amminoacidi

Question 1

aa basici e curva di titolazione

Answer 1

lisina arginina istidina

Question 2

aa aromatici

Answer 2

fenilalanina triptofano tirosina

Question 3

aa IDROFOBICI e caratteristiche

Answer 3

glicina
alanina valina leucina isoleucina prolina fenilalanina

Question 4

aa IDROFILICI e ANFIPATICI e caratteristiche. distinguili tra Amminoacidi che contengono gruppi OH, Amminoacidi acidi, Amminoacidi con gruppi amidici, Amminoacidi che contengono S, Amminoacidi basici, Amminoacidi aromatici

Answer 4

Gli amminoacidi possono essere classificati in base alla natura dei loro gruppi laterali (catene laterali R). Alcuni di questi gruppi laterali sono idrofili (solubili in acqua) e altri sono anfipatici (possono interagire sia con l’acqua che con i lipidi). Ecco una classificazione dettagliata:

1. Amminoacidi che contengono gruppi OH (idrofili)
   Questi amminoacidi hanno gruppi idrossilici (-OH) nelle loro catene laterali, che possono formare legami idrogeno con l’acqua.

• Serina (Ser, S): R = -CH2OH
• Treonina (Thr, T): R = -CH(OH)CH3
• Tirosina (Tyr, Y): R = -CH2-C6H4OH (anche aromatico)

2. Amminoacidi acidi (idrofili)
   Questi amminoacidi hanno gruppi carbossilici (-COOH) nelle loro catene laterali, che possono ionizzarsi a pH fisiologico e formare legami idrogeno con l’acqua.

• Aspartato (Asp, D): R = -CH2COOH
• Glutammato (Glu, E): R = -CH2CH2COOH

3. Amminoacidi con gruppi amidici (idrofili)
   Questi amminoacidi hanno gruppi ammidici (-CONH2) nelle loro catene laterali, che possono formare legami idrogeno con l’acqua.

• Asparagina (Asn, N): R = -CH2CONH2
• Glutammina (Gln, Q): R = -CH2CH2CONH2

4. Amminoacidi che contengono zolfo (idrofili e anfipatici)
   Questi amminoacidi contengono atomi di zolfo nelle loro catene laterali. Alcuni di essi sono idrofili, mentre altri possono essere anfipatici.

• Cisteina (Cys, C): R = -CH2SH (idrofila)
• Metionina (Met, M): R = -CH2CH2SCH3 (anfipatica)

5. Amminoacidi basici (idrofili)
   Questi amminoacidi hanno gruppi basici nelle loro catene laterali, che possono accettare protoni a pH fisiologico e formare legami idrogeno con l’acqua.

• Lisina (Lys, K): R = -CH2CH2CH2CH2NH2
• Arginina (Arg, R): R = -CH2CH2CH2NHC(NH2)NH
• Istidina (His, H): R = -CH2-C3H3N2 (anche aromatico)

6. Amminoacidi aromatici (idrofobi o anfipatici)
   Questi amminoacidi hanno anelli aromatici nelle loro catene laterali. Possono essere idrofobi o anfipatici, a seconda della struttura.

• Fenilalanina (Phe, F): R = -CH2-C6H5 (idrofoba)
• Tirosina (Tyr, Y): R = -CH2-C6H4OH (anfipatica, anche gruppo OH)
• Triptofano (Trp, W): R = -CH2-C8H6N (anfipatica)

Questa classificazione aiuta a capire come gli amminoacidi interagiscono con l’ambiente acquoso e come contribuiscono alla struttura e alla funzione delle proteine.

Question 5

scrivere gli amminoacidi che hanno almeno un azoto nella catena laterale

Answer 5

Gli amminoacidi che hanno almeno un atomo di azoto nella loro catena laterale (R) sono i seguenti:

Lisina (Lys, K) - La catena laterale contiene un gruppo amminico (NH₂).
Arginina (Arg, R) - La catena laterale contiene un gruppo guanidinico (che ha tre atomi di azoto).
Istidina (His, H) - La catena laterale contiene un gruppo imidazolico (che ha due atomi di azoto).
Asparagina (Asn, N) - La catena laterale contiene un gruppo ammidico (che ha un atomo di azoto).
Glutammina (Gln, Q) - La catena laterale contiene un gruppo ammidico (che ha un atomo di azoto).
Triptofano (Trp, W) - La catena laterale contiene un anello indolico (che ha un atomo di azoto).

Question 6

tabella di amminoacidi in cui scrivere la struttura, sigla a 3 lettere, sigla a una lettera, ka COOH, Ka
NH3+, Ka R, punto isoelettrico

Question 7

Calcolare la frazione di lisina protonata a pH 9.5, 10.5 e 12.5

Question 8

tutte le caratteristiche degli amminoacidi che contengono ossigeno

Question 9

Amminoacidi aromatici caratteristiche chimiche e fisiche

Question 10

Formazione selenocisteina

Question 11

Differenza aspartato e glutammat

Question 12

-pKA e come possiamo influenzarla

Question 13

Che vantaggi ha la Prolina e dove l’abbiamo vista?
-Perchè è favorita anche la conformazione Cis ?

Question 14

acido aspartico (caratteristiche, curva di titolazione da disegnare e spiegare) e come
sarebbe la curva nel caso di una catena polipeptidica, quali fattori la influenzano

Question 15

Struttura dell’istidina e pKa

Question 16

Cosa succede all’N dell’asparagina ? IL doppietto che particolarità ha ? Succede anche a
livello della struttura della glutammina.

Question 17

sintesi di pirrolisina

Question 18

Curva titolazione tirosina

Question 19

Scrivere un polipeptide e calcolarne il peso molecolare

Answer 19

facciamo una media tra l’aa più pesante e quello più leggero, ovvero trp e gly. esce un peso medio di 139,5 Da per aa. togliamo le molecole di acqua che vengono eliminate tramite la formazione del legame peptidico, ovvero 18 Da.

Question 20

Aa con N e descrivere