Biochimie Module A Points importants Maechler ter Flashcards
La glycolyse fournit aussi des ___ de molécules complexes.
précurseurs
La glycolyse a lieu partout et toujours, mais:
• N’utilisent que le glucose: les ___ ___ et le ___
• Utilisent en priorité le glucose: les ___
• Utilisent peu le glucose: le ___, le tissu ___
globules rouges; cerveau (voire aussi des corps cétoniques); muscles; foie; adipeux
La capacité de stockage des glucides dans l’organisme est faible/forte(?), donc:
• Stockons/Utilisons(?) le glucose tant qu’il y en a
• Stockons/Utilisons(?) l’excédant sous d’autres formes
faible;
Utilisons;
Stockons
La part de glucose absorbé qui dépasse les besoins énergétiques immédiats de l’organisme est stockée sous d’autres formes (sous forme de ___ et de ___).
glycogène;
lipides
Origines du glucose pour la glycolyse:
• Alimentaire (___ et ___)
• Métabolique (___ et ___)
polysaccharides;
disaccharides;
néoglucogenèse;
glycogénolyse
La glycolyse en 2 phases:
• Phase d’___ (+/-? ___(#?) ATP pour 1 glucose)
• Phase de ___ ___ ___ (+/-? ___(#?) ATP pour 1 glucose)
investissement;
-2;
retour sur investissement;
+4
1ère étape: phosphorylation du glucose: • Phosphorylation en C\_\_\_(#?) produit du \_\_\_ • Génère/Consomme(?) 1 ATP • Réversible/Irréversible(?) • Non limitante/Limitante(?)
6; glucose-6-P; Consomme; Irréversible; Limitante
1ère étape: phosphorylation du glucose:
• ___ le glucose dans la C (charge nég/pos(?) du phosphate)
• Limite/Favorise(?) l’entrée de glucose dans la C
• E: ___ (bas KM)/ ___ (haut KM)
Piège; nég; Favorise; hexokinase; glucokinase
Hexokinase:
• Localisation: ___
• Spécifique/Non spécifique(?) pour le glucose
• Faible/Forte(?) affinité pour le glucose (KM = ___ mM)
ubiquitaire;
Non spécifique (autres substrats: fructose, mannose, etc);
Forte;
0.1
Origines du glucose pour la glycolyse:
• Métabolique/Alimentaire(?) (polysaccharides, disaccharides)
• Métabolique/Alimentaire(?) (néoglucogenèse, glycogénolyse)
Alimentaire;
Métabolique
L’hexokinase peut phosphoryler n’importe quel ___(≠sucre?), ce qui permet à ces ___(≠sucres?), dans les tissus où elle est présente, de rejoindre la glycolyse au niveau du ___(molécule?).
hexose;
hexoses;
fructose-6-phosphate
Hexokinase/Glucokinase(?):
• Active à toutes glycémies
Hexokinase
Hexokinase/Glucokinase(?):
• Confère à sa C une propriété de détecteur de
l’élévation de la glycémie, donc à état de pléthore, stockons.
Glucokinase
Glucokinase:
• Localisation: ___(org?) et C à ___ (C α/β/γ/δ(?) du ___(org?)
• Non spécifique/Spécifique(?) pour le glucose
• Faible/Forte(?) affinité pour le glucose (KM = ___ mM)
Foie; insuline; β; pancréas; Spécifique; Faible; 10
ΔG°’ = variation d’___ ___ ___
énergie libre standard
Hexokinase/Glucokinase(?):
• Active à hautes glycémies (post-prandial)
Glucokinase
Glycolyse: 3 étapes avec ΔG°’ (___/___(unités?)) très positif/négatif(?) sont donc irréversibles
kJ/mol;
négatif
Hexokinase/Glucokinase(?):
• Doit être capable d’alimenter en toutes circonstances la glycolyse pour fournir de l’énergie
Hexokinase
Les 3 étapes irréversibles de la glycolyse:…(précisez les E impliquées dans ces réactions)
- Hexokinase/Glucokinase
- Phosphofructokinase
- Pyruvate kinase
Etapes irréversibles de la glycolyse:
La réaction #___(#?) est aussi très exergonique, mais pratiquement couplée à la réaction #___(#?) qui est endergonique, donc la 1ère est/n’est pas(?) limitante.
7;
6;
n’est pas
ΔG = …(formule?)
ΔG°’ + RTln([C][D]/[A][B])
Réaction #4 de la glycolyse ayant un ΔG°’ de + 23.8 kJ/mol;
• Réaction exergonique/endergonique(?), donc spontanée/pas spontanée(?) mais l’___ de ___ liée aux réactions #___(#?) et #___(#?) suffit à « pousser » la réaction.
endergonique; pas spontanée; action; masse; 1; 3
Si le NAD+/NADH(?) s’accumule dans le compartiment cytosolique, la glycolyse s’arrête.
NADH
Réoxydation du NADH en NAD+ par la ___ ___(E?), en aérobiose/anaérobiose(?) par fermentation lactique dans le compartiment mitochondrial/cytosolique(?).
lactate déshydrogénase;
anaérobiose;
cytosolique
Réoxydation du NADH en NAD+ par les ___, en aérobiose/anaérobiose(?), et par la chaîne ___ dans le compartiment mitochondrial/cytosolique(?).
navettes;
aérobiose;
respiratoire;
mitochondrial
• Le NAD ne passe pas la membrane externe/interne(?) des mitochondries.
interne
• Des ___ prennent en charge et transfèrent les équivalents réducteurs du cytosol à la mitochondrie.
navettes
• 1 seul et même pool/2 pools(?) de NAD: cytosolique et mitochondrial.
2 pools
• Dans la mitochondrie, les ___ ___
sont transférés sur la chaîne respiratoire.
• Il y a donc production in fine d’___(molécule?) par ce mécanisme (contrairement à/tout comme lors de(?) la fermentation lactique).
équivalents réducteurs;
ATP;
contrairement à
• Il existe essentiellement 2 navettes (celle du ___ et la navette ___/___)
glycérol-3-phosphate;
malate/aspartate
Navette glycérophosphate:
• 1er temps: Réduction du ___ en ___ et oxydation du ___ en ___
dihydroxyacétone-P;
glycérol-3-phosphate;
NADH;
NAD+
Navette glycérophosphate:
• 2ème temps: oxydation du ___ par le ___(CoE?) en ___ (navette bouclée)
glycérol-3-phosphate;
FAD;
dihydroxyacétone-P
Navette glycérophosphate:
• 3ème temps: le ___(CoE?) produit transfert ses électrons à la chaîne respiratoire
FADH2
En bout de chaîne: 1 FADH2 génère ___(#?) ATP
2
Navette malate/aspartate:
• 1er temps: Réduction/Oxydation(?) du NADH en NAD+ et formation de ___
Oxydation;
malate
Navette malate/aspartate:
• 2ème: le ___ entre dans la mitochondrie et est réduit/oxydé(?) par le ___(CoE?) mitochondrial/cytosolique(?)
malate;
oxydé;
NAD+;
mitochondrial
Navette malate/aspartate:
• 3ème: l’___ est exporté dans le cytosol
aspartate
Navette malate/aspartate:
• 4ème: le ___(CoE?) produit transfert ses électrons à la chaîne respiratoire
NADH
En bout de chaîne: 1 NADH génère ___(#?) ATP
3
Adaptation métabolique: 2 types de course → 2 types de métabolisme;
• 100m: utilisation majoritaire des oxydations phosphorylantes de la chaîne respiratoire/de la lactate déshydrogénase(?)
• Marathon: utilisation majoritaire des oxydations phosphorylantes de la chaîne respiratoire/de la lactate déshydrogénase(?)
de la lactate déshydrogénase;
des oxydations phosphorylantes de la chaîne respiratoire
La ___ catalyse l’étape irréversible et limitante qui contrôle le flux glycolytique sous contrôle allostérique.
phosphofructokinase
Phosphofructokinase et son contrôle allostérique:
• ADP en est un effecteur allostérique positif/négatif(?)
• ATP en est un effecteur allostérique positif/négatif(?)
positif;
négatif
Destinées du pyruvate:
• Anaérobiose: le pyruvate est oxydé/réduit(?) en ___ (permet la régénération du ___)
réduit;
lactate;
NAD+
Destinées du pyruvate:
• Anaérobiose/Aérobiose(?): le pyruvate est métabolisé dans la mitochondrie
Aérobiose
Cycle de l’___ ___=Cycle de Krebs= ___ ___(ang?) cycle (=___ (abr?) cycle)
acide citrique;
tricarboxylic acid;
TCA
Krebs cycle, which was first described by Hans Adolf Krebs in 1937. It is called tricarboxylic acid cycle because the ___(≠tricarboxylic?) acid is both the first product and the final reactant, and it contains ___(#?) ___ groups.
citric;
three carboxyl
Cycle de l’acide citrique: définitions:
• Voie de l’anabolisme/du catabolisme(?) réducteur/oxydatif(?) aérobie/anaérobie(?)
• Réduction/Oxydation(?) du groupement acétyl sous sa forme active ___
• Voie cytosolique/mitochondriale(?)
du catabolisme; oxydatif; aérobie; Oxydation; acétyl-CoA; mitochondriale
Cycle de l’acide citrique: définitions:
• ___ de l’anabolisme et du catabolisme
• Dans peu de/toutes les(?) cellules (sauf dans les ___ ___)
• Fournit ___% de l’énergie cellulaire
Carrefour;
toutes les;
GR;
90
Cycle de l’acide citrique;
Voie du catabolisme oxydatif aérobie:
• Produit du ___ à partir d’un intermédiaire « utilisable », l’___: catabolisme/oxydatif/aérobie(?)
CO2;
acétyl-CoA;
catabolisme
Cycle de l’acide citrique;
Voie du catabolisme oxydatif aérobie:
• ___(CoE?) et ___(CoE?) sont les accepteurs d’équivalents réducteurs: catabolisme/oxydatif/aérobie(?)
NAD+;
FAD;
oxydatif
Cycle de l’acide citrique: Voie du ___ ___ ___
catabolisme oxydatif aérobie
Cycle de l’acide citrique;
Voie du catabolisme oxydatif aérobie:
• Dépend de la fourniture d’___ sur la chaîne respiratoire: catabolisme/oxydatif/aérobie(?)
oxygène;
aérobie
Origines de l’acétyl-CoA sont diverses/univoques(?) et dépendent de l’état ___:
• graisses → acides gras et glycérol
• polysaccharides, disaccharides → glucose et autres sucres
• protéines → acides aminés
diverses;
nutritionnel
Origines de l’acétyl-CoA sont diverses/univoques(?) et dépendent de l’état \_\_\_: Catabolisme des: • \_\_\_(macronutriments?) • \_\_\_(macronutriments?) • \_\_\_(macronutriments?)
diverses; nutritionnel; Glucides; Lipides; Protéines
Origines de l’acétyl-CoA: glucides:
• Dans le cytosol, le glucose (6C) produit du
___ (3C)
• Dans la mitochondrie, le ___ produit de l’acétyl-CoA
pyruvate;
pyruvate;
Origines de l’acétyl-CoA: lipides:
• Dans le cytosol, les triglycérides produisent
des ___ ___
• Dans la mitochondrie, le catabolisme des ___ ___ (lors de la ___(voie métabolique?)) produit de l’acétyl-CoA
• Les ___ ___ (en période de jeûne) produisent aussi de l’acétyl-CoA
acides gras;
acides gras;
β-oxydation;
corps cétoniques
Origines de l’acétyl-CoA: protéines:
• Le catabolisme/L’anabolisme(?) des protéines produit des acides aminés
• Les acides aminés forment soit du ___, soit de l’___, soit entrent directement dans le cycle de l’___ ___
Le catabolisme;
pyruvate;
acétyl-CoA;
acide citrique
Cycle de l’acide citrique: la fourniture d’___(molécule?) règle la vitesse du cycle
acétyl-CoA
La fourniture d’acétyl-CoA règle la vitesse du cycle de Krebs; la ___(E?):
• En amont du cycle, commande le flux d’entrée de l’acétyl-CoA
• Son activité dépend de la disponibilité de ___ et de ___ (les coenzymes de la réactions)
• Son activité est contrôlée par modification non covalente/covalente(?)
Pyruvate-DH;
NAD+;
CoA-SH;
covalente
Pyruvate-DH catalyse la réaction suivante:
… → …
Pyruvate + CoA-SH + NAD+ → NADH + H+ + CO2 + Acétyl-CoA
PDH phosphorylée = active/inactive(?):
• PDH kinase: activée par l’___, l’___, le ___, (inhibée par le ___)
inactive; ATP; acétyl-CoA; NADH; pyruvate
PDH déphosphorylée = active/inactive(?):
• PDH phosphatase: activée par le ___(ion?), l’___(H?)
active;
Ca2+;
insuline
• Contrôle par modification covalente/allostérique(?) de la PDH-Kase et de la PDH-Pase
allostérique
Contrôle de l’activité de la PDH par modification covalente/allostérique(?)
modification covalente (PY/dPY)
Cycle de l’acide citrique: Vue d’ensemble:
• Total de ___(#?) réactions
• ___(#?) carbones de l’acétyl éliminés à chaque « tour » sous forme de ___(#?) ___(molécule?)
8;
2;
2 CO2
Cycle de l’acide citrique: Vue d’ensemble:
• ___(#?) réactions d’oxydation (transfert d’équivalents réducteurs sur ___ et ___)
• 1 réaction produit du ___ (directement converti en ATP)
4;
NAD+;
FAD;
GTP
Cycle de l’acide citrique: Vue d’ensemble: ● 4 réactions redox: • 3x2e- transmis au \_\_\_ • 1x2e- \_\_\_ ● 1 GTP (liaison basse/haute(?) énergie)
NAD+;
FAD;
haute
Cycle de l’acide citrique: ___(#?) réactions réversibles/irréversibles(?) & limitantes/non limitantes(?) règlent la vitesse du cycle. De quelles réactions s’agit-il (précisez le #)?
3;
irréversibles;
limitantes;
# 1, 3 et 4
Cycle de l’acide citrique: 3 réactions irréversibles & limitantes règlent la vitesse du cycle: #1: ...(E?): \_\_\_(réaction?) de l’\_\_\_ et de l'\_\_\_ en \_\_\_ (libère 1 \_\_\_)
Citrate synthase; condensation; acétyl-CoA; oxaloacétate; citrate; CoA-SH
Cycle de l’acide citrique: 3 réactions irréversibles & limitantes règlent la vitesse du cycle: #3: ...(E?): \_\_\_(réaction?) (produit du \_\_\_) oxydative/réductive(?) (produit du ...) de l’\_\_\_.
Isocitrate-DH; décarboxylation; CO2; oxydative; NADH + H+; isocitrate
Cycle de l’acide citrique: 3 réactions irréversibles & limitantes règlent la vitesse du cycle: #4: ...(E?): \_\_\_(réaction?) (produit du \_\_\_) oxydative/réductive(?) (produit du ...) de l'\_\_\_
α-Cétoglutarate-DH; décarboxylation; CO2; oxydative; NADH + H+; α-cétoglutarate
Cycle de l’acide citrique: Réactions irréversibles & limitantes: quelles sont les E impliquées?
citrate synthase, isocitrate-DH, et l’α-cétoglutarate-DH
Cycle de l’acide citrique: Réactions irréversibles & limitantes: CS, ICDH, α-CGDH:
• Activité régulée par la ___ en substrats
• Activées/Inhibées(?) par leurs produits
• Contrôle allostérique (inhibiteurs: ___ et ___)
disponibilité;
Inhibées;
ATP;
NADH
Cycle de l’acide citrique fournit des précurseurs pour l’anabolisme/le catabolisme(?).

l’anabolisme
Cycle de l’acide citrique fournit des précurseurs pour l’anabolisme: formation de:
• Glucides: ___(voie métabolique?)
• Lipides: le ___(molécule?) quitte la mitochondrie et
forme des acides gras dans le cytosol
• Protéines: différents intermédiaires du cycle de l’acide citrique
• Autres: porphyrines, etc.
néoglucogenèse;
citrate
La ___ combinée au ___(ion?) forme l’___ ; c’est un constituant de base des hémoglobines et des myoglobines, qui sont les transporteurs d’oxygène atmosphérique.
porphyrine;
fer;
hème
Cycle de l’acide citrique fournit des précurseurs pour l'anabolisme: formation de: • \_\_\_(macronutriments?) • \_\_\_(macronutriments?) • \_\_\_(macronutriments?) • Autres: \_\_\_(molécules?), etc.
Glucides;
Lipides;
Protéines;
porphyrines
Cycle de l’acide citrique fournit des précurseurs pour l’anabolisme: formation de: Glucides via la néoglucogenèse:
• Depuis le cycle de l’acide citrique: ___ mitochondrial → ___ cytosolique → ___ (via la ___(E?)) → ___ (via la ___(E?))
• contourne la réaction défavorable ___(molécule?) → ___(molécule?)
malate; malate; oxaloacétate; MDH; phosphoénolpyruvate; PEPCK=Phosphoénolpyruvate carboxykinase; pyruvate; phosphoénolpyruvate
L’___ est la partie protéique d’une molécule qui comporte une partie non protéique.
apoprotéine
Dans l’exemple de l’hémoglobine, la globine est l’___, l’hème le ___.
apoprotéine;
cofacteur
