Bio-informatica Flashcards
Wat is bio-informatica?
Bio-informatica is een interdisciplinair vakgebied dat computerwetenschap, statistiek en biologie combineert om biologische data (zoals DNA- en eiwitsequenties) te analyseren en interpreteren.
Wat zijn enkele toepassingen van bio-informatica?
• Analyse van DNA- en RNA-sequenties (genoomanalyse).
• Ontwikkeling van nieuwe geneesmiddelen en vaccins.
• Studie van eiwitstructuren en -functies.
• Evolutie- en fylogenetisch onderzoek.
• Identificatie van genetische ziekten en biomarkers.
Wat is een genoom en hoe wordt het bestudeerd in bio-informatica?
Een genoom is het volledige set genetisch materiaal (DNA) van een organisme. Bio-informatica helpt bij het sequentiëren, annoteren en comparerend analyseren van genomen om genfuncties en genetische variaties te begrijpen.
Wat is sequentie-uitlijning en waarom is het belangrijk?
Sequentie-uitlijning vergelijkt DNA-, RNA- of eiwitsequenties om overeenkomsten en verschillen te vinden. Dit helpt bij:
• Evolutieonderzoek en fylogenetische analyses.
• Identificatie van functionele genen.
• Detectie van mutaties die ziekten kunnen veroorzaken.
Wat zijn BLAST en FASTA in bio-informatica?
• BLAST (Basic Local Alignment Search Tool): Een algoritme dat sequenties vergelijkt om overeenkomsten te vinden in databanken.
• FASTA: Een bestandsformaat en tool voor snelle sequentie-uitlijning en vergelijking.
Wat is een fylogenetische boom?
Een fylogenetische boom is een diagram dat de evolutionaire relaties tussen organismen of genen weergeeft op basis van DNA- of eiwitsequentie-overeenkomsten.
Wat is proteomics en hoe wordt het ondersteund door bio-informatica?
Proteomics bestudeert de structuur en functie van eiwitten in cellen. Bio-informatica helpt bij:
• Identificatie van eiwitsequenties en -structuren.
• Voorspelling van eiwitinteracties.
• Analyse van eiwitexpressieprofielen.
Wat zijn databases zoals GenBank en UniProt?
• GenBank: Een publieke databank met DNA-sequenties en annotaties.
• UniProt: Een uitgebreide databank met eiwitinformatie, inclusief sequenties, functies en structuren.
Wat is transcriptomics en hoe helpt bio-informatica hierbij?
Transcriptomics bestudeert de expressie van genen via RNA-sequenties. Bio-informatica wordt gebruikt om RNA-sequencing (RNA-Seq) gegevens te analyseren en genexpressiepatronen te begrijpen.
Hoe draagt bio-informatica bij aan de ontwikkeling van geneesmiddelen?
Bio-informatica helpt bij:
• Identificatie van doelwitten voor geneesmiddelen (drug targets).
• Ontwerp van moleculen met specifieke interacties.
• Simulaties van eiwit-drug-interacties (moleculaire modellering).
• Analyse van klinische gegevens en gepersonaliseerde geneeskunde.
