Biochimie Module A Points importants Maechler bis Flashcards
La ___, E de la glycolyse, est sous contrôle allostérique:
• ADP en est un inhibiteur/activateur(?) allostérique
• ATP en est un inhibiteur/activateur(?) allostérique
phosphofructokinase;
activateur;
inhibiteur
Inhibiteurs enzymatiques: ○ \_\_\_ \_\_\_: \_\_\_: ● La \_\_\_ ● Le \_\_\_ ● L'\_\_\_ ● Les \_\_\_ \_\_\_ ○ \_\_\_: ● \_\_\_: • \_\_\_ (analogues du S, E michaéliennes) • \_\_\_ \_\_\_ (non analogues du S, E michaéliennes) • \_\_\_ \_\_\_ \_\_\_ (non analogues du S, E allostériques non michaéliennes) ● \_\_\_


Non spécifique; Dénaturation; température; pH (acides/bases); alcool; métaux lourds; Spécifique; Réversible; Compétitif; Non compétitif; Effecteur allostérique négatif; Irréversible
Inhibiteur non compétitif ou effecteur allostérique?
• Ne change pas la KM
Inhibiteur non compétitif
Inhibiteur non compétitif ou effecteur allostérique?
• Effets sur une enzyme allostérique non michaélienne
effecteur allostérique
Inhibiteur non compétitif ou effecteur allostérique?
• Effets physiologiques, enzyme régulée
effecteur allostérique
Inhibiteur non compétitif ou effecteur allostérique?
• Effets sur une enzyme michaélienne
Inhibiteur non compétitif
Inhibiteur non compétitif ou effecteur allostérique?
• Effets non physiologiques, enzyme piratée
Inhibiteur non compétitif
Inhibiteur non compétitif ou effecteur allostérique?
• Module la K0.5
effecteur allostérique
Régulation métabolique: Adapter la demande/l’offre(?) métabolique à la demande/l’offre(?) Cr:
• Ajuster la concentration d’un métabolite spécifique au besoin Cr
• Freiner/accélérer(?) la production lorsque la demande est insatisfaite
l’offre;
la demande;
accélérer;
Régulation métabolique: Adapter la demande/l’offre(?) métabolique à la demande/l’offre(?) Cr:
• Freiner/accélérer(?) la production lorsque la demande est satisfaite
• L’enzyme régulant une voie métabolique catalyse la réaction ___
l’offre;
la demande;
freiner;
limitante
Régulation métabolique: Réaction limitante:
• Dans une chaîne de réactions, les enzymes ne sont pas/sont(?) en excès, sauf pour la réaction limitante
• L’étape régulatrice est en tout début/toute fin(?) de chaîne de réactions
sont;
tout début
Régulation métabolique: Réaction limitante:
• La première réaction de la chaîne doit être non spécifique/spécifique(?) de la voie métabolique
• La première réaction spécifique est réversible/irréversible(?) (en conditions cellulaires=selon la T, le pH, la concentration de substrat et produits)
spécifique (si c’est une réaction carrefour: on affecterait plusieurs voies);
irréversible
Régulation métabolique: réactions limitantes:
• L’étape régulatrice en fin/début(?) de chaîne
• Première réaction doit être spécifique/non spécifique(?) de la voie
• La première réaction spécifique est réversible/irréversible(?)
début;
spécifique;
irréversible
Vitesse de réaction limitante: • Fonction de la disponibilité en \_\_\_ (et en \_\_\_ associé) • Dépend de l’\_\_\_ de l’enzyme • Dépend de la \_\_\_ de l’enzyme 
substrat;
coenzyme;
activité;
concentration
___ en ___:
- Approvisionnement en précurseur A et flux métabolique
- Compétition avec une éventuelle autre réaction
- Approvisionnement en CoE (et sa régénération)
Disponibilité;
substrat
Activité de l’enzyme:
- Activation par ___ (réversible/irréversible(?), enzymes digestives)
- Activation par fixation d’une protéine de ___ (réversible/irréversible(?))
- Contrôle par ___/___ (covalent/non covalent(?), réversible/irréversible(?))
- Contrôle ___ (covalent/non covalent(?), réversible/irréversible(?))
protéolyse; irréversible; contrôle; réversible; phosphorylation / déphosphoprylation; covalent; réversible; allostérique; non covalent; réversible
Phosphorylation / déphosphorylation:
• Phosphorylation (sur ___(AA?), ___(AA?) ou ___(AA?)) catalysée par une ___ (qui peut être elle-même phosphorylée → cascade)
• Déphosphorylation par une ___
• Le contrôle ___ passe généralement par des
réaction P/dé-P
• La cascade d’activation permet l’___ de la réponse signal
serine; thréonine; tyrosine; kinase; phosphatase; hormonal; amplification
La cascade d’activation permet l’amplification du signal: exemple du métabolisme du ___. Mobilisation de ___ à partir du ___.
glycogène;
glucose-1-phosphate;
glycogène
Contrôle allostérique → enzymes michaéliennes/non michaéliennes(?):
• Activateurs (par métabolite aval (produit)/amont (substrat)(?), effecteur positif/négatif(?))
• Inhibiteurs (par métabolite aval (produit)/amont (substrat)(?), feedback positif/négatif(?))
non michaéliennes; amont (substrat); positif; aval (produit); négatif
Les enzymes allostériques ont des effecteurs:
• Se lient sur les sites allostériques =/≠(?) site substrat
• Effecteurs positifs (=___) ou négatifs (=___)
• Augmentation ou diminution de l’___ (à comprendre dans le sens de ___) envers le substrat
≠; activateurs; inhibiteurs; affinité; saturabilité
La ___ (E de la glycolyse) est sous contrôle allostérique:
• ADP/ATP(?) en est un activateur
• ADP/ATP(?) en est un inhibiteur
• réaction catalysée: ___ + ___ → ___ + ___
phosphofructokinase; ADP; ATP; Fructose-6-P; ATP; Fructose-1,6-BP; ADP
Un effecteur allostérique négatif est un:
• inhibiteur/activateur(?)
• compétitif/non compétitif(?)
• irréversible/réversible(?)
• d’enzymes allostériques/michaéliennes(?)
inhibiteur;
non compétitif;
réversible;
allostériques
Effecteur allostérique:
• Module la K___
• Effets sur une enzyme allostérique michaélienne/non michaélienne(?)
• Effets non physiologiques/physiologiques(?), enzyme piratée/régulée(?)
0.5;
non michaélienne;
physiologiques;
régulée
Régulation par activité de l’enzyme:
- ___
- Protéine de ___
- ___/___
- Contrôle ___
Protéolyse;
contrôle;
Phosphorylation/déphosphorylation;
allostérique
Régulation par concentration de l’enzyme ou contrôle transcriptionnel dépend de:
• Vitesse de synthèse et dégradation (=___(ang?))
• Facteurs de transcriptions (protéines régulatrices se fixant sur l’ADN, dans la région ___(≠régulatrice?) du gène codant pour l’enzyme)
turnover;
promotrice
Régulation par concentration de l’enzyme ou contrôle transcriptionnel dépend de:
• Induction/Répression(?) si synthèse de l’enzyme est accélérée
• Induction/Répression(?) si synthèse est freinée
• Facteurs de transcriptions eux-mêmes sous contrôle ___ et/ou ___
Induction;
Répression;
hormonal;
métabolique
Vitesse de réaction limitante:
• Fonction de la disponibilité en ___ (et en ___ associé)
• Dépend de l’___ de l’enzyme (protéolyse, fixation d’un P de contrôle, P/dé-P, contrôle allostérique)
• Dépend de la ___ de l’enzyme

substrat;
coenzyme;
activité;
concentration
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?):
• Réponse immédiate comme l’E est tout de suite informée par une molécule qui se trouve dans la C (ordre: ≤ à la seconde)

allostérique
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?):
• Régulation physiologique, à l’échelle de l’organisme, aux conditions nutritionnelle et métabolique
par modification covalente
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?):
• Réponse à long terme (ordre: heures à mois)
transcriptionnel
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?):
• Permet l’amplification du signal hormonal
par modification covalente
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?):
• Réponse moyen terme (ordre: seconde à minutes)
par modification covalente
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?):
• Régulation adaptative, Cr et/ou à l’échelle de l’organisme, aux conditions de vie (alimentation, activité, périodes de vie, maladie, saisons)
transcriptionnel
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?):
• Permet l’économie des ressources
transcriptionnel
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?):
• Régulation locale, Cr, aux concentrations de métabolites
allostérique
Régulation métabolique:
• Régulation adaptative aux conditions de vie (alimentation, activité, saisons)
• Réponse long terme (ordre: heures à mois)
• Permet l’économie des ressources
Mécanisme observable chez quel animal par exemple?
Hibernation d’une marmotte
Contrôle allostérique/par modification covalente (type P / dé-P)/transcriptionnel(?):
• Niveau: organisme (physiologique)



par modification covalente (type P / dé-P)
Contrôle allostérique/par modification covalente (type P / dé-P)/transcriptionnel(?):
• Délai: ≤ à la seconde
allostérique
Contrôle allostérique/par modification covalente (type P / dé-P)/transcriptionnel(?):
• Délai: heures à mois
transcriptionnel
Contrôle allostérique/par modification covalente (type P / dé-P)/transcriptionnel(?):
• Niveau: cellulaire et/ou organisme
transcriptionnel
Contrôle allostérique/par modification covalente (type P / dé-P)/transcriptionnel(?):
• Délai: secondes à minutes
par modification covalente (type P / dé-P)
Contrôle allostérique/par modification covalente (type P / dé-P)/transcriptionnel(?):
• Niveau: cellulaire (local)
allostérique
Les coenzymes:
• Indispensable à l’activité de certaines ___
• Sont/Ne sont pas(?) des protéines
• Ne retrouvent pas/Retrouvent(?) leur état initial
• Participent/Ne participent pas(?) à la stœchiométrie de la réaction
• Sont généralement des ___(molécules?)
enzymes; Ne sont pas; Retrouvent; Participent; vitamines
Les coenzymes transfèrent d’une molécule à une autre, par prise en charge permanente/transitoire(?), des:
• ___
• ___
• ___
transitoire;
Électrons;
Atomes;
Molécules
Les coenzymes: Deux mécanismes:
• ___ (coenzyme lié/libre(?)), par ex. NAD
• ___ ___ (coenzyme lié/libre(?)), par ex. FAD
Cosubstrat;
libre;
Groupe prosthétique;
lié
Les coenzymes: Deux fonctions:
• ___(réaction?)
• Transfert de ___ d’___
Oxydoréduction;
groupements;
atomes
Mécanismes des coenzymes;
cosubstrats/groupes=groupements prosthétiques(?):
• Faiblement fixés (liaisons non covalentes)
cosubstrats
Mécanismes des coenzymes; cosubstrats/groupes=groupements prosthétiques(?):
• Fonctionnent dans une double réaction couplée en 1 seule opération (prise en charge et transfert facteur X)
groupes=groupements prosthétiques
Mécanismes des coenzymes; cosubstrats/groupes=groupements prosthétiques(?):
• Solidement fixés (liaisons covalentes)
groupes=groupements prosthétiques
Mécanismes des coenzymes; cosubstrats/groupes=groupements prosthétiques(?):
• Participent à 2 réactions enzymatiques séquentielles couplées:
1. prise en charge facteur X
2. transfert facteur X
cosubstrats
Coenzymes d’oxydoréduction: Transfert d’___ ___:
• Électrons e-
• Atomes d’hydrogène H
• Ion hydrure H-
équivalents réducteurs
1 équivalent réducteur = 1 ___ transféré dans une réaction oxred (indépendamment du mode de transfert)
e-
Coenzymes d’___: Transfert d’équivalents réducteurs:
• Coenzymes ___ (NAD & NADP)
• Coenzymes ___ (FAD & FMN)
oxydoréduction;
pyridiniques;
flaviniques
coenzymes d’oxydoréduction = (syn?)___ des ___
cofacteurs;
oxydoréductases
Groupes d’oxydoréductases:
• ___ (l’accepteur d’hydrogène est l’oxygène lui-même)
• ___ (l’accepteur d’e- ou d’hydrogène est un autre substrat que l’oxygène)
• ___ (l’accepteur d’hydrogène est le peroxyde d’hydrogène, dégradent H2O2)
• ___ (l’oxygène est fixé directement sur une molécule de substrat)

Oxydases;
Déshydrogénases;
Hydroperoxydases;
Oxygénases
AH2 + NAD+ → A + NADH + H+:
• L’enzyme E a extrait des ___ ___ du métabolite AH2
• Le coenzyme oxydé/réduit(?) pourra lui-même transférer ses e-
• Donc: correspond à extraction et transfert d’___(≠e-?)
équivalents réducteurs;
réduit;
énergie
Coenzymes d’oxydoréduction: Transfert d’___ ___:
• Coenzymes pyridiniques (___ & ___)
• Coenzymes flaviniques (___ & ___)
équivalents réducteurs; NAD; NADP; FAD; FMN
NAD=___ ___ ___
Nicotinamide Adénine Dinucléotide
NAD: Coenzyme d’___(réaction?)
oxydoréduction
Potentiel d’oxydoréduction du couple NAD+/NADH+H+:
+/-? x.xx V
- 0.32
NADH absorbe/émet de(?) la lumière à ___nm
absorbe;
340
La concentration de substrat n’influence pas/influence(?) la Vi. On détermine la vitesse maximale Vmax.
influence
NAD: Extraction et transfert d’___ ___ dans les réactions anaboliques/cataboliques(?)
équivalents réducteurs;
cataboliques
- 1er temps: NAD+ est un réducteur/oxydant(?) qui accepte les équivalents réducteurs extraits de substrats oxydés/réduits(?) AH2
- 2ème temps: NADH est réducteur/oxydant(?) et transfert ses équivalents réducteurs à la ___ respiratoire
oxydant;
réduits;
réducteur;
chaîne
NAD: Extraction d’___ ___ dans les réactions anaboliques/cataboliques(?) et transfert sur la
chaîne ___ (produit de l’___(molécule?))
équivalents réducteurs;
cataboliques;
respiratoire;
ATP
NADP:
• Est principalement impliqué dans les voies de biosynthèse/catabolisme(?)
• Agit principalement comme oxydant/réducteur(?) (NADP/NADPH(?))
• Sous sa forme oxydée/réduite(?), donne ses équivalents réducteurs dans les réactions cataboliques/anaboliques(?)
biosynthèse; réducteur; NADPH; réduite; anaboliques
FAD = ___ ___ ___
Flavine Adénine Dinucléotide
FAD: dinucléotide formé de ___ & d’___ (= respectivement___ ___ & ___ ___)
FMN;
AMP;
flavine mononucléotide;
adénosine monophosphate
FAD:
• Dérivé de la ___ (=vitamine ___)
• ___ ___ de quelques déshydrogénases
riboflavine;
B2;
Groupe prosthétique
FAD:
• Transfert des ___ ___ à la chaîne respiratoire
• Est localisé dans les ___(≠cellules?)
équivalents réducteurs;
mitochondries
Potentiel d’oxydoréduction du couple FAD/FADH2: +/-? x.x V
- 0.1
___ & ___: Coenzymes transporteurs d’électrons impliqués dans les voies anaboliques/cataboliques(?)
(production de précurseurs et d’énergie)

NAD;
FAD;
cataboliques
___: Coenzyme transporteur d’électrons impliqués dans les voies anaboliques/cataboliques(?) (production de molécules complexes)
NADP;
anaboliques
Coenzymes de transfert de groupes d’atomes; groupes d’atomes tels que du/des:
• ___
• Groupes ___
• Autres
CO2;
pluricarbonés
___(CoE?) assists in various metabolic reactions involving the transfer of carbon dioxide.
Biotin
CoA:
• Transporte les groupes ___, par ex. ___ à 2 carbones
• Dérivé vitaminique: acide ___ = vitamine ___
acyles;
acétyle;
pantothénique;
B5
CoA:
• Formation d’acetyl-CoA est couplée à des
réactions endergoniques/exergoniques(?)
• Acétyl-CoA est le ___ des voies métaboliques
exergoniques;
carrefour
Co-co-co-coment;
Classe:
• Coenzyme = ___
Cofacteur
Co-co-co-coment;
Mécanisme:
• ___: faible liaison, non covalente
• ___ ___: liaison covalente

Cosubstrat;
Groupe prosthétique
Co-co-co-coment;
Fonction (précisez de quels CoE il s’agit):
• Oxred (___ et ___)
• Oxred (___ et ___)
• Transfert de groupe pluricarbonés (___)
NAD; NADP; FAD; FMN; CoA
Voies du glucose:
• Glucose-6-P → ___ (voie métabolique?) → Pyruvate
• Glucose-6-P → ___(molécule?) (dépôt)
• Glucose-6-P → Ribose-5P (voie des ___)
Glycolyse;
Glycogène;
pentoses
Glycolyse: Voie du catabolisme/de l’anabolisme(?) réducteur/oxydatif(?) aérobie/anaérobie(?)
du catabolisme;
oxydatif;
anaérobie
Glycolyse:
• Insertion/Extraction(?) d’équivalents réducteurs
• Accepteur d’équivalents réducteurs: ___(CoE?)
• Ne consomme pas/consomme(?) d’oxygène
• Consomme/Fournit(?) des métabolites ou précurseurs
• Voie cytosolique/mitochondriale(?)
Extraction; NAD+; Ne consomme pas; Fournit; cytosolique
Glycolyse: classes de réactions enzymatiques (précisez de quelles E il s’agit):
• Transfert de phosphate: ___
• Changement de position de phosphore: ___
• Conversion cétose/aldose: ___
kinase;
mutase;
Isomérase
Glycolyse: classes de réactions enzymatiques (précisez de quelles E il s’agit):
• Déshydratation: ___
• Clivage liaison C-C d’un aldose: ___
• Extraction d’équivalents réducteurs: ___
énolase;
aldolase;
déshydrogénase
Glycolyse: Phase préparatoire d’investissement:
• Génère/Nécessite(?) de l’énergie
• Débute à ___ carbones
• Finit à 2 x ___ carbones
Nécessite;
6;
3
Glycolyse: Phase de retour sur investissement:
• Génère de l’énergie directe (___(molécule?)) et indirecte (___(molécule?))
• Compte à double/simple(?)
• Produit du ___
ATP;
NADH;
à double;
pyruvate
Bilan glycolyse:
• ___(#?) ___
• ___(#?) ___
• ___(#?) ___
2 ATP;
2 NADH;
2 pyruvates
Phase préparatoire d’investissement/Phase de retour sur investissement(?) compte x2.
Phase de retour sur investissement
Glucose → Glycolyse → Pyruvate → voie anaérobie chez les levures → production in fine d’___(molécule précise?) et de ___


EtOH;
CO2
Glucose → Glycolyse → Pyruvate → voie anaérobie chez les animaux → production in fine de ___ et de ___(#?) ATP
Lactate;
2
biotine = vitamine ___
B8
Coenzyme NAD(P) dont le précurseur est la vitamine ___ =___ aussi appelée ___:
• ___: désigne l’acide nicotinique et l’amide nicotinique (appelé aussi nicotinamide)
• NAD et NADP jouent un rôle essentiel pour le transfert d’___(≠énergie?) dans les voies métaboliques
• La ___ est présente dans les aliments d’origine animale et végétale.
PP=pellagra preventive ; B3; niacine; Niacine; électrons; niacine
Biotin assists in various metabolic reactions involving the transfer of ___ ___(molecule?) .
carbon dioxide
