Biochimie Module A Points importants Maechler Flashcards
Le métabolisme fournit les éléments de ___ des cellules.
construction
Flux de l’énergie;Les hétérotrophes/autotrophes(?) produisent à l’aide de l’énergie solaire de l’O2 et des composés organiques. Les hétérotrophes/autotrophes(?) transforment ces derniers grâce à la respiration Cr en H2O et CO2.
autotrophes;hétérotrophes
• Un organisme vivant se ___ et se ___.• Cela nécessite de la ___ et de l’___. 
conserve;reproduit;matière;énergie
• Le métabolisme comprend le ___ et l’___.• Organismes hétérotrophes dérivent l’énergie de molécules simples/complexes(?) et la matière de molécules simples/complexes(?).
catabolisme;anabolisme;complexes;simples
Organisme autotrophe libérant son énergie stockée sous forme minérale/organique(?): production de ___, de ___, et d’___
organique;chaleur;CO2;eau
Bois, charbon, gaz, pétrole: des végétaux qui fournissent de l’énergie grâce à la combustion de leur carbone minéral/organique(?).
organique
• Le carbone de la matière organique est globalement oxydé/réduit(?).• Le carbone organique/minéral(?) sous forme de CO2 est oxydé/réduit(?).
réduit;minéral;oxydé
• Respiration cellulaire oxyde/réduit(?) le carbone minéral/organique(?) en carbone minéral/organique(?).• Ceci produit de l’___ (ATP).
oxyde;organique;minéral;énergie
ATP=___ ___(abr?): une ___ d’___ énergétique
adénosine triphosphate;monnaie;échange
ATP utilisée pour: • ___ • ___ ___ • ___ • ___
Mouvements;Gradients ioniques;Signalisation;Anabolisme
ATP est « la monnaie » de l’énergie:• Continuellement/alternativement(?) formé et consommé • Un être humain, au repos, en consomme: ___kg/jour • Exercice intense, consommation: ___kg/min • Concentration cellulaire: ___-___ mM
Continuellement;40;0.5;2-4
• Catabolisme: réactions exergoniques/endergoniques(?)• Anabolisme: réactions exergoniques/endergoniques(?)
exergoniques;endergoniques
dégradations:Voies cataboliques ou anaboliques?
cataboliques
nécessite énergie:Voies cataboliques ou anaboliques?
anaboliques
réductives (nécessite des électrons):Voies cataboliques ou anaboliques?
anaboliques
Les voies sont convergentes:Voies cataboliques ou anaboliques?
cataboliques
oxydatives (donne des électrons):Voies cataboliques ou anaboliques?
cataboliques
fournit de l’énergie:Voies cataboliques ou anaboliques?
cataboliques
Biosynthèse:Voies cataboliques ou anaboliques?
anaboliques
Les voies sont divergentes:Voies cataboliques ou anaboliques?
anaboliques
utilisent ___(CoE?) et ___(CoE?) comme porteurs d’électrons (accepteurs):Voies cataboliques ou anaboliques?
NAD+;FAD;cataboliques
utilisent ___(CoE?) comme donneur d’électrons:Voies cataboliques ou anaboliques?
NADPH;anaboliques
Les voies anaboliques sont le plus souvent/ne sont le plus souvent pas(?) l’inverse des voies cataboliques.
ne sont le plus souvent pas
NADH et FADH2: une monnaie ___(≠ énergétique?): des équivalents réducteurs échangés contre de l’___(molécule?)
red-ox;ATP
- Keq = [C]eq[D]eq/[A]eq[B]eq
* Keq = ___ d’___
constante;
équilibre
- ΔH = ___ générée/absorbée entre l’état initial et final
- ΔS = ___ (=état de désordre) décroît/croît(?) dans l’univers par un processus spontané
- ΔG = ___ ___ de ___ = variation de la ___ de la réaction
chaleur; entropie; croît; énergie libre; Gibbs; spontanéité
• ΔH « – » : réaction défavorable/favorable(?) sur le plan de l’enthalpie (endothermique/exothermique(?))
• ΔS « + » : réaction défavorable/favorable(?) sur le plan de l’entropie
⇉ Donc ΔG « – » : réaction non-spontanée/spontanée(?) endergonique/exergonique(?)
favorable; exothermique; favorable; spontanée; exergonique
Conditions standards définissent la variation d’énergie libre standard ΔG°’:
● “ °/’(?) “ Pression = 101.3 kPa (=___ atm)
● “ °/’(?) “ Température = ___° K (___°C)
● “ °/’(?) “ pH = ___
● Conditions initiales de concentration des réactants: [A] = [B] = [C] = [D] = ___M
°; 1; °; 298; 25; ’; 7.0; 1
- ΔG°’= …(formule?)
- Si ΔG°’ négative: réaction exergonique/endergonique(?)
- Si ΔG°’ positive: réaction exergonique/endergonique(?)
-RTln(Keq);
exergonique;
endergonique
Les conditions réelles de la vie cellulaire définissent la variation d’énergie libre ΔG:
• ΔG°’= …(formule?)
• ΔG = …(formule?)
• ΔG varie/ne varie pas(?) au cours de la réaction
-RTln(Keq);
ΔG°’+RTln([C][D]/[A][B]);
varie
- ΔG°’ est une autre manière d’exprimer la ___ d’___
* ΔG°’ reflète les propriétés des composés (i.e. ___ et ___)
constante;
équilibre;
substrats;
produits
Molécules A, B, C et D ont une énergie libre:
Lors de la réaction A+B (état initial) vers C+D (état final), il y a ___ d’énergie libre ΔG:
• ΔG = ΔGproduits – ΔGsubstrats
• Si ΔG négative: réaction non spontanée/spontanée(?) → le système a gagné/perdu(?) de l’énergie libre
variation;
spontanée;
perdu
- Si ΔG°’ négative: réaction endergonique/exergonique(?)
* Si ΔG°’ positive: réaction endergonique/exergonique(?)
exergonique;
endergonique
ΔG = variation de la spontanéité de la réaction;
1) A+B ⇆ C+D
2) ΔG°’= - RTln(Keq)
3) +RTln([C][D]/[A][B])
• Quelle numéro correspond au terme “réaction”?
1) A+B ⇆ C+D
ΔG = variation de la spontanéité de la réaction;
1) A+B ⇆ C+D
2) ΔG°’= - RTln(Keq)
3) +RTln([C][D]/[A][B])
• Quelle numéro correspond au terme “spontanéité”?
2) ΔG°’= - RTln(Keq)
ΔG = variation de la spontanéité de la réaction;
1) A+B ⇆ C+D
2) ΔG°’= - RTln(Keq)
3) +RTln([C][D]/[A][B])
• Quelle numéro correspond au terme “variation”?
3) +RTln([C][D]/[A][B])
- ln(1)=___
* log(1)=___
0;
0
- ln(e)=___
* log(10)=___
1;
1
L’ATP occupe une position basse/intermédiaire/supérieure(?) sur le thermomètre des ΔG°’ → monnaie d’échange
intermédiaire
Dans les conditions cellulaire, l’hydrolyse de l’ATP est une réaction endergonique/exergonique(?). ___ kJ/mol
exergonique;
-30,5
Une réaction endergonique peut/ne peut pas(?) être possible si elle est « poussée » par un rapport Produit/Substrat très favorable.
peut
Une réaction endergonique (ΔG°’ positive/négative(?)) est possible si elle est couplée à une réaction exergonique (ΔG°’ positive/négative(?)).
positive;
négative
ΔG# = ___ ___ d’___
énergie libre;
activation
ΔG ne nous dit rien de la ___ de réaction. Cette dernière dépend de ΔG#: différence d’___ ___ entre l’___ ___ et l’___ de ___.
vitesse; énergie libre; état initial; état; transition
La vitesse de réaction est directement/inversement(?)
proportionnelle au ΔG#.
inversement
Comment passer la barrière de l’état de transition;
• Le chimiste ___ son tube à essai
• Le biologiste introduit des ___
chauffe;
enzymes
ΔG#/ΔG°’/ΔG(?): variation d’énergie libre dans une réaction
(variation de la spontanéité de la réaction)
ΔG#/ΔG°’/ΔG(?): variation d’énergie libre en conditions
standards (propriétés de la réaction)
ΔG#/ΔG°’/ΔG(?): énergie libre d’activation (détermine la vitesse de la réaction)
ΔG;
ΔG°’;
ΔG#
Les électrons sont transférés de l’oxydant au réducteur/du réducteur à l’oxydant(?):
• réducteur: accepteur/donneur(?) d’électrons
• oxydant: accepteur/donneur(?) d’électrons
du réducteur à l’oxydant;
donneur;
accepteur
un ___ ___ = un e- transféré dans une réaction d’oxydoréduction
équivalent réducteur
Potentiel redox standard E°; en condition Cr (pH=___) on définit E°’;
• couple 2H+/H2: +/- x,xx(?) V
• couple NAD+/NADH+H+: +/- x,xx(?) V
• couple O2/H2O: +/- x,xx(?) V
7;
-0.42;
-0.32;
+0.82
Une réaction endergonique/exergonique(?) est spontanée et spontanée ≠/=(?) instantanée.
exergonique;
≠
saccharose + H2O → ___ + ___, ΔG°’= -29.3 kJ/mol;
Une enzyme spécifique (ici la ___) catalyse (accélère) la réaction dans une échelle de secondes.
glucose;
fructose;
saccharase
- enzyme vient des racines grecques en (=___) zume (=___).
- Le ___, est la pâte de levures vivantes utilisée pour faire lever le pain.
- Les premières enzymes identifiées ont été extraites des levures (celles-ci transforment le glucose en ___(≠éthanol?)).
dans;
levain;
levain;
alcool
Classification des enzymes;
• ___: transfert d’électrons
• ___: transfert d’atomes ou de groupements
• ___: coupure de liaison par H2O
• ___=___: autres coupures de liaison
• ___=___: crée des liaisons (produit/consomme(?) de l’ATP)
• ___: isomérisation
Oxydoréductase; Transférase; Hydrolase; Lyase; synthase; Ligase; synthétase; consomme; Isomérase
La vitesse de réaction dépend de ΔG___: différence d’énergie libre entre l’état initial et l’état de transition.
#
Enzyme:
• Est une ___
• ___ biologique de réactions biochimiques
• Augmente la ___ de réaction
• Change/ne change pas(?) la constante d’équilibre Keq
• ↗/↘(?) l’énergie libre d’___ ΔG#
• Est non spécifique/spécifique(?) à son substrat
• Est régulable/non régulable(?)
protéine; Catalyseur; vitesse; ne change pas; ↘; activation; spécifique; régulable
La concentration de substrat influence/n’influence pas(?) la Vi=vitesse initiale, on détermine la vitesse maximale de E = Vmax
influence (+ il y a de S à t0, + Vi sera élevée jusqu’à atteindre un plateau équivalent à la Vmax)
Modèle Michaelis-Menten;
Enzyme complémentaire à l’état de ___
transition
___ = constante de Michaelis-Menten: elle définit la relation enzyme↔substrat
KM
Modèle Michaelis-Menten;
Quand [S] tend vers l’infini, Vi = ___. Dans ces conditions, la vitesse dépend des propriétés de l’enzyme définies par la ___
Vmax;
KM
Constante Michaelis-Menten KM = [___] à ___/___
S;
Vmax/2
KM: concentration de substrat qui permet à l’enzyme de travailler au quart/au tiers/a la moitié(?) de sa vitesse maximale.
a la moitié
La KM indique la ___ de travail d’une enzyme, le nombre de ___ sur un télésiège aussi.
cadence;
places
- La Vmax est la vitesse de réaction lorsque l’enzyme est à demi-saturation/saturation(?)
- La KM est la concentration de substrat lorsque l’enzyme est à demi-saturation/saturation(?) (indique la ___ de travail d’une enzyme)
saturation;
demi-saturation;
cadence
• KM élevée/basse(?) rime avec haute affinité et faible capacité.
• KM élevée/basse(?) rime avec faible affinité et haute capacité.
• affinité à comprendre dans le sens de ___.
basse;
élevée;
saturabilité
- Km basse → basse/haute(?) affinité=il n’y a pas besoin d’avoir bcp de substrat pour que tous les sièges du télésiège soit plein.
- Si la Km est élevée → basse/haute(?) capacité → basse/haute(?) affinité → +/-(?) difficilement saturable
haute;
haute;
basse;
+
La ___ permet de prédire:
• si une enzyme opère proche de sa Vmax
• si un changement dans la concentration du substrat va changer sa vitesse

KM
KM en mM glucose:
• HEXOKINASE: ___ mM
• GLUCOKINASE: ___ mM;
La concentration sanguine de glucose (glycémie) varie de ___ à ___ mM. Laquelle de ces kinases va réagir aux changements de la concentration de glucose?
0.1;
10;
4 à 10;
GLUCOKINASE
Avec son KM bas, la glucokinase/l’hexokinase(?) est continuellement en Vmax, métabolisant le glucose efficacement dans des conditions physiologiques.
l’hexokinase
Avec son KM élevé, la glucokinase/l’hexokinase(?) peut « sentir » des changements de glucose entre 4-10 mM. (+/- active, donc senseur au glucose)
la glucokinase
KM est directement/inversement(?) proportionnel à l’affinité de l’enzyme pour le substrat.
inversement
Cinétique enzymatique;
Representation de ___-___ ou “double inverse”
LINEWEAVER-BURK
Site \_\_\_ d’une enzyme: • Site de liaison du/des substrat/s • Lieu de la réaction • Localisé au fond d’une poche de la zone interne/externe(?) de la protéine • Modèle de \_\_\_↔\_\_\_ • Modèle d’\_\_\_ \_\_\_
actif; interne; clé; serrure; ajustement induit
Modèle d’ajustement induit = ___ ___(ang?)
induced fit
Dans le site actif des E, il y a catalyse car:
• ↗/↘(?) de la concentration des réactants
• ___ propice des molécules
• ↗/↘(?) de l’énergie libre d’activation ΔG___ pour atteindre l’___ ___ ___
↗; Orientation; ↘; #; état de transition
A l’extrême, une dénaturation des protéines (en l’occurrence d’E) par une température trop élevée produit une inhibition spécifique/non spécifique(?).
non spécifique
Protéines = ___(all?) = blanc d’œuf
Eiweiss
Les inhibiteurs:
• Irréversibles/réversibles(?) (se lient de façon covalente à un groupe fonctionnel)
• Irréversibles/réversibles(?) (compétitifs, non compétitifs, mixtes)
Irréversibles;
réversibles
Inhibiteurs réversibles compétitifs:
• Non analogues/analogues(?) structuraux du substrat
• ↗/↘/ne changent pas(?) la KM, ↗/↘/ne changent pas(?) la Vmax
analogues;
↗;
ne changent pas
Le cyanure est un inhibiteur compétitif/non compétitif(?) de la ___ ___ ___(= complexe ___(#?) de la chaîne respiratoire mitochondriale). E essentielle à l’une des dernières étapes de la respiration Cr. Sans son activité, les mouvements respiratoires pulmonaires cessent.
Le ___-___ utilisé dans les camps de la mort nazis était constitué d’acide ___.
compétitif; cytochrome c oxydase; IV; Zyclon-B; cyanhydrique
L’éthanol est catabolisé dans …(org?) par une double réduction/oxydation(?): 1) en ___, 2) en acide ___.
le foie;
oxydation;
acétaldéhyde;
acétique
Antabuse: inhibiteur compétitif/non compétitif(?) de l’___ ___(E?), causant une accumulation d’___ aux effets indésirables (hypotension, vomissements, nausée, inconfort).
compétitif;
acétaldéhyde déshydrogénase;
acétaldéhyde
Inhibiteurs non compétitifs:
• Non analogues/analogues(?) structuraux du substrat
• ↗/↘/ne changent pas(?) la KM, mais ↗/↘/ne changent pas(?) la Vmax
Non analogues;
ne changent pas;
↘
Inhibiteurs compétitifs/non compétitifs(?):
Typiquement des ions ___ (___, ___, ___ etc.) qui modifient la répartition des charges de l’enzyme.
non compétitifs; métalliques; cuivre; mercure; argent
• Inhibiteurs compétitifs/non compétitifs(?):
Augmentent la KM, ne changent pas la Vmax
• Inhibiteurs compétitifs/non compétitifs(?):
Ne changent pas la KM, mais diminuent la Vmax
compétitifs;
non compétitifs
Les activateurs:
• Ions ___ (___, ___ etc.)
• ___ ___ ___ (clivage d’une liaison peptidique d’une ___ = ___, comme pour les E de la digestion)
• Modification covalente/non covalente(?) réversible/non réversible(?) (Py/déPy)
métalliques; calcium; magnésium; Protéolyse limitée activante; proE; zymogène; covalente; réversible
Enzymes allostériques sont caractérisés par une courbe ___ (donc elles sont michaéliennes/non michaéliennes(?))
sigmoïde;
non michaéliennes
Les enzymes allostériques:
• Vi ralenti/accélère(?) à l’approche du KM (ou plutôt K0.5), point d’___ au KM, puis Vi ralenti/accélère(?) brutalement après KM
• La fixation du substrat sur l’enzyme ↗/↘(?) l’affinité de l’enzyme pour le substrat: effet ___
accélère; inflexion; ralenti; ↗; coopératif
Les enzymes allostériques: coopérativité: 2 modèles s’opposent:
• modèle ___
• modèle ___

concerté;
séquentiel
Les enzymes michaéliennes/allostériques(?) ont des effecteurs:
• Se lient sur les sites ___ (du grec ___=
autre=différent), donc =/≠(?) site substrat
• Effecteurs positifs (=___) ou négatifs (=___)
• Augmentation ou diminution de l’___ (à comprendre dans le sens de ___) envers le substrat
allostériques; allostériques; allos; ≠; activateurs; inhibiteurs; affinité; saturabilité
