Biology 3 Flashcards
Replicazione
La duplicazione dell’informazione genetica contenuta nel DNA
Trascrizione
Processo grazie al quale alcune porzioni del nostro DNA vengono trascritte da RNA polimerasi a produrre le molecole di RNA.
Unità di trascrizione
Sequenza di DNA trascritta in un singolo RNA, che inizia da un promotore e finisce ad un terminatore.
mRNA
RNA messaggeri, codifica per le proteine.
Determina la sequenza aminoacidica dei polipeptidi.
rRNA
RNA ribosomiali, formano la struttura base dei ribosomi. è la componente dei ribosomi che serve come sito della sintesi proteica.
tRNA
RNA transfer, adattatore tra mRNA e aminoacidi.
Si lega agli aminoacidi e li porta alle posizioni corrette nella catena polipeptidica in fase di sintesi.
RNA polimerasi dei tRNA
RNA polimerasi III
RNA polimerasi III
tRNA
RNA polimerasi degli mRNA
RNA polimerasi II
RNA polimerasi II
mRNA
RNA polimerasi I
rRNA
RNA polimerasi degli rRNA
RNA polimerasi I
Gene
Un’intera sequenza polinucleotidica necessaria per la sintesi di una proteina. Anche le regioni di DNA che codificano per RNA sono geni. Sono disposti tra zone di DNA non funzionale che non codificano per proteine. Possono contenere al loro interno introni.
Dove avviene la trascrizione del DNA negli eucarioti?
Nel nucleo
Dove avviene la maturazione dell’mRNA?
Nel nucleo
Occorrente per la trascrizione (3)
1) RNA polimerasi
2) Promotore
3) Terminatore
Filamento senso
Filamento non usato come stampo, che ha la stessa sequenza dell’RNA neosintetizzato
Filamento non senso
Filamento usato come stampo per la sintesi dell’RNA neosintetizzato
Promotore
Sequenza di DNA situata a monte del gene e alla quale si lega l’RNA polimerasi per iniziare la trascrizione. Il promotore contiene informazioni che determinano quale dei due filamenti di DNA deve essere trascritto e il sito da cui iniziare la trascrizione.
Elementi regolatori distali
Regioni del cromosoma che regolano l’attività del promotore stesso. Interagiscono con regioni del promotore per renderlo più o meno forte, coordinando le informazioni necessarie perché un certo gene venga trascritti in certi tessuti, in certi momenti e sottotipi cellulari.
(Regolazione della trascrizione tessuto - specifica)
Terminatore
Sequenza di regolazione, localizzata all’estremità distale di un gene, che segnala la fine della trascrizione.
Sequenze critiche per l’inizio della trascrizione negli eucarioti
- 100 (GC box)
- 80 (CAAT / CAT box)
- 25 (TATA box)
Regioni UTR
3’ e 5’, sono porzioni della regione trascritta di DNA che non sono tradotte.
Processi di maturazione del mRNA
- Capping
- Splicing
- Poliadenilazione
Dove avviene la maturazione dell’mRNA?
Nel nucleolo
Capping
Il processo di aggiunta di una metilguanosina al 5’ fosfato libero dell’RNA
Funzioni capping (2)
1) Conferisce stabilità all’RNA, proteggendo dalla degradazione da parte di nucleasi;
2) Posiziona l’mRNA sul ribosoma per l’inizio della sintesi proteica.
Legame del capping
Ponte trifosfato 5’ - 5’ (l’unico caso di legame 5’-5’)
5’ fosfato della guanosina interagisce con il 5’ fosfato del trascritto.
Metilguanosina
Guanosina trifosfato metilata
(Guanosina trifosfato = nucleotide, guanina + anello di ribosio + 3 gruppi fosfato)
Perché non vengono rimossi 3’ e 5’ UTR?
5’ UTR consente il riconoscimento dell’RNA messaggero da parte del ribosoma
Spliceosoma (struttura)
Complesso riboproteico che consiste di cinque tipi di RNA combinati con oltre 200 proteine.
Spliceosoma (funzione)
Identifica i punti corretti per il taglio, rompe e forma legami fosfodiesterici.
Splicing
Modifica del pre-mRNA nella quale gli introni sono rimossi e gli esoni vengono uniti.
Splicing alternativo
Processo che consente di ottenere molecole di mRNA maturo differenti partendo dallo stesso trascritto primario (taglio “non standard” degli esoni e introni).
Risultato splicing alternativo
Produzione di molecole diverse di mRNA, ognuna della quali codifica per una proteina differente. Un unico gene può così dare origine a delle isoforme di splicing con funzioni leggermente diverse. Contribuisce alla variabilità e alla regolazione fine delle funzioni delle proteine (REGOLAZIONE TESSUTO - SPECIFICA)
Poliadenilazione
Aggiunta di una coda di poli(A) all’estremità 3’ dell’RNA (senza filamento stampo). La coda di adenine si trova solo sull’mRNA, e non sul gene.
Chi catalizza l’aggiunta della coda poli(A)?
L’enzima poli(A) polimerasi
Funzioni poliadenilazione (2)
1) Conferisce stabilità all’mRNA, la protegge dalla degradazione ad opera delle nucleasi.
2) Favorire l’export dal nucleo (la “coda” è riconosciuta da alcune proteine coinvolte nell’export)
Segnale di poliadenilazione
Sequenza consensus AAUAA
Geni housekeeping
(o a espressione ubiquitaria)
Geni che devono essere espressi in tutti i tipi cellulari sempre allo stesso livello.
Geni specializzati/tessuto-specifici
Geni specifici di un certo stadio di sviluppo / tessuto
Geni inducibili
Geni che possono essere espressi in qualunque momento della vita di un individuo in qualunque tessuto ma vengono trascritti solo in risposta ad uno specifico segnale che arriva dall’ambiente esterno.
Il codice genetico è … (4)
1) a triplette
2) ridondante → (la maggior parte degli) aminoacidi sono codificati da più di una tripletta
3) universale → le triplette hanno lo stesso significato in tutti gli organismi viventi
4) lineare → ogni nucleotide è letto una sola volta
Mutazione missenso
Mutazione del primo nucleotide. Cambia l’aminoacido per il quale codifica la tripletta. Potenzialmente patologica.
Mutazione nonsenso
Mutazione che trasforma un’aminoacido in codone di stop (o viceversa). Può interrompere la produzione della proteina o produrre una proteina più lunga.
Mutazione silente
Mutazione del terzo nucleotide di un aminoacido codificato da 4 codoni. Non ha conseguenze, l’aminoacido rimane lo stesso.
Loop dell’anticodone
Loop in basso del tRNA, sul quale è presente l’anticodone dell’aminoacido associato.
Codone
Tripletta sull’mRNA
tRNA carico
aminoacil-tRNA
Aminoacil-tRNA
tRNA carico
Legame tRNA - aminoacido
Tra gruppo carbossilico dell’aminoacido e il 3’ OH dell’ultimo nucleotide del tRNA
Enzima che “carica” tRNA
Aminoacil-tRNA sintetasi
Aminoacil-tRNA sintetasi
Enzima che catalizza l’unione di un aminoacido al corrispondete tRNA mediante la formazione di un legame esterico.
Qual è la differenza più importante tra i ribosomi eucariotici e procariotici?
La presenza di un rRNA in più, e il numero più grande di proteine (55 e 82)
Ribosoma
Macrostruttura costituita da RNA e proteine, struttura nella quale avviene la sintesi proteica
Unità di trascrizione
Sequenza di DNA trascritta in un singolo RNA, che inizia da un promotore e finisce ad un terminatore. Viene ripetuta un numero elevatissimo di volte (circa 300-400 ripetizioni sul genoma, distribuite su 5 cromosomi).
