as ligações, formando o aminoacil-tRNA;
Iniciação: Capeamento e adição de cauda poli-A (Integridade da proteína); Subunidade menor reconhece a sequência inicial e se liga ao RNAm; Acoplamento da subunidade maior;
Elongação: Leitura do RNAm -> Polipetídeo nascente e elongado pela ligação peptídica de novos aminoácidos
Terminação: Reconhecimento e leitura da sequência final (stop códon); Desligamento do polipetídeo
Em que consiste a tradução?
A tradução envolve “decodificar” um RNA mensageiro (RNAm) e usar sua informação para produzir um polipeptídeo ou cadeia de aminoácidos.
Qual a diferença entre proteína e polipeptídeo?
Polipeptídeo é uma proteína com a diferença técnica que algumas proteínas grandes são formadas por muitas cadeias de polipeptídeos.
Quais são os principais códons de parada ou stop códons?
UAA, UAG e UGA
Qual o principal start códon?
AUG (Metionina)
Onde ocorre a tradução?
No citoplasma da célula
Como o RNAm é transportado do núcleo para o citoplasma?
Através do complexo do poro nuclear (NPC), de forma que o RNAm recebe um marcador (fator de exportação nuclear), o qual permite a entrada do RNAm no canal central de transporte do NPC. Contudo, ao adentrar o citoplasma, perde esse marcador, uma vez que caso permanecesse, o RNA poderia retornar ao núcleo, e as proteínas que ele codifica não seriam feitas.
As moléculas de RNAt atuam como adaptadoras no processo de síntese de proteínas, uma vez que elas definem
a posição dos aminoácidos de acordo com a sequência de bases do RNAm. Essa característica dos RNAt se deve a que?
Ao fato deles terem duas regiões de ligação em sua molécula, uma onde se liga covalentemente um aminoácido específico e outra, o anticódon, o qual se liga ao códon do RNAm, por meio de pontes de hidrogênio.
Como ocorre a ligação de um RNAt com seu aminoácido específico?
Ocorre a clivagem da ligação altamente energética do ATP, liberando pirofosfato. Essa reação fornece energia para a ativação do aminoácido, formando aminoacil-adenilato. O aminoácido ativado reage com o RNAt, liberando uma molécula de AMP.
Qual enzima auxilia na ligação do RNAt e do aminoácido?
Sintetase do aminoacil-RNAt
Explique a teoria do emparelhamento incerto ou oscilação (ou wobble).
Consiste na ideia de que o emparelhamento da primeira base do anticódon não seria espacialmente tão restrito como para as outras duas, de modo que a primeira base de um anticódon poderia fazer pontes de hidrogênio com mais de um tipo de base na terceira posição do códon.
Porque o emparelhamento incerto ocorreria/ocorre?
Ocorre porque a conformação da alça do anticódon do RNAt permite esta flexibilidade na primeira base do anticódon. Modificações das bases vizinhas do anticódon também influenciam no emparelhamento da primeira base.
Quais os sítios do ribossomo e suas respectivas funções?
O sítio P, ou sítio de ligação do peptidil-RNAt: Onde ocorre a associação de RNAt à extremidade carboxílica
do polipeptídeo em crescimento. O sítio A, ou sítio de entrada do aminoacil-RNAt: associa o RNAt
recém-chegado ao ribossomo e que traz o aminoácido a ser incorporado na cadeia polipeptídica em crescimento.
O sítio E (do inglês exit), ou sítio de saída: é ocupado transitoriamente pelo RNAt livre de aminoácido que acabou
de sair do sítio P e que está, portanto, deixando o ribossomo
Qual o nome sa estrutura formada por uma molécula de RNA mensageiro associada a vários ribossomos?
Polissomo
Em bactérias, os polissomos contêm, em geral,
dezenas de ribossomos e podem ser encontrados
associados ao DNA. Porque isso ocorre?
Isso ocorre porque em
bactérias, a tradução e a transcrição são acopladas,
ou seja, os RNAm começam a ser traduzidos antes do término de sua síntese
Discorra sobre a etapa de desempacotamento do RNAm.
Uma proteína reconhece o cap da extremidade 5’ dos mensageiros eucarióticos, enquanto que outros fatores protéicos desfazem dobramentos no início do mensageiro.
Onde se dá a ligação entre o RNAt e o aminoácido?
Entre o grupo carboxila do aminoácido e carbono 3’ da ribose do último ribonucleotídeo da extremidade 3’ do RNAt, o qual contém sempre a base adenina.
A formação da ligação peptídica é uma atividade enzimática desempenhada por qual estrutura?
Subunidade maior do ribossomo
Como os códons de terminação são reconhecidos?
Por fatores proteicos ou fatores de liberação, os quais os quais se adaptam perfeitamente no sítio P (embora não sejam RNAt).
Como ocorre a iniciação do processo de tradução?
Depende de proteínas especializadas “auxiliares” chamadas de fatores de iniciação. A função delas é ajudar as subunidades ribossômicas, RNAt, e RNAm a se encontrarem de maneira ordenada e previsível.
RNAt não correspondentes também podem entrar no sitio A. Por que isso não faz com que aminoácidos errados sejam adicionados à cadeia?
RNAt não correspondentes podem até ser capazes de entrar no sítio A… mas no geral não permanecem ali. Em um processo cuidadoso, cada RNA é acompanhado por proteínas assistentes, e somente o RNAt que é o correspondente perfeito do códon será “liberado” no sítio A por suas ajudantes exigentes
Como o aminoácido se solta cadeia?
Fatores de liberação confundem a enzima que normalmente forma as ligações peptídicas: fazem-na adicionar uma molécula de água ao último aminoácido da cadeia. Isso faz com que a cadeia seja separada do RNAt e, assim, a proteína recém-produzida liberada.
Em que consiste o processamento pós-traducional?
Dobramento do novo polipeptídeo em uma estrutura tridimensional distinta;
Associação a outros polipeptídeos para formar uma proteína com múltiplas partes -> Apolipoproteínas
Qual proteína auxilia no dobramento de proteínas?
Chaperonas
Qual a função das chaperonas?
Evitar que as proteínas se unam incorretamente durante o dobramento.
