Biochimie Module A Points importants Maechler bis Flashcards
La ___, E de la glycolyse, est sous contrôle allostérique:
• ADP en est un inhibiteur/activateur(?) allostérique
• ATP en est un inhibiteur/activateur(?) allostérique
phosphofructokinase;
activateur;
inhibiteur
Inhibiteurs enzymatiques: ○ \_\_\_ \_\_\_: \_\_\_: ● La \_\_\_ ● Le \_\_\_ ● L'\_\_\_ ● Les \_\_\_ \_\_\_ ○ \_\_\_: ● \_\_\_: • \_\_\_ (analogues du S, E michaéliennes) • \_\_\_ \_\_\_ (non analogues du S, E michaéliennes) • \_\_\_ \_\_\_ \_\_\_ (non analogues du S, E allostériques non michaéliennes) ● \_\_\_


Non spécifique; Dénaturation; température; pH (acides/bases); alcool; métaux lourds; Spécifique; Réversible; Compétitif; Non compétitif; Effecteur allostérique négatif; Irréversible
Inhibiteur non compétitif ou effecteur allostérique?
• Ne change pas la KM
Inhibiteur non compétitif
Inhibiteur non compétitif ou effecteur allostérique?
• Effets sur une enzyme allostérique non michaélienne
effecteur allostérique
Inhibiteur non compétitif ou effecteur allostérique?
• Effets physiologiques, enzyme régulée
effecteur allostérique
Inhibiteur non compétitif ou effecteur allostérique?
• Effets sur une enzyme michaélienne
Inhibiteur non compétitif
Inhibiteur non compétitif ou effecteur allostérique?
• Effets non physiologiques, enzyme piratée
Inhibiteur non compétitif
Inhibiteur non compétitif ou effecteur allostérique?
• Module la K0.5
effecteur allostérique
Régulation métabolique: Adapter la demande/l’offre(?) métabolique à la demande/l’offre(?) Cr:
• Ajuster la concentration d’un métabolite spécifique au besoin Cr
• Freiner/accélérer(?) la production lorsque la demande est insatisfaite
l’offre;
la demande;
accélérer;
Régulation métabolique: Adapter la demande/l’offre(?) métabolique à la demande/l’offre(?) Cr:
• Freiner/accélérer(?) la production lorsque la demande est satisfaite
• L’enzyme régulant une voie métabolique catalyse la réaction ___
l’offre;
la demande;
freiner;
limitante
Régulation métabolique: Réaction limitante:
• Dans une chaîne de réactions, les enzymes ne sont pas/sont(?) en excès, sauf pour la réaction limitante
• L’étape régulatrice est en tout début/toute fin(?) de chaîne de réactions
sont;
tout début
Régulation métabolique: Réaction limitante:
• La première réaction de la chaîne doit être non spécifique/spécifique(?) de la voie métabolique
• La première réaction spécifique est réversible/irréversible(?) (en conditions cellulaires=selon la T, le pH, la concentration de substrat et produits)
spécifique (si c’est une réaction carrefour: on affecterait plusieurs voies);
irréversible
Régulation métabolique: réactions limitantes:
• L’étape régulatrice en fin/début(?) de chaîne
• Première réaction doit être spécifique/non spécifique(?) de la voie
• La première réaction spécifique est réversible/irréversible(?)
début;
spécifique;
irréversible
Vitesse de réaction limitante: • Fonction de la disponibilité en \_\_\_ (et en \_\_\_ associé) • Dépend de l’\_\_\_ de l’enzyme • Dépend de la \_\_\_ de l’enzyme 
substrat;
coenzyme;
activité;
concentration
___ en ___:
- Approvisionnement en précurseur A et flux métabolique
- Compétition avec une éventuelle autre réaction
- Approvisionnement en CoE (et sa régénération)
Disponibilité;
substrat
Activité de l’enzyme:
- Activation par ___ (réversible/irréversible(?), enzymes digestives)
- Activation par fixation d’une protéine de ___ (réversible/irréversible(?))
- Contrôle par ___/___ (covalent/non covalent(?), réversible/irréversible(?))
- Contrôle ___ (covalent/non covalent(?), réversible/irréversible(?))
protéolyse; irréversible; contrôle; réversible; phosphorylation / déphosphoprylation; covalent; réversible; allostérique; non covalent; réversible
Phosphorylation / déphosphorylation:
• Phosphorylation (sur ___(AA?), ___(AA?) ou ___(AA?)) catalysée par une ___ (qui peut être elle-même phosphorylée → cascade)
• Déphosphorylation par une ___
• Le contrôle ___ passe généralement par des
réaction P/dé-P
• La cascade d’activation permet l’___ de la réponse signal
serine; thréonine; tyrosine; kinase; phosphatase; hormonal; amplification
La cascade d’activation permet l’amplification du signal: exemple du métabolisme du ___. Mobilisation de ___ à partir du ___.
glycogène;
glucose-1-phosphate;
glycogène
Contrôle allostérique → enzymes michaéliennes/non michaéliennes(?):
• Activateurs (par métabolite aval (produit)/amont (substrat)(?), effecteur positif/négatif(?))
• Inhibiteurs (par métabolite aval (produit)/amont (substrat)(?), feedback positif/négatif(?))
non michaéliennes; amont (substrat); positif; aval (produit); négatif
Les enzymes allostériques ont des effecteurs:
• Se lient sur les sites allostériques =/≠(?) site substrat
• Effecteurs positifs (=___) ou négatifs (=___)
• Augmentation ou diminution de l’___ (à comprendre dans le sens de ___) envers le substrat
≠; activateurs; inhibiteurs; affinité; saturabilité
La ___ (E de la glycolyse) est sous contrôle allostérique:
• ADP/ATP(?) en est un activateur
• ADP/ATP(?) en est un inhibiteur
• réaction catalysée: ___ + ___ → ___ + ___
phosphofructokinase; ADP; ATP; Fructose-6-P; ATP; Fructose-1,6-BP; ADP
Un effecteur allostérique négatif est un:
• inhibiteur/activateur(?)
• compétitif/non compétitif(?)
• irréversible/réversible(?)
• d’enzymes allostériques/michaéliennes(?)
inhibiteur;
non compétitif;
réversible;
allostériques
Effecteur allostérique:
• Module la K___
• Effets sur une enzyme allostérique michaélienne/non michaélienne(?)
• Effets non physiologiques/physiologiques(?), enzyme piratée/régulée(?)
0.5;
non michaélienne;
physiologiques;
régulée
Régulation par activité de l’enzyme:
- ___
- Protéine de ___
- ___/___
- Contrôle ___
Protéolyse;
contrôle;
Phosphorylation/déphosphorylation;
allostérique
Régulation par concentration de l’enzyme ou contrôle transcriptionnel dépend de:
• Vitesse de synthèse et dégradation (=___(ang?))
• Facteurs de transcriptions (protéines régulatrices se fixant sur l’ADN, dans la région ___(≠régulatrice?) du gène codant pour l’enzyme)
turnover;
promotrice
Régulation par concentration de l’enzyme ou contrôle transcriptionnel dépend de:
• Induction/Répression(?) si synthèse de l’enzyme est accélérée
• Induction/Répression(?) si synthèse est freinée
• Facteurs de transcriptions eux-mêmes sous contrôle ___ et/ou ___
Induction;
Répression;
hormonal;
métabolique
Vitesse de réaction limitante:
• Fonction de la disponibilité en ___ (et en ___ associé)
• Dépend de l’___ de l’enzyme (protéolyse, fixation d’un P de contrôle, P/dé-P, contrôle allostérique)
• Dépend de la ___ de l’enzyme

substrat;
coenzyme;
activité;
concentration
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?):
• Réponse immédiate comme l’E est tout de suite informée par une molécule qui se trouve dans la C (ordre: ≤ à la seconde)

allostérique
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?):
• Régulation physiologique, à l’échelle de l’organisme, aux conditions nutritionnelle et métabolique
par modification covalente
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?):
• Réponse à long terme (ordre: heures à mois)
transcriptionnel
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?):
• Permet l’amplification du signal hormonal
par modification covalente
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?):
• Réponse moyen terme (ordre: seconde à minutes)
par modification covalente
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?):
• Régulation adaptative, Cr et/ou à l’échelle de l’organisme, aux conditions de vie (alimentation, activité, périodes de vie, maladie, saisons)
transcriptionnel
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?):
• Permet l’économie des ressources
transcriptionnel
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?):
• Régulation locale, Cr, aux concentrations de métabolites
allostérique
Régulation métabolique:
• Régulation adaptative aux conditions de vie (alimentation, activité, saisons)
• Réponse long terme (ordre: heures à mois)
• Permet l’économie des ressources
Mécanisme observable chez quel animal par exemple?
Hibernation d’une marmotte
Contrôle allostérique/par modification covalente (type P / dé-P)/transcriptionnel(?):
• Niveau: organisme (physiologique)



par modification covalente (type P / dé-P)