Aminosäuren : fertig Flashcards
In welcher Form können AS auftreten?
Polar Apolar Basisch Sauer Aromatische Aliphatisch
Grundaufbau einer AS
H2N-HCR-COOH
Das erste C neben der Carboxylgruppe wird als alpha-C bezeichnet
pH wert abhängige Ionisierung von AS (mögliche Zustände von AS)
Protoniert: +H3N-CHR-COOH
Ladungsneutral:
+H3N-CHR-COO- (es wird zunächst die carboxylgruppe deprotoniert)
Deprotoniert: H2N-CHR-COO-
Zwitterionenform
Ladungsneutrale Form einer AS
+H3N-CHR-COO-
(es wird zunächst die carboxylgruppe deprotoniert)
Glycin
Glycin, G
Unpolare SK (Seitenkette)
+H3N-CH2-COO-
Kleinste AS
Alanin
Alanin, A
unpolare SK
+H3N-CHCH3-COO-
Grundverbindung
AS mit aliphatischen SK
apolar: Valin V Leucin L Isoleucin I Methionin M
polar:
Serin S
Threonin T
(Cystein C)
Leucin
Leu, L
aliphatisch/unpolar
H3C-CH-CH3 \ CH2 / \+H3N-CH \ COO-
Valin
Val, V
aliphatisch/unpolar
H3C-CH-CH3
|
+H3N-CH-COO-
Isoleucin
Ile, I
Isomer von leucin
aliphatisch/unpolar
CH2 / H3C-CH2-CH3 | \+H3N-HC-COO-
Methionin
Met, M
->Thioether
aliphatisch/unpolar
+H3N-HC(nach oben: CH2-CH2-S-Ch3)-COO-
AS mit aromatischen SK
Phenylalanin F
Tyrosin Y
Tryptophan W
Prolin
Pro, P
Unpolar
Ring aus:
-+H2N-(HCCOO-)-CH2-CH2-CH2-
Phenylalanin
Phe, F
unpolar,Aromat
Abs.max:258nm
+H3N-(HCCOO-)-CH2-Phenyl(6 Ring mit 3DB)
Tyrosin
Hydroxyphenylalanin
Tyr, T
Polar, Aromat
Abs.max: 275nm
+H3N-(HCCOO-)-CH2-Hydroxyphenyl(6 Ring mit 3DB)-OH
Zur Quantifizierung von Proteinen mittels spektrokopie
Tryptophan
Indolalanin
Trp, W
unpolar, Aromat
Abs.max:280nm
+H3N-(HCCOO-)-CH2-Indol(5 Ring mit 1DB und einem N an 6Ring mit 3DB)
UV/Vis spektroskopie (Formel)
Wie viel Licht kommt durch die Küvette
Lambert-beer’sches Gesetz:
E= log(l_0)/l = epsilon×c×d
Wieso können manche Stoffe Licht absorbieren?
Amphiphatische AS haben keine Energieorbitale die diesen Eigenschaften entsprechen
Bei Aromaten: konjugierters Pi - Elektronensystem
Serin
Hydroxylalanin
Ser, S
aliphatisch, Sehr Polar, da OH Gruppe
OH-CH2 | \+H3N-HCCOO-
Threonin
Thr, T
aliphatisch, polar
HO-CH-CH3 | \+H3N-HCCOO-
Cystein
Cys, C
(- schwach sauer/polar)
HS-CH2 | \+H3N-HCCOO-
Cystein oxidiert/reduziert
-> reversible Reaktion
R-SH + HS-R R-S-S-R + 2H+ + 2e-
Aromatische AS
Phenylalanin
Tyrosin
Tryptophan
Basische AS
Lysin
Arginin
Histidin
Polare AS
Tyrosin
Serin
Threonin
Apolare AS
Glycin Alanin Valin Leucin Isoleucin Methionin Prolin Tryptophan Phenylalanin
Saure AS
Cystein
Aspartat
Glutamat
Welche AS haben bei physiologischen pH eine positive Ladung?
Lysin
Arginin
(Histidin)
Welche AS haben bei physiologischen pH eine negative ladung?
Asparat
Glutamat
Welche AS absorbieren strahlung in einem Wellenlängenbereich von 260-280nm
phenylalanin
Tyrosin
Tryptophan
-> aromatische AS mit konjungierten pi-e–System
Welche AS ist zyklisch aufgebaut?
Prolin
Welche AS kann in oxidierer Form vorliegen?
Cystein
Lysin
Lys, K
- basische AS
- praktisch IMMER positiv geladen
- lang und flexibel
- basisch
NH3+ CH2 CH2 CH2 CH2 / \+H3N-HC-COO-
Arginin
Arg, R
- praktisch IMMER positiv geladen
- lang und flexibel
- basisch
H2N + NH2 \ / NH CH2 CH2 CH2 \ \+H3N-HC-COO-
Histidin
Histidin, H
- Basisch
- Imidazil (0-3fach protoniert)
- bei pH7: positiv, pH8: neutral
_ H // N N \ \ // CH2 / \+H3N-HC-COO-
AS mit Carboxylat Funktion
Asparat
Glutamat
Asparat
Asp, D
- mit Carboxylat Funktion
- negative ladung
- saure AS
COO- \ CH2 / \+H3N-HC-COO-
AS mit Carboxamid Funktion in der SK
Asparagin
Glutamin
Asparagin
Asn, N
- NIE positiv geladen
- können H+weder aufnehmen/abgeben - werden Resonanzstabilisiert
O NH2 \\ / C \ CH2 / \+H3N-HC-COO-
Glutamat
Glu, E
- Carboxylat Funktion
- negative ladung
- sauer
COO- / CH2 \ CH2 / \+H3N-HC-COO-
Glutamin
Gln, Q
- NIE positiv geladen
- können H+ weder aufnehmen/abgeben - werden Resonanzstabilisiert
- Carboxamid Funktion
O NH2 \\ / C / CH2 \ CH2 / \+H3N-HC-COO-
Wieso diese 20 AS?
- breites Spektrum an Reaktivität
- schon unter probiotischen Bedingungen verfügbar
- weniger reaktiv als andere AS -> gehen keine intra-Reaktionen ein
Chirale Verbindung
Bild-Spiegelbild
Chiraler Kohlenstoff -> mit 4 verschiedenen substituenten
Fischerprojektion
Längste Kette: vertikal -> zeigt nach hinten
Je nachdem ob OH Gruppe links (L) oder rechts (D) -> L/D-Form
CHO | OH-C-H | CH2OH
-> L-Glycerinaldehyd
Welche AS ist nicht chiral?
Glycin
Nur 3 verschiedene substituenten
r/s Nomenklatur
- Substituent mit der geringsten Wertigkeit nach hinten
- Und dann Prioritäten von hoch zu niedrig
- C - 3. N - 2. O
1. S
- C - 3. N - 2. O
Peptidbindung
2AS < Peptid + H2O
- > Kondensation
- Gleichgewichtsreaktion - Schwerpunkt auf den einzelnen AS, aber peptidbindung sehr reaktionsträge, lange Halbwertszeit bis zum Zerfall
Peptid hat je nach zusammengesetzter Reihenfolge andere Eigenschaften
welche AS ist keine L-AS?
Cystein
was bedeutet aliphatisch?
sind organische chemische Verbindungen, die aus Kohlenstoff und Wasserstoff zusammengesetzt und nicht aromatisch sind.
Buchstabencode
W
Tryptophan
Buchstabencode
Y
Tyrosin
Buchstabencode
K
Lysin
Buchstabencode
R
Arginin
Buchstabencode
D
Aspartat
Buchstabencode
E
Glutamat
Buchstabencode
N
Asparagin
Buchstabencode
Q
Glutamin