bacteria taxonomy Flashcards
What is taxonomy
Taksonomi, organizmaları düzenli gruplara veya kategorilere ayırma sanatıdır.
ADLANDIRMA
SINFLANDIRMA
…..sinifladirmanin en belirleyci sevisyesidir
tur
Who manages the naming of prokaryotesand how are updates notified
Prokaryotların Sistematik Komitesi (ICSP)
updates:The International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
Naminf rules
*only one name( if many available, oldes is valid)
*latin names only
* Genus species ( capitalization rule bu sekilde)
*genus and species name must be italicized or underlined
What are some of the factors considered in placing an organism in a cins and tur?
*geleneksel olarak, tüm üyelerinin pek çok FENOTIPIK özelliği bakımından benzerliğine dayanır.
*Tanısal mikrobiyoloji laboratuvarında,
metabolic and molecular features are checked and compared to existing data
*Mevcut teknoloji, taksonomik amaçlarla genetik ilişkililiğin (DNA ve RNA yapısı ve homologisi) analizini mümkün kılmıştır. Ribozomal RNA (rRNA) gen dizilimi analizi, bu amaç için özellikle faydalı olmuştur. Bu çalışmalardan elde edilen bilgiler, bazı bakterilerin yeniden sınıflandırılmasına yol açmıştır.
Adlandırma Hiyerarşisi
Takım — Adlar “-ales” ile biter.
* Aile — Adlar “-aceae” ile biter.
* Kabile — Adlar “-eae” ile biter.
* Cins
* Tür — Ortak özelliklere sahip suşların bir araya geldiği bir topluluk.
* Suş — Saf bir izolatın türediği bakteri kültürü.
What is sayisal(numerical taxonomy)
Many rapid identification systems use numerical taxonomy, where a numerical value is assigned to phenotypic characteristics and the resulting number represents the genus and species of the bacteria.
Turler nelere gore alt turler ayrilir
fenotipik farklara dayalı olarak- alt tür (“subsp.” olarak kısaltılır)
serolojik farklara dayalı olarak- serovar (“serovar” olarak kısaltılır)
biyokimyasal test sonuçlarındaki farklara dayalı olarak- biovar (“biovar” olarak kısaltılır) olarak alt bölümlere ayrılabilir.
belirli bakteriyel fajlara duyarlılık esasına dayalı –faj tipi kullanımı
Peptidoglycan sentezini hedef alan antibakteriyel sınıfı nedir ve bu sınıfın etki mekanizması nedir?
Beta Laktam antibakteriyalleri (ve vankomisin) peptidoglikan sentezini etki mekanizmaları olarak hedef alır.
GRAM -ve baketrinin benzersiz dış zar bileşeninin hangi kısmı, insan fizyolojisi üzerinde derin etkiler yapar?
Lipopolisakarit (endotoksin), dış zarın dış katmanında bulunur.Lipid A, insan fizyolojisi üzerinde derin etkiler yapar.
Lipopolisakarit (endotoksin), dış zarın dış katmanında bulunur.
Lipid A KISMI insan fizyolojisi üzerinde derin etkiler yapar.